MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022443	AGC	2	6	196770	196775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636632
4002	NC_022443	AAAG	2	8	196818	196825	75 %	0 %	25 %	0 %	545636632
4003	NC_022443	AAT	2	6	196861	196866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636632
4004	NC_022443	TTTA	2	8	197089	197096	25 %	75 %	0 %	0 %	545636633
4005	NC_022443	ATA	2	6	197154	197159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636633
4006	NC_022443	TCT	2	6	197160	197165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636633
4007	NC_022443	CATGT	2	10	197237	197246	20 %	40 %	20 %	20 %	545636633
4008	NC_022443	TGA	2	6	197248	197253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636633
4009	NC_022443	ATAA	2	8	197254	197261	75 %	25 %	0 %	0 %	545636633
4010	NC_022443	TAA	2	6	197291	197296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636633
4011	NC_022443	GAT	2	6	197300	197305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636633
4012	NC_022443	TTGAA	2	10	197312	197321	40 %	40 %	20 %	0 %	545636633
4013	NC_022443	TCG	2	6	197343	197348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636633
4014	NC_022443	CCA	2	6	197409	197414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636633
4015	NC_022443	AAC	2	6	197469	197474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636633
4016	NC_022443	TAA	2	6	197488	197493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636633
4017	NC_022443	TCA	2	6	197496	197501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636633
4018	NC_022443	ATGA	2	8	197519	197526	50 %	25 %	25 %	0 %	545636633
4019	NC_022443	TCA	2	6	197628	197633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636633
4020	NC_022443	AAAC	2	8	197639	197646	75 %	0 %	0 %	25 %	545636633
4021	NC_022443	CGA	2	6	197698	197703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636633
4022	NC_022443	CCCTGA	2	12	197726	197737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545636633
4023	NC_022443	TAA	2	6	197852	197857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636633
4024	NC_022443	GGCG	2	8	197880	197887	0 %	0 %	75 %	25 %	545636633
4025	NC_022443	TGA	2	6	197892	197897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636633
4026	NC_022443	TGT	2	6	197937	197942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636633
4027	NC_022443	GTGA	2	8	198041	198048	25 %	25 %	50 %	0 %	545636633
4028	NC_022443	ATA	2	6	198054	198059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636633
4029	NC_022443	GTT	2	6	198132	198137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636633
4030	NC_022443	ACC	2	6	198206	198211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636633
4031	NC_022443	TTG	2	6	198239	198244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636633
4032	NC_022443	TTTG	2	8	198343	198350	0 %	75 %	25 %	0 %	545636633
4033	NC_022443	AG	3	6	198377	198382	50 %	0 %	50 %	0 %	545636633
4034	NC_022443	TGT	2	6	198423	198428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636633
4035	NC_022443	AAT	2	6	198470	198475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636633
4036	NC_022443	GTA	2	6	198508	198513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636633
4037	NC_022443	TCCTGA	2	12	198545	198556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545636633
4038	NC_022443	CAA	2	6	198562	198567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636633
4039	NC_022443	T	7	7	198581	198587	0 %	100 %	0 %	0 %	545636633
4040	NC_022443	T	6	6	198606	198611	0 %	100 %	0 %	0 %	545636633
4041	NC_022443	TCA	2	6	198630	198635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636633
4042	NC_022443	AATTG	2	10	198637	198646	40 %	40 %	20 %	0 %	545636633
4043	NC_022443	TAA	2	6	198668	198673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636633
4044	NC_022443	ATG	2	6	198681	198686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636633
4045	NC_022443	TTTTC	2	10	198886	198895	0 %	80 %	0 %	20 %	545636634
4046	NC_022443	A	6	6	198905	198910	100 %	0 %	0 %	0 %	545636634
4047	NC_022443	TAA	2	6	198920	198925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636634
4048	NC_022443	AAATAT	2	12	198963	198974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636634
4049	NC_022443	CAA	2	6	198981	198986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636634
4050	NC_022443	CA	3	6	198995	199000	50 %	0 %	0 %	50 %	545636634
4051	NC_022443	AAG	2	6	199009	199014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636634
4052	NC_022443	TAT	2	6	199099	199104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636634
4053	NC_022443	TCA	2	6	199114	199119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636634
4054	NC_022443	TATT	2	8	199163	199170	25 %	75 %	0 %	0 %	545636634
4055	NC_022443	TTAG	2	8	199179	199186	25 %	50 %	25 %	0 %	545636634
4056	NC_022443	AT	3	6	199187	199192	50 %	50 %	0 %	0 %	545636634
4057	NC_022443	TCA	2	6	199222	199227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636634
4058	NC_022443	GT	3	6	199243	199248	0 %	50 %	50 %	0 %	545636634
4059	NC_022443	CAA	2	6	199306	199311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636634
4060	NC_022443	TCAAT	2	10	199325	199334	40 %	40 %	0 %	20 %	545636634
4061	NC_022443	CAT	2	6	199341	199346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636634
4062	NC_022443	TTATT	2	10	199358	199367	20 %	80 %	0 %	0 %	545636634
4063	NC_022443	AAT	2	6	199472	199477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636634
4064	NC_022443	ATTA	2	8	199505	199512	50 %	50 %	0 %	0 %	545636634
4065	NC_022443	TTA	2	6	199623	199628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636634
4066	NC_022443	CCA	2	6	199665	199670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636634
4067	NC_022443	TGC	2	6	199733	199738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636634
4068	NC_022443	TCT	2	6	199761	199766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636634
4069	NC_022443	CGA	2	6	199822	199827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636634
4070	NC_022443	AGT	2	6	199832	199837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636634
4071	NC_022443	ATT	2	6	199863	199868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636634
4072	NC_022443	TCT	2	6	199889	199894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636634
4073	NC_022443	CAG	2	6	199918	199923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636634
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4075	NC_022443	CAG	2	6	199996	200001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636634
4076	NC_022443	TGGG	2	8	200005	200012	0 %	25 %	75 %	0 %	545636634
4077	NC_022443	TA	4	8	200017	200024	50 %	50 %	0 %	0 %	545636634
4078	NC_022443	ATT	2	6	200052	200057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636634
4079	NC_022443	AT	3	6	200059	200064	50 %	50 %	0 %	0 %	545636634
4080	NC_022443	ACA	2	6	200135	200140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636635
4081	NC_022443	CAT	2	6	200281	200286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636635
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4083	NC_022443	AACA	2	8	200310	200317	75 %	0 %	0 %	25 %	545636635
4084	NC_022443	CAT	2	6	200324	200329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636635
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4087	NC_022443	TTG	2	6	200363	200368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636635
4088	NC_022443	ATT	2	6	200395	200400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636635
4089	NC_022443	ACT	2	6	200480	200485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636635
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4091	NC_022443	TGA	2	6	200638	200643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636635
4092	NC_022443	TCAATT	2	12	200696	200707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636635
4093	NC_022443	AGT	2	6	200713	200718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636635
4094	NC_022443	GT	3	6	200736	200741	0 %	50 %	50 %	0 %	545636635
4095	NC_022443	TAA	2	6	200784	200789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636635
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4098	NC_022443	CAT	2	6	200850	200855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636635
4099	NC_022443	ATT	2	6	200879	200884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636635
4100	NC_022443	CAT	2	6	200907	200912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636635
4101	NC_022443	GCA	2	6	200969	200974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636635
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4103	NC_022443	AGT	2	6	201089	201094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636635
4104	NC_022443	GTA	2	6	201159	201164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636635
4105	NC_022443	ACT	2	6	201165	201170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636635
4106	NC_022443	TAT	2	6	201211	201216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636635
4107	NC_022443	TCG	2	6	201219	201224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636635
4108	NC_022443	AGCG	2	8	201414	201421	25 %	0 %	50 %	25 %	545636636
4109	NC_022443	CAAG	2	8	201444	201451	50 %	0 %	25 %	25 %	545636636
4110	NC_022443	CTATG	2	10	201614	201623	20 %	40 %	20 %	20 %	545636636
4111	NC_022443	ATT	2	6	201629	201634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636636
4112	NC_022443	GTT	2	6	201683	201688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636636
4113	NC_022443	AAAC	2	8	201723	201730	75 %	0 %	0 %	25 %	545636636
4114	NC_022443	A	6	6	201794	201799	100 %	0 %	0 %	0 %	545636636
4115	NC_022443	CAA	2	6	201873	201878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636636
4116	NC_022443	ACA	2	6	201886	201891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636636
4117	NC_022443	TAG	2	6	201893	201898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636636
4118	NC_022443	TGA	2	6	201922	201927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636636
4119	NC_022443	CAA	2	6	201930	201935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636636
4120	NC_022443	AATATG	2	12	201996	202007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	545636636
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4122	NC_022443	AAC	2	6	202046	202051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636636
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4245	NC_022443	AGT	2	6	209097	209102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636641
4246	NC_022443	GGAAT	2	10	209152	209161	40 %	20 %	40 %	0 %	545636641
4247	NC_022443	T	6	6	209242	209247	0 %	100 %	0 %	0 %	545636641
4248	NC_022443	A	6	6	209252	209257	100 %	0 %	0 %	0 %	545636641
4249	NC_022443	ATCGT	2	10	209264	209273	20 %	40 %	20 %	20 %	545636641
4250	NC_022443	TTA	2	6	209332	209337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636642
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4253	NC_022443	CTG	2	6	209567	209572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636642
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4259	NC_022443	ATA	2	6	209762	209767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636642
4260	NC_022443	A	6	6	209767	209772	100 %	0 %	0 %	0 %	545636642
4261	NC_022443	AGA	2	6	209799	209804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636642
4262	NC_022443	TGC	2	6	209817	209822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636642
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4272	NC_022443	ATC	2	6	210339	210344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636642
4273	NC_022443	AGCA	2	8	210371	210378	50 %	0 %	25 %	25 %	545636642
4274	NC_022443	CGA	2	6	210494	210499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636642
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4277	NC_022443	TAA	2	6	210629	210634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636643
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4281	NC_022443	TACT	2	8	210933	210940	25 %	50 %	0 %	25 %	545636643
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4283	NC_022443	GGTT	2	8	211061	211068	0 %	50 %	50 %	0 %	545636643
4284	NC_022443	TTA	2	6	211126	211131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636643
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4332	NC_022443	A	6	6	213205	213210	100 %	0 %	0 %	0 %	545636645
4333	NC_022443	TA	3	6	213257	213262	50 %	50 %	0 %	0 %	545636645
4334	NC_022443	ATTT	2	8	213292	213299	25 %	75 %	0 %	0 %	545636645
4335	NC_022443	TCG	3	9	213318	213326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636645
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4353	NC_022443	GAC	2	6	214251	214256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636646
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4358	NC_022443	A	6	6	214354	214359	100 %	0 %	0 %	0 %	545636646
4359	NC_022443	TGGT	2	8	214376	214383	0 %	50 %	50 %	0 %	545636646
4360	NC_022443	TAG	2	6	214391	214396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636646
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4362	NC_022443	CTA	2	6	214519	214524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636646
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4490	NC_022443	TGA	2	6	221006	221011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636651
4491	NC_022443	AAT	3	9	221062	221070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636651
4492	NC_022443	TAG	2	6	221091	221096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636651
4493	NC_022443	ATC	2	6	221152	221157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636652
4494	NC_022443	ATG	2	6	221169	221174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636652
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4498	NC_022443	GTT	2	6	221617	221622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636652
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4500	NC_022443	ACT	2	6	221719	221724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636652

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