MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022443	CAA	2	6	172843	172848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636614
3502	NC_022443	ATC	2	6	172880	172885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636614
3503	NC_022443	TAC	2	6	172959	172964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636614
3504	NC_022443	ACA	2	6	172989	172994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636614
3505	NC_022443	TAA	2	6	172998	173003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636614
3506	NC_022443	TTG	2	6	173042	173047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636614
3507	NC_022443	ATG	2	6	173075	173080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636614
3508	NC_022443	GAT	2	6	173092	173097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636614
3509	NC_022443	TGG	2	6	173109	173114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636614
3510	NC_022443	CAT	2	6	173164	173169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636614
3511	NC_022443	CAA	2	6	173236	173241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636614
3512	NC_022443	TGA	2	6	173471	173476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636614
3513	NC_022443	ATT	2	6	173489	173494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636614
3514	NC_022443	AGA	2	6	173499	173504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636614
3515	NC_022443	ATG	2	6	173515	173520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636614
3516	NC_022443	TTG	2	6	173540	173545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636614
3517	NC_022443	GAT	2	6	173563	173568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636614
3518	NC_022443	GTT	2	6	173569	173574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636614
3519	NC_022443	ATT	2	6	173596	173601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636614
3520	NC_022443	TGA	4	12	173631	173642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636614
3521	NC_022443	CAA	2	6	173692	173697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636614
3522	NC_022443	CAT	2	6	173698	173703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636614
3523	NC_022443	AT	3	6	173713	173718	50 %	50 %	0 %	0 %	545636614
3524	NC_022443	AGA	2	6	173760	173765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636614
3525	NC_022443	ACT	2	6	173802	173807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636614
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3527	NC_022443	AATG	2	8	173970	173977	50 %	25 %	25 %	0 %	545636614
3528	NC_022443	AC	3	6	174083	174088	50 %	0 %	0 %	50 %	545636614
3529	NC_022443	TAA	2	6	174117	174122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636614
3530	NC_022443	TGA	2	6	174180	174185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636614
3531	NC_022443	AAC	3	9	174254	174262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636614
3532	NC_022443	GATA	2	8	174270	174277	50 %	25 %	25 %	0 %	545636614
3533	NC_022443	AAT	2	6	174294	174299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636614
3534	NC_022443	TAAC	2	8	174329	174336	50 %	25 %	0 %	25 %	545636614
3535	NC_022443	AT	3	6	174360	174365	50 %	50 %	0 %	0 %	545636614
3536	NC_022443	TAAG	2	8	174381	174388	50 %	25 %	25 %	0 %	545636614
3537	NC_022443	GAA	2	6	174445	174450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636615
3538	NC_022443	A	6	6	174478	174483	100 %	0 %	0 %	0 %	545636615
3539	NC_022443	TTA	2	6	174577	174582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636615
3540	NC_022443	GT	4	8	174694	174701	0 %	50 %	50 %	0 %	545636615
3541	NC_022443	AAAG	2	8	174841	174848	75 %	0 %	25 %	0 %	545636615
3542	NC_022443	ATTG	2	8	174858	174865	25 %	50 %	25 %	0 %	545636615
3543	NC_022443	TATGA	2	10	174895	174904	40 %	40 %	20 %	0 %	545636615
3544	NC_022443	ATCA	2	8	174920	174927	50 %	25 %	0 %	25 %	545636615
3545	NC_022443	GTGAA	2	10	174929	174938	40 %	20 %	40 %	0 %	545636615
3546	NC_022443	ATTT	2	8	174948	174955	25 %	75 %	0 %	0 %	545636615
3547	NC_022443	A	6	6	175009	175014	100 %	0 %	0 %	0 %	545636615
3548	NC_022443	ATT	2	6	175029	175034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636615
3549	NC_022443	AGT	2	6	175036	175041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636615
3550	NC_022443	AATT	2	8	175370	175377	50 %	50 %	0 %	0 %	545636616
3551	NC_022443	TGT	2	6	175400	175405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636616
3552	NC_022443	TCA	2	6	175422	175427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636616
3553	NC_022443	GAC	2	6	175432	175437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636616
3554	NC_022443	AAT	2	6	175445	175450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636616
3555	NC_022443	CA	3	6	175481	175486	50 %	0 %	0 %	50 %	545636616
3556	NC_022443	TAAG	2	8	175573	175580	50 %	25 %	25 %	0 %	545636616
3557	NC_022443	T	6	6	175585	175590	0 %	100 %	0 %	0 %	545636616
3558	NC_022443	AATA	2	8	175602	175609	75 %	25 %	0 %	0 %	545636616
3559	NC_022443	ACT	2	6	175702	175707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636616
3560	NC_022443	TTG	2	6	175717	175722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636616
3561	NC_022443	TTG	2	6	175743	175748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636616
3562	NC_022443	ACA	2	6	175809	175814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636616
3563	NC_022443	CCA	2	6	175817	175822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636616
3564	NC_022443	TGA	2	6	176142	176147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636617
3565	NC_022443	CAA	2	6	176165	176170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636617
3566	NC_022443	ATT	2	6	176175	176180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636617
3567	NC_022443	ATA	2	6	176194	176199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636617
3568	NC_022443	AAT	2	6	176220	176225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636617
3569	NC_022443	AAC	2	6	176346	176351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636617
3570	NC_022443	ATG	2	6	176405	176410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636617
3571	NC_022443	GT	3	6	176429	176434	0 %	50 %	50 %	0 %	545636617
3572	NC_022443	TGT	2	6	176444	176449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636617
3573	NC_022443	CAT	2	6	176459	176464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636617
3574	NC_022443	TGA	2	6	176486	176491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636617
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3576	NC_022443	TTG	2	6	176565	176570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636617
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3578	NC_022443	CTA	2	6	176651	176656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636617
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3580	NC_022443	TAA	2	6	176774	176779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636617
3581	NC_022443	TGT	2	6	176813	176818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636617
3582	NC_022443	TGT	2	6	176837	176842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636617
3583	NC_022443	TAA	2	6	176843	176848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636617
3584	NC_022443	GATG	2	8	176851	176858	25 %	25 %	50 %	0 %	545636617
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3588	NC_022443	TTG	2	6	177296	177301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636618
3589	NC_022443	CAA	2	6	177362	177367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636618
3590	NC_022443	TAA	2	6	177504	177509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636618
3591	NC_022443	TGA	2	6	177511	177516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636618
3592	NC_022443	GTT	2	6	177544	177549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636618
3593	NC_022443	AGCA	2	8	177555	177562	50 %	0 %	25 %	25 %	545636618
3594	NC_022443	CCA	2	6	177607	177612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636618
3595	NC_022443	GTT	2	6	177673	177678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636618
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3599	NC_022443	CAT	2	6	177854	177859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636618
3600	NC_022443	AAC	2	6	177903	177908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636618
3601	NC_022443	GTG	2	6	177962	177967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636618
3602	NC_022443	TA	3	6	177989	177994	50 %	50 %	0 %	0 %	545636618
3603	NC_022443	T	6	6	178041	178046	0 %	100 %	0 %	0 %	545636618
3604	NC_022443	ACC	2	6	178071	178076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636618
3605	NC_022443	TAA	2	6	178115	178120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636618
3606	NC_022443	ATATA	2	10	178223	178232	60 %	40 %	0 %	0 %	545636619
3607	NC_022443	ATCA	2	8	178277	178284	50 %	25 %	0 %	25 %	545636619
3608	NC_022443	GTT	2	6	178308	178313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636619
3609	NC_022443	AGT	2	6	178339	178344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636619
3610	NC_022443	TAC	2	6	178345	178350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636619
3611	NC_022443	CTT	2	6	178357	178362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636619
3612	NC_022443	ATA	2	6	178415	178420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636619
3613	NC_022443	GAT	2	6	178461	178466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636619
3614	NC_022443	AT	3	6	178475	178480	50 %	50 %	0 %	0 %	545636619
3615	NC_022443	GATA	2	8	178553	178560	50 %	25 %	25 %	0 %	545636619
3616	NC_022443	TCAT	2	8	178620	178627	25 %	50 %	0 %	25 %	545636619
3617	NC_022443	AAT	3	9	178691	178699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636619
3618	NC_022443	T	6	6	178717	178722	0 %	100 %	0 %	0 %	545636619
3619	NC_022443	TAA	2	6	178726	178731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636619
3620	NC_022443	TAA	2	6	178745	178750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636619
3621	NC_022443	TGC	2	6	178856	178861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636619
3622	NC_022443	AT	3	6	178886	178891	50 %	50 %	0 %	0 %	545636619
3623	NC_022443	CTA	2	6	178948	178953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636619
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3740	NC_022443	GTT	2	6	184140	184145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636623
3741	NC_022443	GTC	2	6	184205	184210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636623
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3988	NC_022443	TGA	2	6	196104	196109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636632
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3990	NC_022443	AGA	2	6	196157	196162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636632
3991	NC_022443	TA	3	6	196172	196177	50 %	50 %	0 %	0 %	545636632
3992	NC_022443	TAA	2	6	196230	196235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636632
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