MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022443	TA	3	6	123879	123884	50 %	50 %	0 %	0 %	545636575
2502	NC_022443	TA	3	6	123921	123926	50 %	50 %	0 %	0 %	545636575
2503	NC_022443	TTTA	2	8	123991	123998	25 %	75 %	0 %	0 %	545636575
2504	NC_022443	ATC	2	6	124068	124073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636575
2505	NC_022443	ACA	2	6	124085	124090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636575
2506	NC_022443	ATT	2	6	124193	124198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636575
2507	NC_022443	GCTTT	2	10	124287	124296	0 %	60 %	20 %	20 %	545636575
2508	NC_022443	TAATT	2	10	124372	124381	40 %	60 %	0 %	0 %	545636575
2509	NC_022443	TGC	2	6	124414	124419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636575
2510	NC_022443	ATG	2	6	124458	124463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636575
2511	NC_022443	TAT	2	6	124483	124488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636575
2512	NC_022443	ATT	2	6	124493	124498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636575
2513	NC_022443	AAAT	2	8	124565	124572	75 %	25 %	0 %	0 %	545636575
2514	NC_022443	AGTA	2	8	124644	124651	50 %	25 %	25 %	0 %	545636576
2515	NC_022443	AT	3	6	124665	124670	50 %	50 %	0 %	0 %	545636576
2516	NC_022443	ATC	2	6	124720	124725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636576
2517	NC_022443	TG	3	6	124759	124764	0 %	50 %	50 %	0 %	545636576
2518	NC_022443	GCA	2	6	124786	124791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636576
2519	NC_022443	AGA	2	6	124881	124886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636576
2520	NC_022443	TCA	2	6	124922	124927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636576
2521	NC_022443	TGA	2	6	124956	124961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636576
2522	NC_022443	ACA	2	6	124965	124970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636576
2523	NC_022443	CA	3	6	125005	125010	50 %	0 %	0 %	50 %	545636576
2524	NC_022443	ATT	2	6	125020	125025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636576
2525	NC_022443	TTG	2	6	125035	125040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636576
2526	NC_022443	AGA	2	6	125139	125144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636576
2527	NC_022443	CGTA	2	8	125202	125209	25 %	25 %	25 %	25 %	545636576
2528	NC_022443	AGA	2	6	125214	125219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636576
2529	NC_022443	CAGATT	2	12	125297	125308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636576
2530	NC_022443	AT	4	8	125313	125320	50 %	50 %	0 %	0 %	545636576
2531	NC_022443	AGT	2	6	125523	125528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636577
2532	NC_022443	AAC	2	6	125540	125545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636577
2533	NC_022443	ATACT	2	10	125553	125562	40 %	40 %	0 %	20 %	545636577
2534	NC_022443	CAA	2	6	125680	125685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636577
2535	NC_022443	GAA	2	6	125689	125694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636577
2536	NC_022443	GTT	2	6	125710	125715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636577
2537	NC_022443	TGC	2	6	125823	125828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636577
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2539	NC_022443	TAT	2	6	125919	125924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636577
2540	NC_022443	GGT	2	6	126031	126036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636577
2541	NC_022443	ATG	2	6	126038	126043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636577
2542	NC_022443	ATG	2	6	126074	126079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636577
2543	NC_022443	TGA	2	6	126137	126142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636577
2544	NC_022443	AAGA	2	8	126151	126158	75 %	0 %	25 %	0 %	545636577
2545	NC_022443	CTT	2	6	126174	126179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636577
2546	NC_022443	TAG	2	6	126185	126190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636577
2547	NC_022443	TCG	2	6	126213	126218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636577
2548	NC_022443	GAT	2	6	126256	126261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636577
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2551	NC_022443	CAG	2	6	126314	126319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636577
2552	NC_022443	GA	3	6	126360	126365	50 %	0 %	50 %	0 %	545636577
2553	NC_022443	AT	3	6	126366	126371	50 %	50 %	0 %	0 %	545636577
2554	NC_022443	GGT	2	6	126403	126408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636577
2555	NC_022443	TAC	2	6	126426	126431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636577
2556	NC_022443	TAATA	2	10	126719	126728	60 %	40 %	0 %	0 %	545636578
2557	NC_022443	GTG	2	6	126769	126774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636578
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2559	NC_022443	AGGC	2	8	126859	126866	25 %	0 %	50 %	25 %	545636578
2560	NC_022443	CAC	2	6	126913	126918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636578
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2562	NC_022443	GCG	2	6	127182	127187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545636578
2563	NC_022443	TAA	2	6	127235	127240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636578
2564	NC_022443	TA	3	6	127256	127261	50 %	50 %	0 %	0 %	545636578
2565	NC_022443	AAT	2	6	127284	127289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636578
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2569	NC_022443	TG	3	6	127430	127435	0 %	50 %	50 %	0 %	545636578
2570	NC_022443	GAC	3	9	127504	127512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636579
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2573	NC_022443	ACA	2	6	127691	127696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636579
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2587	NC_022443	ATTA	2	8	128426	128433	50 %	50 %	0 %	0 %	545636580
2588	NC_022443	ATC	2	6	128471	128476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636580
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2593	NC_022443	TCT	2	6	128667	128672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636580
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2595	NC_022443	TGAT	2	8	128833	128840	25 %	50 %	25 %	0 %	545636580
2596	NC_022443	TGAA	2	8	128847	128854	50 %	25 %	25 %	0 %	545636580
2597	NC_022443	TAA	2	6	128897	128902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636580
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2599	NC_022443	CT	3	6	129281	129286	0 %	50 %	0 %	50 %	545636581
2600	NC_022443	TAA	2	6	129346	129351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636581
2601	NC_022443	CTT	2	6	129361	129366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636581
2602	NC_022443	T	6	6	129392	129397	0 %	100 %	0 %	0 %	545636581
2603	NC_022443	GT	3	6	129481	129486	0 %	50 %	50 %	0 %	545636581
2604	NC_022443	TGGT	2	8	129500	129507	0 %	50 %	50 %	0 %	545636581
2605	NC_022443	T	6	6	129509	129514	0 %	100 %	0 %	0 %	545636581
2606	NC_022443	GCA	2	6	129546	129551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636581
2607	NC_022443	TAA	2	6	129566	129571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636581
2608	NC_022443	T	6	6	129645	129650	0 %	100 %	0 %	0 %	545636581
2609	NC_022443	CAG	2	6	129676	129681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636581
2610	NC_022443	T	6	6	129749	129754	0 %	100 %	0 %	0 %	545636581
2611	NC_022443	TCT	2	6	129807	129812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636581
2612	NC_022443	TAA	3	9	129836	129844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636581
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2615	NC_022443	CAA	2	6	129928	129933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636581
2616	NC_022443	TTGTA	2	10	129934	129943	20 %	60 %	20 %	0 %	545636581
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2618	NC_022443	TGC	3	9	130148	130156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636581
2619	NC_022443	T	6	6	130199	130204	0 %	100 %	0 %	0 %	545636581
2620	NC_022443	A	7	7	130439	130445	100 %	0 %	0 %	0 %	545636582
2621	NC_022443	TA	3	6	130446	130451	50 %	50 %	0 %	0 %	545636582
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2623	NC_022443	TAT	2	6	130557	130562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636582
2624	NC_022443	TGC	2	6	130591	130596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636582
2625	NC_022443	GCA	2	6	130766	130771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636582
2626	NC_022443	TGT	2	6	130801	130806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636582
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2630	NC_022443	TGCAA	2	10	130939	130948	40 %	20 %	20 %	20 %	545636582
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2724	NC_022443	A	6	6	135432	135437	100 %	0 %	0 %	0 %	545636585
2725	NC_022443	GAC	2	6	135462	135467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636585
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2732	NC_022443	TA	3	6	135661	135666	50 %	50 %	0 %	0 %	545636585
2733	NC_022443	AAG	2	6	136101	136106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636586
2734	NC_022443	TGAT	2	8	136116	136123	25 %	50 %	25 %	0 %	545636586
2735	NC_022443	A	6	6	136142	136147	100 %	0 %	0 %	0 %	545636586
2736	NC_022443	AAG	2	6	136176	136181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636586
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2740	NC_022443	TA	3	6	136273	136278	50 %	50 %	0 %	0 %	545636586
2741	NC_022443	AT	4	8	136315	136322	50 %	50 %	0 %	0 %	545636586
2742	NC_022443	ATT	2	6	136355	136360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636586
2743	NC_022443	CAA	3	9	136428	136436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636586
2744	NC_022443	GAT	2	6	136465	136470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636586
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2993	NC_022443	TGT	2	6	147964	147969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636595
2994	NC_022443	GCTA	2	8	147976	147983	25 %	25 %	25 %	25 %	545636595
2995	NC_022443	TTG	2	6	148008	148013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636595
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