MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022443	AGA	2	6	24336	24341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636489
502	NC_022443	ATGTA	2	10	24387	24396	40 %	40 %	20 %	0 %	545636489
503	NC_022443	TCT	2	6	24407	24412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636489
504	NC_022443	AACA	2	8	24431	24438	75 %	0 %	0 %	25 %	545636489
505	NC_022443	GTT	2	6	25671	25676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636490
506	NC_022443	TGA	3	9	25682	25690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636490
507	NC_022443	A	7	7	25724	25730	100 %	0 %	0 %	0 %	545636490
508	NC_022443	ATG	2	6	25765	25770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636490
509	NC_022443	GAA	3	9	25788	25796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636490
510	NC_022443	TAT	2	6	25807	25812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636490
511	NC_022443	A	6	6	25866	25871	100 %	0 %	0 %	0 %	545636490
512	NC_022443	CGT	2	6	26010	26015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636490
513	NC_022443	A	6	6	26106	26111	100 %	0 %	0 %	0 %	545636490
514	NC_022443	TGAATT	2	12	26141	26152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	545636490
515	NC_022443	ATT	2	6	26158	26163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636490
516	NC_022443	TTA	2	6	26202	26207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636490
517	NC_022443	GTAC	2	8	26241	26248	25 %	25 %	25 %	25 %	545636490
518	NC_022443	TCG	2	6	26264	26269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636490
519	NC_022443	GAT	2	6	26289	26294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636490
520	NC_022443	TCC	2	6	26341	26346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545636490
521	NC_022443	AAC	2	6	26347	26352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636490
522	NC_022443	GCT	2	6	26492	26497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636491
523	NC_022443	AAG	2	6	26508	26513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636491
524	NC_022443	TTA	2	6	26607	26612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636491
525	NC_022443	ATT	3	9	26670	26678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636491
526	NC_022443	CGA	3	9	26680	26688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636491
527	NC_022443	AATC	2	8	26708	26715	50 %	25 %	0 %	25 %	545636491
528	NC_022443	GGT	2	6	26796	26801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636491
529	NC_022443	TA	3	6	26818	26823	50 %	50 %	0 %	0 %	545636491
530	NC_022443	ATA	2	6	26905	26910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636491
531	NC_022443	TTG	2	6	26926	26931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636491
532	NC_022443	ATT	2	6	26945	26950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636491
533	NC_022443	ACCAA	2	10	26991	27000	60 %	0 %	0 %	40 %	545636491
534	NC_022443	ATG	2	6	27073	27078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636491
535	NC_022443	TAA	2	6	27104	27109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636491
536	NC_022443	AAG	2	6	27127	27132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636491
537	NC_022443	TAT	2	6	27197	27202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636491
538	NC_022443	CCG	2	6	27212	27217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545636491
539	NC_022443	AGA	2	6	27272	27277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636491
540	NC_022443	CAT	2	6	27278	27283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636491
541	NC_022443	GAA	2	6	27333	27338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636491
542	NC_022443	AAT	2	6	27348	27353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636491
543	NC_022443	TTA	2	6	27363	27368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636491
544	NC_022443	GAA	3	9	27378	27386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636491
545	NC_022443	AAC	3	9	27475	27483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636491
546	NC_022443	CGT	2	6	27498	27503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636491
547	NC_022443	TTG	2	6	27508	27513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636491
548	NC_022443	GAA	2	6	27576	27581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636491
549	NC_022443	GAA	2	6	27633	27638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636491
550	NC_022443	ATCAA	2	10	27703	27712	60 %	20 %	0 %	20 %	545636491
551	NC_022443	TAA	2	6	27743	27748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636491
552	NC_022443	ATT	2	6	27750	27755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636491
553	NC_022443	ACA	2	6	27783	27788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636491
554	NC_022443	GGT	2	6	28050	28055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636491
555	NC_022443	ATCT	2	8	28142	28149	25 %	50 %	0 %	25 %	545636491
556	NC_022443	AAT	2	6	28195	28200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636491
557	NC_022443	ACT	2	6	28230	28235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636492
558	NC_022443	TGA	2	6	28241	28246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636492
559	NC_022443	AT	3	6	28260	28265	50 %	50 %	0 %	0 %	545636492
560	NC_022443	AAG	2	6	28315	28320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636492
561	NC_022443	GAAAC	2	10	28324	28333	60 %	0 %	20 %	20 %	545636492
562	NC_022443	ATT	2	6	28387	28392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636492
563	NC_022443	ATC	2	6	28406	28411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636492
564	NC_022443	GAAGT	2	10	28474	28483	40 %	20 %	40 %	0 %	545636492
565	NC_022443	TCG	2	6	28497	28502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636492
566	NC_022443	TGA	2	6	28514	28519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636492
567	NC_022443	ATT	2	6	28545	28550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636492
568	NC_022443	ATTTCA	2	12	28625	28636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545636492
569	NC_022443	ATG	2	6	28655	28660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636492
570	NC_022443	TGA	2	6	28662	28667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636492
571	NC_022443	AAC	2	6	28719	28724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636492
572	NC_022443	AGC	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636492
573	NC_022443	A	6	6	28768	28773	100 %	0 %	0 %	0 %	545636492
574	NC_022443	ATC	2	6	28795	28800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636492
575	NC_022443	ACAA	2	8	28801	28808	75 %	0 %	0 %	25 %	545636492
576	NC_022443	ACG	2	6	28825	28830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636492
577	NC_022443	AATG	2	8	28905	28912	50 %	25 %	25 %	0 %	545636492
578	NC_022443	TCGT	2	8	28937	28944	0 %	50 %	25 %	25 %	545636492
579	NC_022443	GTG	2	6	28955	28960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636492
580	NC_022443	ACA	2	6	28970	28975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636492
581	NC_022443	ATA	2	6	28976	28981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636492
582	NC_022443	GAA	2	6	29065	29070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636492
583	NC_022443	TTA	2	6	29093	29098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636492
584	NC_022443	TGG	2	6	29106	29111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636492
585	NC_022443	ATT	2	6	29133	29138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636492
586	NC_022443	AAT	2	6	29146	29151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636492
587	NC_022443	TAA	2	6	29202	29207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636492
588	NC_022443	TCG	2	6	29262	29267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636492
589	NC_022443	GTT	2	6	29287	29292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636492
590	NC_022443	ATA	2	6	29306	29311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636492
591	NC_022443	AACA	2	8	29382	29389	75 %	0 %	0 %	25 %	545636492
592	NC_022443	ATG	2	6	29483	29488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636492
593	NC_022443	TAA	2	6	29604	29609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636493
594	NC_022443	CA	3	6	29621	29626	50 %	0 %	0 %	50 %	545636493
595	NC_022443	AAG	2	6	29666	29671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636493
596	NC_022443	GCA	2	6	29788	29793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636493
597	NC_022443	ATT	2	6	29805	29810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636493
598	NC_022443	GT	3	6	29885	29890	0 %	50 %	50 %	0 %	545636493
599	NC_022443	GTTCTG	2	12	29924	29935	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	545636493
600	NC_022443	AGA	2	6	30006	30011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636493
601	NC_022443	CAAT	2	8	30034	30041	50 %	25 %	0 %	25 %	545636493
602	NC_022443	GATG	2	8	30042	30049	25 %	25 %	50 %	0 %	545636493
603	NC_022443	ATTAT	2	10	30117	30126	40 %	60 %	0 %	0 %	545636493
604	NC_022443	A	6	6	30139	30144	100 %	0 %	0 %	0 %	545636493
605	NC_022443	TGA	2	6	30147	30152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636493
606	NC_022443	TAC	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636493
607	NC_022443	AACGA	2	10	30190	30199	60 %	0 %	20 %	20 %	545636493
608	NC_022443	TACT	2	8	30264	30271	25 %	50 %	0 %	25 %	545636493
609	NC_022443	ATA	2	6	30287	30292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636493
610	NC_022443	ATT	2	6	30301	30306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636493
611	NC_022443	GTA	2	6	30740	30745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636494
612	NC_022443	GAA	2	6	30820	30825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636494
613	NC_022443	GGCA	2	8	30962	30969	25 %	0 %	50 %	25 %	545636494
614	NC_022443	AAAG	2	8	30975	30982	75 %	0 %	25 %	0 %	545636494
615	NC_022443	ATG	2	6	31076	31081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636494
616	NC_022443	ATA	2	6	31109	31114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636494
617	NC_022443	AAG	2	6	31120	31125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636494
618	NC_022443	AAC	2	6	31259	31264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636494
619	NC_022443	ATA	2	6	31373	31378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636494
620	NC_022443	GAAC	2	8	31419	31426	50 %	0 %	25 %	25 %	545636494
621	NC_022443	AAG	2	6	31445	31450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636494
622	NC_022443	AT	3	6	31489	31494	50 %	50 %	0 %	0 %	545636494
623	NC_022443	TAC	2	6	31740	31745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636495
624	NC_022443	AGC	2	6	31815	31820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636495
625	NC_022443	AAC	2	6	31846	31851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636495
626	NC_022443	CAA	2	6	31877	31882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636495
627	NC_022443	CAA	2	6	31890	31895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636495
628	NC_022443	TCA	2	6	31906	31911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636495
629	NC_022443	GAA	2	6	31919	31924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636495
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752	NC_022443	AATAT	2	10	39387	39396	60 %	40 %	0 %	0 %	545636502
753	NC_022443	GAA	2	6	39473	39478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636502
754	NC_022443	AAG	2	6	39504	39509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636502
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