MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022443	TGT	2	6	250851	250856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636673
5002	NC_022443	TAT	2	6	250909	250914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636673
5003	NC_022443	GT	3	6	250916	250921	0 %	50 %	50 %	0 %	545636673
5004	NC_022443	ATG	2	6	250946	250951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636673
5005	NC_022443	ATT	2	6	250982	250987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636673
5006	NC_022443	A	6	6	251075	251080	100 %	0 %	0 %	0 %	545636673
5007	NC_022443	TTAT	2	8	251081	251088	25 %	75 %	0 %	0 %	545636673
5008	NC_022443	TGA	2	6	251139	251144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636673
5009	NC_022443	TAA	2	6	251152	251157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636673
5010	NC_022443	AGA	2	6	251254	251259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636673
5011	NC_022443	CA	3	6	251308	251313	50 %	0 %	0 %	50 %	545636673
5012	NC_022443	CAT	2	6	251369	251374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636673
5013	NC_022443	TGA	2	6	251386	251391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636673
5014	NC_022443	AT	3	6	251446	251451	50 %	50 %	0 %	0 %	545636673
5015	NC_022443	TGA	2	6	251473	251478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636673
5016	NC_022443	ATT	2	6	251609	251614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636673
5017	NC_022443	TGC	2	6	251623	251628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636673
5018	NC_022443	AC	3	6	251642	251647	50 %	0 %	0 %	50 %	545636673
5019	NC_022443	TAC	2	6	251658	251663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636673
5020	NC_022443	GA	3	6	251668	251673	50 %	0 %	50 %	0 %	545636673
5021	NC_022443	CAT	2	6	251704	251709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636673
5022	NC_022443	A	6	6	251746	251751	100 %	0 %	0 %	0 %	545636673
5023	NC_022443	AAG	2	6	251763	251768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636673
5024	NC_022443	ATGG	2	8	251778	251785	25 %	25 %	50 %	0 %	545636673
5025	NC_022443	AAG	2	6	252035	252040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636674
5026	NC_022443	ACAG	2	8	252072	252079	50 %	0 %	25 %	25 %	545636674
5027	NC_022443	GAT	2	6	252118	252123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636674
5028	NC_022443	ACA	2	6	252138	252143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636674
5029	NC_022443	GAA	2	6	252166	252171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636674
5030	NC_022443	ACGA	2	8	252189	252196	50 %	0 %	25 %	25 %	545636674
5031	NC_022443	ATT	2	6	252230	252235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636674
5032	NC_022443	TAG	2	6	252285	252290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636675
5033	NC_022443	GTG	2	6	252294	252299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636675
5034	NC_022443	AGT	2	6	252319	252324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636675
5035	NC_022443	AAT	2	6	252326	252331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636675
5036	NC_022443	TTA	2	6	252425	252430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636675
5037	NC_022443	AAAG	2	8	252448	252455	75 %	0 %	25 %	0 %	545636675
5038	NC_022443	TGGTAT	2	12	252496	252507	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545636675
5039	NC_022443	GAA	2	6	252509	252514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636675
5040	NC_022443	ACA	2	6	252520	252525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636675
5041	NC_022443	CTTG	2	8	252851	252858	0 %	50 %	25 %	25 %	545636676
5042	NC_022443	TTA	2	6	252948	252953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636676
5043	NC_022443	CAG	2	6	252970	252975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636676
5044	NC_022443	TGAT	2	8	253015	253022	25 %	50 %	25 %	0 %	545636676
5045	NC_022443	CAT	2	6	253039	253044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636676
5046	NC_022443	CAT	2	6	253057	253062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636676
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5048	NC_022443	CAG	2	6	253177	253182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636676
5049	NC_022443	TTA	2	6	253221	253226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636676
5050	NC_022443	GCA	2	6	253227	253232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636676
5051	NC_022443	GAT	2	6	253280	253285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636676
5052	NC_022443	GAGT	2	8	253286	253293	25 %	25 %	50 %	0 %	545636676
5053	NC_022443	GT	3	6	253486	253491	0 %	50 %	50 %	0 %	545636676
5054	NC_022443	CAT	2	6	253514	253519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636676
5055	NC_022443	TAAA	2	8	253624	253631	75 %	25 %	0 %	0 %	545636676
5056	NC_022443	ATTGG	2	10	253656	253665	20 %	40 %	40 %	0 %	545636676
5057	NC_022443	TTA	2	6	253734	253739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636676
5058	NC_022443	TAC	2	6	253765	253770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636676
5059	NC_022443	TGT	2	6	253799	253804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636676
5060	NC_022443	TTG	2	6	253813	253818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636676
5061	NC_022443	GCA	2	6	253821	253826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636676
5062	NC_022443	ATT	2	6	253836	253841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636676
5063	NC_022443	TA	3	6	253882	253887	50 %	50 %	0 %	0 %	545636676
5064	NC_022443	GGT	2	6	253983	253988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636676
5065	NC_022443	TATCT	2	10	254001	254010	20 %	60 %	0 %	20 %	545636676
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5070	NC_022443	CAT	2	6	254444	254449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636677
5071	NC_022443	CAT	2	6	254507	254512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636677
5072	NC_022443	TTG	2	6	254616	254621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636677
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5081	NC_022443	GA	3	6	255099	255104	50 %	0 %	50 %	0 %	545636677
5082	NC_022443	GTAA	2	8	255186	255193	50 %	25 %	25 %	0 %	545636678
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5093	NC_022443	AGA	2	6	255919	255924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636679
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5099	NC_022443	TAT	2	6	256222	256227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636679
5100	NC_022443	T	6	6	256234	256239	0 %	100 %	0 %	0 %	545636679
5101	NC_022443	AAGA	2	8	256283	256290	75 %	0 %	25 %	0 %	545636679
5102	NC_022443	TTA	2	6	256318	256323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636679
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5105	NC_022443	AGTG	2	8	256976	256983	25 %	25 %	50 %	0 %	545636680
5106	NC_022443	ATT	2	6	256995	257000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636680
5107	NC_022443	A	7	7	257045	257051	100 %	0 %	0 %	0 %	545636680
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5109	NC_022443	GGT	2	6	257088	257093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636680
5110	NC_022443	CGAAA	2	10	257100	257109	60 %	0 %	20 %	20 %	545636680
5111	NC_022443	TAA	2	6	257153	257158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636680
5112	NC_022443	TGA	2	6	257159	257164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636680
5113	NC_022443	ATG	2	6	257179	257184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636680
5114	NC_022443	TAT	2	6	257210	257215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636680
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5117	NC_022443	AGT	2	6	257403	257408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636680
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5122	NC_022443	A	6	6	257725	257730	100 %	0 %	0 %	0 %	545636681
5123	NC_022443	AGT	2	6	257808	257813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636681
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5139	NC_022443	AAATG	2	10	258753	258762	60 %	20 %	20 %	0 %	545636682
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5179	NC_022443	A	6	6	261365	261370	100 %	0 %	0 %	0 %	545636683
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5240	NC_022443	ATG	2	6	264072	264077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636686
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5242	NC_022443	TTA	2	6	264161	264166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636686
5243	NC_022443	ATG	2	6	264219	264224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636686
5244	NC_022443	AAG	3	9	264249	264257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636686
5245	NC_022443	GGC	2	6	264332	264337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545636686
5246	NC_022443	TGT	3	9	264406	264414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636686
5247	NC_022443	TCGT	2	8	264444	264451	0 %	50 %	25 %	25 %	545636686
5248	NC_022443	ATTT	2	8	264505	264512	25 %	75 %	0 %	0 %	545636686
5249	NC_022443	ACG	2	6	264530	264535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636686
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5251	NC_022443	GTT	2	6	264568	264573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636686
5252	NC_022443	CAT	2	6	264703	264708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636686
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5255	NC_022443	ATC	2	6	264903	264908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636686
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5263	NC_022443	AT	3	6	265358	265363	50 %	50 %	0 %	0 %	545636686
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5268	NC_022443	ATG	2	6	265651	265656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636687
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5270	NC_022443	TGA	2	6	265767	265772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636687
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5273	NC_022443	TGG	2	6	265857	265862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636687
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5276	NC_022443	GCA	3	9	265963	265971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636687
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5341	NC_022443	TATCT	2	10	268805	268814	20 %	60 %	0 %	20 %	545636689
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5357	NC_022443	T	6	6	269605	269610	0 %	100 %	0 %	0 %	545636689
5358	NC_022443	TTCAA	2	10	269612	269621	40 %	40 %	0 %	20 %	545636689
5359	NC_022443	AATA	2	8	269647	269654	75 %	25 %	0 %	0 %	545636689
5360	NC_022443	T	6	6	269692	269697	0 %	100 %	0 %	0 %	545636689
5361	NC_022443	GTGC	2	8	269759	269766	0 %	25 %	50 %	25 %	545636689
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5366	NC_022443	ATT	2	6	270094	270099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636689
5367	NC_022443	GCA	2	6	270110	270115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636689
5368	NC_022443	GT	3	6	270154	270159	0 %	50 %	50 %	0 %	545636689
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5380	NC_022443	CATA	2	8	270696	270703	50 %	25 %	0 %	25 %	545636690
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5399	NC_022443	TCT	2	6	271582	271587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636692
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5484	NC_022443	TGC	2	6	276117	276122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636696
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5487	NC_022443	ATTG	2	8	276290	276297	25 %	50 %	25 %	0 %	545636696
5488	NC_022443	TCA	2	6	276298	276303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636696
5489	NC_022443	AGC	2	6	276315	276320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636696
5490	NC_022443	TTG	2	6	276327	276332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636696
5491	NC_022443	AT	3	6	276340	276345	50 %	50 %	0 %	0 %	545636696
5492	NC_022443	CTG	3	9	276356	276364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636696
5493	NC_022443	TTAT	2	8	276397	276404	25 %	75 %	0 %	0 %	545636696
5494	NC_022443	GTAT	2	8	276429	276436	25 %	50 %	25 %	0 %	545636696
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5496	NC_022443	TTG	2	6	276510	276515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636696
5497	NC_022443	CTT	2	6	276533	276538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636696
5498	NC_022443	ACC	2	6	276540	276545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636696
5499	NC_022443	CTT	2	6	276593	276598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636696
5500	NC_022443	CTT	2	6	276870	276875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636697

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