MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022443	TCT	2	6	221824	221829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636652
4502	NC_022443	GAT	2	6	221831	221836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636652
4503	NC_022443	AC	3	6	221852	221857	50 %	0 %	0 %	50 %	545636652
4504	NC_022443	CAC	2	6	221873	221878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636652
4505	NC_022443	AGT	2	6	221911	221916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636652
4506	NC_022443	TGAT	2	8	221997	222004	25 %	50 %	25 %	0 %	545636652
4507	NC_022443	A	7	7	222070	222076	100 %	0 %	0 %	0 %	545636652
4508	NC_022443	ATA	2	6	222083	222088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636652
4509	NC_022443	AG	3	6	222779	222784	50 %	0 %	50 %	0 %	545636653
4510	NC_022443	AGA	2	6	222889	222894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4511	NC_022443	GGC	2	6	222905	222910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545636653
4512	NC_022443	CAA	2	6	222939	222944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636653
4513	NC_022443	ATG	2	6	222954	222959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636653
4514	NC_022443	GGT	2	6	223040	223045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636653
4515	NC_022443	AGC	2	6	223060	223065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636653
4516	NC_022443	GAA	2	6	223094	223099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4517	NC_022443	A	6	6	223104	223109	100 %	0 %	0 %	0 %	545636653
4518	NC_022443	GGACGT	2	12	223220	223231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545636653
4519	NC_022443	TCG	2	6	223246	223251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636653
4520	NC_022443	GAA	2	6	223283	223288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4521	NC_022443	A	6	6	223287	223292	100 %	0 %	0 %	0 %	545636653
4522	NC_022443	AGA	2	6	223327	223332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4523	NC_022443	GAA	2	6	223349	223354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4524	NC_022443	CAG	2	6	223428	223433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636653
4525	NC_022443	AAG	2	6	223443	223448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4526	NC_022443	TGC	2	6	223477	223482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636653
4527	NC_022443	GCA	2	6	223502	223507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636653
4528	NC_022443	TTA	2	6	223572	223577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636653
4529	NC_022443	ATT	2	6	223598	223603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636653
4530	NC_022443	TCA	2	6	223611	223616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636653
4531	NC_022443	ATT	2	6	223663	223668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636653
4532	NC_022443	GGT	2	6	223703	223708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636653
4533	NC_022443	GACG	2	8	223718	223725	25 %	0 %	50 %	25 %	545636653
4534	NC_022443	TAT	2	6	223806	223811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636653
4535	NC_022443	ATG	2	6	223890	223895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636653
4536	NC_022443	TGT	2	6	223937	223942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636653
4537	NC_022443	TTC	2	6	223976	223981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636653
4538	NC_022443	TGG	2	6	224026	224031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636653
4539	NC_022443	ATG	2	6	224129	224134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636653
4540	NC_022443	GTAC	2	8	224240	224247	25 %	25 %	25 %	25 %	545636653
4541	NC_022443	AGC	2	6	224278	224283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636653
4542	NC_022443	GAA	2	6	224333	224338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4543	NC_022443	GTA	2	6	224345	224350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636653
4544	NC_022443	GAC	2	6	224393	224398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636653
4545	NC_022443	GAT	2	6	224405	224410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636653
4546	NC_022443	TAG	2	6	224424	224429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636653
4547	NC_022443	AC	3	6	224538	224543	50 %	0 %	0 %	50 %	545636653
4548	NC_022443	GACG	2	8	224546	224553	25 %	0 %	50 %	25 %	545636653
4549	NC_022443	AGA	2	6	224719	224724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4550	NC_022443	TAACT	2	10	224734	224743	40 %	40 %	0 %	20 %	545636653
4551	NC_022443	GCAAT	2	10	224762	224771	40 %	20 %	20 %	20 %	545636653
4552	NC_022443	CAC	2	6	224777	224782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636653
4553	NC_022443	AGA	2	6	224836	224841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
4554	NC_022443	ATTAA	2	10	224888	224897	60 %	40 %	0 %	0 %	545636653
4555	NC_022443	AAC	2	6	224904	224909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636653
4556	NC_022443	AT	4	8	225035	225042	50 %	50 %	0 %	0 %	545636654
4557	NC_022443	CTTA	2	8	225059	225066	25 %	50 %	0 %	25 %	545636654
4558	NC_022443	TGA	2	6	225131	225136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636654
4559	NC_022443	TGAA	2	8	225142	225149	50 %	25 %	25 %	0 %	545636654
4560	NC_022443	CAGT	2	8	225196	225203	25 %	25 %	25 %	25 %	545636654
4561	NC_022443	ATT	2	6	225242	225247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636654
4562	NC_022443	GAA	2	6	225336	225341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636654
4563	NC_022443	ATT	2	6	225365	225370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636654
4564	NC_022443	AC	3	6	225426	225431	50 %	0 %	0 %	50 %	545636654
4565	NC_022443	CG	3	6	225443	225448	0 %	0 %	50 %	50 %	545636654
4566	NC_022443	AAC	2	6	225466	225471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636654
4567	NC_022443	TGA	2	6	225509	225514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636654
4568	NC_022443	TTAA	2	8	225525	225532	50 %	50 %	0 %	0 %	545636654
4569	NC_022443	TTA	2	6	225544	225549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636654
4570	NC_022443	ATC	2	6	225589	225594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636654
4571	NC_022443	AGA	2	6	225641	225646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636654
4572	NC_022443	GAT	2	6	225660	225665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636654
4573	NC_022443	AGC	2	6	225677	225682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636654
4574	NC_022443	AT	3	6	226083	226088	50 %	50 %	0 %	0 %	545636655
4575	NC_022443	TAG	2	6	226171	226176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636655
4576	NC_022443	ATG	2	6	226202	226207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636655
4577	NC_022443	CTT	2	6	226283	226288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636655
4578	NC_022443	ATT	2	6	226376	226381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636655
4579	NC_022443	ATTT	2	8	226457	226464	25 %	75 %	0 %	0 %	545636655
4580	NC_022443	A	6	6	226513	226518	100 %	0 %	0 %	0 %	545636655
4581	NC_022443	GAA	2	6	226544	226549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636655
4582	NC_022443	ACG	2	6	226559	226564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636655
4583	NC_022443	TTTAC	2	10	226628	226637	20 %	60 %	0 %	20 %	545636655
4584	NC_022443	TCA	2	6	226746	226751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636655
4585	NC_022443	ATTA	2	8	226768	226775	50 %	50 %	0 %	0 %	545636655
4586	NC_022443	GAA	2	6	226811	226816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636655
4587	NC_022443	TCA	2	6	226835	226840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636655
4588	NC_022443	TGT	2	6	226849	226854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636655
4589	NC_022443	TTC	2	6	226871	226876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636655
4590	NC_022443	TAT	2	6	226877	226882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636655
4591	NC_022443	GT	3	6	226908	226913	0 %	50 %	50 %	0 %	545636655
4592	NC_022443	TACT	2	8	227051	227058	25 %	50 %	0 %	25 %	545636655
4593	NC_022443	AAT	2	6	227063	227068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636655
4594	NC_022443	ATT	2	6	227090	227095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636655
4595	NC_022443	GCT	2	6	227150	227155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636655
4596	NC_022443	TGT	2	6	227215	227220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636655
4597	NC_022443	TAA	2	6	227257	227262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636655
4598	NC_022443	GTC	2	6	227291	227296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636655
4599	NC_022443	CTA	2	6	227384	227389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636655
4600	NC_022443	CAG	2	6	227418	227423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636655
4601	NC_022443	ATG	2	6	227499	227504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636655
4602	NC_022443	TGA	2	6	227505	227510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636655
4603	NC_022443	A	7	7	227518	227524	100 %	0 %	0 %	0 %	545636655
4604	NC_022443	AAG	2	6	227661	227666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636655
4605	NC_022443	GAA	2	6	227690	227695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636655
4606	NC_022443	TAT	2	6	227731	227736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636655
4607	NC_022443	AGA	2	6	227770	227775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636655
4608	NC_022443	AAAG	2	8	227776	227783	75 %	0 %	25 %	0 %	545636655
4609	NC_022443	ATT	2	6	227815	227820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636655
4610	NC_022443	AAT	2	6	227823	227828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636655
4611	NC_022443	ATT	2	6	227987	227992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636656
4612	NC_022443	ATTT	2	8	228161	228168	25 %	75 %	0 %	0 %	545636656
4613	NC_022443	TGCT	2	8	228248	228255	0 %	50 %	25 %	25 %	545636656
4614	NC_022443	TGT	2	6	228327	228332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636656
4615	NC_022443	AAT	2	6	228536	228541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636657
4616	NC_022443	ATT	2	6	228679	228684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636657
4617	NC_022443	AAT	2	6	228689	228694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636657
4618	NC_022443	AGAA	2	8	228824	228831	75 %	0 %	25 %	0 %	545636657
4619	NC_022443	A	7	7	228830	228836	100 %	0 %	0 %	0 %	545636657
4620	NC_022443	TA	3	6	228862	228867	50 %	50 %	0 %	0 %	545636657
4621	NC_022443	A	6	6	228867	228872	100 %	0 %	0 %	0 %	545636657
4622	NC_022443	A	6	6	228876	228881	100 %	0 %	0 %	0 %	545636657
4623	NC_022443	GAA	2	6	228948	228953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636657
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4743	NC_022443	TAATT	2	10	235838	235847	40 %	60 %	0 %	0 %	545636660
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4745	NC_022443	TTG	2	6	235942	235947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636660
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4784	NC_022443	AAT	2	6	237767	237772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636662
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4858	NC_022443	GAC	2	6	241606	241611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636664
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4860	NC_022443	TTTG	2	8	241696	241703	0 %	75 %	25 %	0 %	545636664
4861	NC_022443	AT	3	6	241722	241727	50 %	50 %	0 %	0 %	545636664
4862	NC_022443	ATGAT	2	10	241806	241815	40 %	40 %	20 %	0 %	545636664
4863	NC_022443	T	7	7	241843	241849	0 %	100 %	0 %	0 %	545636664
4864	NC_022443	AAG	2	6	241873	241878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636664
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4867	NC_022443	TTA	2	6	241957	241962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636664
4868	NC_022443	ATT	2	6	241997	242002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636664
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4989	NC_022443	TTG	2	6	250155	250160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636673
4990	NC_022443	TGA	2	6	250162	250167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636673
4991	NC_022443	TTC	2	6	250184	250189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636673
4992	NC_022443	TTGA	2	8	250196	250203	25 %	50 %	25 %	0 %	545636673
4993	NC_022443	TG	3	6	250364	250369	0 %	50 %	50 %	0 %	545636673
4994	NC_022443	ATTA	2	8	250415	250422	50 %	50 %	0 %	0 %	545636673
4995	NC_022443	ACTT	2	8	250521	250528	25 %	50 %	0 %	25 %	545636673
4996	NC_022443	CAA	2	6	250530	250535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636673
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4999	NC_022443	TGA	2	6	250723	250728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636673
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