MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022358	AC	3	6	1696	1701	50 %	0 %	0 %	50 %	543966430
2	NC_022358	CG	3	6	4717	4722	0 %	0 %	50 %	50 %	543966433
3	NC_022358	TC	3	6	4875	4880	0 %	50 %	0 %	50 %	543966433
4	NC_022358	GT	4	8	5000	5007	0 %	50 %	50 %	0 %	543966433
5	NC_022358	GT	3	6	5081	5086	0 %	50 %	50 %	0 %	543966433
6	NC_022358	TC	4	8	5647	5654	0 %	50 %	0 %	50 %	543966433
7	NC_022358	TG	3	6	5918	5923	0 %	50 %	50 %	0 %	543966434
8	NC_022358	GA	4	8	6581	6588	50 %	0 %	50 %	0 %	543966434
9	NC_022358	CA	3	6	8008	8013	50 %	0 %	0 %	50 %	543966436
10	NC_022358	CA	3	6	8391	8396	50 %	0 %	0 %	50 %	543966436
11	NC_022358	CA	3	6	8735	8740	50 %	0 %	0 %	50 %	543966437
12	NC_022358	AT	3	6	9143	9148	50 %	50 %	0 %	0 %	543966437
13	NC_022358	AG	3	6	9227	9232	50 %	0 %	50 %	0 %	543966437
14	NC_022358	GC	3	6	16834	16839	0 %	0 %	50 %	50 %	543966445
15	NC_022358	GT	4	8	17244	17251	0 %	50 %	50 %	0 %	543966446
16	NC_022358	TG	3	6	18199	18204	0 %	50 %	50 %	0 %	543966447
17	NC_022358	TC	3	6	18545	18550	0 %	50 %	0 %	50 %	543966448
18	NC_022358	CG	3	6	18588	18593	0 %	0 %	50 %	50 %	543966448
19	NC_022358	CG	3	6	18973	18978	0 %	0 %	50 %	50 %	543966448
20	NC_022358	AC	3	6	20770	20775	50 %	0 %	0 %	50 %	543966449
21	NC_022358	CG	3	6	22370	22375	0 %	0 %	50 %	50 %	543966450
22	NC_022358	GC	3	6	23847	23852	0 %	0 %	50 %	50 %	543966451
23	NC_022358	GC	3	6	25778	25783	0 %	0 %	50 %	50 %	543966453
24	NC_022358	AC	4	8	25885	25892	50 %	0 %	0 %	50 %	543966454
25	NC_022358	AC	3	6	27380	27385	50 %	0 %	0 %	50 %	543966456
26	NC_022358	CG	3	6	27666	27671	0 %	0 %	50 %	50 %	543966457
27	NC_022358	GT	3	6	29178	29183	0 %	50 %	50 %	0 %	543966459
28	NC_022358	CG	3	6	31083	31088	0 %	0 %	50 %	50 %	543966461
29	NC_022358	GC	3	6	31702	31707	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
30	NC_022358	CG	3	6	32747	32752	0 %	0 %	50 %	50 %	543966463
31	NC_022358	TC	3	6	32972	32977	0 %	50 %	0 %	50 %	543966463
32	NC_022358	GC	3	6	32978	32983	0 %	0 %	50 %	50 %	543966463
33	NC_022358	GC	3	6	33459	33464	0 %	0 %	50 %	50 %	543966464
34	NC_022358	CG	3	6	34048	34053	0 %	0 %	50 %	50 %	543966465
35	NC_022358	AC	3	6	34453	34458	50 %	0 %	0 %	50 %	543966466
36	NC_022358	GC	3	6	34795	34800	0 %	0 %	50 %	50 %	543966467
37	NC_022358	GC	3	6	35127	35132	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
38	NC_022358	GC	3	6	35211	35216	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
39	NC_022358	CG	3	6	35354	35359	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
40	NC_022358	GC	3	6	35717	35722	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
41	NC_022358	GC	3	6	36092	36097	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
42	NC_022358	GC	3	6	37023	37028	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
43	NC_022358	GC	4	8	37234	37241	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
44	NC_022358	GC	3	6	37259	37264	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
45	NC_022358	GC	3	6	37373	37378	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
46	NC_022358	GC	3	6	38260	38265	0 %	0 %	50 %	50 %	543966470
47	NC_022358	CG	3	6	38437	38442	0 %	0 %	50 %	50 %	543966470
48	NC_022358	CG	3	6	38464	38469	0 %	0 %	50 %	50 %	543966470
49	NC_022358	CG	3	6	38962	38967	0 %	0 %	50 %	50 %	543966470
50	NC_022358	AC	3	6	41026	41031	50 %	0 %	0 %	50 %	543966472
51	NC_022358	CG	3	6	41286	41291	0 %	0 %	50 %	50 %	543966473
52	NC_022358	GA	3	6	42123	42128	50 %	0 %	50 %	0 %	543966474
53	NC_022358	CG	3	6	42175	42180	0 %	0 %	50 %	50 %	543966474
54	NC_022358	GC	3	6	42201	42206	0 %	0 %	50 %	50 %	543966474
55	NC_022358	GA	3	6	42468	42473	50 %	0 %	50 %	0 %	543966474
56	NC_022358	CG	3	6	42670	42675	0 %	0 %	50 %	50 %	543966474
57	NC_022358	GC	3	6	43743	43748	0 %	0 %	50 %	50 %	543966475
58	NC_022358	GC	3	6	44908	44913	0 %	0 %	50 %	50 %	543966475
59	NC_022358	CG	3	6	44993	44998	0 %	0 %	50 %	50 %	543966475
60	NC_022358	GC	3	6	45450	45455	0 %	0 %	50 %	50 %	543966475
61	NC_022358	CG	3	6	46337	46342	0 %	0 %	50 %	50 %	543966476
62	NC_022358	CG	3	6	46417	46422	0 %	0 %	50 %	50 %	543966476
63	NC_022358	GC	3	6	46501	46506	0 %	0 %	50 %	50 %	543966476
64	NC_022358	CG	3	6	46564	46569	0 %	0 %	50 %	50 %	543966476
65	NC_022358	CG	3	6	47437	47442	0 %	0 %	50 %	50 %	543966477
66	NC_022358	GC	3	6	47677	47682	0 %	0 %	50 %	50 %	543966477
67	NC_022358	GC	3	6	47818	47823	0 %	0 %	50 %	50 %	543966477
68	NC_022358	GC	3	6	48058	48063	0 %	0 %	50 %	50 %	543966477
69	NC_022358	GA	3	6	48777	48782	50 %	0 %	50 %	0 %	543966478
70	NC_022358	GC	3	6	48853	48858	0 %	0 %	50 %	50 %	543966478
71	NC_022358	GC	3	6	48975	48980	0 %	0 %	50 %	50 %	543966478
72	NC_022358	CG	3	6	49000	49005	0 %	0 %	50 %	50 %	543966478
73	NC_022358	GT	3	6	49406	49411	0 %	50 %	50 %	0 %	543966478
74	NC_022358	CG	3	6	49649	49654	0 %	0 %	50 %	50 %	543966479
75	NC_022358	GC	3	6	49908	49913	0 %	0 %	50 %	50 %	543966479
76	NC_022358	GC	3	6	49934	49939	0 %	0 %	50 %	50 %	543966479
77	NC_022358	GC	3	6	50411	50416	0 %	0 %	50 %	50 %	543966480
78	NC_022358	CG	3	6	51385	51390	0 %	0 %	50 %	50 %	543966482
79	NC_022358	GC	3	6	51726	51731	0 %	0 %	50 %	50 %	543966482
80	NC_022358	CG	3	6	51825	51830	0 %	0 %	50 %	50 %	543966482
81	NC_022358	GC	3	6	51951	51956	0 %	0 %	50 %	50 %	543966482
82	NC_022358	GC	3	6	52009	52014	0 %	0 %	50 %	50 %	543966482
83	NC_022358	GC	3	6	52186	52191	0 %	0 %	50 %	50 %	543966482
84	NC_022358	CG	3	6	52358	52363	0 %	0 %	50 %	50 %	543966482
85	NC_022358	TC	3	6	52969	52974	0 %	50 %	0 %	50 %	543966484
86	NC_022358	AT	3	6	53566	53571	50 %	50 %	0 %	0 %	543966485
87	NC_022358	AG	3	6	54074	54079	50 %	0 %	50 %	0 %	543966485
88	NC_022358	GA	3	6	54681	54686	50 %	0 %	50 %	0 %	543966486
89	NC_022358	AG	3	6	54964	54969	50 %	0 %	50 %	0 %	543966487
90	NC_022358	GC	3	6	55101	55106	0 %	0 %	50 %	50 %	543966487
91	NC_022358	GC	3	6	55309	55314	0 %	0 %	50 %	50 %	543966487
92	NC_022358	GC	3	6	55439	55444	0 %	0 %	50 %	50 %	543966487
93	NC_022358	CG	3	6	57933	57938	0 %	0 %	50 %	50 %	543966489
94	NC_022358	GC	3	6	58074	58079	0 %	0 %	50 %	50 %	543966489
95	NC_022358	GC	4	8	58139	58146	0 %	0 %	50 %	50 %	543966489
96	NC_022358	GC	3	6	58404	58409	0 %	0 %	50 %	50 %	543966489
97	NC_022358	CG	3	6	58649	58654	0 %	0 %	50 %	50 %	543966489
98	NC_022358	GC	3	6	58720	58725	0 %	0 %	50 %	50 %	543966489
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100	NC_022358	GC	4	8	59293	59300	0 %	0 %	50 %	50 %	543966490
101	NC_022358	GA	3	6	59387	59392	50 %	0 %	50 %	0 %	543966490
102	NC_022358	GC	3	6	59513	59518	0 %	0 %	50 %	50 %	543966490
103	NC_022358	GC	3	6	59572	59577	0 %	0 %	50 %	50 %	543966490
104	NC_022358	CG	3	6	59720	59725	0 %	0 %	50 %	50 %	543966490
105	NC_022358	GC	3	6	59809	59814	0 %	0 %	50 %	50 %	543966490
106	NC_022358	GC	3	6	60003	60008	0 %	0 %	50 %	50 %	543966490
107	NC_022358	CG	4	8	60376	60383	0 %	0 %	50 %	50 %	543966491
108	NC_022358	GC	5	10	60465	60474	0 %	0 %	50 %	50 %	543966491
109	NC_022358	CG	3	6	60646	60651	0 %	0 %	50 %	50 %	543966491
110	NC_022358	GC	3	6	60821	60826	0 %	0 %	50 %	50 %	543966491
111	NC_022358	CG	4	8	61057	61064	0 %	0 %	50 %	50 %	543966491
112	NC_022358	GC	3	6	61283	61288	0 %	0 %	50 %	50 %	543966491
113	NC_022358	CG	3	6	61313	61318	0 %	0 %	50 %	50 %	543966491
114	NC_022358	GC	3	6	61743	61748	0 %	0 %	50 %	50 %	543966492
115	NC_022358	GC	3	6	61862	61867	0 %	0 %	50 %	50 %	543966492
116	NC_022358	GC	4	8	62371	62378	0 %	0 %	50 %	50 %	543966493
117	NC_022358	GC	3	6	62877	62882	0 %	0 %	50 %	50 %	543966495
118	NC_022358	CG	3	6	63225	63230	0 %	0 %	50 %	50 %	543966496
119	NC_022358	GC	3	6	63231	63236	0 %	0 %	50 %	50 %	543966496
120	NC_022358	GC	3	6	63646	63651	0 %	0 %	50 %	50 %	543966497
121	NC_022358	CG	3	6	63941	63946	0 %	0 %	50 %	50 %	543966497
122	NC_022358	CG	3	6	64098	64103	0 %	0 %	50 %	50 %	543966497
123	NC_022358	AC	3	6	64434	64439	50 %	0 %	0 %	50 %	543966498
124	NC_022358	GC	3	6	65044	65049	0 %	0 %	50 %	50 %	543966499
125	NC_022358	CT	3	6	66879	66884	0 %	50 %	0 %	50 %	543966501
126	NC_022358	CG	3	6	67073	67078	0 %	0 %	50 %	50 %	543966502
127	NC_022358	AC	3	6	67337	67342	50 %	0 %	0 %	50 %	543966502
128	NC_022358	GC	3	6	67759	67764	0 %	0 %	50 %	50 %	543966503
129	NC_022358	CG	3	6	67956	67961	0 %	0 %	50 %	50 %	543966503
130	NC_022358	CG	3	6	68049	68054	0 %	0 %	50 %	50 %	543966503
131	NC_022358	GC	3	6	69160	69165	0 %	0 %	50 %	50 %	543966505
132	NC_022358	CG	3	6	69727	69732	0 %	0 %	50 %	50 %	543966505
133	NC_022358	CG	3	6	70937	70942	0 %	0 %	50 %	50 %	543966506
134	NC_022358	AC	3	6	71465	71470	50 %	0 %	0 %	50 %	543966506
135	NC_022358	CG	3	6	71535	71540	0 %	0 %	50 %	50 %	543966506
136	NC_022358	CG	3	6	73806	73811	0 %	0 %	50 %	50 %	543966508
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139	NC_022358	GC	3	6	75193	75198	0 %	0 %	50 %	50 %	543966509
140	NC_022358	CT	3	6	75632	75637	0 %	50 %	0 %	50 %	543966510
141	NC_022358	CG	3	6	77525	77530	0 %	0 %	50 %	50 %	543966511
142	NC_022358	CG	3	6	79052	79057	0 %	0 %	50 %	50 %	543966512
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.