MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	TA	3	6	5677	5682	50 %	50 %	0 %	0 %	538397729
2	NC_022248	TA	3	6	6857	6862	50 %	50 %	0 %	0 %	538397730
3	NC_022248	AG	3	6	7495	7500	50 %	0 %	50 %	0 %	538397732
4	NC_022248	AT	3	6	7638	7643	50 %	50 %	0 %	0 %	538397732
5	NC_022248	GC	3	6	11432	11437	0 %	0 %	50 %	50 %	538397735
6	NC_022248	GC	3	6	11507	11512	0 %	0 %	50 %	50 %	538397735
7	NC_022248	GC	3	6	12346	12351	0 %	0 %	50 %	50 %	538397736
8	NC_022248	CA	3	6	13615	13620	50 %	0 %	0 %	50 %	538397737
9	NC_022248	GA	3	6	15810	15815	50 %	0 %	50 %	0 %	538397740
10	NC_022248	CT	3	6	16260	16265	0 %	50 %	0 %	50 %	538397740
11	NC_022248	GC	3	6	16653	16658	0 %	0 %	50 %	50 %	538397741
12	NC_022248	CA	3	6	17787	17792	50 %	0 %	0 %	50 %	538397742
13	NC_022248	GA	3	6	18238	18243	50 %	0 %	50 %	0 %	538397742
14	NC_022248	CT	3	6	18957	18962	0 %	50 %	0 %	50 %	538397742
15	NC_022248	CT	3	6	21173	21178	0 %	50 %	0 %	50 %	538397743
16	NC_022248	CT	3	6	21751	21756	0 %	50 %	0 %	50 %	538397744
17	NC_022248	GC	3	6	22247	22252	0 %	0 %	50 %	50 %	538397745
18	NC_022248	GT	3	6	26101	26106	0 %	50 %	50 %	0 %	538397747
19	NC_022248	TA	3	6	32069	32074	50 %	50 %	0 %	0 %	538397751
20	NC_022248	GC	3	6	32288	32293	0 %	0 %	50 %	50 %	538397751
21	NC_022248	CG	3	6	33159	33164	0 %	0 %	50 %	50 %	538397752
22	NC_022248	GA	3	6	34026	34031	50 %	0 %	50 %	0 %	538397753
23	NC_022248	CG	3	6	34051	34056	0 %	0 %	50 %	50 %	538397753
24	NC_022248	AC	3	6	34764	34769	50 %	0 %	0 %	50 %	538397754
25	NC_022248	CG	3	6	40713	40718	0 %	0 %	50 %	50 %	538397758
26	NC_022248	TG	3	6	40904	40909	0 %	50 %	50 %	0 %	538397758
27	NC_022248	TC	3	6	41956	41961	0 %	50 %	0 %	50 %	538397759
28	NC_022248	CA	3	6	42105	42110	50 %	0 %	0 %	50 %	538397760
29	NC_022248	TG	3	6	44948	44953	0 %	50 %	50 %	0 %	538397760
30	NC_022248	CT	3	6	45539	45544	0 %	50 %	0 %	50 %	538397760
31	NC_022248	GC	3	6	45690	45695	0 %	0 %	50 %	50 %	538397760
32	NC_022248	CG	3	6	46720	46725	0 %	0 %	50 %	50 %	538397760
33	NC_022248	TG	3	6	47007	47012	0 %	50 %	50 %	0 %	538397760
34	NC_022248	TG	3	6	49077	49082	0 %	50 %	50 %	0 %	538397762
35	NC_022248	CG	3	6	49518	49523	0 %	0 %	50 %	50 %	538397762
36	NC_022248	CA	3	6	49895	49900	50 %	0 %	0 %	50 %	538397762
37	NC_022248	TA	3	6	50670	50675	50 %	50 %	0 %	0 %	538397763
38	NC_022248	TA	3	6	50936	50941	50 %	50 %	0 %	0 %	538397763
39	NC_022248	AT	3	6	51265	51270	50 %	50 %	0 %	0 %	538397764
40	NC_022248	CA	3	6	60788	60793	50 %	0 %	0 %	50 %	538397767
41	NC_022248	CG	3	6	63234	63239	0 %	0 %	50 %	50 %	538397768
42	NC_022248	GC	3	6	63526	63531	0 %	0 %	50 %	50 %	538397769
43	NC_022248	AC	3	6	67378	67383	50 %	0 %	0 %	50 %	538397770
44	NC_022248	AT	3	6	71365	71370	50 %	50 %	0 %	0 %	538397772
45	NC_022248	AC	3	6	73158	73163	50 %	0 %	0 %	50 %	538397775
46	NC_022248	GA	3	6	73268	73273	50 %	0 %	50 %	0 %	538397775
47	NC_022248	GA	3	6	73761	73766	50 %	0 %	50 %	0 %	538397776
48	NC_022248	TC	3	6	73942	73947	0 %	50 %	0 %	50 %	538397776
49	NC_022248	TA	4	8	74007	74014	50 %	50 %	0 %	0 %	538397776
50	NC_022248	GA	3	6	74525	74530	50 %	0 %	50 %	0 %	538397777
51	NC_022248	TG	3	6	75629	75634	0 %	50 %	50 %	0 %	538397778
52	NC_022248	GT	3	6	82426	82431	0 %	50 %	50 %	0 %	538397783
53	NC_022248	CA	3	6	82676	82681	50 %	0 %	0 %	50 %	538397783
54	NC_022248	TA	3	6	83195	83200	50 %	50 %	0 %	0 %	538397783
55	NC_022248	TG	3	6	86529	86534	0 %	50 %	50 %	0 %	538397785
56	NC_022248	GC	4	8	86661	86668	0 %	0 %	50 %	50 %	538397785
57	NC_022248	AC	3	6	89334	89339	50 %	0 %	0 %	50 %	538397786
58	NC_022248	AT	3	6	92626	92631	50 %	50 %	0 %	0 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.