MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022248	CAT	2	6	45964	45969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397760
502	NC_022248	TGA	2	6	46020	46025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397760
503	NC_022248	GCT	2	6	46138	46143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
504	NC_022248	GACA	2	8	46153	46160	50 %	0 %	25 %	25 %	538397760
505	NC_022248	GCT	2	6	46221	46226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
506	NC_022248	TCA	2	6	46241	46246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397760
507	NC_022248	CCCGG	2	10	46249	46258	0 %	0 %	40 %	60 %	538397760
508	NC_022248	CGG	2	6	46282	46287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397760
509	NC_022248	CTG	2	6	46375	46380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
510	NC_022248	GCT	2	6	46389	46394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
511	NC_022248	TGC	2	6	46414	46419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
512	NC_022248	CCGC	2	8	46428	46435	0 %	0 %	25 %	75 %	538397760
513	NC_022248	GCC	2	6	46553	46558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397760
514	NC_022248	TCC	2	6	46583	46588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397760
515	NC_022248	CG	3	6	46720	46725	0 %	0 %	50 %	50 %	538397760
516	NC_022248	GCT	2	6	46795	46800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
517	NC_022248	CCA	2	6	46839	46844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397760
518	NC_022248	CGTC	2	8	46941	46948	0 %	25 %	25 %	50 %	538397760
519	NC_022248	TGG	2	6	46956	46961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397760
520	NC_022248	TG	3	6	47007	47012	0 %	50 %	50 %	0 %	538397760
521	NC_022248	TCAG	2	8	47015	47022	25 %	25 %	25 %	25 %	538397760
522	NC_022248	GCC	2	6	47107	47112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397760
523	NC_022248	CTG	2	6	47116	47121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
524	NC_022248	CCT	2	6	47175	47180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397760
525	NC_022248	GCT	2	6	47205	47210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
526	NC_022248	TGC	2	6	47241	47246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397760
527	NC_022248	GTA	2	6	47254	47259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397760
528	NC_022248	TAA	2	6	47276	47281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397760
529	NC_022248	CGG	2	6	47283	47288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397760
530	NC_022248	TCA	2	6	47319	47324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397760
531	NC_022248	A	6	6	47678	47683	100 %	0 %	0 %	0 %	538397761
532	NC_022248	A	6	6	47776	47781	100 %	0 %	0 %	0 %	538397761
533	NC_022248	GAAA	2	8	47793	47800	75 %	0 %	25 %	0 %	538397761
534	NC_022248	GTTT	2	8	47819	47826	0 %	75 %	25 %	0 %	538397761
535	NC_022248	GCCG	2	8	47855	47862	0 %	0 %	50 %	50 %	538397761
536	NC_022248	GAT	2	6	47930	47935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397761
537	NC_022248	CACG	2	8	47943	47950	25 %	0 %	25 %	50 %	538397761
538	NC_022248	TTG	2	6	47965	47970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397761
539	NC_022248	AAC	2	6	47976	47981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397761
540	NC_022248	GTGG	2	8	48000	48007	0 %	25 %	75 %	0 %	538397761
541	NC_022248	ATC	2	6	48047	48052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397762
542	NC_022248	CCT	2	6	48103	48108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397762
543	NC_022248	CCG	2	6	48110	48115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
544	NC_022248	CTG	3	9	48122	48130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397762
545	NC_022248	CCT	2	6	48139	48144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397762
546	NC_022248	GCC	2	6	48151	48156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
547	NC_022248	CGC	2	6	48167	48172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
548	NC_022248	CCA	2	6	48178	48183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397762
549	NC_022248	G	6	6	48206	48211	0 %	0 %	100 %	0 %	538397762
550	NC_022248	GCT	2	6	48217	48222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397762
551	NC_022248	CGG	2	6	48280	48285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397762
552	NC_022248	CGC	2	6	48290	48295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
553	NC_022248	T	6	6	48302	48307	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
554	NC_022248	GGCTGT	2	12	48324	48335	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538397762
555	NC_022248	CTG	3	9	48403	48411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397762
556	NC_022248	CAGGT	2	10	48615	48624	20 %	20 %	40 %	20 %	538397762
557	NC_022248	GAA	2	6	48803	48808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397762
558	NC_022248	TCA	2	6	48820	48825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397762
559	NC_022248	CAG	2	6	48830	48835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397762
560	NC_022248	GCC	2	6	48840	48845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
561	NC_022248	TCC	2	6	48864	48869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397762
562	NC_022248	AGC	2	6	48901	48906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397762
563	NC_022248	TCA	2	6	48972	48977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397762
564	NC_022248	AGA	2	6	48979	48984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397762
565	NC_022248	ACGGTT	2	12	48995	49006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538397762
566	NC_022248	CAG	2	6	49019	49024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397762
567	NC_022248	GAA	2	6	49071	49076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397762
568	NC_022248	TG	3	6	49077	49082	0 %	50 %	50 %	0 %	538397762
569	NC_022248	GAA	2	6	49092	49097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397762
570	NC_022248	CAGC	2	8	49103	49110	25 %	0 %	25 %	50 %	538397762
571	NC_022248	T	7	7	49113	49119	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
572	NC_022248	TCC	2	6	49122	49127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397762
573	NC_022248	TCT	2	6	49243	49248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397762
574	NC_022248	T	6	6	49252	49257	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
575	NC_022248	CCA	2	6	49261	49266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397762
576	NC_022248	GCC	2	6	49272	49277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
577	NC_022248	AGGT	2	8	49290	49297	25 %	25 %	50 %	0 %	538397762
578	NC_022248	AGC	2	6	49323	49328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397762
579	NC_022248	GTCC	2	8	49398	49405	0 %	25 %	25 %	50 %	538397762
580	NC_022248	CTTC	2	8	49426	49433	0 %	50 %	0 %	50 %	538397762
581	NC_022248	CGC	2	6	49457	49462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
582	NC_022248	CG	3	6	49518	49523	0 %	0 %	50 %	50 %	538397762
583	NC_022248	GTA	2	6	49559	49564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397762
584	NC_022248	CAC	2	6	49598	49603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397762
585	NC_022248	CGC	2	6	49609	49614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397762
586	NC_022248	AGCC	2	8	49631	49638	25 %	0 %	25 %	50 %	538397762
587	NC_022248	ACTG	2	8	49664	49671	25 %	25 %	25 %	25 %	538397762
588	NC_022248	T	6	6	49754	49759	0 %	100 %	0 %	0 %	538397762
589	NC_022248	TCC	2	6	49802	49807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397762
590	NC_022248	CAT	2	6	49813	49818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397762
591	NC_022248	CTG	2	6	49826	49831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397762
592	NC_022248	A	6	6	49865	49870	100 %	0 %	0 %	0 %	538397762
593	NC_022248	CA	3	6	49895	49900	50 %	0 %	0 %	50 %	538397762
594	NC_022248	GGC	2	6	49901	49906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397762
595	NC_022248	GCG	2	6	49971	49976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397762
596	NC_022248	TTAA	2	8	50028	50035	50 %	50 %	0 %	0 %	538397762
597	NC_022248	ACC	2	6	50062	50067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397762
598	NC_022248	CGA	2	6	50125	50130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397762
599	NC_022248	AGA	2	6	50137	50142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397762
600	NC_022248	ATG	2	6	50247	50252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397762
601	NC_022248	TGA	2	6	50571	50576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397763
602	NC_022248	AAC	2	6	50631	50636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397763
603	NC_022248	ATC	2	6	50646	50651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397763
604	NC_022248	TTTA	2	8	50664	50671	25 %	75 %	0 %	0 %	538397763
605	NC_022248	TA	3	6	50670	50675	50 %	50 %	0 %	0 %	538397763
606	NC_022248	T	6	6	50711	50716	0 %	100 %	0 %	0 %	538397763
607	NC_022248	CAC	2	6	50861	50866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397763
608	NC_022248	GCT	2	6	50902	50907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397763
609	NC_022248	CAA	2	6	50918	50923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397763
610	NC_022248	TA	3	6	50936	50941	50 %	50 %	0 %	0 %	538397763
611	NC_022248	ATT	2	6	51007	51012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538397763
612	NC_022248	TAA	2	6	51111	51116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538397763
613	NC_022248	TTA	2	6	51131	51136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538397763
614	NC_022248	AT	3	6	51265	51270	50 %	50 %	0 %	0 %	538397764
615	NC_022248	GATT	2	8	51275	51282	25 %	50 %	25 %	0 %	538397764
616	NC_022248	TTG	2	6	51336	51341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397764
617	NC_022248	GCA	2	6	51549	51554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397764
618	NC_022248	CTG	2	6	51577	51582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397764
619	NC_022248	AGT	2	6	51715	51720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397764
620	NC_022248	CCGT	2	8	51835	51842	0 %	25 %	25 %	50 %	538397764
621	NC_022248	CAC	2	6	51925	51930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397764
622	NC_022248	CAT	2	6	51968	51973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397764
623	NC_022248	T	7	7	51976	51982	0 %	100 %	0 %	0 %	538397764
624	NC_022248	TCA	2	6	51988	51993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397764
625	NC_022248	TCT	2	6	57652	57657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538397765
626	NC_022248	GTC	2	6	57684	57689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397765
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