MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 2702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022241	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	538360567
2	NC_022241	CGCTG	2	10	3112	3121	0 %	20 %	40 %	40 %	538360568
3	NC_022241	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	538360568
4	NC_022241	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	538360569
5	NC_022241	CCGCG	2	10	7162	7171	0 %	0 %	40 %	60 %	538360572
6	NC_022241	GCGTG	2	10	13968	13977	0 %	20 %	60 %	20 %	538360579
7	NC_022241	GTGAT	2	10	14891	14900	20 %	40 %	40 %	0 %	538360580
8	NC_022241	AATCA	2	10	15486	15495	60 %	20 %	0 %	20 %	538360581
9	NC_022241	GGCTG	2	10	18831	18840	0 %	20 %	60 %	20 %	538360585
10	NC_022241	AGAGC	2	10	19352	19361	40 %	0 %	40 %	20 %	538360585
11	NC_022241	CCTGA	2	10	19893	19902	20 %	20 %	20 %	40 %	538360585
12	NC_022241	TACCG	2	10	21030	21039	20 %	20 %	20 %	40 %	538360586
13	NC_022241	GGCCG	2	10	21654	21663	0 %	0 %	60 %	40 %	538360586
14	NC_022241	CTTTT	2	10	23373	23382	0 %	80 %	0 %	20 %	538360587
15	NC_022241	CGGTA	2	10	24541	24550	20 %	20 %	40 %	20 %	538360588
16	NC_022241	CTGTT	2	10	24580	24589	0 %	60 %	20 %	20 %	538360588
17	NC_022241	TATTT	2	10	25414	25423	20 %	80 %	0 %	0 %	538360589
18	NC_022241	CGGCG	2	10	28611	28620	0 %	0 %	60 %	40 %	538360591
19	NC_022241	ATCTG	2	10	30945	30954	20 %	40 %	20 %	20 %	538360594
20	NC_022241	TTACG	2	10	31000	31009	20 %	40 %	20 %	20 %	538360594
21	NC_022241	GGGCG	2	10	31769	31778	0 %	0 %	80 %	20 %	538360595
22	NC_022241	TGCGT	2	10	32148	32157	0 %	40 %	40 %	20 %	538360596
23	NC_022241	AAAAG	2	10	32542	32551	80 %	0 %	20 %	0 %	538360597
24	NC_022241	TATAA	2	10	34145	34154	60 %	40 %	0 %	0 %	538360598
25	NC_022241	ATCGT	2	10	34898	34907	20 %	40 %	20 %	20 %	538360600
26	NC_022241	ATTTT	2	10	34942	34951	20 %	80 %	0 %	0 %	538360600
27	NC_022241	AGCGA	2	10	35571	35580	40 %	0 %	40 %	20 %	538360601
28	NC_022241	TCCTG	2	10	35781	35790	0 %	40 %	20 %	40 %	538360601
29	NC_022241	GGTCA	2	10	38016	38025	20 %	20 %	40 %	20 %	538360602
30	NC_022241	TTCAT	2	10	39274	39283	20 %	60 %	0 %	20 %	538360603
31	NC_022241	TGAAA	2	10	40091	40100	60 %	20 %	20 %	0 %	538360604
32	NC_022241	ACGGC	2	10	44451	44460	20 %	0 %	40 %	40 %	538360607
33	NC_022241	TTTTA	2	10	44777	44786	20 %	80 %	0 %	0 %	538360607
34	NC_022241	GGGCT	2	10	46525	46534	0 %	20 %	60 %	20 %	538360608
35	NC_022241	GCGTA	2	10	48401	48410	20 %	20 %	40 %	20 %	538360610
36	NC_022241	GACCA	2	10	49006	49015	40 %	0 %	20 %	40 %	538360610
37	NC_022241	CCGGC	2	10	49148	49157	0 %	0 %	40 %	60 %	538360610
38	NC_022241	CAGAC	2	10	50338	50347	40 %	0 %	20 %	40 %	538360610
39	NC_022241	GTTTG	2	10	55421	55430	0 %	60 %	40 %	0 %	538360614
40	NC_022241	CACTA	2	10	56552	56561	40 %	20 %	0 %	40 %	538360614
41	NC_022241	CGGCG	2	10	57090	57099	0 %	0 %	60 %	40 %	538360615
42	NC_022241	TTCAC	2	10	57345	57354	20 %	40 %	0 %	40 %	538360616
43	NC_022241	AAAAT	2	10	58916	58925	80 %	20 %	0 %	0 %	538360618
44	NC_022241	GGAAA	2	10	59703	59712	60 %	0 %	40 %	0 %	538360618
45	NC_022241	CGCTG	2	10	60193	60202	0 %	20 %	40 %	40 %	538360619
46	NC_022241	CGTGC	2	10	69682	69691	0 %	20 %	40 %	40 %	538360628
47	NC_022241	ACCGC	2	10	70412	70421	20 %	0 %	20 %	60 %	538360628
48	NC_022241	TTAAT	2	10	73658	73667	40 %	60 %	0 %	0 %	538360633
49	NC_022241	GCGAA	2	10	76837	76846	40 %	0 %	40 %	20 %	538360636
50	NC_022241	CGTAC	2	10	77727	77736	20 %	20 %	20 %	40 %	538360636
51	NC_022241	TTGCC	2	10	79364	79373	0 %	40 %	20 %	40 %	538360638
52	NC_022241	CATCC	2	10	79474	79483	20 %	20 %	0 %	60 %	538360638
53	NC_022241	TCAGC	2	10	82592	82601	20 %	20 %	20 %	40 %	538360641
54	NC_022241	GGCCA	2	10	82740	82749	20 %	0 %	40 %	40 %	538360641
55	NC_022241	GTACG	2	10	85311	85320	20 %	20 %	40 %	20 %	538360643
56	NC_022241	CAGAA	2	10	86024	86033	60 %	0 %	20 %	20 %	538360643
57	NC_022241	CCGCA	2	10	88143	88152	20 %	0 %	20 %	60 %	538360646
58	NC_022241	CGGTT	2	10	88648	88657	0 %	40 %	40 %	20 %	538360647
59	NC_022241	TGGCG	2	10	90428	90437	0 %	20 %	60 %	20 %	538360649
60	NC_022241	TTTCC	2	10	94347	94356	0 %	60 %	0 %	40 %	538360653
61	NC_022241	GTGGC	2	10	94916	94925	0 %	20 %	60 %	20 %	538360653
62	NC_022241	TGCAC	2	10	96980	96989	20 %	20 %	20 %	40 %	538360654
63	NC_022241	TGGCA	2	10	97049	97058	20 %	20 %	40 %	20 %	538360654
64	NC_022241	TCTGT	2	10	97375	97384	0 %	60 %	20 %	20 %	538360655
65	NC_022241	GCGCT	2	10	97685	97694	0 %	20 %	40 %	40 %	538360655
66	NC_022241	GGCGC	2	10	98099	98108	0 %	0 %	60 %	40 %	538360655
67	NC_022241	AACGT	2	10	100869	100878	40 %	20 %	20 %	20 %	538360658
68	NC_022241	CCCAA	2	10	103019	103028	40 %	0 %	0 %	60 %	538360661
69	NC_022241	TTGTT	2	10	103726	103735	0 %	80 %	20 %	0 %	538360661
70	NC_022241	GCTTC	2	10	105106	105115	0 %	40 %	20 %	40 %	538360662
71	NC_022241	TGCGT	2	10	105393	105402	0 %	40 %	40 %	20 %	538360662
72	NC_022241	TGATC	2	10	107093	107102	20 %	40 %	20 %	20 %	538360663
73	NC_022241	GCTGA	2	10	108603	108612	20 %	20 %	40 %	20 %	538360665
74	NC_022241	TGGCG	2	10	110253	110262	0 %	20 %	60 %	20 %	538360665
75	NC_022241	AGCGC	2	10	110813	110822	20 %	0 %	40 %	40 %	538360665
76	NC_022241	CCGCG	2	10	111898	111907	0 %	0 %	40 %	60 %	538360666
77	NC_022241	GGGGT	2	10	113294	113303	0 %	20 %	80 %	0 %	538360666
78	NC_022241	ACAGA	2	10	115024	115033	60 %	0 %	20 %	20 %	538360668
79	NC_022241	CAGCG	2	10	116199	116208	20 %	0 %	40 %	40 %	538360670
80	NC_022241	GCCGG	2	10	116499	116508	0 %	0 %	60 %	40 %	538360670
81	NC_022241	CGAGC	2	10	116624	116633	20 %	0 %	40 %	40 %	538360670
82	NC_022241	ATTTG	2	10	117067	117076	20 %	60 %	20 %	0 %	538360670
83	NC_022241	GACCA	2	10	118098	118107	40 %	0 %	20 %	40 %	538360671
84	NC_022241	TTGCC	2	10	121571	121580	0 %	40 %	20 %	40 %	538360674
85	NC_022241	AGTTT	2	10	124471	124480	20 %	60 %	20 %	0 %	538360676
86	NC_022241	TAGTG	2	10	124889	124898	20 %	40 %	40 %	0 %	538360677
87	NC_022241	TCGAT	2	10	126319	126328	20 %	40 %	20 %	20 %	538360678
88	NC_022241	CGTTT	2	10	129411	129420	0 %	60 %	20 %	20 %	538360682
89	NC_022241	GGTTT	2	10	132567	132576	0 %	60 %	40 %	0 %	538360685
90	NC_022241	ATTCC	2	10	134512	134521	20 %	40 %	0 %	40 %	538360687
91	NC_022241	CCGCA	2	10	137343	137352	20 %	0 %	20 %	60 %	538360689
92	NC_022241	AGTTC	2	10	139714	139723	20 %	40 %	20 %	20 %	538360691
93	NC_022241	TGCCT	2	10	139814	139823	0 %	40 %	20 %	40 %	538360692
94	NC_022241	AAGCG	2	10	144467	144476	40 %	0 %	40 %	20 %	538360695
95	NC_022241	GTTTG	2	10	146370	146379	0 %	60 %	40 %	0 %	538360697
96	NC_022241	CGTAT	2	10	147841	147850	20 %	40 %	20 %	20 %	538360698
97	NC_022241	ATCAG	2	10	149677	149686	40 %	20 %	20 %	20 %	538360700
98	NC_022241	CTGCC	2	10	151686	151695	0 %	20 %	20 %	60 %	538360701
99	NC_022241	CGGCG	2	10	154416	154425	0 %	0 %	60 %	40 %	538360704
100	NC_022241	CCGGC	2	10	157770	157779	0 %	0 %	40 %	60 %	538360707
101	NC_022241	GATCA	2	10	162812	162821	40 %	20 %	20 %	20 %	538360712
102	NC_022241	CGTCA	2	10	163558	163567	20 %	20 %	20 %	40 %	538360713
103	NC_022241	ATCCC	2	10	165258	165267	20 %	20 %	0 %	60 %	538360716
104	NC_022241	AGCGC	2	10	165966	165975	20 %	0 %	40 %	40 %	538360716
105	NC_022241	TGAGC	2	10	167815	167824	20 %	20 %	40 %	20 %	538360717
106	NC_022241	CGCAT	2	10	168077	168086	20 %	20 %	20 %	40 %	538360718
107	NC_022241	CGAAC	2	10	168806	168815	40 %	0 %	20 %	40 %	538360719
108	NC_022241	GTTCA	2	10	169072	169081	20 %	40 %	20 %	20 %	538360719
109	NC_022241	ATGAC	2	10	170038	170047	40 %	20 %	20 %	20 %	538360720
110	NC_022241	CTGGA	2	10	170628	170637	20 %	20 %	40 %	20 %	538360721
111	NC_022241	CAGAA	2	10	172747	172756	60 %	0 %	20 %	20 %	538360723
112	NC_022241	CGAAG	2	10	175618	175627	40 %	0 %	40 %	20 %	538360726
113	NC_022241	AGCAA	2	10	177831	177840	60 %	0 %	20 %	20 %	538360727
114	NC_022241	GGCAT	2	10	182897	182906	20 %	20 %	40 %	20 %	538360731
115	NC_022241	GGCCA	2	10	183319	183328	20 %	0 %	40 %	40 %	538360732
116	NC_022241	GCGCC	2	10	183332	183341	0 %	0 %	40 %	60 %	538360732
117	NC_022241	CGTTT	2	10	183834	183843	0 %	60 %	20 %	20 %	538360732
118	NC_022241	GGGGA	2	10	183886	183895	20 %	0 %	80 %	0 %	538360732
119	NC_022241	TCTGG	2	10	187522	187531	0 %	40 %	40 %	20 %	538360734
120	NC_022241	CCGCT	2	10	191539	191548	0 %	20 %	20 %	60 %	538360738
121	NC_022241	ATCGG	2	10	195887	195896	20 %	20 %	40 %	20 %	538360743
122	NC_022241	GCCGC	2	10	197097	197106	0 %	0 %	40 %	60 %	538360745
123	NC_022241	ATCCA	2	10	202447	202456	40 %	20 %	0 %	40 %	538360748
124	NC_022241	CGGCG	2	10	204561	204570	0 %	0 %	60 %	40 %	538360751
125	NC_022241	TGGTC	2	10	205427	205436	0 %	40 %	40 %	20 %	538360751
126	NC_022241	CGTCA	2	10	207125	207134	20 %	20 %	20 %	40 %	538360752
127	NC_022241	AGCGC	2	10	208076	208085	20 %	0 %	40 %	40 %	538360752
128	NC_022241	CGGCG	2	10	209990	209999	0 %	0 %	60 %	40 %	538360756
129	NC_022241	TTCGG	2	10	210870	210879	0 %	40 %	40 %	20 %	538360757
130	NC_022241	CTTGC	2	10	211879	211888	0 %	40 %	20 %	40 %	538360758
131	NC_022241	TGAGC	2	10	212291	212300	20 %	20 %	40 %	20 %	538360759
132	NC_022241	GCACG	2	10	213555	213564	20 %	0 %	40 %	40 %	538360760
133	NC_022241	AGATC	2	10	213960	213969	40 %	20 %	20 %	20 %	538360761
134	NC_022241	CGCGG	2	10	214382	214391	0 %	0 %	60 %	40 %	538360762
135	NC_022241	CGCGG	2	10	214566	214575	0 %	0 %	60 %	40 %	538360762
136	NC_022241	GCCAG	2	10	216550	216559	20 %	0 %	40 %	40 %	538360763
137	NC_022241	GCGCG	2	10	217116	217125	0 %	0 %	60 %	40 %	538360764
138	NC_022241	CGGGG	2	10	218934	218943	0 %	0 %	80 %	20 %	538360767
139	NC_022241	GCGAA	2	10	221054	221063	40 %	0 %	40 %	20 %	538360767
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141	NC_022241	GGCGG	2	10	222867	222876	0 %	0 %	80 %	20 %	538360768
142	NC_022241	GTTGA	2	10	224716	224725	20 %	40 %	40 %	0 %	538360770
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249	NC_022241	GCGCT	2	10	407678	407687	0 %	20 %	40 %	40 %	538360943
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257	NC_022241	CGTAT	2	10	417045	417054	20 %	40 %	20 %	20 %	538360950
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259	NC_022241	CGGCG	2	10	418786	418795	0 %	0 %	60 %	40 %	538360952
260	NC_022241	GCCAT	2	10	423759	423768	20 %	20 %	20 %	40 %	538360956
261	NC_022241	CGTTG	2	10	426046	426055	0 %	40 %	40 %	20 %	538360958
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263	NC_022241	TGACC	2	10	429514	429523	20 %	20 %	20 %	40 %	538360961
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