MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022241	TGG	2	6	184735	184740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360733
3502	NC_022241	TGA	2	6	184741	184746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360733
3503	NC_022241	TCG	2	6	184747	184752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360733
3504	NC_022241	TGC	2	6	184766	184771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360733
3505	NC_022241	AAC	2	6	184774	184779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360733
3506	NC_022241	GGT	2	6	184785	184790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360733
3507	NC_022241	CTG	2	6	184839	184844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360733
3508	NC_022241	CGG	2	6	184869	184874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360733
3509	NC_022241	ACC	2	6	184933	184938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360733
3510	NC_022241	TGA	2	6	184961	184966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360733
3511	NC_022241	CGG	2	6	184971	184976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360733
3512	NC_022241	TGG	3	9	185000	185008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360733
3513	NC_022241	TTG	2	6	185009	185014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360733
3514	NC_022241	CGG	2	6	185021	185026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360733
3515	NC_022241	TGC	2	6	185062	185067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360733
3516	NC_022241	GAGC	2	8	185096	185103	25 %	0 %	50 %	25 %	538360733
3517	NC_022241	CATC	2	8	185123	185130	25 %	25 %	0 %	50 %	538360733
3518	NC_022241	TGGC	2	8	185251	185258	0 %	25 %	50 %	25 %	538360733
3519	NC_022241	CGC	2	6	185484	185489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360733
3520	NC_022241	CA	3	6	185560	185565	50 %	0 %	0 %	50 %	538360733
3521	NC_022241	GCT	2	6	186084	186089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3522	NC_022241	GAA	3	9	186109	186117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360734
3523	NC_022241	TCC	2	6	186147	186152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360734
3524	NC_022241	GCT	2	6	186193	186198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3525	NC_022241	ACC	2	6	186214	186219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360734
3526	NC_022241	CTG	2	6	186253	186258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3527	NC_022241	ACA	2	6	186278	186283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360734
3528	NC_022241	TGAT	2	8	186293	186300	25 %	50 %	25 %	0 %	538360734
3529	NC_022241	TGC	2	6	186330	186335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3530	NC_022241	CTG	2	6	186355	186360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3531	NC_022241	ACG	2	6	186377	186382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3532	NC_022241	AGA	2	6	186384	186389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360734
3533	NC_022241	CCG	2	6	186466	186471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360734
3534	NC_022241	A	6	6	186479	186484	100 %	0 %	0 %	0 %	538360734
3535	NC_022241	TCACCG	2	12	186485	186496	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538360734
3536	NC_022241	CGA	2	6	186525	186530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3537	NC_022241	TC	4	8	186531	186538	0 %	50 %	0 %	50 %	538360734
3538	NC_022241	CAAA	2	8	186648	186655	75 %	0 %	0 %	25 %	538360734
3539	NC_022241	A	6	6	186670	186675	100 %	0 %	0 %	0 %	538360734
3540	NC_022241	GTG	2	6	186703	186708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360734
3541	NC_022241	TTC	2	6	186717	186722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360734
3542	NC_022241	GCG	3	9	186791	186799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360734
3543	NC_022241	TCT	2	6	186830	186835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360734
3544	NC_022241	CGA	2	6	186996	187001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3545	NC_022241	GTGC	2	8	187003	187010	0 %	25 %	50 %	25 %	538360734
3546	NC_022241	GGT	2	6	187012	187017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360734
3547	NC_022241	ACC	2	6	187048	187053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360734
3548	NC_022241	AGC	2	6	187120	187125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3549	NC_022241	GGTC	2	8	187152	187159	0 %	25 %	50 %	25 %	538360734
3550	NC_022241	GCG	2	6	187166	187171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360734
3551	NC_022241	TAC	2	6	187233	187238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360734
3552	NC_022241	CCG	2	6	187289	187294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360734
3553	NC_022241	CAC	2	6	187350	187355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360734
3554	NC_022241	CAC	2	6	187357	187362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360734
3555	NC_022241	TC	3	6	187397	187402	0 %	50 %	0 %	50 %	538360734
3556	NC_022241	TGC	3	9	187445	187453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3557	NC_022241	CGG	2	6	187470	187475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360734
3558	NC_022241	CGG	2	6	187514	187519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360734
3559	NC_022241	TCTGG	2	10	187522	187531	0 %	40 %	40 %	20 %	538360734
3560	NC_022241	GCC	2	6	187540	187545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360734
3561	NC_022241	CTG	2	6	187672	187677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3562	NC_022241	GAA	2	6	187686	187691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360734
3563	NC_022241	TCT	2	6	187706	187711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360734
3564	NC_022241	CTG	2	6	187864	187869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3565	NC_022241	GAT	2	6	187875	187880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360734
3566	NC_022241	CGT	2	6	187900	187905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3567	NC_022241	TGGC	2	8	187939	187946	0 %	25 %	50 %	25 %	538360734
3568	NC_022241	CTG	2	6	187957	187962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3569	NC_022241	CGG	2	6	187988	187993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360734
3570	NC_022241	TG	3	6	188033	188038	0 %	50 %	50 %	0 %	538360734
3571	NC_022241	GAC	2	6	188053	188058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3572	NC_022241	CTG	2	6	188065	188070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3573	NC_022241	CGA	2	6	188094	188099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3574	NC_022241	CG	3	6	188140	188145	0 %	0 %	50 %	50 %	538360734
3575	NC_022241	GCT	2	6	188154	188159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3576	NC_022241	GCC	2	6	188202	188207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360734
3577	NC_022241	GAA	2	6	188236	188241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360734
3578	NC_022241	TAC	2	6	188245	188250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360734
3579	NC_022241	GTC	2	6	188341	188346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360734
3580	NC_022241	GGC	2	6	188418	188423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360734
3581	NC_022241	CGG	2	6	188495	188500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360734
3582	NC_022241	CT	3	6	188533	188538	0 %	50 %	0 %	50 %	538360734
3583	NC_022241	CTT	2	6	188622	188627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360735
3584	NC_022241	TAT	2	6	188631	188636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360735
3585	NC_022241	ATT	2	6	188684	188689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360735
3586	NC_022241	AT	3	6	188734	188739	50 %	50 %	0 %	0 %	538360735
3587	NC_022241	GTA	2	6	188745	188750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360735
3588	NC_022241	CGT	2	6	188788	188793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360735
3589	NC_022241	ACC	2	6	188800	188805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360735
3590	NC_022241	ATC	2	6	188822	188827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360735
3591	NC_022241	ATT	2	6	188834	188839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360735
3592	NC_022241	T	6	6	188838	188843	0 %	100 %	0 %	0 %	538360735
3593	NC_022241	GC	3	6	188865	188870	0 %	0 %	50 %	50 %	538360735
3594	NC_022241	GAG	2	6	188896	188901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360735
3595	NC_022241	TAA	2	6	188919	188924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360735
3596	NC_022241	AAT	2	6	188980	188985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360735
3597	NC_022241	AACC	2	8	189050	189057	50 %	0 %	0 %	50 %	538360735
3598	NC_022241	ATT	2	6	189068	189073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360735
3599	NC_022241	TCG	2	6	189577	189582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360736
3600	NC_022241	AAT	2	6	189615	189620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360736
3601	NC_022241	ACG	2	6	189621	189626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360736
3602	NC_022241	T	7	7	189710	189716	0 %	100 %	0 %	0 %	538360736
3603	NC_022241	GCG	2	6	189762	189767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360736
3604	NC_022241	CCG	2	6	189779	189784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360736
3605	NC_022241	CATT	2	8	189824	189831	25 %	50 %	0 %	25 %	538360736
3606	NC_022241	GGT	2	6	190166	190171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360737
3607	NC_022241	CG	3	6	190235	190240	0 %	0 %	50 %	50 %	538360737
3608	NC_022241	TGGA	2	8	190296	190303	25 %	25 %	50 %	0 %	538360737
3609	NC_022241	GAA	2	6	190308	190313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360737
3610	NC_022241	TGA	2	6	190315	190320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360737
3611	NC_022241	TTA	2	6	190373	190378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360737
3612	NC_022241	AG	3	6	190385	190390	50 %	0 %	50 %	0 %	538360737
3613	NC_022241	GGA	2	6	190409	190414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360737
3614	NC_022241	GTC	2	6	190425	190430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360737
3615	NC_022241	A	6	6	190707	190712	100 %	0 %	0 %	0 %	538360738
3616	NC_022241	CGG	2	6	190730	190735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360738
3617	NC_022241	ATG	2	6	190737	190742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360738
3618	NC_022241	CGG	2	6	190802	190807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360738
3619	NC_022241	CTG	2	6	190860	190865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360738
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3621	NC_022241	TGC	2	6	191060	191065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360738
3622	NC_022241	ATG	2	6	191125	191130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360738
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3864	NC_022241	CTG	2	6	204325	204330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360750
3865	NC_022241	TC	3	6	204482	204487	0 %	50 %	0 %	50 %	538360751
3866	NC_022241	GAATCT	2	12	204491	204502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538360751
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3882	NC_022241	TGGTC	2	10	205427	205436	0 %	40 %	40 %	20 %	538360751
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3983	NC_022241	ATC	2	6	210812	210817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360757
3984	NC_022241	TGA	2	6	210828	210833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360757
3985	NC_022241	CCA	2	6	210860	210865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360757
3986	NC_022241	TTCGG	2	10	210870	210879	0 %	40 %	40 %	20 %	538360757
3987	NC_022241	GGA	2	6	210945	210950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360757
3988	NC_022241	CG	3	6	210964	210969	0 %	0 %	50 %	50 %	538360757
3989	NC_022241	GC	4	8	210979	210986	0 %	0 %	50 %	50 %	538360757
3990	NC_022241	GGT	2	6	210987	210992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360757
3991	NC_022241	TAT	2	6	211077	211082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360757
3992	NC_022241	T	6	6	211197	211202	0 %	100 %	0 %	0 %	538360757
3993	NC_022241	TCG	2	6	211221	211226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360757
3994	NC_022241	TA	3	6	211235	211240	50 %	50 %	0 %	0 %	538360757
3995	NC_022241	ATA	2	6	211253	211258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360757
3996	NC_022241	CGG	2	6	211282	211287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360757
3997	NC_022241	TCTT	2	8	211320	211327	0 %	75 %	0 %	25 %	538360757
3998	NC_022241	GGC	2	6	211336	211341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360757
3999	NC_022241	AGC	2	6	211362	211367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360757
4000	NC_022241	CAC	2	6	211395	211400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360757

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