MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_022241	CCG	2	6	107439	107444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360663
2003	NC_022241	ATG	2	6	107448	107453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360663
2004	NC_022241	CAC	2	6	107824	107829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360664
2005	NC_022241	GCGG	2	8	107830	107837	0 %	0 %	75 %	25 %	538360664
2006	NC_022241	TAT	2	6	107838	107843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360664
2007	NC_022241	CCG	2	6	107844	107849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360664
2008	NC_022241	CCA	2	6	107856	107861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360664
2009	NC_022241	AC	3	6	107899	107904	50 %	0 %	0 %	50 %	538360664
2010	NC_022241	CCG	2	6	107961	107966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360664
2011	NC_022241	GGGA	2	8	107967	107974	25 %	0 %	75 %	0 %	538360664
2012	NC_022241	CG	3	6	107985	107990	0 %	0 %	50 %	50 %	538360664
2013	NC_022241	CGC	2	6	108075	108080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360664
2014	NC_022241	TGG	2	6	108081	108086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360664
2015	NC_022241	CTGC	2	8	108111	108118	0 %	25 %	25 %	50 %	538360664
2016	NC_022241	ACA	2	6	108183	108188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360664
2017	NC_022241	ACC	2	6	108206	108211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360664
2018	NC_022241	CCAG	2	8	108240	108247	25 %	0 %	25 %	50 %	538360664
2019	NC_022241	GCG	2	6	108255	108260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360664
2020	NC_022241	GAC	2	6	108306	108311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2021	NC_022241	GCCT	2	8	108339	108346	0 %	25 %	25 %	50 %	538360665
2022	NC_022241	CTG	2	6	108366	108371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2023	NC_022241	TCG	3	9	108397	108405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360665
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2028	NC_022241	GCTGA	2	10	108603	108612	20 %	20 %	40 %	20 %	538360665
2029	NC_022241	GGC	2	6	108639	108644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360665
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2034	NC_022241	TGC	3	9	108803	108811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360665
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2036	NC_022241	CGC	2	6	108998	109003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360665
2037	NC_022241	CGA	2	6	109022	109027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2038	NC_022241	GTC	3	9	109065	109073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2039	NC_022241	TTC	2	6	109077	109082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360665
2040	NC_022241	GTT	2	6	109097	109102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360665
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2042	NC_022241	CAG	2	6	109134	109139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360665
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2044	NC_022241	CG	3	6	109278	109283	0 %	0 %	50 %	50 %	538360665
2045	NC_022241	T	6	6	109355	109360	0 %	100 %	0 %	0 %	538360665
2046	NC_022241	GAC	2	6	109412	109417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2047	NC_022241	CAG	2	6	109431	109436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2048	NC_022241	GC	3	6	109529	109534	0 %	0 %	50 %	50 %	538360665
2049	NC_022241	TCT	2	6	109540	109545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360665
2050	NC_022241	GGC	3	9	109557	109565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360665
2051	NC_022241	CGG	2	6	109604	109609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360665
2052	NC_022241	TTCGCG	2	12	109620	109631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2053	NC_022241	GGT	2	6	109656	109661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360665
2054	NC_022241	CCA	2	6	109746	109751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360665
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2056	NC_022241	CGGCAG	2	12	109878	109889	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538360665
2057	NC_022241	TCA	2	6	109996	110001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360665
2058	NC_022241	GGC	2	6	110004	110009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360665
2059	NC_022241	CGT	2	6	110015	110020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360665
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2061	NC_022241	CAG	2	6	110121	110126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360665
2062	NC_022241	TTC	2	6	110166	110171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360665
2063	NC_022241	TGGCG	2	10	110253	110262	0 %	20 %	60 %	20 %	538360665
2064	NC_022241	CAG	3	9	110265	110273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360665
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2070	NC_022241	CGG	2	6	110419	110424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360665
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2086	NC_022241	CATC	2	8	111122	111129	25 %	25 %	0 %	50 %	538360665
2087	NC_022241	CAA	2	6	111131	111136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360665
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2097	NC_022241	GCG	2	6	111796	111801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360666
2098	NC_022241	GCTG	2	8	111844	111851	0 %	25 %	50 %	25 %	538360666
2099	NC_022241	T	6	6	111881	111886	0 %	100 %	0 %	0 %	538360666
2100	NC_022241	CCGCG	2	10	111898	111907	0 %	0 %	40 %	60 %	538360666
2101	NC_022241	CTCCAG	2	12	111947	111958	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538360666
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2105	NC_022241	GC	4	8	112057	112064	0 %	0 %	50 %	50 %	538360666
2106	NC_022241	GAC	2	6	112173	112178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360666
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2108	NC_022241	GGCA	2	8	112326	112333	25 %	0 %	50 %	25 %	538360666
2109	NC_022241	ATCA	2	8	112424	112431	50 %	25 %	0 %	25 %	538360666
2110	NC_022241	GCC	2	6	112520	112525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360666
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2116	NC_022241	GCG	2	6	112766	112771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360666
2117	NC_022241	A	7	7	112929	112935	100 %	0 %	0 %	0 %	538360666
2118	NC_022241	GCA	2	6	113026	113031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360666
2119	NC_022241	CAC	2	6	113048	113053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360666
2120	NC_022241	GAT	2	6	113063	113068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360666
2121	NC_022241	GCGG	2	8	113119	113126	0 %	0 %	75 %	25 %	538360666
2122	NC_022241	GCG	2	6	113278	113283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360666
2123	NC_022241	GGGGT	2	10	113294	113303	0 %	20 %	80 %	0 %	538360666
2124	NC_022241	TAA	2	6	113365	113370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360666
2125	NC_022241	CGG	2	6	113393	113398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360666
2126	NC_022241	GCA	2	6	113437	113442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360666
2127	NC_022241	TAA	2	6	113827	113832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360667
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2130	NC_022241	TGA	2	6	113898	113903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360667
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2134	NC_022241	CGC	2	6	114108	114113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360667
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2137	NC_022241	TGT	2	6	114172	114177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360667
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2139	NC_022241	CTGA	2	8	114291	114298	25 %	25 %	25 %	25 %	538360667
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2141	NC_022241	ATG	2	6	114349	114354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360667
2142	NC_022241	ATGA	2	8	114388	114395	50 %	25 %	25 %	0 %	538360667
2143	NC_022241	T	6	6	115003	115008	0 %	100 %	0 %	0 %	538360668
2144	NC_022241	ACAGA	2	10	115024	115033	60 %	0 %	20 %	20 %	538360668
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2147	NC_022241	A	6	6	115095	115100	100 %	0 %	0 %	0 %	538360668
2148	NC_022241	ATT	2	6	115117	115122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360668
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2152	NC_022241	ATT	2	6	115222	115227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360668
2153	NC_022241	AT	3	6	115275	115280	50 %	50 %	0 %	0 %	538360668
2154	NC_022241	TCA	2	6	115293	115298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360668
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2231	NC_022241	CGG	2	6	118868	118873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360671
2232	NC_022241	GCC	2	6	118944	118949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360671
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2238	NC_022241	GAT	2	6	119231	119236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360671
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2240	NC_022241	CTT	2	6	119273	119278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360671
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2242	NC_022241	TCG	2	6	119314	119319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360671
2243	NC_022241	GC	3	6	119344	119349	0 %	0 %	50 %	50 %	538360671
2244	NC_022241	CAATTG	2	12	119375	119386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538360671
2245	NC_022241	T	7	7	119829	119835	0 %	100 %	0 %	0 %	538360672
2246	NC_022241	ATCG	2	8	119836	119843	25 %	25 %	25 %	25 %	538360672
2247	NC_022241	AT	3	6	119862	119867	50 %	50 %	0 %	0 %	538360672
2248	NC_022241	TAA	3	9	119901	119909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360672
2249	NC_022241	TGTC	2	8	119922	119929	0 %	50 %	25 %	25 %	538360672
2250	NC_022241	AT	3	6	119939	119944	50 %	50 %	0 %	0 %	538360672
2251	NC_022241	CCG	2	6	119953	119958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360672
2252	NC_022241	TCA	2	6	119967	119972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360672
2253	NC_022241	GC	3	6	120103	120108	0 %	0 %	50 %	50 %	538360672
2254	NC_022241	ATC	2	6	120139	120144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360672
2255	NC_022241	CTG	2	6	120193	120198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360672
2256	NC_022241	AGC	2	6	120200	120205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360672
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2258	NC_022241	CCG	2	6	120247	120252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360672
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2268	NC_022241	TAT	2	6	120883	120888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360673
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2353	NC_022241	TTG	2	6	124902	124907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360677
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2361	NC_022241	GC	3	6	125315	125320	0 %	0 %	50 %	50 %	538360678
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2486	NC_022241	GGTTT	2	10	132567	132576	0 %	60 %	40 %	0 %	538360685
2487	NC_022241	GGATAA	2	12	132626	132637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	538360685
2488	NC_022241	TAA	2	6	132673	132678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360685
2489	NC_022241	ATT	2	6	132917	132922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360686
2490	NC_022241	CG	3	6	133090	133095	0 %	0 %	50 %	50 %	538360686
2491	NC_022241	CAG	2	6	133295	133300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360686
2492	NC_022241	ATA	2	6	133339	133344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360686
2493	NC_022241	A	6	6	133375	133380	100 %	0 %	0 %	0 %	538360686
2494	NC_022241	CGT	2	6	133411	133416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360686
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2499	NC_022241	GTT	2	6	133608	133613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360686
2500	NC_022241	TC	3	6	133614	133619	0 %	50 %	0 %	50 %	538360686

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