MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022241	CAC	2	6	79484	79489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360638
1502	NC_022241	GGTATC	2	12	79541	79552	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538360638
1503	NC_022241	GCCT	2	8	79592	79599	0 %	25 %	25 %	50 %	538360638
1504	NC_022241	CAC	2	6	79718	79723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360638
1505	NC_022241	TCT	2	6	79926	79931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360639
1506	NC_022241	GCA	2	6	79936	79941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360639
1507	NC_022241	CGC	2	6	79963	79968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360639
1508	NC_022241	CTT	2	6	79987	79992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360639
1509	NC_022241	CG	3	6	80012	80017	0 %	0 %	50 %	50 %	538360639
1510	NC_022241	GTT	2	6	80065	80070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360639
1511	NC_022241	CG	4	8	80080	80087	0 %	0 %	50 %	50 %	538360639
1512	NC_022241	CTT	2	6	80143	80148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360639
1513	NC_022241	CGG	2	6	80195	80200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360639
1514	NC_022241	AGGC	2	8	80210	80217	25 %	0 %	50 %	25 %	538360639
1515	NC_022241	CGC	3	9	80224	80232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360639
1516	NC_022241	CCG	2	6	80302	80307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360639
1517	NC_022241	CCG	2	6	80325	80330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360639
1518	NC_022241	GCC	2	6	80402	80407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360639
1519	NC_022241	CAGC	2	8	80460	80467	25 %	0 %	25 %	50 %	538360639
1520	NC_022241	CGC	2	6	80485	80490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360639
1521	NC_022241	GGTC	2	8	80589	80596	0 %	25 %	50 %	25 %	538360639
1522	NC_022241	ACTC	2	8	80641	80648	25 %	25 %	0 %	50 %	538360639
1523	NC_022241	T	8	8	80714	80721	0 %	100 %	0 %	0 %	538360640
1524	NC_022241	ATT	2	6	80723	80728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360640
1525	NC_022241	TCA	2	6	80876	80881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360640
1526	NC_022241	ACCA	2	8	80899	80906	50 %	0 %	0 %	50 %	538360640
1527	NC_022241	ATA	2	6	80939	80944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360640
1528	NC_022241	CCG	2	6	80975	80980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360640
1529	NC_022241	CGA	2	6	81006	81011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1530	NC_022241	CATCCT	2	12	81024	81035	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	538360640
1531	NC_022241	CGG	2	6	81168	81173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360640
1532	NC_022241	TCG	2	6	81191	81196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1533	NC_022241	AAT	2	6	81271	81276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360640
1534	NC_022241	CAG	2	6	81310	81315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1535	NC_022241	GAT	2	6	81390	81395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360640
1536	NC_022241	GCG	2	6	81413	81418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360640
1537	NC_022241	ATC	3	9	81440	81448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360640
1538	NC_022241	TGC	2	6	81534	81539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1539	NC_022241	CGG	2	6	81540	81545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360640
1540	NC_022241	GCG	2	6	81560	81565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360640
1541	NC_022241	TCA	2	6	81614	81619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360640
1542	NC_022241	AGT	2	6	81645	81650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360640
1543	NC_022241	CAC	2	6	81682	81687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360640
1544	NC_022241	GGT	2	6	81703	81708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360640
1545	NC_022241	CCG	2	6	81729	81734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360640
1546	NC_022241	GTG	2	6	81770	81775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360640
1547	NC_022241	CGT	2	6	81813	81818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1548	NC_022241	GCT	2	6	81828	81833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1549	NC_022241	CAGA	2	8	81841	81848	50 %	0 %	25 %	25 %	538360640
1550	NC_022241	CAG	2	6	81919	81924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1551	NC_022241	TTC	2	6	81958	81963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360640
1552	NC_022241	A	6	6	82095	82100	100 %	0 %	0 %	0 %	538360640
1553	NC_022241	GTC	2	6	82213	82218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360640
1554	NC_022241	GGC	2	6	82398	82403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360641
1555	NC_022241	GTT	2	6	82449	82454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360641
1556	NC_022241	ATG	2	6	82468	82473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360641
1557	NC_022241	TCAGC	2	10	82592	82601	20 %	20 %	20 %	40 %	538360641
1558	NC_022241	GC	3	6	82605	82610	0 %	0 %	50 %	50 %	538360641
1559	NC_022241	GT	4	8	82627	82634	0 %	50 %	50 %	0 %	538360641
1560	NC_022241	GCCA	2	8	82636	82643	25 %	0 %	25 %	50 %	538360641
1561	NC_022241	CGA	2	6	82661	82666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360641
1562	NC_022241	GATG	2	8	82691	82698	25 %	25 %	50 %	0 %	538360641
1563	NC_022241	GGCCA	2	10	82740	82749	20 %	0 %	40 %	40 %	538360641
1564	NC_022241	GTA	2	6	82839	82844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360641
1565	NC_022241	CGC	2	6	82880	82885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360641
1566	NC_022241	AGT	2	6	82892	82897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360641
1567	NC_022241	CAT	2	6	82899	82904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360641
1568	NC_022241	GCA	2	6	82922	82927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360641
1569	NC_022241	GTC	2	6	83005	83010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360641
1570	NC_022241	CGG	2	6	83033	83038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360641
1571	NC_022241	CTC	2	6	83139	83144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360641
1572	NC_022241	TCA	2	6	83212	83217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360641
1573	NC_022241	CGG	2	6	83227	83232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360641
1574	NC_022241	GCG	2	6	83346	83351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360641
1575	NC_022241	A	6	6	83480	83485	100 %	0 %	0 %	0 %	538360641
1576	NC_022241	TCA	2	6	83534	83539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360641
1577	NC_022241	T	6	6	83554	83559	0 %	100 %	0 %	0 %	538360641
1578	NC_022241	ACC	2	6	83706	83711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360642
1579	NC_022241	GGT	2	6	83756	83761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360642
1580	NC_022241	CAG	2	6	83898	83903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360642
1581	NC_022241	CGA	2	6	84059	84064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360642
1582	NC_022241	CTT	2	6	84086	84091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360642
1583	NC_022241	CCGA	2	8	84117	84124	25 %	0 %	25 %	50 %	538360642
1584	NC_022241	TCA	2	6	84151	84156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360642
1585	NC_022241	CAG	2	6	84169	84174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360642
1586	NC_022241	TTG	2	6	84205	84210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360642
1587	NC_022241	TC	3	6	84280	84285	0 %	50 %	0 %	50 %	538360642
1588	NC_022241	CCT	2	6	84514	84519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360642
1589	NC_022241	ACA	2	6	84530	84535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360642
1590	NC_022241	GC	3	6	84545	84550	0 %	0 %	50 %	50 %	538360642
1591	NC_022241	TCCA	2	8	84565	84572	25 %	25 %	0 %	50 %	538360642
1592	NC_022241	CGG	2	6	84575	84580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360642
1593	NC_022241	CCG	2	6	84607	84612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360642
1594	NC_022241	TTC	2	6	84615	84620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360642
1595	NC_022241	CAG	2	6	84627	84632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360642
1596	NC_022241	TAA	2	6	84858	84863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360643
1597	NC_022241	GAA	2	6	84889	84894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360643
1598	NC_022241	TCC	2	6	84904	84909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360643
1599	NC_022241	CAG	2	6	84952	84957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360643
1600	NC_022241	GAT	2	6	84967	84972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360643
1601	NC_022241	GGC	2	6	85010	85015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360643
1602	NC_022241	GAA	2	6	85108	85113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360643
1603	NC_022241	TGG	2	6	85122	85127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360643
1604	NC_022241	GGC	2	6	85144	85149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360643
1605	NC_022241	GC	4	8	85166	85173	0 %	0 %	50 %	50 %	538360643
1606	NC_022241	CAG	3	9	85225	85233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360643
1607	NC_022241	TGC	2	6	85239	85244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360643
1608	NC_022241	GTACG	2	10	85311	85320	20 %	20 %	40 %	20 %	538360643
1609	NC_022241	CAC	2	6	85373	85378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360643
1610	NC_022241	GCC	2	6	85411	85416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360643
1611	NC_022241	AGT	2	6	85488	85493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360643
1612	NC_022241	CAG	2	6	85628	85633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360643
1613	NC_022241	ATG	3	9	85637	85645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360643
1614	NC_022241	CCA	2	6	85749	85754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360643
1615	NC_022241	CGA	2	6	85767	85772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360643
1616	NC_022241	AAC	2	6	85781	85786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360643
1617	NC_022241	CGA	2	6	85806	85811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360643
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1619	NC_022241	CGG	2	6	85984	85989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360643
1620	NC_022241	TAG	3	9	86000	86008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360643
1621	NC_022241	CAGAA	2	10	86024	86033	60 %	0 %	20 %	20 %	538360643
1622	NC_022241	AGG	2	6	86049	86054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360643
1623	NC_022241	CAT	2	6	86059	86064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360643
1624	NC_022241	CCAG	2	8	86136	86143	25 %	0 %	25 %	50 %	538360643
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1750	NC_022241	TGAAAC	2	12	92272	92283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538360651
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1864	NC_022241	CGA	2	6	99334	99339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360656
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1869	NC_022241	CAG	3	9	99819	99827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360657
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1871	NC_022241	GCG	2	6	99946	99951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360657
1872	NC_022241	TAA	2	6	100036	100041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360657
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1874	NC_022241	TTG	2	6	100323	100328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360657
1875	NC_022241	ACGC	2	8	100385	100392	25 %	0 %	25 %	50 %	538360657
1876	NC_022241	TAA	2	6	100505	100510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360657
1877	NC_022241	TCG	2	6	100521	100526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360657
1878	NC_022241	GCG	2	6	100679	100684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360658
1879	NC_022241	CGC	2	6	100697	100702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360658
1880	NC_022241	AACGT	2	10	100869	100878	40 %	20 %	20 %	20 %	538360658
1881	NC_022241	AC	3	6	100929	100934	50 %	0 %	0 %	50 %	538360658
1882	NC_022241	CG	3	6	101030	101035	0 %	0 %	50 %	50 %	538360659
1883	NC_022241	GGT	2	6	101132	101137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360659
1884	NC_022241	TTG	2	6	101179	101184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360659
1885	NC_022241	CAC	2	6	101201	101206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360659
1886	NC_022241	GCG	3	9	101224	101232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360659
1887	NC_022241	GGC	2	6	101244	101249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360659
1888	NC_022241	CTT	2	6	101347	101352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360659
1889	NC_022241	GCA	2	6	101356	101361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360659
1890	NC_022241	TAT	2	6	101425	101430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360659
1891	NC_022241	AC	3	6	101446	101451	50 %	0 %	0 %	50 %	538360659
1892	NC_022241	TCATGG	2	12	101491	101502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538360659
1893	NC_022241	CTG	2	6	101507	101512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360659
1894	NC_022241	CGC	2	6	101558	101563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360659
1895	NC_022241	GCC	2	6	101628	101633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360659
1896	NC_022241	ATT	2	6	101768	101773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360659
1897	NC_022241	TAA	2	6	101817	101822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360660
1898	NC_022241	CCGA	2	8	101923	101930	25 %	0 %	25 %	50 %	538360660
1899	NC_022241	CAG	2	6	102024	102029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360660
1900	NC_022241	TCG	2	6	102068	102073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360660
1901	NC_022241	ATG	2	6	102083	102088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360660
1902	NC_022241	TGCG	2	8	102127	102134	0 %	25 %	50 %	25 %	538360660
1903	NC_022241	TTC	2	6	102292	102297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360660
1904	NC_022241	CAT	2	6	102307	102312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360660
1905	NC_022241	T	6	6	102319	102324	0 %	100 %	0 %	0 %	538360660
1906	NC_022241	CGT	2	6	102378	102383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360660
1907	NC_022241	TAA	2	6	102384	102389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360660
1908	NC_022241	GCG	2	6	102561	102566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360660
1909	NC_022241	GGC	2	6	102619	102624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360660
1910	NC_022241	GC	3	6	102639	102644	0 %	0 %	50 %	50 %	538360660
1911	NC_022241	GAC	2	6	102655	102660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360660
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1913	NC_022241	ACA	2	6	102695	102700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360660
1914	NC_022241	CGG	2	6	102717	102722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360660
1915	NC_022241	AAC	2	6	102739	102744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360660
1916	NC_022241	GC	3	6	102793	102798	0 %	0 %	50 %	50 %	538360661
1917	NC_022241	CGC	2	6	102816	102821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360661
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1921	NC_022241	CCCAA	2	10	103019	103028	40 %	0 %	0 %	60 %	538360661
1922	NC_022241	CGC	2	6	103074	103079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360661
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1924	NC_022241	GC	3	6	103137	103142	0 %	0 %	50 %	50 %	538360661
1925	NC_022241	CTG	2	6	103143	103148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360661
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1927	NC_022241	CTG	2	6	103377	103382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360661
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1931	NC_022241	CGT	2	6	103541	103546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360661
1932	NC_022241	CTT	2	6	103580	103585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360661
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1941	NC_022241	ACG	2	6	103939	103944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360661
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1952	NC_022241	GCT	4	12	104534	104545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360662
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1965	NC_022241	TGC	2	6	105513	105518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360662
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1967	NC_022241	GCCT	2	8	105614	105621	0 %	25 %	25 %	50 %	538360662
1968	NC_022241	ATA	2	6	105651	105656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360662
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1975	NC_022241	GCT	2	6	105994	105999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360662
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1977	NC_022241	ATC	2	6	106121	106126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360662
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1980	NC_022241	TGA	2	6	106401	106406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360662
1981	NC_022241	TGG	2	6	106429	106434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360662
1982	NC_022241	AGA	2	6	106437	106442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360662
1983	NC_022241	T	6	6	106454	106459	0 %	100 %	0 %	0 %	538360662
1984	NC_022241	TGA	2	6	106756	106761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360663
1985	NC_022241	GCG	2	6	106765	106770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360663
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1987	NC_022241	T	6	6	106875	106880	0 %	100 %	0 %	0 %	538360663
1988	NC_022241	CCA	2	6	106882	106887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360663
1989	NC_022241	CAGT	2	8	106955	106962	25 %	25 %	25 %	25 %	538360663
1990	NC_022241	TGATC	2	10	107093	107102	20 %	40 %	20 %	20 %	538360663
1991	NC_022241	GGC	2	6	107129	107134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360663
1992	NC_022241	ATG	2	6	107235	107240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360663
1993	NC_022241	GCG	2	6	107245	107250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360663
1994	NC_022241	GGC	2	6	107259	107264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360663
1995	NC_022241	ATC	2	6	107269	107274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360663
1996	NC_022241	CGG	3	9	107282	107290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360663
1997	NC_022241	GCA	2	6	107294	107299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360663
1998	NC_022241	ACC	2	6	107352	107357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360663
1999	NC_022241	ACC	2	6	107367	107372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360663
2000	NC_022241	TGA	2	6	107395	107400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360663

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