MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022241	GCA	2	6	52368	52373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360612
1002	NC_022241	TGA	2	6	52411	52416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360612
1003	NC_022241	CAT	2	6	52424	52429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360612
1004	NC_022241	GCCC	2	8	53036	53043	0 %	0 %	25 %	75 %	538360613
1005	NC_022241	GCG	2	6	53086	53091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360613
1006	NC_022241	CGC	2	6	53121	53126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360613
1007	NC_022241	CTG	2	6	53163	53168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360613
1008	NC_022241	GAT	2	6	53205	53210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360613
1009	NC_022241	TTA	2	6	53247	53252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360613
1010	NC_022241	GGC	2	6	53310	53315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360613
1011	NC_022241	AGT	2	6	53325	53330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360613
1012	NC_022241	GGA	2	6	53354	53359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360613
1013	NC_022241	CTG	2	6	53382	53387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360613
1014	NC_022241	CGA	2	6	53426	53431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360613
1015	NC_022241	TGGC	2	8	53578	53585	0 %	25 %	50 %	25 %	538360613
1016	NC_022241	CAA	2	6	53592	53597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360613
1017	NC_022241	CTG	2	6	53610	53615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360613
1018	NC_022241	AGC	2	6	53680	53685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360613
1019	NC_022241	TGA	2	6	53699	53704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360613
1020	NC_022241	T	6	6	53748	53753	0 %	100 %	0 %	0 %	538360613
1021	NC_022241	TGA	2	6	53817	53822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1022	NC_022241	GCG	2	6	53871	53876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360614
1023	NC_022241	GAT	3	9	53918	53926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1024	NC_022241	CAT	2	6	53935	53940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360614
1025	NC_022241	A	6	6	53951	53956	100 %	0 %	0 %	0 %	538360614
1026	NC_022241	A	7	7	53960	53966	100 %	0 %	0 %	0 %	538360614
1027	NC_022241	ATG	2	6	53979	53984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1028	NC_022241	GCA	2	6	54003	54008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1029	NC_022241	CAT	2	6	54310	54315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360614
1030	NC_022241	CG	3	6	54317	54322	0 %	0 %	50 %	50 %	538360614
1031	NC_022241	GCGGAA	2	12	54404	54415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538360614
1032	NC_022241	ACC	2	6	54539	54544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360614
1033	NC_022241	CTG	2	6	54725	54730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1034	NC_022241	CTG	2	6	54974	54979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1035	NC_022241	GC	3	6	54990	54995	0 %	0 %	50 %	50 %	538360614
1036	NC_022241	A	6	6	55008	55013	100 %	0 %	0 %	0 %	538360614
1037	NC_022241	GCA	2	6	55015	55020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1038	NC_022241	CG	3	6	55064	55069	0 %	0 %	50 %	50 %	538360614
1039	NC_022241	AAG	2	6	55098	55103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360614
1040	NC_022241	GCT	2	6	55270	55275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1041	NC_022241	GGC	2	6	55294	55299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360614
1042	NC_022241	GTG	2	6	55345	55350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360614
1043	NC_022241	GTTTG	2	10	55421	55430	0 %	60 %	40 %	0 %	538360614
1044	NC_022241	CCA	2	6	55440	55445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360614
1045	NC_022241	TCC	2	6	55538	55543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360614
1046	NC_022241	TGA	2	6	55545	55550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1047	NC_022241	CGC	2	6	55659	55664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360614
1048	NC_022241	TGA	2	6	55671	55676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1049	NC_022241	TGC	2	6	55765	55770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1050	NC_022241	TCG	2	6	55780	55785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1051	NC_022241	CG	3	6	55798	55803	0 %	0 %	50 %	50 %	538360614
1052	NC_022241	CTG	2	6	55808	55813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1053	NC_022241	TGG	2	6	55866	55871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360614
1054	NC_022241	GCA	2	6	55909	55914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1055	NC_022241	CAT	2	6	56011	56016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360614
1056	NC_022241	CG	3	6	56053	56058	0 %	0 %	50 %	50 %	538360614
1057	NC_022241	TGA	2	6	56137	56142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1058	NC_022241	ACG	2	6	56199	56204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1059	NC_022241	GTT	2	6	56206	56211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360614
1060	NC_022241	GAA	2	6	56228	56233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360614
1061	NC_022241	CAA	2	6	56281	56286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360614
1062	NC_022241	AAG	2	6	56378	56383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360614
1063	NC_022241	G	6	6	56452	56457	0 %	0 %	100 %	0 %	538360614
1064	NC_022241	TGA	3	9	56461	56469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1065	NC_022241	GCT	2	6	56544	56549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360614
1066	NC_022241	CACTA	2	10	56552	56561	40 %	20 %	0 %	40 %	538360614
1067	NC_022241	AAC	2	6	56634	56639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360614
1068	NC_022241	TGA	2	6	56651	56656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360614
1069	NC_022241	GTA	2	6	56698	56703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360615
1070	NC_022241	GCA	2	6	56726	56731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360615
1071	NC_022241	TCC	2	6	56741	56746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360615
1072	NC_022241	GCG	2	6	56843	56848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360615
1073	NC_022241	TGA	2	6	56906	56911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360615
1074	NC_022241	ATC	2	6	56962	56967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360615
1075	NC_022241	GGC	2	6	56968	56973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360615
1076	NC_022241	GC	3	6	56972	56977	0 %	0 %	50 %	50 %	538360615
1077	NC_022241	TGT	2	6	57012	57017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360615
1078	NC_022241	CGGCG	2	10	57090	57099	0 %	0 %	60 %	40 %	538360615
1079	NC_022241	TTCAC	2	10	57345	57354	20 %	40 %	0 %	40 %	538360616
1080	NC_022241	GAT	2	6	57365	57370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360616
1081	NC_022241	CGG	2	6	57378	57383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360616
1082	NC_022241	AGCC	2	8	57405	57412	25 %	0 %	25 %	50 %	538360616
1083	NC_022241	AGC	3	9	57453	57461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360616
1084	NC_022241	AAG	2	6	57474	57479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360616
1085	NC_022241	AAAG	2	8	57484	57491	75 %	0 %	25 %	0 %	538360616
1086	NC_022241	CGC	2	6	57511	57516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360616
1087	NC_022241	GGC	2	6	57571	57576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360616
1088	NC_022241	ATGG	2	8	57617	57624	25 %	25 %	50 %	0 %	538360616
1089	NC_022241	TTG	2	6	57821	57826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360617
1090	NC_022241	GC	3	6	57848	57853	0 %	0 %	50 %	50 %	538360617
1091	NC_022241	TCT	2	6	57968	57973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360617
1092	NC_022241	GC	4	8	58078	58085	0 %	0 %	50 %	50 %	538360617
1093	NC_022241	GAA	2	6	58099	58104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360617
1094	NC_022241	G	6	6	58174	58179	0 %	0 %	100 %	0 %	538360617
1095	NC_022241	TGAT	2	8	58289	58296	25 %	50 %	25 %	0 %	538360617
1096	NC_022241	TCG	2	6	58322	58327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360617
1097	NC_022241	GTG	2	6	58405	58410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360617
1098	NC_022241	TGG	2	6	58412	58417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360617
1099	NC_022241	TCTAAC	2	12	58435	58446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360617
1100	NC_022241	GAA	2	6	58475	58480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360617
1101	NC_022241	CGA	2	6	58494	58499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360617
1102	NC_022241	GCG	2	6	58501	58506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360617
1103	NC_022241	AGG	2	6	58514	58519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360617
1104	NC_022241	GCC	2	6	58534	58539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360617
1105	NC_022241	CTG	2	6	58553	58558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360617
1106	NC_022241	GGC	3	9	58615	58623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360617
1107	NC_022241	GAA	2	6	58648	58653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360617
1108	NC_022241	AAAAT	2	10	58916	58925	80 %	20 %	0 %	0 %	538360618
1109	NC_022241	TGGA	2	8	58958	58965	25 %	25 %	50 %	0 %	538360618
1110	NC_022241	CAA	2	6	58968	58973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360618
1111	NC_022241	CCTG	2	8	58994	59001	0 %	25 %	25 %	50 %	538360618
1112	NC_022241	CT	3	6	59068	59073	0 %	50 %	0 %	50 %	538360618
1113	NC_022241	GAA	2	6	59162	59167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360618
1114	NC_022241	CAG	2	6	59209	59214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360618
1115	NC_022241	A	6	6	59246	59251	100 %	0 %	0 %	0 %	538360618
1116	NC_022241	CACGAA	2	12	59314	59325	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	538360618
1117	NC_022241	GATT	2	8	59356	59363	25 %	50 %	25 %	0 %	538360618
1118	NC_022241	G	6	6	59472	59477	0 %	0 %	100 %	0 %	538360618
1119	NC_022241	GCG	2	6	59664	59669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360618
1120	NC_022241	TGC	2	6	59672	59677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360618
1121	NC_022241	GGAAA	2	10	59703	59712	60 %	0 %	40 %	0 %	538360618
1122	NC_022241	GATC	2	8	59725	59732	25 %	25 %	25 %	25 %	538360618
1123	NC_022241	TAT	2	6	59815	59820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360618
1124	NC_022241	CGC	2	6	59853	59858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360618
1125	NC_022241	ATT	2	6	60146	60151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360619
1126	NC_022241	TGA	2	6	60172	60177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360619
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1128	NC_022241	C	6	6	60207	60212	0 %	0 %	0 %	100 %	538360619
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1133	NC_022241	TGA	2	6	60465	60470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360619
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1135	NC_022241	CTGC	2	8	60743	60750	0 %	25 %	25 %	50 %	538360619
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1146	NC_022241	TCA	2	6	61272	61277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360620
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1156	NC_022241	CGA	2	6	61820	61825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360620
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1160	NC_022241	AAT	2	6	61971	61976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360621
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1164	NC_022241	ATA	2	6	62172	62177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360621
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1241	NC_022241	ACC	2	6	66155	66160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360624
1242	NC_022241	CAT	2	6	66185	66190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360624
1243	NC_022241	CAG	2	6	66284	66289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360624
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1245	NC_022241	TTTC	2	8	66400	66407	0 %	75 %	0 %	25 %	538360624
1246	NC_022241	GCC	2	6	66467	66472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360624
1247	NC_022241	AT	3	6	66474	66479	50 %	50 %	0 %	0 %	538360624
1248	NC_022241	ACC	2	6	66548	66553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360624
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1250	NC_022241	TAA	2	6	66593	66598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360624
1251	NC_022241	TAAT	2	8	66601	66608	50 %	50 %	0 %	0 %	538360624
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1492	NC_022241	CGTC	2	8	79183	79190	0 %	25 %	25 %	50 %	538360638
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1496	NC_022241	CAG	2	6	79358	79363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360638
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1499	NC_022241	CT	3	6	79419	79424	0 %	50 %	0 %	50 %	538360638
1500	NC_022241	CATCC	2	10	79474	79483	20 %	20 %	0 %	60 %	538360638

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