MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022241	TAC	2	6	25611	25616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360589
502	NC_022241	A	6	6	25647	25652	100 %	0 %	0 %	0 %	538360589
503	NC_022241	CCG	2	6	25671	25676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360589
504	NC_022241	ACG	2	6	25746	25751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360589
505	NC_022241	ATG	2	6	25775	25780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360589
506	NC_022241	TCTG	2	8	25911	25918	0 %	50 %	25 %	25 %	538360590
507	NC_022241	GGC	2	6	25968	25973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
508	NC_022241	ACG	2	6	26050	26055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360590
509	NC_022241	GC	3	6	26063	26068	0 %	0 %	50 %	50 %	538360590
510	NC_022241	GCCT	2	8	26092	26099	0 %	25 %	25 %	50 %	538360590
511	NC_022241	GGC	3	9	26160	26168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
512	NC_022241	GCC	2	6	26203	26208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360590
513	NC_022241	GCA	2	6	26229	26234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360590
514	NC_022241	GGC	2	6	26259	26264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
515	NC_022241	GGC	2	6	26377	26382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
516	NC_022241	ACT	2	6	26450	26455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360590
517	NC_022241	GCG	2	6	26474	26479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
518	NC_022241	AGCGAC	2	12	26488	26499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360590
519	NC_022241	GCA	2	6	26502	26507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360590
520	NC_022241	ATT	2	6	26586	26591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360590
521	NC_022241	CCTT	2	8	26598	26605	0 %	50 %	0 %	50 %	538360590
522	NC_022241	GAC	2	6	26629	26634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360590
523	NC_022241	CAT	2	6	26727	26732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360590
524	NC_022241	GCC	2	6	26748	26753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360590
525	NC_022241	CCG	2	6	26786	26791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360590
526	NC_022241	GCG	2	6	26795	26800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
527	NC_022241	CCG	2	6	26861	26866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360590
528	NC_022241	GGC	2	6	26888	26893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
529	NC_022241	GCG	2	6	26902	26907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
530	NC_022241	TAG	2	6	26931	26936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360590
531	NC_022241	TCAG	2	8	26957	26964	25 %	25 %	25 %	25 %	538360590
532	NC_022241	GCG	2	6	27053	27058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
533	NC_022241	ATA	2	6	27122	27127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360590
534	NC_022241	GAT	2	6	27241	27246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360590
535	NC_022241	ATT	2	6	27323	27328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360590
536	NC_022241	TAT	2	6	27337	27342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360590
537	NC_022241	AGG	2	6	27346	27351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538360590
538	NC_022241	TTA	2	6	27404	27409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360590
539	NC_022241	TGA	2	6	27438	27443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360590
540	NC_022241	TTG	2	6	27454	27459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360590
541	NC_022241	ACA	2	6	27509	27514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360590
542	NC_022241	GAT	2	6	27598	27603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360590
543	NC_022241	CTG	2	6	27697	27702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360590
544	NC_022241	ACA	2	6	27722	27727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360590
545	NC_022241	GCG	2	6	27764	27769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
546	NC_022241	CAG	2	6	27844	27849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360590
547	NC_022241	GCG	2	6	27866	27871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360590
548	NC_022241	TGG	2	6	27875	27880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360590
549	NC_022241	AGCC	2	8	27904	27911	25 %	0 %	25 %	50 %	538360590
550	NC_022241	CG	3	6	27993	27998	0 %	0 %	50 %	50 %	538360590
551	NC_022241	GGT	2	6	28008	28013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360590
552	NC_022241	ACA	2	6	28024	28029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360590
553	NC_022241	TGA	2	6	28071	28076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360590
554	NC_022241	TGA	2	6	28086	28091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360590
555	NC_022241	CCGA	2	8	28111	28118	25 %	0 %	25 %	50 %	538360590
556	NC_022241	GC	3	6	28121	28126	0 %	0 %	50 %	50 %	538360590
557	NC_022241	GC	3	6	28157	28162	0 %	0 %	50 %	50 %	538360590
558	NC_022241	ACGGTG	2	12	28213	28224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538360590
559	NC_022241	TTG	2	6	28247	28252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360590
560	NC_022241	GT	3	6	28335	28340	0 %	50 %	50 %	0 %	538360590
561	NC_022241	ATC	2	6	28349	28354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360590
562	NC_022241	TC	3	6	28353	28358	0 %	50 %	0 %	50 %	538360590
563	NC_022241	TCC	2	6	28360	28365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360590
564	NC_022241	ACA	2	6	28383	28388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360590
565	NC_022241	CTG	2	6	28429	28434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360591
566	NC_022241	GT	3	6	28471	28476	0 %	50 %	50 %	0 %	538360591
567	NC_022241	ATTA	2	8	28504	28511	50 %	50 %	0 %	0 %	538360591
568	NC_022241	A	6	6	28571	28576	100 %	0 %	0 %	0 %	538360591
569	NC_022241	GT	3	6	28600	28605	0 %	50 %	50 %	0 %	538360591
570	NC_022241	CGGCG	2	10	28611	28620	0 %	0 %	60 %	40 %	538360591
571	NC_022241	TTC	2	6	28740	28745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360591
572	NC_022241	GGCG	2	8	28746	28753	0 %	0 %	75 %	25 %	538360591
573	NC_022241	AAC	2	6	28771	28776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360591
574	NC_022241	ATG	2	6	28790	28795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360591
575	NC_022241	TCG	2	6	28871	28876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360591
576	NC_022241	CCG	2	6	28925	28930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360591
577	NC_022241	A	6	6	29098	29103	100 %	0 %	0 %	0 %	538360591
578	NC_022241	ATG	2	6	29264	29269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360591
579	NC_022241	ACA	2	6	29344	29349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360591
580	NC_022241	GAC	2	6	29482	29487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360592
581	NC_022241	AAC	2	6	29610	29615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360592
582	NC_022241	TGGGGT	2	12	29769	29780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360592
583	NC_022241	ATG	2	6	29792	29797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360592
584	NC_022241	AAT	2	6	29818	29823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360592
585	NC_022241	CGG	2	6	29924	29929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360592
586	NC_022241	ATGA	2	8	29951	29958	50 %	25 %	25 %	0 %	538360592
587	NC_022241	TGC	2	6	30005	30010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360593
588	NC_022241	GGC	2	6	30012	30017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360593
589	NC_022241	CT	3	6	30085	30090	0 %	50 %	0 %	50 %	538360593
590	NC_022241	CG	3	6	30148	30153	0 %	0 %	50 %	50 %	538360593
591	NC_022241	GCA	2	6	30203	30208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360593
592	NC_022241	GCG	2	6	30215	30220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360593
593	NC_022241	GCG	2	6	30241	30246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360593
594	NC_022241	CG	3	6	30411	30416	0 %	0 %	50 %	50 %	538360593
595	NC_022241	GGC	2	6	30430	30435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360593
596	NC_022241	GC	3	6	30743	30748	0 %	0 %	50 %	50 %	538360594
597	NC_022241	CCG	2	6	30792	30797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360594
598	NC_022241	CGC	2	6	30826	30831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360594
599	NC_022241	TTCG	2	8	30876	30883	0 %	50 %	25 %	25 %	538360594
600	NC_022241	GCA	2	6	30928	30933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360594
601	NC_022241	ATCTG	2	10	30945	30954	20 %	40 %	20 %	20 %	538360594
602	NC_022241	TTACG	2	10	31000	31009	20 %	40 %	20 %	20 %	538360594
603	NC_022241	TTA	2	6	31016	31021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360594
604	NC_022241	GC	3	6	31033	31038	0 %	0 %	50 %	50 %	538360594
605	NC_022241	TAT	2	6	31250	31255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360595
606	NC_022241	TAT	2	6	31257	31262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360595
607	NC_022241	CGC	2	6	31331	31336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360595
608	NC_022241	CGG	2	6	31369	31374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360595
609	NC_022241	GTCA	2	8	31386	31393	25 %	25 %	25 %	25 %	538360595
610	NC_022241	CGC	2	6	31454	31459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360595
611	NC_022241	CAG	2	6	31482	31487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360595
612	NC_022241	CAA	2	6	31494	31499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360595
613	NC_022241	AGC	2	6	31548	31553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360595
614	NC_022241	GCG	2	6	31584	31589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360595
615	NC_022241	GTG	2	6	31590	31595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360595
616	NC_022241	GTG	2	6	31619	31624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360595
617	NC_022241	T	6	6	31702	31707	0 %	100 %	0 %	0 %	538360595
618	NC_022241	GGC	2	6	31733	31738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360595
619	NC_022241	GGGCG	2	10	31769	31778	0 %	0 %	80 %	20 %	538360595
620	NC_022241	GCC	2	6	31890	31895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360595
621	NC_022241	AAG	2	6	31900	31905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360595
622	NC_022241	AGC	2	6	31911	31916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360595
623	NC_022241	ATG	2	6	31927	31932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360595
624	NC_022241	CTC	2	6	31935	31940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538360595
625	NC_022241	GCA	2	6	31958	31963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360595
626	NC_022241	GTC	2	6	31992	31997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360595
627	NC_022241	TGCGT	2	10	32148	32157	0 %	40 %	40 %	20 %	538360596
628	NC_022241	ACCG	2	8	32206	32213	25 %	0 %	25 %	50 %	538360596
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745	NC_022241	CAA	2	6	37301	37306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360602
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750	NC_022241	GAAG	2	8	37530	37537	50 %	0 %	50 %	0 %	538360602
751	NC_022241	ACC	2	6	37639	37644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360602
752	NC_022241	T	6	6	37761	37766	0 %	100 %	0 %	0 %	538360602
753	NC_022241	GC	3	6	37946	37951	0 %	0 %	50 %	50 %	538360602
754	NC_022241	AGC	2	6	38008	38013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360602
755	NC_022241	GGTCA	2	10	38016	38025	20 %	20 %	40 %	20 %	538360602
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