MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 2471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	537435371
2	NC_022221	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	537435372
3	NC_022221	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	537435373
4	NC_022221	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	537435375
5	NC_022221	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	537435382
6	NC_022221	GGCTG	2	10	18853	18862	0 %	20 %	60 %	20 %	537435388
7	NC_022221	AGAGC	2	10	19374	19383	40 %	0 %	40 %	20 %	537435388
8	NC_022221	CCTGA	2	10	19915	19924	20 %	20 %	20 %	40 %	537435388
9	NC_022221	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	537435389
10	NC_022221	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	537435390
11	NC_022221	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	537435390
12	NC_022221	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	537435391
13	NC_022221	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	537435396
14	NC_022221	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	537435396
15	NC_022221	GGGCG	2	10	31788	31797	0 %	0 %	80 %	20 %	537435397
16	NC_022221	TGCGT	2	10	32167	32176	0 %	40 %	40 %	20 %	537435398
17	NC_022221	AAAAG	2	10	32561	32570	80 %	0 %	20 %	0 %	537435399
18	NC_022221	TATAA	2	10	34164	34173	60 %	40 %	0 %	0 %	537435400
19	NC_022221	ATCGT	2	10	34917	34926	20 %	40 %	20 %	20 %	537435402
20	NC_022221	ATTTT	2	10	34961	34970	20 %	80 %	0 %	0 %	537435402
21	NC_022221	AGCGA	2	10	35590	35599	40 %	0 %	40 %	20 %	537435403
22	NC_022221	TCCTG	2	10	35800	35809	0 %	40 %	20 %	40 %	537435403
23	NC_022221	GGTCA	2	10	38035	38044	20 %	20 %	40 %	20 %	537435404
24	NC_022221	TTCAT	2	10	39307	39316	20 %	60 %	0 %	20 %	537435405
25	NC_022221	TGAAA	2	10	40123	40132	60 %	20 %	20 %	0 %	537435406
26	NC_022221	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	537435409
27	NC_022221	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	537435411
28	NC_022221	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	537435411
29	NC_022221	CCGGC	2	10	49180	49189	0 %	0 %	40 %	60 %	537435411
30	NC_022221	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	537435411
31	NC_022221	TGTGC	2	10	53130	53139	0 %	40 %	40 %	20 %	537435414
32	NC_022221	GTTTG	2	10	55452	55461	0 %	60 %	40 %	0 %	537435415
33	NC_022221	CACTA	2	10	56583	56592	40 %	20 %	0 %	40 %	537435415
34	NC_022221	CGGCG	2	10	57121	57130	0 %	0 %	60 %	40 %	537435416
35	NC_022221	TTCAC	2	10	57376	57385	20 %	40 %	0 %	40 %	537435417
36	NC_022221	AAAAT	2	10	58947	58956	80 %	20 %	0 %	0 %	537435419
37	NC_022221	GGAAA	2	10	59734	59743	60 %	0 %	40 %	0 %	537435420
38	NC_022221	CGCTG	2	10	60224	60233	0 %	20 %	40 %	40 %	537435421
39	NC_022221	CGGCG	2	10	63990	63999	0 %	0 %	60 %	40 %	537435424
40	NC_022221	GCCTG	2	10	64783	64792	0 %	20 %	40 %	40 %	537435424
41	NC_022221	GCGCG	2	10	64937	64946	0 %	0 %	60 %	40 %	537435425
42	NC_022221	CGTGC	2	10	71278	71287	0 %	20 %	40 %	40 %	537435430
43	NC_022221	TTGAT	2	10	71448	71457	20 %	60 %	20 %	0 %	537435430
44	NC_022221	ACCGC	2	10	72008	72017	20 %	0 %	20 %	60 %	537435430
45	NC_022221	CGATG	2	10	77490	77499	20 %	20 %	40 %	20 %	537435437
46	NC_022221	GCGAA	2	10	78431	78440	40 %	0 %	40 %	20 %	537435437
47	NC_022221	CGTAC	2	10	79321	79330	20 %	20 %	20 %	40 %	537435437
48	NC_022221	TTGCC	2	10	80957	80966	0 %	40 %	20 %	40 %	537435439
49	NC_022221	CGTCC	2	10	81067	81076	0 %	20 %	20 %	60 %	537435439
50	NC_022221	TCAGC	2	10	84186	84195	20 %	20 %	20 %	40 %	537435442
51	NC_022221	GGCCA	2	10	84334	84343	20 %	0 %	40 %	40 %	537435442
52	NC_022221	GTACG	2	10	86905	86914	20 %	20 %	40 %	20 %	537435444
53	NC_022221	CAGAA	2	10	87618	87627	60 %	0 %	20 %	20 %	537435444
54	NC_022221	CCGCA	2	10	89737	89746	20 %	0 %	20 %	60 %	537435447
55	NC_022221	CGGTT	2	10	90242	90251	0 %	40 %	40 %	20 %	537435448
56	NC_022221	GCTCC	2	10	91378	91387	0 %	20 %	20 %	60 %	537435448
57	NC_022221	TGGCG	2	10	92022	92031	0 %	20 %	60 %	20 %	537435450
58	NC_022221	TGCAC	2	10	98420	98429	20 %	20 %	20 %	40 %	537435454
59	NC_022221	TGGCA	2	10	98489	98498	20 %	20 %	40 %	20 %	537435454
60	NC_022221	TCTGT	2	10	98815	98824	0 %	60 %	20 %	20 %	537435455
61	NC_022221	GCGCT	2	10	99125	99134	0 %	20 %	40 %	40 %	537435455
62	NC_022221	GGCGC	2	10	99539	99548	0 %	0 %	60 %	40 %	537435455
63	NC_022221	AACGT	2	10	102321	102330	40 %	20 %	20 %	20 %	537435458
64	NC_022221	CCCAA	2	10	104471	104480	40 %	0 %	0 %	60 %	537435461
65	NC_022221	TTGTT	2	10	105178	105187	0 %	80 %	20 %	0 %	537435461
66	NC_022221	GCTTC	2	10	106558	106567	0 %	40 %	20 %	40 %	537435462
67	NC_022221	TGCGT	2	10	106845	106854	0 %	40 %	40 %	20 %	537435462
68	NC_022221	TGATC	2	10	108545	108554	20 %	40 %	20 %	20 %	537435464
69	NC_022221	TGGCG	2	10	111705	111714	0 %	20 %	60 %	20 %	537435466
70	NC_022221	AGCGC	2	10	112265	112274	20 %	0 %	40 %	40 %	537435466
71	NC_022221	ACGTT	2	10	113082	113091	20 %	40 %	20 %	20 %	537435467
72	NC_022221	CCGCG	2	10	113350	113359	0 %	0 %	40 %	60 %	537435467
73	NC_022221	GGGGT	2	10	114746	114755	0 %	20 %	80 %	0 %	537435467
74	NC_022221	ACAGA	2	10	116476	116485	60 %	0 %	20 %	20 %	537435469
75	NC_022221	CAGCG	2	10	117651	117660	20 %	0 %	40 %	40 %	537435471
76	NC_022221	GCCGG	2	10	117951	117960	0 %	0 %	60 %	40 %	537435471
77	NC_022221	CGAGC	2	10	118076	118085	20 %	0 %	40 %	40 %	537435471
78	NC_022221	ATTTG	2	10	118519	118528	20 %	60 %	20 %	0 %	537435471
79	NC_022221	TTGCC	2	10	123022	123031	0 %	40 %	20 %	40 %	537435475
80	NC_022221	AGCAG	2	10	123699	123708	40 %	0 %	40 %	20 %	537435476
81	NC_022221	AGTTT	2	10	125929	125938	20 %	60 %	20 %	0 %	537435477
82	NC_022221	TAGTG	2	10	126347	126356	20 %	40 %	40 %	0 %	537435478
83	NC_022221	TCGAT	2	10	127777	127786	20 %	40 %	20 %	20 %	537435479
84	NC_022221	CGGCG	2	10	130406	130415	0 %	0 %	60 %	40 %	537435483
85	NC_022221	CGTTT	2	10	130868	130877	0 %	60 %	20 %	20 %	537435483
86	NC_022221	ATTGG	2	10	131132	131141	20 %	40 %	40 %	0 %	537435484
87	NC_022221	AAAGC	2	10	138265	138274	60 %	0 %	20 %	20 %	537435488
88	NC_022221	CCGCA	2	10	138798	138807	20 %	0 %	20 %	60 %	537435488
89	NC_022221	AGTTC	2	10	141169	141178	20 %	40 %	20 %	20 %	537435490
90	NC_022221	AAGCG	2	10	145922	145931	40 %	0 %	40 %	20 %	537435494
91	NC_022221	GTTTG	2	10	147825	147834	0 %	60 %	40 %	0 %	537435496
92	NC_022221	CGTAT	2	10	149296	149305	20 %	40 %	20 %	20 %	537435497
93	NC_022221	ATCAG	2	10	151132	151141	40 %	20 %	20 %	20 %	537435499
94	NC_022221	CGGCG	2	10	155871	155880	0 %	0 %	60 %	40 %	537435502
95	NC_022221	CCGGC	2	10	159225	159234	0 %	0 %	40 %	60 %	537435505
96	NC_022221	CGCTG	2	10	160117	160126	0 %	20 %	40 %	40 %	537435505
97	NC_022221	GATCA	2	10	164268	164277	40 %	20 %	20 %	20 %	537435510
98	NC_022221	CGTCA	2	10	165014	165023	20 %	20 %	20 %	40 %	537435511
99	NC_022221	ATCCC	2	10	166714	166723	20 %	20 %	0 %	60 %	537435513
100	NC_022221	AGCGC	2	10	167422	167431	20 %	0 %	40 %	40 %	537435513
101	NC_022221	TGAGC	2	10	169271	169280	20 %	20 %	40 %	20 %	537435514
102	NC_022221	CGCAT	2	10	169533	169542	20 %	20 %	20 %	40 %	537435515
103	NC_022221	CGAAC	2	10	170262	170271	40 %	0 %	20 %	40 %	537435516
104	NC_022221	GTTCA	2	10	170528	170537	20 %	40 %	20 %	20 %	537435516
105	NC_022221	ATGAC	2	10	171494	171503	40 %	20 %	20 %	20 %	537435517
106	NC_022221	CTGGA	2	10	172084	172093	20 %	20 %	40 %	20 %	537435518
107	NC_022221	CAGAA	2	10	174203	174212	60 %	0 %	20 %	20 %	537435520
108	NC_022221	CGAAG	2	10	177074	177083	40 %	0 %	40 %	20 %	537435524
109	NC_022221	GACTG	2	10	178875	178884	20 %	20 %	40 %	20 %	537435525
110	NC_022221	AGCAA	2	10	179287	179296	60 %	0 %	20 %	20 %	537435525
111	NC_022221	GGCAT	2	10	184349	184358	20 %	20 %	40 %	20 %	537435529
112	NC_022221	GGCCA	2	10	184771	184780	20 %	0 %	40 %	40 %	537435530
113	NC_022221	GCGCC	2	10	184784	184793	0 %	0 %	40 %	60 %	537435530
114	NC_022221	CGTTT	2	10	185286	185295	0 %	60 %	20 %	20 %	537435530
115	NC_022221	GGGGA	2	10	185338	185347	20 %	0 %	80 %	0 %	537435530
116	NC_022221	CTGGT	2	10	188973	188982	0 %	40 %	40 %	20 %	537435531
117	NC_022221	CGGCG	2	10	192282	192291	0 %	0 %	60 %	40 %	537435537
118	NC_022221	CCGCT	2	10	192989	192998	0 %	20 %	20 %	60 %	537435537
119	NC_022221	GCCCA	2	10	195541	195550	20 %	0 %	20 %	60 %	537435540
120	NC_022221	GCGCA	2	10	195946	195955	20 %	0 %	40 %	40 %	537435540
121	NC_022221	ATCGG	2	10	197337	197346	20 %	20 %	40 %	20 %	537435542
122	NC_022221	GCCGC	2	10	198547	198556	0 %	0 %	40 %	60 %	537435544
123	NC_022221	ATCCA	2	10	203897	203906	40 %	20 %	0 %	40 %	537435547
124	NC_022221	CGGCG	2	10	206017	206026	0 %	0 %	60 %	40 %	537435550
125	NC_022221	TGGTC	2	10	206883	206892	0 %	40 %	40 %	20 %	537435550
126	NC_022221	GTGTT	2	10	209916	209925	0 %	60 %	40 %	0 %	537435551
127	NC_022221	CGGCG	2	10	211446	211455	0 %	0 %	60 %	40 %	537435553
128	NC_022221	TTCGG	2	10	212326	212335	0 %	40 %	40 %	20 %	537435554
129	NC_022221	CTTGC	2	10	213335	213344	0 %	40 %	20 %	40 %	537435555
130	NC_022221	TGAGC	2	10	213747	213756	20 %	20 %	40 %	20 %	537435556
131	NC_022221	CGGCA	2	10	214832	214841	20 %	0 %	40 %	40 %	537435557
132	NC_022221	GCACG	2	10	215011	215020	20 %	0 %	40 %	40 %	537435557
133	NC_022221	AGATC	2	10	215416	215425	40 %	20 %	20 %	20 %	537435558
134	NC_022221	CGCGG	2	10	215838	215847	0 %	0 %	60 %	40 %	537435559
135	NC_022221	CGCGG	2	10	216022	216031	0 %	0 %	60 %	40 %	537435559
136	NC_022221	GCCAG	2	10	218006	218015	20 %	0 %	40 %	40 %	537435560
137	NC_022221	GCGCG	2	10	218572	218581	0 %	0 %	60 %	40 %	537435561
138	NC_022221	CGGGG	2	10	220390	220399	0 %	0 %	80 %	20 %	537435564
139	NC_022221	GCGAA	2	10	222486	222495	40 %	0 %	40 %	20 %	537435564
140	NC_022221	CAGCG	2	10	222549	222558	20 %	0 %	40 %	40 %	537435564
141	NC_022221	GGCGG	2	10	224299	224308	0 %	0 %	80 %	20 %	537435565
142	NC_022221	GTTGA	2	10	226145	226154	20 %	40 %	40 %	0 %	537435567
143	NC_022221	TTCAA	2	10	226251	226260	40 %	40 %	0 %	20 %	537435567
144	NC_022221	GGAAT	2	10	227005	227014	40 %	20 %	40 %	0 %	537435567
145	NC_022221	GCAGC	2	10	227664	227673	20 %	0 %	40 %	40 %	537435567
146	NC_022221	TGGCG	2	10	228867	228876	0 %	20 %	60 %	20 %	537435569
147	NC_022221	TGGTC	2	10	228995	229004	0 %	40 %	40 %	20 %	537435569
148	NC_022221	GGCGT	2	10	230058	230067	0 %	20 %	60 %	20 %	537435570
149	NC_022221	CTGTC	2	10	231771	231780	0 %	40 %	20 %	40 %	537435571
150	NC_022221	TCACC	2	10	236109	236118	20 %	20 %	0 %	60 %	537435573
151	NC_022221	GCCGC	2	10	236792	236801	0 %	0 %	40 %	60 %	537435574
152	NC_022221	CAGGT	2	10	239634	239643	20 %	20 %	40 %	20 %	537435576
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154	NC_022221	TGCTT	2	10	241621	241630	0 %	60 %	20 %	20 %	537435578
155	NC_022221	CGGCG	2	10	251988	251997	0 %	0 %	60 %	40 %	537435587
156	NC_022221	TTCGG	2	10	254541	254550	0 %	40 %	40 %	20 %	537435588
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162	NC_022221	TACGG	2	10	265828	265837	20 %	20 %	40 %	20 %	537435599
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165	NC_022221	ATGCC	2	10	270234	270243	20 %	20 %	20 %	40 %	537435604
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177	NC_022221	CTATG	2	10	298179	298188	20 %	40 %	20 %	20 %	537435626
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185	NC_022221	CGCCC	2	10	304614	304623	0 %	0 %	20 %	80 %	537435631
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242	NC_022221	TGCGC	2	10	382577	382586	0 %	20 %	40 %	40 %	537435702
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244	NC_022221	TTGTT	2	10	389149	389158	0 %	80 %	20 %	0 %	537435709
245	NC_022221	ACCGA	2	10	391238	391247	40 %	0 %	20 %	40 %	537435711
246	NC_022221	ACGGT	2	10	391284	391293	20 %	20 %	40 %	20 %	537435711
247	NC_022221	GCGCC	2	10	395873	395882	0 %	0 %	40 %	60 %	537435716
248	NC_022221	AGCAC	2	10	398104	398113	40 %	0 %	20 %	40 %	537435717
249	NC_022221	CGATG	2	10	400058	400067	20 %	20 %	40 %	20 %	537435717
250	NC_022221	AACGA	2	10	401595	401604	60 %	0 %	20 %	20 %	537435717
251	NC_022221	CCAAA	2	10	409927	409936	60 %	0 %	0 %	40 %	537435718
252	NC_022221	GGCGC	2	10	410116	410125	0 %	0 %	60 %	40 %	537435718
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254	NC_022221	GCGCC	2	10	416591	416600	0 %	0 %	40 %	60 %	537435719
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256	NC_022221	GCATC	2	10	418764	418773	20 %	20 %	20 %	40 %	537435721
257	NC_022221	GGGCC	2	10	419956	419965	0 %	0 %	60 %	40 %	537435721
258	NC_022221	TCCGT	2	10	420104	420113	0 %	40 %	20 %	40 %	537435721
259	NC_022221	ACGTA	2	10	425989	425998	40 %	20 %	20 %	20 %	537435725
260	NC_022221	TGAGA	2	10	427013	427022	40 %	20 %	40 %	0 %	537435726
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262	NC_022221	CTTCG	2	10	429094	429103	0 %	40 %	20 %	40 %	537435727
263	NC_022221	CGGAG	2	10	429270	429279	20 %	0 %	60 %	20 %	537435728
264	NC_022221	GGTAC	2	10	429312	429321	20 %	20 %	40 %	20 %	537435728
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500	NC_022221	CCGCG	2	10	887891	887900	0 %	0 %	40 %	60 %	537436141

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