MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 8513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	537435371
2	NC_022221	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	537435371
3	NC_022221	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	537435372
4	NC_022221	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	537435373
5	NC_022221	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	537435373
6	NC_022221	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	537435373
7	NC_022221	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	537435373
8	NC_022221	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	537435373
9	NC_022221	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	537435375
10	NC_022221	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	537435375
11	NC_022221	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	537435376
12	NC_022221	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	537435376
13	NC_022221	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	537435378
14	NC_022221	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	537435379
15	NC_022221	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	537435380
16	NC_022221	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	537435380
17	NC_022221	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	537435381
18	NC_022221	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	537435381
19	NC_022221	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	537435381
20	NC_022221	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	537435381
21	NC_022221	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	537435381
22	NC_022221	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	537435381
23	NC_022221	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	537435382
24	NC_022221	TCAG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	537435384
25	NC_022221	TTTG	2	8	15535	15542	0 %	75 %	25 %	0 %	537435384
26	NC_022221	CGAA	2	8	15750	15757	50 %	0 %	25 %	25 %	537435384
27	NC_022221	ATTG	2	8	15762	15769	25 %	50 %	25 %	0 %	537435384
28	NC_022221	ATTA	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	537435385
29	NC_022221	ATAA	2	8	16522	16529	75 %	25 %	0 %	0 %	537435386
30	NC_022221	AATA	2	8	17998	18005	75 %	25 %	0 %	0 %	537435388
31	NC_022221	GGGC	2	8	18584	18591	0 %	0 %	75 %	25 %	537435388
32	NC_022221	CGTG	2	8	19284	19291	0 %	25 %	50 %	25 %	537435388
33	NC_022221	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	537435389
34	NC_022221	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	537435389
35	NC_022221	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	537435390
36	NC_022221	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	537435390
37	NC_022221	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	537435391
38	NC_022221	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	537435391
39	NC_022221	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	537435392
40	NC_022221	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	537435392
41	NC_022221	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	537435392
42	NC_022221	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	537435392
43	NC_022221	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	537435392
44	NC_022221	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
45	NC_022221	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
46	NC_022221	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
47	NC_022221	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	537435393
48	NC_022221	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	537435393
49	NC_022221	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	537435394
50	NC_022221	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	537435396
51	NC_022221	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	537435396
52	NC_022221	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	537435396
53	NC_022221	GTCA	2	8	31405	31412	25 %	25 %	25 %	25 %	537435397
54	NC_022221	ACCG	2	8	32225	32232	25 %	0 %	25 %	50 %	537435398
55	NC_022221	AGGC	2	8	32263	32270	25 %	0 %	50 %	25 %	537435398
56	NC_022221	CCTG	2	8	32699	32706	0 %	25 %	25 %	50 %	537435399
57	NC_022221	AACA	2	8	32715	32722	75 %	0 %	0 %	25 %	537435399
58	NC_022221	CGCA	2	8	32889	32896	25 %	0 %	25 %	50 %	537435399
59	NC_022221	TAAA	2	8	32959	32966	75 %	25 %	0 %	0 %	537435399
60	NC_022221	TTAT	2	8	33528	33535	25 %	75 %	0 %	0 %	537435400
61	NC_022221	TTGG	2	8	33912	33919	0 %	50 %	50 %	0 %	537435400
62	NC_022221	CTTT	2	8	34292	34299	0 %	75 %	0 %	25 %	537435400
63	NC_022221	GAAG	2	8	34332	34339	50 %	0 %	50 %	0 %	537435400
64	NC_022221	ATAA	2	8	34663	34670	75 %	25 %	0 %	0 %	537435401
65	NC_022221	GTGC	2	8	34786	34793	0 %	25 %	50 %	25 %	537435401
66	NC_022221	TTAA	2	8	34796	34803	50 %	50 %	0 %	0 %	537435401
67	NC_022221	TGGA	2	8	35548	35555	25 %	25 %	50 %	0 %	537435403
68	NC_022221	GGGA	2	8	36492	36499	25 %	0 %	75 %	0 %	537435403
69	NC_022221	ATAC	2	8	37477	37484	50 %	25 %	0 %	25 %	537435404
70	NC_022221	GAAG	2	8	37549	37556	50 %	0 %	50 %	0 %	537435404
71	NC_022221	CACG	2	8	38112	38119	25 %	0 %	25 %	50 %	537435404
72	NC_022221	TAAT	2	8	38214	38221	50 %	50 %	0 %	0 %	537435404
73	NC_022221	CCAT	2	8	38670	38677	25 %	25 %	0 %	50 %	537435404
74	NC_022221	GCGG	2	8	40535	40542	0 %	0 %	75 %	25 %	537435406
75	NC_022221	CTGG	2	8	40753	40760	0 %	25 %	50 %	25 %	537435406
76	NC_022221	CCGA	2	8	41270	41277	25 %	0 %	25 %	50 %	537435406
77	NC_022221	ATCG	2	8	41426	41433	25 %	25 %	25 %	25 %	537435406
78	NC_022221	TCAA	2	8	41487	41494	50 %	25 %	0 %	25 %	537435406
79	NC_022221	AACC	2	8	41753	41760	50 %	0 %	0 %	50 %	537435407
80	NC_022221	GAAA	2	8	41805	41812	75 %	0 %	25 %	0 %	537435407
81	NC_022221	GGTC	2	8	42377	42384	0 %	25 %	50 %	25 %	537435407
82	NC_022221	TTTG	2	8	42901	42908	0 %	75 %	25 %	0 %	537435407
83	NC_022221	GTAT	2	8	43196	43203	25 %	50 %	25 %	0 %	537435408
84	NC_022221	TCCG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	25 %	50 %	537435408
85	NC_022221	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	537435409
86	NC_022221	TCGC	2	8	46917	46924	0 %	25 %	25 %	50 %	537435409
87	NC_022221	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	537435409
88	NC_022221	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	537435410
89	NC_022221	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	537435410
90	NC_022221	CTGC	2	8	47970	47977	0 %	25 %	25 %	50 %	537435410
91	NC_022221	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	537435411
92	NC_022221	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	537435411
93	NC_022221	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	537435411
94	NC_022221	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	537435411
95	NC_022221	GCCC	2	8	53067	53074	0 %	0 %	25 %	75 %	537435414
96	NC_022221	TGGC	2	8	53609	53616	0 %	25 %	50 %	25 %	537435414
97	NC_022221	AGCC	2	8	57436	57443	25 %	0 %	25 %	50 %	537435417
98	NC_022221	AAAG	2	8	57515	57522	75 %	0 %	25 %	0 %	537435417
99	NC_022221	ATGG	2	8	57648	57655	25 %	25 %	50 %	0 %	537435417
100	NC_022221	TGAT	2	8	58320	58327	25 %	50 %	25 %	0 %	537435418
101	NC_022221	TGGA	2	8	58989	58996	25 %	25 %	50 %	0 %	537435419
102	NC_022221	GATT	2	8	59387	59394	25 %	50 %	25 %	0 %	537435420
103	NC_022221	GATC	2	8	59756	59763	25 %	25 %	25 %	25 %	537435420
104	NC_022221	CTGG	2	8	60881	60888	0 %	25 %	50 %	25 %	537435421
105	NC_022221	GTGG	2	8	61046	61053	0 %	25 %	75 %	0 %	537435421
106	NC_022221	CTGC	2	8	61256	61263	0 %	25 %	25 %	50 %	537435422
107	NC_022221	ACCA	2	8	61892	61899	50 %	0 %	0 %	50 %	537435423
108	NC_022221	CATT	2	8	62117	62124	25 %	50 %	0 %	25 %	537435423
109	NC_022221	TCAA	2	8	63158	63165	50 %	25 %	0 %	25 %	537435423
110	NC_022221	GCCA	2	8	64744	64751	25 %	0 %	25 %	50 %	537435424
111	NC_022221	GCTG	2	8	65126	65133	0 %	25 %	50 %	25 %	537435425
112	NC_022221	ACGT	2	8	66033	66040	25 %	25 %	25 %	25 %	537435425
113	NC_022221	CCAG	2	8	66158	66165	25 %	0 %	25 %	50 %	537435425
114	NC_022221	TTCA	2	8	66874	66881	25 %	50 %	0 %	25 %	537435426
115	NC_022221	GAAG	2	8	67626	67633	50 %	0 %	50 %	0 %	537435427
116	NC_022221	CAGA	2	8	67799	67806	50 %	0 %	25 %	25 %	537435427
117	NC_022221	TTTC	2	8	68072	68079	0 %	75 %	0 %	25 %	537435427
118	NC_022221	AGTC	2	8	68231	68238	25 %	25 %	25 %	25 %	537435427
119	NC_022221	TAAT	2	8	68273	68280	50 %	50 %	0 %	0 %	537435427
120	NC_022221	ATTT	2	8	68659	68666	25 %	75 %	0 %	0 %	537435428
121	NC_022221	GTCG	2	8	68691	68698	0 %	25 %	50 %	25 %	537435428
122	NC_022221	GCAG	2	8	68976	68983	25 %	0 %	50 %	25 %	537435428
123	NC_022221	ACCG	2	8	69202	69209	25 %	0 %	25 %	50 %	537435428
124	NC_022221	GATC	2	8	69348	69355	25 %	25 %	25 %	25 %	537435428
125	NC_022221	GGCA	2	8	69722	69729	25 %	0 %	50 %	25 %	537435429
126	NC_022221	TCCA	2	8	69764	69771	25 %	25 %	0 %	50 %	537435429
127	NC_022221	CTGA	2	8	71390	71397	25 %	25 %	25 %	25 %	537435430
128	NC_022221	CAAT	2	8	71824	71831	50 %	25 %	0 %	25 %	537435430
129	NC_022221	ATGG	2	8	72588	72595	25 %	25 %	50 %	0 %	537435431
130	NC_022221	GTTG	2	8	72913	72920	0 %	50 %	50 %	0 %	537435432
131	NC_022221	TGGA	2	8	73046	73053	25 %	25 %	50 %	0 %	537435432
132	NC_022221	CGGG	2	8	74563	74570	0 %	0 %	75 %	25 %	537435433
133	NC_022221	ACTT	2	8	75432	75439	25 %	50 %	0 %	25 %	537435435
134	NC_022221	TCCT	2	8	75747	75754	0 %	50 %	0 %	50 %	537435436
135	NC_022221	CTTA	2	8	75775	75782	25 %	50 %	0 %	25 %	537435436
136	NC_022221	GACC	2	8	76944	76951	25 %	0 %	25 %	50 %	537435437
137	NC_022221	CCGT	2	8	77283	77290	0 %	25 %	25 %	50 %	537435437
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