MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 56056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435370
2	NC_022221	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435370
3	NC_022221	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
4	NC_022221	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
5	NC_022221	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
6	NC_022221	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
7	NC_022221	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
8	NC_022221	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
9	NC_022221	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
10	NC_022221	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
11	NC_022221	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
12	NC_022221	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
13	NC_022221	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
14	NC_022221	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
15	NC_022221	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
16	NC_022221	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435371
17	NC_022221	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435371
18	NC_022221	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435371
19	NC_022221	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
20	NC_022221	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
21	NC_022221	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
22	NC_022221	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
23	NC_022221	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435371
24	NC_022221	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
25	NC_022221	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
26	NC_022221	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435371
27	NC_022221	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435371
28	NC_022221	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435371
29	NC_022221	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435371
30	NC_022221	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435371
31	NC_022221	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435371
32	NC_022221	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
33	NC_022221	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
34	NC_022221	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435371
35	NC_022221	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
36	NC_022221	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435371
37	NC_022221	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435371
38	NC_022221	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
39	NC_022221	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435371
40	NC_022221	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
41	NC_022221	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
42	NC_022221	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
43	NC_022221	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435371
44	NC_022221	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435371
45	NC_022221	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
46	NC_022221	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435371
47	NC_022221	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435371
48	NC_022221	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435371
49	NC_022221	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435371
50	NC_022221	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435372
51	NC_022221	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435372
52	NC_022221	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435372
53	NC_022221	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435372
54	NC_022221	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435372
55	NC_022221	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
56	NC_022221	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435372
57	NC_022221	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435372
58	NC_022221	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435372
59	NC_022221	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
60	NC_022221	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435372
61	NC_022221	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
62	NC_022221	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435372
63	NC_022221	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435372
64	NC_022221	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435373
65	NC_022221	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435373
66	NC_022221	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435373
67	NC_022221	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
68	NC_022221	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
69	NC_022221	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435373
70	NC_022221	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
71	NC_022221	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435373
72	NC_022221	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435373
73	NC_022221	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
74	NC_022221	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435373
75	NC_022221	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435373
76	NC_022221	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
77	NC_022221	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435373
78	NC_022221	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
79	NC_022221	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
80	NC_022221	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435373
81	NC_022221	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435373
82	NC_022221	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435373
83	NC_022221	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435373
84	NC_022221	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435373
85	NC_022221	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435373
86	NC_022221	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435374
87	NC_022221	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435374
88	NC_022221	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435374
89	NC_022221	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435374
90	NC_022221	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435374
91	NC_022221	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435374
92	NC_022221	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435374
93	NC_022221	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435374
94	NC_022221	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435374
95	NC_022221	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435374
96	NC_022221	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435374
97	NC_022221	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435375
98	NC_022221	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435375
99	NC_022221	TGA	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435375
100	NC_022221	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435375
101	NC_022221	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435375
102	NC_022221	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435375
103	NC_022221	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435375
104	NC_022221	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435375
105	NC_022221	GAT	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435375
106	NC_022221	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435375
107	NC_022221	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435375
108	NC_022221	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435375
109	NC_022221	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435375
110	NC_022221	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435375
111	NC_022221	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435375
112	NC_022221	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435375
113	NC_022221	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435375
114	NC_022221	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435375
115	NC_022221	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435375
116	NC_022221	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435376
117	NC_022221	AGC	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435376
118	NC_022221	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435376
119	NC_022221	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435376
120	NC_022221	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435376
121	NC_022221	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435376
122	NC_022221	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435376
123	NC_022221	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435376
124	NC_022221	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435376
125	NC_022221	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435376
126	NC_022221	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435376
127	NC_022221	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435376
128	NC_022221	GCG	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435377
129	NC_022221	GAG	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435377
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253	NC_022221	AAT	2	6	17002	17007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435386
254	NC_022221	GTC	2	6	17094	17099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435387
255	NC_022221	GCG	2	6	17103	17108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435387
256	NC_022221	TAA	2	6	17209	17214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435387
257	NC_022221	CAT	2	6	17281	17286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435387
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259	NC_022221	TAA	2	6	17404	17409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435387
260	NC_022221	ACT	2	6	17911	17916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435388
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262	NC_022221	GAT	2	6	17950	17955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435388
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269	NC_022221	GTG	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435388
270	NC_022221	GCT	2	6	18627	18632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435388
271	NC_022221	CTG	2	6	18701	18706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435388
272	NC_022221	ACT	2	6	18709	18714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435388
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278	NC_022221	CGC	2	6	18974	18979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435388
279	NC_022221	CTA	2	6	19010	19015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435388
280	NC_022221	CGC	2	6	19181	19186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435388
281	NC_022221	CGA	2	6	19389	19394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435388
282	NC_022221	GCG	2	6	19423	19428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435388
283	NC_022221	CTG	2	6	19435	19440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435388
284	NC_022221	TTC	2	6	19479	19484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435388
285	NC_022221	TGA	2	6	19485	19490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435388
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287	NC_022221	GAA	2	6	19747	19752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435388
288	NC_022221	GAT	2	6	19771	19776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435388
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332	NC_022221	ATT	2	6	26608	26613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435392
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362	NC_022221	TGA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435392
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373	NC_022221	CCG	2	6	28947	28952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435393
374	NC_022221	ATG	2	6	29286	29291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435393
375	NC_022221	ACA	2	6	29366	29371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435393
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