MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022221	GCG	2	6	224723	224728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435565
4002	NC_022221	CG	3	6	224734	224739	0 %	0 %	50 %	50 %	537435565
4003	NC_022221	GGC	2	6	224829	224834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435565
4004	NC_022221	GCA	2	6	224856	224861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4005	NC_022221	GTC	2	6	224863	224868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4006	NC_022221	GAC	2	6	224934	224939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4007	NC_022221	ACA	2	6	224942	224947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435565
4008	NC_022221	AAC	2	6	225013	225018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435565
4009	NC_022221	CGA	2	6	225023	225028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4010	NC_022221	GCG	2	6	225044	225049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435565
4011	NC_022221	GACGCC	2	12	225084	225095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435565
4012	NC_022221	CGC	2	6	225107	225112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435565
4013	NC_022221	TGG	2	6	225122	225127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435565
4014	NC_022221	ACG	2	6	225143	225148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4015	NC_022221	GCG	2	6	225164	225169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435565
4016	NC_022221	GGAC	2	8	225191	225198	25 %	0 %	50 %	25 %	537435565
4017	NC_022221	CAG	2	6	225217	225222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4018	NC_022221	GAT	2	6	225228	225233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435565
4019	NC_022221	GCA	2	6	225234	225239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4020	NC_022221	CAG	3	9	225241	225249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4021	NC_022221	GTC	2	6	225273	225278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4022	NC_022221	GCA	2	6	225285	225290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4023	NC_022221	GCA	2	6	225297	225302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435565
4024	NC_022221	GCC	2	6	225306	225311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435565
4025	NC_022221	AGA	2	6	225315	225320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435565
4026	NC_022221	CGG	2	6	225360	225365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435565
4027	NC_022221	TTA	2	6	225508	225513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435566
4028	NC_022221	CCTT	2	8	225516	225523	0 %	50 %	0 %	50 %	537435566
4029	NC_022221	GTT	2	6	225532	225537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435566
4030	NC_022221	GAT	2	6	225584	225589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435566
4031	NC_022221	TGC	2	6	225603	225608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435566
4032	NC_022221	TAA	2	6	225614	225619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435566
4033	NC_022221	TCA	2	6	225645	225650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435566
4034	NC_022221	GTA	2	6	225716	225721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435567
4035	NC_022221	TGTC	2	8	225741	225748	0 %	50 %	25 %	25 %	537435567
4036	NC_022221	GGC	2	6	225757	225762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435567
4037	NC_022221	AGA	2	6	225775	225780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435567
4038	NC_022221	CGC	2	6	225844	225849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435567
4039	NC_022221	CCA	4	12	225861	225872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435567
4040	NC_022221	A	6	6	225891	225896	100 %	0 %	0 %	0 %	537435567
4041	NC_022221	GGT	2	6	225913	225918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435567
4042	NC_022221	AGATGC	2	12	225930	225941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	537435567
4043	NC_022221	CAGT	2	8	225950	225957	25 %	25 %	25 %	25 %	537435567
4044	NC_022221	AAG	2	6	225960	225965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435567
4045	NC_022221	AGC	2	6	225995	226000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435567
4046	NC_022221	AAC	2	6	226067	226072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435567
4047	NC_022221	GTTGA	2	10	226145	226154	20 %	40 %	40 %	0 %	537435567
4048	NC_022221	CGTC	2	8	226167	226174	0 %	25 %	25 %	50 %	537435567
4049	NC_022221	ACT	2	6	226229	226234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435567
4050	NC_022221	GAAA	2	8	226243	226250	75 %	0 %	25 %	0 %	537435567
4051	NC_022221	TTCAA	2	10	226251	226260	40 %	40 %	0 %	20 %	537435567
4052	NC_022221	GGAC	2	8	226266	226273	25 %	0 %	50 %	25 %	537435567
4053	NC_022221	AGC	2	6	226368	226373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435567
4054	NC_022221	TGA	2	6	226429	226434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435567
4055	NC_022221	GAAC	2	8	226468	226475	50 %	0 %	25 %	25 %	537435567
4056	NC_022221	CTA	2	6	226486	226491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435567
4057	NC_022221	GGCT	2	8	226493	226500	0 %	25 %	50 %	25 %	537435567
4058	NC_022221	TGG	2	6	226602	226607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435567
4059	NC_022221	A	6	6	226686	226691	100 %	0 %	0 %	0 %	537435567
4060	NC_022221	GCG	2	6	226712	226717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435567
4061	NC_022221	ATGCGT	2	12	226850	226861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537435567
4062	NC_022221	GC	3	6	226887	226892	0 %	0 %	50 %	50 %	537435567
4063	NC_022221	CGG	2	6	226939	226944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435567
4064	NC_022221	AAAC	2	8	226973	226980	75 %	0 %	0 %	25 %	537435567
4065	NC_022221	GGAAT	2	10	227005	227014	40 %	20 %	40 %	0 %	537435567
4066	NC_022221	CGG	2	6	227032	227037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435567
4067	NC_022221	AT	3	6	227101	227106	50 %	50 %	0 %	0 %	537435567
4068	NC_022221	ACC	2	6	227118	227123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435567
4069	NC_022221	GTT	3	9	227306	227314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435567
4070	NC_022221	CCG	2	6	227355	227360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435567
4071	NC_022221	CCAA	2	8	227363	227370	50 %	0 %	0 %	50 %	537435567
4072	NC_022221	AGC	2	6	227431	227436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435567
4073	NC_022221	CGT	2	6	227547	227552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435567
4074	NC_022221	GCAGC	2	10	227664	227673	20 %	0 %	40 %	40 %	537435567
4075	NC_022221	GATG	2	8	227677	227684	25 %	25 %	50 %	0 %	537435567
4076	NC_022221	GTC	2	6	227687	227692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435567
4077	NC_022221	TAA	2	6	227746	227751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435567
4078	NC_022221	GCT	2	6	227778	227783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435567
4079	NC_022221	CATT	2	8	227914	227921	25 %	50 %	0 %	25 %	537435568
4080	NC_022221	ACC	2	6	227927	227932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435568
4081	NC_022221	GCC	2	6	228072	228077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435568
4082	NC_022221	GCC	2	6	228082	228087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435568
4083	NC_022221	AGC	2	6	228134	228139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435568
4084	NC_022221	CAA	2	6	228173	228178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435568
4085	NC_022221	GGAA	2	8	228190	228197	50 %	0 %	50 %	0 %	537435568
4086	NC_022221	TGG	2	6	228213	228218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435568
4087	NC_022221	GC	3	6	228243	228248	0 %	0 %	50 %	50 %	537435568
4088	NC_022221	CGG	2	6	228346	228351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435568
4089	NC_022221	GC	3	6	228361	228366	0 %	0 %	50 %	50 %	537435568
4090	NC_022221	CTG	3	9	228404	228412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435568
4091	NC_022221	GGT	2	6	228499	228504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435568
4092	NC_022221	TGC	2	6	228510	228515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435568
4093	NC_022221	GGC	2	6	228529	228534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435568
4094	NC_022221	ATT	2	6	228546	228551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435568
4095	NC_022221	CGG	2	6	228565	228570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435568
4096	NC_022221	CGG	2	6	228663	228668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435568
4097	NC_022221	CGC	2	6	228721	228726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435569
4098	NC_022221	TTA	2	6	228730	228735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435569
4099	NC_022221	CGC	2	6	228752	228757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435569
4100	NC_022221	CCG	2	6	228801	228806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435569
4101	NC_022221	GCT	3	9	228837	228845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435569
4102	NC_022221	TGGCG	2	10	228867	228876	0 %	20 %	60 %	20 %	537435569
4103	NC_022221	CCG	2	6	228910	228915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435569
4104	NC_022221	TGAT	2	8	228929	228936	25 %	50 %	25 %	0 %	537435569
4105	NC_022221	CTG	2	6	228967	228972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435569
4106	NC_022221	CGT	2	6	228986	228991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435569
4107	NC_022221	TGGTC	2	10	228995	229004	0 %	40 %	40 %	20 %	537435569
4108	NC_022221	CGCT	2	8	229102	229109	0 %	25 %	25 %	50 %	537435569
4109	NC_022221	GCCA	2	8	229183	229190	25 %	0 %	25 %	50 %	537435569
4110	NC_022221	CCG	2	6	229206	229211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435569
4111	NC_022221	G	6	6	229213	229218	0 %	0 %	100 %	0 %	537435569
4112	NC_022221	TGA	2	6	229229	229234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435569
4113	NC_022221	AGG	2	6	229289	229294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435569
4114	NC_022221	CGG	2	6	229355	229360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435569
4115	NC_022221	ATCG	2	8	229366	229373	25 %	25 %	25 %	25 %	537435569
4116	NC_022221	AAG	2	6	229388	229393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435569
4117	NC_022221	CGC	2	6	229451	229456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435569
4118	NC_022221	CCG	2	6	229505	229510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435569
4119	NC_022221	GCC	2	6	229675	229680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435570
4120	NC_022221	GTTG	2	8	229706	229713	0 %	50 %	50 %	0 %	537435570
4121	NC_022221	CTG	2	6	229718	229723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
4122	NC_022221	CAGT	2	8	229760	229767	25 %	25 %	25 %	25 %	537435570
4123	NC_022221	CAT	2	6	229799	229804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435570
4124	NC_022221	GAT	2	6	229811	229816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435570
4125	NC_022221	CAGC	2	8	229826	229833	25 %	0 %	25 %	50 %	537435570
4126	NC_022221	GCT	2	6	229853	229858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
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4128	NC_022221	GC	3	6	229996	230001	0 %	0 %	50 %	50 %	537435570
4129	NC_022221	GCC	2	6	230016	230021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435570
4130	NC_022221	TCG	2	6	230038	230043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
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4132	NC_022221	GGCGT	2	10	230058	230067	0 %	20 %	60 %	20 %	537435570
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4141	NC_022221	CTG	2	6	230475	230480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
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4143	NC_022221	GC	3	6	230602	230607	0 %	0 %	50 %	50 %	537435570
4144	NC_022221	GCT	2	6	230609	230614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
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4150	NC_022221	GCT	2	6	230801	230806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
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4153	NC_022221	GGCG	2	8	230855	230862	0 %	0 %	75 %	25 %	537435570
4154	NC_022221	TGGCGG	2	12	230869	230880	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	537435570
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4157	NC_022221	CTGC	2	8	231009	231016	0 %	25 %	25 %	50 %	537435570
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4177	NC_022221	CTGTC	2	10	231771	231780	0 %	40 %	20 %	40 %	537435571
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4197	NC_022221	T	6	6	236310	236315	0 %	100 %	0 %	0 %	537435573
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4213	NC_022221	TGG	2	6	237760	237765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435575
4214	NC_022221	TCG	2	6	237819	237824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435575
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4226	NC_022221	TTCA	2	8	239477	239484	25 %	50 %	0 %	25 %	537435576
4227	NC_022221	GCC	2	6	239499	239504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435576
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4230	NC_022221	GAT	2	6	239618	239623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435576
4231	NC_022221	CAGGT	2	10	239634	239643	20 %	20 %	40 %	20 %	537435576
4232	NC_022221	ACG	2	6	239649	239654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435576
4233	NC_022221	GTA	2	6	239657	239662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435576
4234	NC_022221	TCA	2	6	239698	239703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435576
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4238	NC_022221	GCG	2	6	239773	239778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435576
4239	NC_022221	CGA	2	6	239809	239814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435576
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4242	NC_022221	GC	3	6	239947	239952	0 %	0 %	50 %	50 %	537435576
4243	NC_022221	CAG	2	6	239969	239974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435576
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4486	NC_022221	TGAC	2	8	253055	253062	25 %	25 %	25 %	25 %	537435588
4487	NC_022221	CCAG	2	8	253082	253089	25 %	0 %	25 %	50 %	537435588
4488	NC_022221	GC	3	6	253151	253156	0 %	0 %	50 %	50 %	537435588
4489	NC_022221	CGC	3	9	253172	253180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435588
4490	NC_022221	GCG	2	6	253207	253212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435588
4491	NC_022221	TCT	2	6	253282	253287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435588
4492	NC_022221	GT	3	6	253324	253329	0 %	50 %	50 %	0 %	537435588
4493	NC_022221	CGA	2	6	253373	253378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4494	NC_022221	TG	3	6	253379	253384	0 %	50 %	50 %	0 %	537435588
4495	NC_022221	GCA	2	6	253430	253435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4496	NC_022221	GCA	2	6	253463	253468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4497	NC_022221	GC	3	6	253485	253490	0 %	0 %	50 %	50 %	537435588
4498	NC_022221	GGC	2	6	253523	253528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435588
4499	NC_022221	CGT	2	6	253551	253556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4500	NC_022221	CAT	2	6	253590	253595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435588

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