MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022221	GCG	2	6	143434	143439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435493
2502	NC_022221	GTG	2	6	143458	143463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435493
2503	NC_022221	TCA	2	6	143466	143471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435493
2504	NC_022221	AT	3	6	143487	143492	50 %	50 %	0 %	0 %	537435493
2505	NC_022221	ATT	2	6	143524	143529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435493
2506	NC_022221	GCGA	2	8	143548	143555	25 %	0 %	50 %	25 %	537435493
2507	NC_022221	GTC	2	6	143587	143592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435493
2508	NC_022221	CAGC	2	8	143598	143605	25 %	0 %	25 %	50 %	537435493
2509	NC_022221	TGG	2	6	143669	143674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435493
2510	NC_022221	ACC	4	12	143698	143709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435493
2511	NC_022221	ACT	2	6	143712	143717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435493
2512	NC_022221	TCT	2	6	143890	143895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435493
2513	NC_022221	GCA	2	6	143907	143912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435493
2514	NC_022221	GGC	2	6	143919	143924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435493
2515	NC_022221	GCC	2	6	143935	143940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435493
2516	NC_022221	GGC	2	6	144003	144008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435493
2517	NC_022221	CCAC	2	8	144026	144033	25 %	0 %	0 %	75 %	537435493
2518	NC_022221	GAT	2	6	144061	144066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435493
2519	NC_022221	CGC	2	6	144076	144081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435493
2520	NC_022221	CGA	2	6	144194	144199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435493
2521	NC_022221	GCC	2	6	144239	144244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435493
2522	NC_022221	CTG	2	6	144274	144279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435493
2523	NC_022221	GCT	2	6	144291	144296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435493
2524	NC_022221	CCG	2	6	144332	144337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435493
2525	NC_022221	CG	3	6	144336	144341	0 %	0 %	50 %	50 %	537435493
2526	NC_022221	GGT	3	9	144396	144404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435493
2527	NC_022221	GGC	2	6	144447	144452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435493
2528	NC_022221	GAA	2	6	144544	144549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435493
2529	NC_022221	TCG	2	6	144560	144565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435493
2530	NC_022221	TGAC	2	8	144569	144576	25 %	25 %	25 %	25 %	537435493
2531	NC_022221	GAG	2	6	144592	144597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435493
2532	NC_022221	CG	3	6	144599	144604	0 %	0 %	50 %	50 %	537435493
2533	NC_022221	TAT	2	6	144606	144611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435493
2534	NC_022221	CGT	2	6	144714	144719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435493
2535	NC_022221	ATT	2	6	144776	144781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435493
2536	NC_022221	AC	3	6	144910	144915	50 %	0 %	0 %	50 %	537435494
2537	NC_022221	CTG	2	6	145014	145019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435494
2538	NC_022221	GCC	2	6	145092	145097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435494
2539	NC_022221	GTG	2	6	145125	145130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435494
2540	NC_022221	CCG	2	6	145174	145179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435494
2541	NC_022221	AAC	2	6	145227	145232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435494
2542	NC_022221	GCT	2	6	145253	145258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435494
2543	NC_022221	GCG	2	6	145353	145358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435494
2544	NC_022221	GGC	3	9	145373	145381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435494
2545	NC_022221	GCGAAA	2	12	145416	145427	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	537435494
2546	NC_022221	ATA	2	6	145480	145485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435494
2547	NC_022221	ATT	2	6	145509	145514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435494
2548	NC_022221	GCA	2	6	145627	145632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435494
2549	NC_022221	TGC	3	9	145639	145647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435494
2550	NC_022221	GGC	2	6	145657	145662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435494
2551	NC_022221	GGC	2	6	145682	145687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435494
2552	NC_022221	GCT	2	6	145689	145694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435494
2553	NC_022221	GGC	2	6	145742	145747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435494
2554	NC_022221	CCG	2	6	145843	145848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435494
2555	NC_022221	TGG	2	6	145888	145893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435494
2556	NC_022221	AAGCG	2	10	145922	145931	40 %	0 %	40 %	20 %	537435494
2557	NC_022221	GCG	2	6	145962	145967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435494
2558	NC_022221	TCAG	2	8	145999	146006	25 %	25 %	25 %	25 %	537435494
2559	NC_022221	GCG	2	6	146023	146028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435494
2560	NC_022221	ATG	2	6	146097	146102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435494
2561	NC_022221	TGGC	2	8	146183	146190	0 %	25 %	50 %	25 %	537435495
2562	NC_022221	ATT	2	6	146208	146213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435495
2563	NC_022221	ATGG	2	8	146287	146294	25 %	25 %	50 %	0 %	537435495
2564	NC_022221	CT	3	6	146324	146329	0 %	50 %	0 %	50 %	537435495
2565	NC_022221	GGT	2	6	146338	146343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435495
2566	NC_022221	CGA	2	6	146388	146393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435495
2567	NC_022221	CAT	2	6	146401	146406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435495
2568	NC_022221	GTGC	2	8	146470	146477	0 %	25 %	50 %	25 %	537435495
2569	NC_022221	TGG	2	6	146478	146483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435495
2570	NC_022221	GTG	2	6	146531	146536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435495
2571	NC_022221	GC	3	6	146561	146566	0 %	0 %	50 %	50 %	537435495
2572	NC_022221	TCG	2	6	146622	146627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435495
2573	NC_022221	TGG	2	6	146652	146657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435495
2574	NC_022221	CTG	2	6	146705	146710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435495
2575	NC_022221	TCG	2	6	146724	146729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435495
2576	NC_022221	GCC	2	6	146798	146803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435495
2577	NC_022221	TGG	2	6	146814	146819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435495
2578	NC_022221	TGC	3	9	147018	147026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435495
2579	NC_022221	CTG	2	6	147038	147043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435495
2580	NC_022221	GCG	2	6	147054	147059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435495
2581	NC_022221	TGG	2	6	147066	147071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435495
2582	NC_022221	CAC	2	6	147149	147154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435495
2583	NC_022221	CG	3	6	147180	147185	0 %	0 %	50 %	50 %	537435495
2584	NC_022221	ATT	2	6	147203	147208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435495
2585	NC_022221	CGT	2	6	147282	147287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2586	NC_022221	ATT	2	6	147289	147294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435496
2587	NC_022221	CT	3	6	147313	147318	0 %	50 %	0 %	50 %	537435496
2588	NC_022221	T	6	6	147328	147333	0 %	100 %	0 %	0 %	537435496
2589	NC_022221	CTCG	2	8	147334	147341	0 %	25 %	25 %	50 %	537435496
2590	NC_022221	CGC	2	6	147350	147355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435496
2591	NC_022221	CGC	2	6	147377	147382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435496
2592	NC_022221	GGC	2	6	147424	147429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2593	NC_022221	ACG	2	6	147434	147439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2594	NC_022221	GCG	2	6	147451	147456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2595	NC_022221	TCG	2	6	147464	147469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2596	NC_022221	GCC	2	6	147511	147516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435496
2597	NC_022221	AAGCGC	2	12	147563	147574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2598	NC_022221	ACC	2	6	147616	147621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435496
2599	NC_022221	GCG	2	6	147643	147648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2600	NC_022221	GGC	2	6	147667	147672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2601	NC_022221	TGC	2	6	147695	147700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2602	NC_022221	GCG	3	9	147772	147780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2603	NC_022221	GTTTG	2	10	147825	147834	0 %	60 %	40 %	0 %	537435496
2604	NC_022221	GCG	2	6	147847	147852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2605	NC_022221	GAT	2	6	147898	147903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435496
2606	NC_022221	CAG	2	6	147985	147990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2607	NC_022221	GCG	2	6	148081	148086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2608	NC_022221	CTGGCG	2	12	148087	148098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435496
2609	NC_022221	CG	3	6	148115	148120	0 %	0 %	50 %	50 %	537435496
2610	NC_022221	CAG	2	6	148122	148127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2611	NC_022221	GAC	2	6	148140	148145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2612	NC_022221	GCG	2	6	148243	148248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2613	NC_022221	CTG	3	9	148282	148290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2614	NC_022221	GGC	2	6	148291	148296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435496
2615	NC_022221	GC	3	6	148379	148384	0 %	0 %	50 %	50 %	537435496
2616	NC_022221	CG	3	6	148457	148462	0 %	0 %	50 %	50 %	537435496
2617	NC_022221	TGC	2	6	148481	148486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435496
2618	NC_022221	CGCC	2	8	148490	148497	0 %	0 %	25 %	75 %	537435496
2619	NC_022221	TC	3	6	148584	148589	0 %	50 %	0 %	50 %	537435497
2620	NC_022221	CG	3	6	148606	148611	0 %	0 %	50 %	50 %	537435497
2621	NC_022221	CCT	2	6	148625	148630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435497
2622	NC_022221	GCG	2	6	148644	148649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435497
2623	NC_022221	CG	3	6	148672	148677	0 %	0 %	50 %	50 %	537435497
2624	NC_022221	GCT	2	6	148715	148720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435497
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2862	NC_022221	GCA	2	6	162157	162162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435507
2863	NC_022221	TCT	2	6	162166	162171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435507
2864	NC_022221	CGA	2	6	162221	162226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435507
2865	NC_022221	TCT	2	6	162421	162426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435507
2866	NC_022221	TCG	2	6	162584	162589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435507
2867	NC_022221	CGA	2	6	162607	162612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435507
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2869	NC_022221	GTC	2	6	162729	162734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435507
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2975	NC_022221	GC	3	6	168584	168589	0 %	0 %	50 %	50 %	537435514
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2979	NC_022221	CGCC	2	8	168803	168810	0 %	0 %	25 %	75 %	537435514
2980	NC_022221	GAA	2	6	168932	168937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435514
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2982	NC_022221	CA	3	6	169132	169137	50 %	0 %	0 %	50 %	537435514
2983	NC_022221	ACC	2	6	169201	169206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435514
2984	NC_022221	TGA	2	6	169249	169254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435514
2985	NC_022221	TGAGC	2	10	169271	169280	20 %	20 %	40 %	20 %	537435514
2986	NC_022221	TGT	2	6	169336	169341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435515
2987	NC_022221	CCAG	2	8	169377	169384	25 %	0 %	25 %	50 %	537435515
2988	NC_022221	GGCG	2	8	169407	169414	0 %	0 %	75 %	25 %	537435515
2989	NC_022221	ATG	2	6	169417	169422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435515
2990	NC_022221	TGA	2	6	169460	169465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435515
2991	NC_022221	TGA	2	6	169502	169507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435515
2992	NC_022221	CGCAT	2	10	169533	169542	20 %	20 %	20 %	40 %	537435515
2993	NC_022221	CCA	2	6	169552	169557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435515
2994	NC_022221	GAT	2	6	169680	169685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435515
2995	NC_022221	GTT	2	6	169724	169729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435515
2996	NC_022221	GA	3	6	169974	169979	50 %	0 %	50 %	0 %	537435516
2997	NC_022221	GC	4	8	169984	169991	0 %	0 %	50 %	50 %	537435516
2998	NC_022221	GC	3	6	170005	170010	0 %	0 %	50 %	50 %	537435516
2999	NC_022221	ATG	2	6	170151	170156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435516
3000	NC_022221	CGAAC	2	10	170262	170271	40 %	0 %	20 %	40 %	537435516

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