MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022221	CCGCG	2	10	113350	113359	0 %	0 %	40 %	60 %	537435467
2002	NC_022221	CTCCAG	2	12	113399	113410	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537435467
2003	NC_022221	TGT	2	6	113430	113435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435467
2004	NC_022221	CCA	2	6	113447	113452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435467
2005	NC_022221	CCG	2	6	113488	113493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435467
2006	NC_022221	GC	4	8	113509	113516	0 %	0 %	50 %	50 %	537435467
2007	NC_022221	GAC	2	6	113625	113630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435467
2008	NC_022221	GTG	2	6	113661	113666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435467
2009	NC_022221	GGCA	2	8	113778	113785	25 %	0 %	50 %	25 %	537435467
2010	NC_022221	ATCA	2	8	113876	113883	50 %	25 %	0 %	25 %	537435467
2011	NC_022221	GCC	2	6	113972	113977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435467
2012	NC_022221	GCG	2	6	113989	113994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2013	NC_022221	GCG	2	6	114063	114068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2014	NC_022221	CCG	2	6	114075	114080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435467
2015	NC_022221	TCG	2	6	114106	114111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435467
2016	NC_022221	CG	3	6	114110	114115	0 %	0 %	50 %	50 %	537435467
2017	NC_022221	GCG	2	6	114218	114223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2018	NC_022221	A	7	7	114381	114387	100 %	0 %	0 %	0 %	537435467
2019	NC_022221	GCA	2	6	114478	114483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435467
2020	NC_022221	CAC	2	6	114500	114505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435467
2021	NC_022221	GAT	2	6	114515	114520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435467
2022	NC_022221	CAG	2	6	114563	114568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435467
2023	NC_022221	GCGG	2	8	114571	114578	0 %	0 %	75 %	25 %	537435467
2024	NC_022221	GCG	2	6	114730	114735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2025	NC_022221	GGGGT	2	10	114746	114755	0 %	20 %	80 %	0 %	537435467
2026	NC_022221	TAA	2	6	114817	114822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435467
2027	NC_022221	CGG	2	6	114845	114850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2028	NC_022221	GCA	2	6	114889	114894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435467
2029	NC_022221	GCG	2	6	114976	114981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2030	NC_022221	AGC	2	6	115008	115013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435467
2031	NC_022221	GGC	2	6	115016	115021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2032	NC_022221	CTGG	2	8	115031	115038	0 %	25 %	50 %	25 %	537435467
2033	NC_022221	TGTC	2	8	115093	115100	0 %	50 %	25 %	25 %	537435467
2034	NC_022221	GCCA	2	8	115101	115108	25 %	0 %	25 %	50 %	537435467
2035	NC_022221	GCG	2	6	115129	115134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
2036	NC_022221	CCTG	2	8	115164	115171	0 %	25 %	25 %	50 %	537435467
2037	NC_022221	TAA	2	6	115279	115284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435468
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2039	NC_022221	CCA	2	6	115317	115322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435468
2040	NC_022221	TGA	2	6	115350	115355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435468
2041	NC_022221	GCA	2	6	115397	115402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435468
2042	NC_022221	TTG	3	9	115440	115448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435468
2043	NC_022221	CG	3	6	115481	115486	0 %	0 %	50 %	50 %	537435468
2044	NC_022221	CGC	2	6	115560	115565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435468
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2046	NC_022221	CG	3	6	115611	115616	0 %	0 %	50 %	50 %	537435468
2047	NC_022221	TGT	2	6	115624	115629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435468
2048	NC_022221	CG	3	6	115727	115732	0 %	0 %	50 %	50 %	537435468
2049	NC_022221	CTGA	2	8	115743	115750	25 %	25 %	25 %	25 %	537435468
2050	NC_022221	TGCC	2	8	115805	115812	0 %	25 %	25 %	50 %	537435468
2051	NC_022221	TGA	2	6	115820	115825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435468
2052	NC_022221	ATGA	2	8	115840	115847	50 %	25 %	25 %	0 %	537435468
2053	NC_022221	GTTC	2	8	115848	115855	0 %	50 %	25 %	25 %	537435468
2054	NC_022221	ATG	2	6	115939	115944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435468
2055	NC_022221	TA	3	6	115949	115954	50 %	50 %	0 %	0 %	537435468
2056	NC_022221	CAG	2	6	115955	115960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435468
2057	NC_022221	T	6	6	116455	116460	0 %	100 %	0 %	0 %	537435469
2058	NC_022221	ACAGA	2	10	116476	116485	60 %	0 %	20 %	20 %	537435469
2059	NC_022221	ATT	2	6	116500	116505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435469
2060	NC_022221	T	7	7	116520	116526	0 %	100 %	0 %	0 %	537435469
2061	NC_022221	A	6	6	116547	116552	100 %	0 %	0 %	0 %	537435469
2062	NC_022221	ATT	2	6	116569	116574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435469
2063	NC_022221	CAA	2	6	116606	116611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435469
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2066	NC_022221	ATA	2	6	116669	116674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435469
2067	NC_022221	AT	3	6	116727	116732	50 %	50 %	0 %	0 %	537435469
2068	NC_022221	TCA	2	6	116745	116750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435469
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2071	NC_022221	TGC	2	6	116845	116850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435470
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2073	NC_022221	GGC	2	6	116876	116881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435470
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2089	NC_022221	GCCA	2	8	117785	117792	25 %	0 %	25 %	50 %	537435471
2090	NC_022221	GCG	2	6	117874	117879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435471
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2092	NC_022221	CGA	2	6	117943	117948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435471
2093	NC_022221	GCCGG	2	10	117951	117960	0 %	0 %	60 %	40 %	537435471
2094	NC_022221	GCC	2	6	117998	118003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435471
2095	NC_022221	AC	3	6	118058	118063	50 %	0 %	0 %	50 %	537435471
2096	NC_022221	CGAGC	2	10	118076	118085	20 %	0 %	40 %	40 %	537435471
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2103	NC_022221	GGCG	2	8	118397	118404	0 %	0 %	75 %	25 %	537435471
2104	NC_022221	GCT	2	6	118415	118420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435471
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2107	NC_022221	GTCA	2	8	118547	118554	25 %	25 %	25 %	25 %	537435471
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2117	NC_022221	TGT	2	6	119197	119202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435472
2118	NC_022221	CTG	2	6	119220	119225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435472
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2121	NC_022221	CGG	2	6	119348	119353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2122	NC_022221	GCG	2	6	119362	119367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2123	NC_022221	CGA	2	6	119393	119398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435472
2124	NC_022221	GCA	2	6	119424	119429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435472
2125	NC_022221	GCC	2	6	119463	119468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435472
2126	NC_022221	GC	5	10	119524	119533	0 %	0 %	50 %	50 %	537435472
2127	NC_022221	GCG	2	6	119637	119642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2128	NC_022221	CAC	2	6	119661	119666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435472
2129	NC_022221	GCT	2	6	119723	119728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435472
2130	NC_022221	CTGG	2	8	119730	119737	0 %	25 %	50 %	25 %	537435472
2131	NC_022221	TGC	2	6	119764	119769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435472
2132	NC_022221	GTT	2	6	119777	119782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435472
2133	NC_022221	CAC	2	6	119868	119873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435472
2134	NC_022221	CGC	2	6	120029	120034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435472
2135	NC_022221	CGG	2	6	120107	120112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2136	NC_022221	TCA	2	6	120169	120174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435472
2137	NC_022221	AAG	2	6	120175	120180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435472
2138	NC_022221	GGC	2	6	120187	120192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2139	NC_022221	CGG	2	6	120247	120252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2140	NC_022221	GTG	2	6	120268	120273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435472
2141	NC_022221	AGC	2	6	120280	120285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435472
2142	NC_022221	CA	3	6	120299	120304	50 %	0 %	0 %	50 %	537435472
2143	NC_022221	CGG	2	6	120320	120325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2144	NC_022221	GCC	2	6	120396	120401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435472
2145	NC_022221	AGT	2	6	120413	120418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435472
2146	NC_022221	TCG	2	6	120454	120459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435472
2147	NC_022221	GCG	2	6	120619	120624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435472
2148	NC_022221	CG	3	6	120677	120682	0 %	0 %	50 %	50 %	537435472
2149	NC_022221	GAT	2	6	120683	120688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435472
2150	NC_022221	GTT	2	6	120699	120704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435472
2151	NC_022221	CTT	2	6	120725	120730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435472
2152	NC_022221	TGG	2	6	120755	120760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435472
2153	NC_022221	TCG	2	6	120766	120771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435472
2154	NC_022221	GC	3	6	120796	120801	0 %	0 %	50 %	50 %	537435472
2155	NC_022221	CAATTG	2	12	120827	120838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537435472
2156	NC_022221	T	7	7	121280	121286	0 %	100 %	0 %	0 %	537435473
2157	NC_022221	ATCG	2	8	121287	121294	25 %	25 %	25 %	25 %	537435473
2158	NC_022221	AT	3	6	121313	121318	50 %	50 %	0 %	0 %	537435473
2159	NC_022221	TAA	3	9	121352	121360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435473
2160	NC_022221	TGTC	2	8	121373	121380	0 %	50 %	25 %	25 %	537435473
2161	NC_022221	AT	3	6	121390	121395	50 %	50 %	0 %	0 %	537435473
2162	NC_022221	CCG	2	6	121404	121409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435473
2163	NC_022221	TCA	2	6	121418	121423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435473
2164	NC_022221	GC	3	6	121554	121559	0 %	0 %	50 %	50 %	537435473
2165	NC_022221	ATC	2	6	121590	121595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435473
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2168	NC_022221	TAAT	2	8	121678	121685	50 %	50 %	0 %	0 %	537435473
2169	NC_022221	CCG	2	6	121698	121703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435473
2170	NC_022221	TGCC	2	8	121724	121731	0 %	25 %	25 %	50 %	537435473
2171	NC_022221	CAG	2	6	121830	121835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435473
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2174	NC_022221	CTG	2	6	122155	122160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435474
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2179	NC_022221	TAT	2	6	122334	122339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435474
2180	NC_022221	CTGG	2	8	122370	122377	0 %	25 %	50 %	25 %	537435474
2181	NC_022221	A	8	8	122419	122426	100 %	0 %	0 %	0 %	537435474
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2188	NC_022221	GGC	2	6	122732	122737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435474
2189	NC_022221	GCG	2	6	122828	122833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435474
2190	NC_022221	TGG	2	6	122843	122848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435474
2191	NC_022221	TA	3	6	122876	122881	50 %	50 %	0 %	0 %	537435474
2192	NC_022221	TAG	2	6	123006	123011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435475
2193	NC_022221	TTGCC	2	10	123022	123031	0 %	40 %	20 %	40 %	537435475
2194	NC_022221	CGTC	2	8	123040	123047	0 %	25 %	25 %	50 %	537435475
2195	NC_022221	ACG	2	6	123052	123057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435475
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2198	NC_022221	CAG	3	9	123201	123209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435475
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2202	NC_022221	GCTG	2	8	123341	123348	0 %	25 %	50 %	25 %	537435475
2203	NC_022221	TGC	2	6	123391	123396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435475
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2210	NC_022221	ATG	2	6	123621	123626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435475
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2212	NC_022221	AGCAG	2	10	123699	123708	40 %	0 %	40 %	20 %	537435476
2213	NC_022221	CAG	3	9	123706	123714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435476
2214	NC_022221	CTG	2	6	123760	123765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435476
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2219	NC_022221	TGGCGT	2	12	124166	124177	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	537435476
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2222	NC_022221	AC	3	6	124217	124222	50 %	0 %	0 %	50 %	537435476
2223	NC_022221	CGCC	2	8	124227	124234	0 %	0 %	25 %	75 %	537435476
2224	NC_022221	ACC	2	6	124322	124327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435476
2225	NC_022221	GCG	2	6	124338	124343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435476
2226	NC_022221	AGC	5	15	124346	124360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435476
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2228	NC_022221	CGTC	2	8	124380	124387	0 %	25 %	25 %	50 %	537435476
2229	NC_022221	GCGTCA	2	12	124428	124439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537435476
2230	NC_022221	GCA	2	6	124492	124497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435476
2231	NC_022221	CGC	2	6	124522	124527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435476
2232	NC_022221	GCGG	2	8	124528	124535	0 %	0 %	75 %	25 %	537435476
2233	NC_022221	GTG	2	6	124580	124585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435476
2234	NC_022221	GCC	3	9	124594	124602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435476
2235	NC_022221	GGC	2	6	124671	124676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435476
2236	NC_022221	A	6	6	124703	124708	100 %	0 %	0 %	0 %	537435476
2237	NC_022221	GCG	2	6	124733	124738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435476
2238	NC_022221	GCT	2	6	124746	124751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435476
2239	NC_022221	GCA	2	6	124776	124781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435476
2240	NC_022221	A	6	6	124807	124812	100 %	0 %	0 %	0 %	537435476
2241	NC_022221	GCCA	2	8	124889	124896	25 %	0 %	25 %	50 %	537435476
2242	NC_022221	GCA	2	6	124974	124979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435476
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2244	NC_022221	CCG	2	6	125031	125036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435476
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2363	NC_022221	ACTG	2	8	130987	130994	25 %	25 %	25 %	25 %	537435484
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2469	NC_022221	GC	3	6	142002	142007	0 %	0 %	50 %	50 %	537435492
2470	NC_022221	A	6	6	142038	142043	100 %	0 %	0 %	0 %	537435492
2471	NC_022221	CGC	2	6	142080	142085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435492
2472	NC_022221	TAC	2	6	142086	142091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435492
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2480	NC_022221	TGA	2	6	142525	142530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435492
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2482	NC_022221	TAG	2	6	142711	142716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435492
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2484	NC_022221	GGT	2	6	142801	142806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435492
2485	NC_022221	AG	3	6	142814	142819	50 %	0 %	50 %	0 %	537435492
2486	NC_022221	GTG	2	6	142983	142988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435492
2487	NC_022221	ATG	2	6	142992	142997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435492
2488	NC_022221	GCG	4	12	143017	143028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435492
2489	NC_022221	GGC	2	6	143033	143038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435492
2490	NC_022221	A	6	6	143079	143084	100 %	0 %	0 %	0 %	537435492
2491	NC_022221	CAA	2	6	143108	143113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435492
2492	NC_022221	TGG	2	6	143167	143172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435492
2493	NC_022221	TCA	2	6	143176	143181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435492
2494	NC_022221	TAC	2	6	143202	143207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435492
2495	NC_022221	GGC	2	6	143208	143213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435492
2496	NC_022221	CAT	2	6	143240	143245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435492
2497	NC_022221	GCG	2	6	143248	143253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435492
2498	NC_022221	A	7	7	143299	143305	100 %	0 %	0 %	0 %	537435492
2499	NC_022221	TAAT	2	8	143314	143321	50 %	50 %	0 %	0 %	537435492
2500	NC_022221	GA	3	6	143405	143410	50 %	0 %	50 %	0 %	537435493

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