MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022221	CAT	2	6	84493	84498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435442
1502	NC_022221	GCA	2	6	84516	84521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435442
1503	NC_022221	GCC	2	6	84584	84589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435442
1504	NC_022221	GTC	2	6	84599	84604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435442
1505	NC_022221	CGG	2	6	84627	84632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435442
1506	NC_022221	CTC	2	6	84733	84738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435442
1507	NC_022221	TCA	2	6	84806	84811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435442
1508	NC_022221	CGG	2	6	84821	84826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435442
1509	NC_022221	GCG	2	6	84940	84945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435442
1510	NC_022221	A	6	6	85074	85079	100 %	0 %	0 %	0 %	537435442
1511	NC_022221	TCA	2	6	85128	85133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435442
1512	NC_022221	T	6	6	85148	85153	0 %	100 %	0 %	0 %	537435442
1513	NC_022221	TCA	2	6	85292	85297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435443
1514	NC_022221	ACC	2	6	85300	85305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435443
1515	NC_022221	GGT	2	6	85350	85355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435443
1516	NC_022221	CAG	2	6	85492	85497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435443
1517	NC_022221	CGA	2	6	85653	85658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435443
1518	NC_022221	CTT	2	6	85680	85685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435443
1519	NC_022221	CCGA	2	8	85711	85718	25 %	0 %	25 %	50 %	537435443
1520	NC_022221	CGT	2	6	85743	85748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435443
1521	NC_022221	CAG	2	6	85763	85768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435443
1522	NC_022221	TTG	2	6	85799	85804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435443
1523	NC_022221	TC	3	6	85874	85879	0 %	50 %	0 %	50 %	537435443
1524	NC_022221	CCT	2	6	86108	86113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435443
1525	NC_022221	ACA	2	6	86124	86129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435443
1526	NC_022221	GC	3	6	86139	86144	0 %	0 %	50 %	50 %	537435443
1527	NC_022221	CGG	2	6	86169	86174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435443
1528	NC_022221	CCG	2	6	86201	86206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435443
1529	NC_022221	TTC	2	6	86209	86214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435443
1530	NC_022221	CAG	2	6	86221	86226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435443
1531	NC_022221	TAA	2	6	86452	86457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435444
1532	NC_022221	GAA	2	6	86483	86488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435444
1533	NC_022221	TCC	2	6	86498	86503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435444
1534	NC_022221	ACCC	2	8	86533	86540	25 %	0 %	0 %	75 %	537435444
1535	NC_022221	CAG	2	6	86546	86551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1536	NC_022221	GAT	2	6	86561	86566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435444
1537	NC_022221	GGC	2	6	86604	86609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435444
1538	NC_022221	GAA	2	6	86702	86707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435444
1539	NC_022221	TGG	2	6	86716	86721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435444
1540	NC_022221	GGC	2	6	86738	86743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435444
1541	NC_022221	GC	4	8	86760	86767	0 %	0 %	50 %	50 %	537435444
1542	NC_022221	ACG	2	6	86769	86774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1543	NC_022221	CAG	3	9	86819	86827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1544	NC_022221	TGC	2	6	86833	86838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1545	NC_022221	GTACG	2	10	86905	86914	20 %	20 %	40 %	20 %	537435444
1546	NC_022221	TA	3	6	86958	86963	50 %	50 %	0 %	0 %	537435444
1547	NC_022221	CAC	2	6	86967	86972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435444
1548	NC_022221	GCC	2	6	87005	87010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435444
1549	NC_022221	AGT	2	6	87082	87087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435444
1550	NC_022221	ATG	2	6	87090	87095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435444
1551	NC_022221	CAG	2	6	87222	87227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1552	NC_022221	ATG	3	9	87231	87239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435444
1553	NC_022221	CCA	2	6	87343	87348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435444
1554	NC_022221	CGA	2	6	87361	87366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1555	NC_022221	AAC	2	6	87375	87380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435444
1556	NC_022221	CGA	2	6	87400	87405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1557	NC_022221	CATC	2	8	87436	87443	25 %	25 %	0 %	50 %	537435444
1558	NC_022221	AGA	2	6	87454	87459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435444
1559	NC_022221	CGG	2	6	87578	87583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435444
1560	NC_022221	TAG	3	9	87594	87602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435444
1561	NC_022221	CAGAA	2	10	87618	87627	60 %	0 %	20 %	20 %	537435444
1562	NC_022221	AGG	2	6	87643	87648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435444
1563	NC_022221	CAT	2	6	87653	87658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435444
1564	NC_022221	CCAG	2	8	87730	87737	25 %	0 %	25 %	50 %	537435444
1565	NC_022221	GAC	2	6	87755	87760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435444
1566	NC_022221	TAA	2	6	87817	87822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435444
1567	NC_022221	ATT	2	6	87876	87881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435444
1568	NC_022221	A	8	8	87890	87897	100 %	0 %	0 %	0 %	537435444
1569	NC_022221	T	6	6	87917	87922	0 %	100 %	0 %	0 %	537435444
1570	NC_022221	T	6	6	88171	88176	0 %	100 %	0 %	0 %	537435445
1571	NC_022221	T	6	6	88180	88185	0 %	100 %	0 %	0 %	537435445
1572	NC_022221	TTG	2	6	88205	88210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435445
1573	NC_022221	TTTC	2	8	88250	88257	0 %	75 %	0 %	25 %	537435445
1574	NC_022221	TG	3	6	88303	88308	0 %	50 %	50 %	0 %	537435445
1575	NC_022221	TGA	2	6	88450	88455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435446
1576	NC_022221	TAA	2	6	88471	88476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435446
1577	NC_022221	GCT	2	6	88547	88552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435446
1578	NC_022221	CAG	2	6	88565	88570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435446
1579	NC_022221	GGC	2	6	88604	88609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435446
1580	NC_022221	CT	3	6	88646	88651	0 %	50 %	0 %	50 %	537435446
1581	NC_022221	TGA	2	6	88660	88665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435446
1582	NC_022221	AC	3	6	88711	88716	50 %	0 %	0 %	50 %	537435446
1583	NC_022221	GCC	2	6	88730	88735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435446
1584	NC_022221	GCG	2	6	88736	88741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435446
1585	NC_022221	GCG	2	6	88770	88775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435446
1586	NC_022221	TTC	2	6	88780	88785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435446
1587	NC_022221	CAG	2	6	88799	88804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435446
1588	NC_022221	TGG	2	6	88815	88820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435446
1589	NC_022221	CT	4	8	88865	88872	0 %	50 %	0 %	50 %	537435446
1590	NC_022221	CGG	2	6	88941	88946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435446
1591	NC_022221	GCG	2	6	89009	89014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435446
1592	NC_022221	A	6	6	89015	89020	100 %	0 %	0 %	0 %	537435446
1593	NC_022221	CA	3	6	89077	89082	50 %	0 %	0 %	50 %	537435446
1594	NC_022221	AGC	2	6	89100	89105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435446
1595	NC_022221	GTG	2	6	89120	89125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435446
1596	NC_022221	GAA	2	6	89141	89146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435446
1597	NC_022221	CGC	2	6	89152	89157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435446
1598	NC_022221	TGA	2	6	89262	89267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435447
1599	NC_022221	GC	3	6	89271	89276	0 %	0 %	50 %	50 %	537435447
1600	NC_022221	GCT	2	6	89362	89367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435447
1601	NC_022221	AGA	2	6	89380	89385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435447
1602	NC_022221	GCT	2	6	89405	89410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435447
1603	NC_022221	GCG	2	6	89445	89450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435447
1604	NC_022221	TGC	3	9	89454	89462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435447
1605	NC_022221	GGC	2	6	89488	89493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435447
1606	NC_022221	ACG	2	6	89529	89534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435447
1607	NC_022221	GCG	2	6	89564	89569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435447
1608	NC_022221	CGG	2	6	89587	89592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435447
1609	NC_022221	CAG	2	6	89644	89649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435447
1610	NC_022221	GCG	2	6	89688	89693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435447
1611	NC_022221	CCGCA	2	10	89737	89746	20 %	0 %	20 %	60 %	537435447
1612	NC_022221	TGG	2	6	89793	89798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435447
1613	NC_022221	GCA	2	6	89820	89825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435447
1614	NC_022221	CCCG	2	8	89886	89893	0 %	0 %	25 %	75 %	537435447
1615	NC_022221	TGGA	2	8	89912	89919	25 %	25 %	50 %	0 %	537435447
1616	NC_022221	GC	3	6	90021	90026	0 %	0 %	50 %	50 %	537435447
1617	NC_022221	CAA	2	6	90043	90048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435447
1618	NC_022221	CCTG	2	8	90112	90119	0 %	25 %	25 %	50 %	537435447
1619	NC_022221	CAT	2	6	90218	90223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435448
1620	NC_022221	CGGTT	2	10	90242	90251	0 %	40 %	40 %	20 %	537435448
1621	NC_022221	GCG	2	6	90252	90257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435448
1622	NC_022221	TGCT	2	8	90262	90269	0 %	50 %	25 %	25 %	537435448
1623	NC_022221	CTG	2	6	90310	90315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435448
1624	NC_022221	GAA	2	6	90320	90325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435448
1625	NC_022221	CAT	2	6	90365	90370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435448
1626	NC_022221	ATT	2	6	90460	90465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435448
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1629	NC_022221	GTT	2	6	90594	90599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435448
1630	NC_022221	CTG	2	6	90687	90692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435448
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1641	NC_022221	GTAT	2	8	91276	91283	25 %	50 %	25 %	0 %	537435448
1642	NC_022221	GCTCC	2	10	91378	91387	0 %	20 %	20 %	60 %	537435448
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1652	NC_022221	CG	3	6	91728	91733	0 %	0 %	50 %	50 %	537435449
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1656	NC_022221	TGA	2	6	91932	91937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435450
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1665	NC_022221	TGTT	2	8	92213	92220	0 %	75 %	25 %	0 %	537435450
1666	NC_022221	CGC	2	6	92225	92230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435450
1667	NC_022221	GC	3	6	92328	92333	0 %	0 %	50 %	50 %	537435450
1668	NC_022221	CGC	2	6	92352	92357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435450
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1731	NC_022221	GCC	2	6	99017	99022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435455
1732	NC_022221	GCG	2	6	99024	99029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435455
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1736	NC_022221	CG	3	6	99139	99144	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
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1745	NC_022221	GGCGC	2	10	99539	99548	0 %	0 %	60 %	40 %	537435455
1746	NC_022221	GGC	2	6	99613	99618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435455
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1748	NC_022221	GC	3	6	99674	99679	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
1749	NC_022221	CGA	2	6	99694	99699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435455
1750	NC_022221	TGC	2	6	99759	99764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435455
1751	NC_022221	TGG	2	6	99783	99788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435455
1752	NC_022221	T	6	6	99843	99848	0 %	100 %	0 %	0 %	537435455
1753	NC_022221	GCG	2	6	99890	99895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435455
1754	NC_022221	CGCCCG	2	12	99991	100002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435455
1755	NC_022221	GC	3	6	100071	100076	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
1756	NC_022221	GCTGGG	4	24	100105	100128	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	537435455
1757	NC_022221	GC	3	6	100147	100152	0 %	0 %	50 %	50 %	537435455
1758	NC_022221	TGG	2	6	100182	100187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435455
1759	NC_022221	CGC	3	9	100225	100233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435455
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1761	NC_022221	TGA	2	6	100354	100359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435455
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1763	NC_022221	GCG	2	6	100598	100603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435456
1764	NC_022221	CCTG	2	8	100651	100658	0 %	25 %	25 %	50 %	537435456
1765	NC_022221	TAAA	2	8	100689	100696	75 %	25 %	0 %	0 %	537435456
1766	NC_022221	GTC	2	6	100700	100705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435456
1767	NC_022221	CAG	2	6	100768	100773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435456
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1769	NC_022221	CGA	2	6	100786	100791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435456
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1772	NC_022221	CGT	2	6	101054	101059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435456
1773	NC_022221	CTTCGC	2	12	101182	101193	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	537435457
1774	NC_022221	CAG	3	9	101271	101279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435457
1775	NC_022221	TCCCTT	2	12	101311	101322	0 %	50 %	0 %	50 %	537435457
1776	NC_022221	GCG	2	6	101398	101403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435457
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1782	NC_022221	TCG	2	6	101973	101978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435457
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1786	NC_022221	AC	3	6	102381	102386	50 %	0 %	0 %	50 %	537435458
1787	NC_022221	CG	3	6	102482	102487	0 %	0 %	50 %	50 %	537435459
1788	NC_022221	GGT	2	6	102584	102589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435459
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1802	NC_022221	CAG	2	6	103476	103481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435460
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1824	NC_022221	CCCAA	2	10	104471	104480	40 %	0 %	0 %	60 %	537435461
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1852	NC_022221	AGT	2	6	105796	105801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435462
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1854	NC_022221	AT	3	6	105918	105923	50 %	50 %	0 %	0 %	537435462
1855	NC_022221	GCT	4	12	105986	105997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435462
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1858	NC_022221	TAG	2	6	106158	106163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435462
1859	NC_022221	CGG	2	6	106195	106200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435462
1860	NC_022221	CAT	3	9	106201	106209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435462
1861	NC_022221	GCA	2	6	106309	106314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435462
1862	NC_022221	AAG	2	6	106315	106320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435462
1863	NC_022221	GCTTC	2	10	106558	106567	0 %	40 %	20 %	40 %	537435462
1864	NC_022221	GTA	2	6	106718	106723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435462
1865	NC_022221	GCT	2	6	106754	106759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435462
1866	NC_022221	TGCGT	2	10	106845	106854	0 %	40 %	40 %	20 %	537435462
1867	NC_022221	TACT	2	8	106875	106882	25 %	50 %	0 %	25 %	537435462
1868	NC_022221	TGC	2	6	106965	106970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435462
1869	NC_022221	GAT	2	6	107008	107013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435462
1870	NC_022221	GCCT	2	8	107066	107073	0 %	25 %	25 %	50 %	537435462
1871	NC_022221	ATA	2	6	107103	107108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435462
1872	NC_022221	CGG	2	6	107115	107120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435462
1873	NC_022221	TGG	2	6	107140	107145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435462
1874	NC_022221	TTC	2	6	107336	107341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435462
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1883	NC_022221	TGA	2	6	107853	107858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435462
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1887	NC_022221	TATT	2	8	107921	107928	25 %	75 %	0 %	0 %	537435463
1888	NC_022221	CAT	2	6	107933	107938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435463
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1893	NC_022221	CCA	2	6	108334	108339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435464
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1982	NC_022221	CAT	2	6	112160	112165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435466
1983	NC_022221	GCTC	2	8	112238	112245	0 %	25 %	25 %	50 %	537435466
1984	NC_022221	AGCGC	2	10	112265	112274	20 %	0 %	40 %	40 %	537435466
1985	NC_022221	TCT	2	6	112423	112428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435466
1986	NC_022221	GC	3	6	112518	112523	0 %	0 %	50 %	50 %	537435466
1987	NC_022221	CATC	2	8	112574	112581	25 %	25 %	0 %	50 %	537435466
1988	NC_022221	AGT	2	6	112851	112856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435467
1989	NC_022221	GAA	2	6	112882	112887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435467
1990	NC_022221	TTCC	2	8	112888	112895	0 %	50 %	0 %	50 %	537435467
1991	NC_022221	GCG	2	6	112939	112944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
1992	NC_022221	CTG	2	6	112946	112951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435467
1993	NC_022221	GAC	2	6	113023	113028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435467
1994	NC_022221	GCG	2	6	113061	113066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
1995	NC_022221	GCG	2	6	113074	113079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
1996	NC_022221	ACGTT	2	10	113082	113091	20 %	40 %	20 %	20 %	537435467
1997	NC_022221	CGCC	2	8	113149	113156	0 %	0 %	25 %	75 %	537435467
1998	NC_022221	GCG	2	6	113248	113253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435467
1999	NC_022221	GCTG	2	8	113296	113303	0 %	25 %	50 %	25 %	537435467
2000	NC_022221	T	6	6	113333	113338	0 %	100 %	0 %	0 %	537435467

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