MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022221	TCTAAC	2	12	58466	58477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435418
1002	NC_022221	GAA	2	6	58506	58511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435418
1003	NC_022221	CGA	2	6	58525	58530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435418
1004	NC_022221	GCG	2	6	58532	58537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435418
1005	NC_022221	AGG	2	6	58545	58550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435418
1006	NC_022221	GCC	2	6	58565	58570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435418
1007	NC_022221	CTG	2	6	58584	58589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435418
1008	NC_022221	GGC	3	9	58646	58654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435418
1009	NC_022221	GAA	2	6	58679	58684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435418
1010	NC_022221	T	6	6	58907	58912	0 %	100 %	0 %	0 %	537435419
1011	NC_022221	AAAAT	2	10	58947	58956	80 %	20 %	0 %	0 %	537435419
1012	NC_022221	TGGA	2	8	58989	58996	25 %	25 %	50 %	0 %	537435419
1013	NC_022221	CAA	2	6	58999	59004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435419
1014	NC_022221	GAA	2	6	59193	59198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435420
1015	NC_022221	CAG	2	6	59240	59245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435420
1016	NC_022221	A	6	6	59277	59282	100 %	0 %	0 %	0 %	537435420
1017	NC_022221	CACGAA	2	12	59345	59356	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	537435420
1018	NC_022221	GATT	2	8	59387	59394	25 %	50 %	25 %	0 %	537435420
1019	NC_022221	G	6	6	59503	59508	0 %	0 %	100 %	0 %	537435420
1020	NC_022221	GCG	2	6	59695	59700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435420
1021	NC_022221	TGC	2	6	59703	59708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435420
1022	NC_022221	GGAAA	2	10	59734	59743	60 %	0 %	40 %	0 %	537435420
1023	NC_022221	GATC	2	8	59756	59763	25 %	25 %	25 %	25 %	537435420
1024	NC_022221	TAT	2	6	59846	59851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435420
1025	NC_022221	CGC	2	6	59884	59889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435420
1026	NC_022221	ATT	2	6	60177	60182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435421
1027	NC_022221	TGA	2	6	60203	60208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435421
1028	NC_022221	CGCTG	2	10	60224	60233	0 %	20 %	40 %	40 %	537435421
1029	NC_022221	C	6	6	60238	60243	0 %	0 %	0 %	100 %	537435421
1030	NC_022221	TAA	2	6	60259	60264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435421
1031	NC_022221	A	6	6	60292	60297	100 %	0 %	0 %	0 %	537435421
1032	NC_022221	CGC	2	6	60367	60372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435421
1033	NC_022221	TGC	2	6	60373	60378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435421
1034	NC_022221	TGA	2	6	60496	60501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435421
1035	NC_022221	TG	3	6	60718	60723	0 %	50 %	50 %	0 %	537435421
1036	NC_022221	GTA	2	6	60835	60840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435421
1037	NC_022221	CTGG	2	8	60881	60888	0 %	25 %	50 %	25 %	537435421
1038	NC_022221	ACG	2	6	60960	60965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435421
1039	NC_022221	TGGCGC	2	12	61012	61023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435421
1040	NC_022221	GTGG	2	8	61046	61053	0 %	25 %	75 %	0 %	537435421
1041	NC_022221	TC	3	6	61122	61127	0 %	50 %	0 %	50 %	537435422
1042	NC_022221	CTG	2	6	61216	61221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435422
1043	NC_022221	CTG	2	6	61244	61249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435422
1044	NC_022221	CTGC	2	8	61256	61263	0 %	25 %	25 %	50 %	537435422
1045	NC_022221	TCA	2	6	61303	61308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435422
1046	NC_022221	TGC	2	6	61444	61449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435422
1047	NC_022221	CGG	2	6	61532	61537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435422
1048	NC_022221	AAT	2	6	61545	61550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435422
1049	NC_022221	A	6	6	61612	61617	100 %	0 %	0 %	0 %	537435422
1050	NC_022221	CTT	2	6	61659	61664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435422
1051	NC_022221	CGA	2	6	61691	61696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435422
1052	NC_022221	CCA	2	6	61727	61732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435422
1053	NC_022221	TTC	2	6	61792	61797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435423
1054	NC_022221	ATT	2	6	61840	61845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435423
1055	NC_022221	CGA	2	6	61851	61856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435423
1056	NC_022221	ACCA	2	8	61892	61899	50 %	0 %	0 %	50 %	537435423
1057	NC_022221	GGT	2	6	61930	61935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435423
1058	NC_022221	AAT	2	6	62002	62007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435423
1059	NC_022221	CAA	2	6	62103	62108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435423
1060	NC_022221	CATT	2	8	62117	62124	25 %	50 %	0 %	25 %	537435423
1061	NC_022221	CAA	2	6	62151	62156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435423
1062	NC_022221	ATA	2	6	62203	62208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435423
1063	NC_022221	GGT	3	9	62232	62240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435423
1064	NC_022221	TGG	2	6	62276	62281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435423
1065	NC_022221	CTG	3	9	62290	62298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435423
1066	NC_022221	CAGCGC	2	12	62302	62313	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435423
1067	NC_022221	CAG	2	6	62335	62340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435423
1068	NC_022221	TGG	2	6	62349	62354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435423
1069	NC_022221	TGC	2	6	62375	62380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435423
1070	NC_022221	GC	3	6	62384	62389	0 %	0 %	50 %	50 %	537435423
1071	NC_022221	TTG	2	6	62450	62455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435423
1072	NC_022221	TAA	2	6	62463	62468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435423
1073	NC_022221	AAT	2	6	62491	62496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435423
1074	NC_022221	T	6	6	62551	62556	0 %	100 %	0 %	0 %	537435423
1075	NC_022221	T	7	7	62558	62564	0 %	100 %	0 %	0 %	537435423
1076	NC_022221	GCG	2	6	62565	62570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435423
1077	NC_022221	AAG	2	6	62579	62584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435423
1078	NC_022221	TGG	2	6	62603	62608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435423
1079	NC_022221	GCG	2	6	62656	62661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435423
1080	NC_022221	ACA	2	6	62733	62738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435423
1081	NC_022221	GCT	2	6	62766	62771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435423
1082	NC_022221	GCG	2	6	62815	62820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435423
1083	NC_022221	ACA	2	6	62829	62834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435423
1084	NC_022221	CAG	3	9	62839	62847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435423
1085	NC_022221	CGT	2	6	63036	63041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435423
1086	NC_022221	CGC	2	6	63048	63053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435423
1087	NC_022221	AT	3	6	63059	63064	50 %	50 %	0 %	0 %	537435423
1088	NC_022221	TCAA	2	8	63158	63165	50 %	25 %	0 %	25 %	537435423
1089	NC_022221	TGG	2	6	63324	63329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435423
1090	NC_022221	CAG	2	6	63630	63635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1091	NC_022221	GCC	2	6	63682	63687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1092	NC_022221	CCG	2	6	63695	63700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1093	NC_022221	CCG	2	6	63707	63712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1094	NC_022221	TCA	2	6	63752	63757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435424
1095	NC_022221	GCC	2	6	63778	63783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1096	NC_022221	CAG	3	9	63810	63818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1097	NC_022221	CCA	2	6	63854	63859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435424
1098	NC_022221	CCA	2	6	63938	63943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435424
1099	NC_022221	CGC	2	6	63944	63949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1100	NC_022221	CAG	2	6	63984	63989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1101	NC_022221	CGGCG	2	10	63990	63999	0 %	0 %	60 %	40 %	537435424
1102	NC_022221	GCA	3	9	64004	64012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1103	NC_022221	CCA	2	6	64016	64021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435424
1104	NC_022221	GTA	2	6	64022	64027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435424
1105	NC_022221	CAC	2	6	64032	64037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435424
1106	NC_022221	T	6	6	64049	64054	0 %	100 %	0 %	0 %	537435424
1107	NC_022221	GC	4	8	64115	64122	0 %	0 %	50 %	50 %	537435424
1108	NC_022221	CGC	2	6	64167	64172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1109	NC_022221	CAG	2	6	64188	64193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1110	NC_022221	CGC	2	6	64241	64246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1111	NC_022221	GAT	2	6	64248	64253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435424
1112	NC_022221	GCC	3	9	64261	64269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1113	NC_022221	AGT	2	6	64298	64303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435424
1114	NC_022221	TCAGCG	2	12	64304	64315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1115	NC_022221	GCC	2	6	64348	64353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1116	NC_022221	AGC	2	6	64360	64365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1117	NC_022221	CAG	2	6	64383	64388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1118	NC_022221	GCG	2	6	64433	64438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435424
1119	NC_022221	AAC	2	6	64468	64473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435424
1120	NC_022221	CAGCGC	2	12	64539	64550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435424
1121	NC_022221	GC	3	6	64580	64585	0 %	0 %	50 %	50 %	537435424
1122	NC_022221	CGT	2	6	64622	64627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1123	NC_022221	CAG	2	6	64635	64640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1124	NC_022221	CAG	2	6	64686	64691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1125	NC_022221	CCG	2	6	64693	64698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435424
1126	NC_022221	GCA	3	9	64709	64717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1127	NC_022221	GCCA	2	8	64744	64751	25 %	0 %	25 %	50 %	537435424
1128	NC_022221	CAG	4	12	64752	64763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
1129	NC_022221	CAG	2	6	64770	64775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435424
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1134	NC_022221	CAG	2	6	64980	64985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435425
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1139	NC_022221	CGC	2	6	65138	65143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435425
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1233	NC_022221	GGCA	2	8	69722	69729	25 %	0 %	50 %	25 %	537435429
1234	NC_022221	TGA	2	6	69748	69753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435429
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1236	NC_022221	AG	3	6	69797	69802	50 %	0 %	50 %	0 %	537435429
1237	NC_022221	AGC	2	6	69811	69816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435429
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1241	NC_022221	GC	3	6	69904	69909	0 %	0 %	50 %	50 %	537435429
1242	NC_022221	GGC	3	9	69938	69946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435429
1243	NC_022221	TCG	2	6	70942	70947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435430
1244	NC_022221	CCA	2	6	70981	70986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435430
1245	NC_022221	GTG	2	6	70995	71000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435430
1246	NC_022221	GTG	2	6	71123	71128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435430
1247	NC_022221	CGG	2	6	71218	71223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435430
1248	NC_022221	CGTGC	2	10	71278	71287	0 %	20 %	40 %	40 %	537435430
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1250	NC_022221	CTGA	2	8	71390	71397	25 %	25 %	25 %	25 %	537435430
1251	NC_022221	TTGAT	2	10	71448	71457	20 %	60 %	20 %	0 %	537435430
1252	NC_022221	GGC	2	6	71551	71556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435430
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1257	NC_022221	GC	3	6	71889	71894	0 %	0 %	50 %	50 %	537435430
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1371	NC_022221	CG	3	6	77684	77689	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
1372	NC_022221	CTC	2	6	77697	77702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435437
1373	NC_022221	GGC	2	6	77745	77750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435437
1374	NC_022221	CGA	2	6	77775	77780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435437
1375	NC_022221	TGA	2	6	77783	77788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435437
1376	NC_022221	CGT	2	6	77816	77821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435437
1377	NC_022221	TCGG	2	8	77917	77924	0 %	25 %	50 %	25 %	537435437
1378	NC_022221	CGCA	2	8	77944	77951	25 %	0 %	25 %	50 %	537435437
1379	NC_022221	CGA	2	6	78024	78029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435437
1380	NC_022221	CCG	2	6	78051	78056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435437
1381	NC_022221	GAA	2	6	78178	78183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435437
1382	NC_022221	GGCG	2	8	78294	78301	0 %	0 %	75 %	25 %	537435437
1383	NC_022221	GCG	2	6	78376	78381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435437
1384	NC_022221	GCGAA	2	10	78431	78440	40 %	0 %	40 %	20 %	537435437
1385	NC_022221	CCGT	2	8	78442	78449	0 %	25 %	25 %	50 %	537435437
1386	NC_022221	CGG	3	9	78474	78482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435437
1387	NC_022221	ACT	2	6	78515	78520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435437
1388	NC_022221	CAT	2	6	78567	78572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435437
1389	NC_022221	CGG	2	6	78705	78710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435437
1390	NC_022221	GC	5	10	78730	78739	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
1391	NC_022221	TGAAGC	2	12	78833	78844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	537435437
1392	NC_022221	GAAA	2	8	78894	78901	75 %	0 %	25 %	0 %	537435437
1393	NC_022221	TGG	2	6	78914	78919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435437
1394	NC_022221	CTT	2	6	78926	78931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435437
1395	NC_022221	GGC	2	6	78940	78945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435437
1396	NC_022221	ACG	2	6	78965	78970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435437
1397	NC_022221	CTG	2	6	79030	79035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435437
1398	NC_022221	TGA	2	6	79047	79052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435437
1399	NC_022221	GTGGAC	2	12	79063	79074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537435437
1400	NC_022221	GGCG	2	8	79131	79138	0 %	0 %	75 %	25 %	537435437
1401	NC_022221	CAG	2	6	79210	79215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435437
1402	NC_022221	TGA	2	6	79253	79258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435437
1403	NC_022221	GCG	2	6	79315	79320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435437
1404	NC_022221	CGTAC	2	10	79321	79330	20 %	20 %	20 %	40 %	537435437
1405	NC_022221	GGC	2	6	79371	79376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435437
1406	NC_022221	GC	3	6	79375	79380	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
1407	NC_022221	TAC	2	6	79438	79443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435437
1408	NC_022221	GTG	2	6	79456	79461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435437
1409	NC_022221	CAA	2	6	79470	79475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435437
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1412	NC_022221	GCT	2	6	79614	79619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435437
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1414	NC_022221	GCT	2	6	79668	79673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435437
1415	NC_022221	GTC	2	6	79769	79774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435437
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1442	NC_022221	CAC	2	6	81311	81316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435439
1443	NC_022221	TCT	2	6	81520	81525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435440
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1452	NC_022221	CCG	2	6	81919	81924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435440
1453	NC_022221	GCC	2	6	81996	82001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435440
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1455	NC_022221	CGC	2	6	82079	82084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435440
1456	NC_022221	GGTC	2	8	82183	82190	0 %	25 %	50 %	25 %	537435440
1457	NC_022221	ACTC	2	8	82235	82242	25 %	25 %	0 %	50 %	537435440
1458	NC_022221	T	8	8	82308	82315	0 %	100 %	0 %	0 %	537435441
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1462	NC_022221	ATA	2	6	82533	82538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435441
1463	NC_022221	CGC	2	6	82570	82575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435441
1464	NC_022221	CATCCT	2	12	82618	82629	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	537435441
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1468	NC_022221	CGA	2	6	82873	82878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435441
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1482	NC_022221	GCT	2	6	83422	83427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435441
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1490	NC_022221	ATG	2	6	84062	84067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435442
1491	NC_022221	TCAGC	2	10	84186	84195	20 %	20 %	20 %	40 %	537435442
1492	NC_022221	GC	3	6	84199	84204	0 %	0 %	50 %	50 %	537435442
1493	NC_022221	GT	4	8	84221	84228	0 %	50 %	50 %	0 %	537435442
1494	NC_022221	GCCA	2	8	84230	84237	25 %	0 %	25 %	50 %	537435442
1495	NC_022221	CGA	2	6	84255	84260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435442
1496	NC_022221	GATG	2	8	84285	84292	25 %	25 %	50 %	0 %	537435442
1497	NC_022221	GGCCA	2	10	84334	84343	20 %	0 %	40 %	40 %	537435442
1498	NC_022221	GTA	2	6	84433	84438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435442
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1500	NC_022221	AGT	2	6	84486	84491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435442

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