MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022221	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
502	NC_022221	GC	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
503	NC_022221	GC	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
504	NC_022221	ACGGTG	2	12	28235	28246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537435392
505	NC_022221	TTG	2	6	28269	28274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435392
506	NC_022221	GT	3	6	28357	28362	0 %	50 %	50 %	0 %	537435392
507	NC_022221	ATC	2	6	28371	28376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435392
508	NC_022221	TC	3	6	28375	28380	0 %	50 %	0 %	50 %	537435392
509	NC_022221	TCC	2	6	28382	28387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435392
510	NC_022221	ACA	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435392
511	NC_022221	CTG	2	6	28451	28456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435393
512	NC_022221	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	537435393
513	NC_022221	A	6	6	28593	28598	100 %	0 %	0 %	0 %	537435393
514	NC_022221	GT	3	6	28622	28627	0 %	50 %	50 %	0 %	537435393
515	NC_022221	CCG	2	6	28629	28634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435393
516	NC_022221	TTC	2	6	28762	28767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435393
517	NC_022221	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	537435393
518	NC_022221	AAC	2	6	28793	28798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435393
519	NC_022221	ATG	2	6	28812	28817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435393
520	NC_022221	TCG	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435393
521	NC_022221	CCG	2	6	28947	28952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435393
522	NC_022221	A	6	6	29120	29125	100 %	0 %	0 %	0 %	537435393
523	NC_022221	ATG	2	6	29286	29291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435393
524	NC_022221	ACA	2	6	29366	29371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435393
525	NC_022221	GAC	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435394
526	NC_022221	AAC	2	6	29630	29635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435394
527	NC_022221	ATG	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435394
528	NC_022221	AAT	2	6	29838	29843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435394
529	NC_022221	GGT	2	6	29852	29857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435394
530	NC_022221	CGG	2	6	29944	29949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435394
531	NC_022221	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	537435394
532	NC_022221	TGC	2	6	30025	30030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435395
533	NC_022221	GGC	2	6	30032	30037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435395
534	NC_022221	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	537435395
535	NC_022221	CG	3	6	30168	30173	0 %	0 %	50 %	50 %	537435395
536	NC_022221	GCA	2	6	30223	30228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435395
537	NC_022221	GCG	2	6	30235	30240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435395
538	NC_022221	GCG	2	6	30261	30266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435395
539	NC_022221	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	537435395
540	NC_022221	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	537435395
541	NC_022221	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435395
542	NC_022221	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	537435396
543	NC_022221	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	537435396
544	NC_022221	TGG	2	6	30684	30689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435396
545	NC_022221	CGC	2	6	30740	30745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435396
546	NC_022221	ATT	2	6	30747	30752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435396
547	NC_022221	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	537435396
548	NC_022221	GGT	2	6	30786	30791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435396
549	NC_022221	CCG	2	6	30812	30817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435396
550	NC_022221	CGC	2	6	30846	30851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435396
551	NC_022221	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	537435396
552	NC_022221	GCA	2	6	30948	30953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435396
553	NC_022221	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	537435396
554	NC_022221	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	537435396
555	NC_022221	TTA	2	6	31036	31041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435396
556	NC_022221	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	537435396
557	NC_022221	TAT	2	6	31269	31274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435397
558	NC_022221	TAT	2	6	31276	31281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435397
559	NC_022221	CGC	2	6	31350	31355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435397
560	NC_022221	CGG	2	6	31388	31393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435397
561	NC_022221	GTCA	2	8	31405	31412	25 %	25 %	25 %	25 %	537435397
562	NC_022221	GGT	2	6	31431	31436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435397
563	NC_022221	CGC	2	6	31473	31478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435397
564	NC_022221	CAG	2	6	31501	31506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435397
565	NC_022221	CAA	2	6	31513	31518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435397
566	NC_022221	AGC	2	6	31567	31572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435397
567	NC_022221	GCG	2	6	31603	31608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435397
568	NC_022221	GTG	2	6	31609	31614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435397
569	NC_022221	GTG	2	6	31638	31643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435397
570	NC_022221	T	6	6	31721	31726	0 %	100 %	0 %	0 %	537435397
571	NC_022221	GGC	2	6	31752	31757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435397
572	NC_022221	GGGCG	2	10	31788	31797	0 %	0 %	80 %	20 %	537435397
573	NC_022221	GCC	2	6	31909	31914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435397
574	NC_022221	AAG	2	6	31919	31924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435397
575	NC_022221	AGC	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435397
576	NC_022221	ATG	2	6	31946	31951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435397
577	NC_022221	CTC	2	6	31954	31959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435397
578	NC_022221	GCA	2	6	31977	31982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435397
579	NC_022221	GTC	2	6	32011	32016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435397
580	NC_022221	TGCGT	2	10	32167	32176	0 %	40 %	40 %	20 %	537435398
581	NC_022221	ACCG	2	8	32225	32232	25 %	0 %	25 %	50 %	537435398
582	NC_022221	GTT	2	6	32256	32261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435398
583	NC_022221	AGGC	2	8	32263	32270	25 %	0 %	50 %	25 %	537435398
584	NC_022221	ATA	2	6	32308	32313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435398
585	NC_022221	TAT	2	6	32333	32338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435398
586	NC_022221	ATT	2	6	32392	32397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435398
587	NC_022221	AAAAG	2	10	32561	32570	80 %	0 %	20 %	0 %	537435399
588	NC_022221	A	7	7	32581	32587	100 %	0 %	0 %	0 %	537435399
589	NC_022221	TTA	2	6	32614	32619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435399
590	NC_022221	CAG	2	6	32660	32665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435399
591	NC_022221	CCTG	2	8	32699	32706	0 %	25 %	25 %	50 %	537435399
592	NC_022221	AACA	2	8	32715	32722	75 %	0 %	0 %	25 %	537435399
593	NC_022221	TGT	2	6	32740	32745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435399
594	NC_022221	TCG	2	6	32751	32756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435399
595	NC_022221	CAG	2	6	32757	32762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435399
596	NC_022221	AAG	2	6	32766	32771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435399
597	NC_022221	ATC	2	6	32830	32835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435399
598	NC_022221	CGCA	2	8	32889	32896	25 %	0 %	25 %	50 %	537435399
599	NC_022221	T	6	6	32916	32921	0 %	100 %	0 %	0 %	537435399
600	NC_022221	ATT	2	6	32935	32940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435399
601	NC_022221	TAAA	2	8	32959	32966	75 %	25 %	0 %	0 %	537435399
602	NC_022221	TTA	2	6	32971	32976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435399
603	NC_022221	A	6	6	33374	33379	100 %	0 %	0 %	0 %	537435400
604	NC_022221	A	7	7	33384	33390	100 %	0 %	0 %	0 %	537435400
605	NC_022221	TTA	2	6	33424	33429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435400
606	NC_022221	GCG	2	6	33450	33455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435400
607	NC_022221	GCG	2	6	33477	33482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435400
608	NC_022221	TC	3	6	33484	33489	0 %	50 %	0 %	50 %	537435400
609	NC_022221	CTT	2	6	33495	33500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435400
610	NC_022221	TTAT	2	8	33528	33535	25 %	75 %	0 %	0 %	537435400
611	NC_022221	TGA	2	6	33724	33729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435400
612	NC_022221	AT	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	537435400
613	NC_022221	A	7	7	33759	33765	100 %	0 %	0 %	0 %	537435400
614	NC_022221	TCA	2	6	33814	33819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435400
615	NC_022221	GAT	2	6	33845	33850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435400
616	NC_022221	TGTTTG	2	12	33884	33895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435400
617	NC_022221	A	6	6	33901	33906	100 %	0 %	0 %	0 %	537435400
618	NC_022221	TTGG	2	8	33912	33919	0 %	50 %	50 %	0 %	537435400
619	NC_022221	A	6	6	33925	33930	100 %	0 %	0 %	0 %	537435400
620	NC_022221	TA	3	6	33937	33942	50 %	50 %	0 %	0 %	537435400
621	NC_022221	TGC	2	6	33950	33955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435400
622	NC_022221	TCT	2	6	33987	33992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435400
623	NC_022221	AGT	2	6	34023	34028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435400
624	NC_022221	TTA	2	6	34058	34063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435400
625	NC_022221	GTT	2	6	34092	34097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435400
626	NC_022221	A	6	6	34099	34104	100 %	0 %	0 %	0 %	537435400
627	NC_022221	GCG	2	6	34157	34162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435400
628	NC_022221	TATAA	2	10	34164	34173	60 %	40 %	0 %	0 %	537435400
629	NC_022221	TAC	2	6	34177	34182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435400
630	NC_022221	TGA	2	6	34190	34195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435400
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632	NC_022221	A	6	6	34263	34268	100 %	0 %	0 %	0 %	537435400
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750	NC_022221	A	6	6	40835	40840	100 %	0 %	0 %	0 %	537435406
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753	NC_022221	GGC	2	6	41144	41149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435406
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