MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_022221	GTG	2	6	3226261	3226266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438404
55502	NC_022221	TAA	2	6	3226280	3226285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438404
55503	NC_022221	CAC	2	6	3226341	3226346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438404
55504	NC_022221	ATAA	2	8	3226375	3226382	75 %	25 %	0 %	0 %	537438404
55505	NC_022221	TCC	2	6	3226825	3226830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438405
55506	NC_022221	CT	3	6	3226873	3226878	0 %	50 %	0 %	50 %	537438405
55507	NC_022221	CCA	2	6	3226880	3226885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438405
55508	NC_022221	TTC	2	6	3226894	3226899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438405
55509	NC_022221	TCTG	2	8	3226951	3226958	0 %	50 %	25 %	25 %	537438405
55510	NC_022221	GCG	2	6	3227041	3227046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438405
55511	NC_022221	TTG	2	6	3227075	3227080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438405
55512	NC_022221	AATT	2	8	3227091	3227098	50 %	50 %	0 %	0 %	537438405
55513	NC_022221	CGC	2	6	3227112	3227117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438405
55514	NC_022221	CGC	2	6	3227193	3227198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438405
55515	NC_022221	CCG	2	6	3227204	3227209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438405
55516	NC_022221	GTG	2	6	3227257	3227262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438405
55517	NC_022221	ATC	2	6	3227295	3227300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438405
55518	NC_022221	CGC	2	6	3227343	3227348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438405
55519	NC_022221	GCC	2	6	3227356	3227361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438405
55520	NC_022221	GT	3	6	3227470	3227475	0 %	50 %	50 %	0 %	537438405
55521	NC_022221	CAGC	2	8	3227556	3227563	25 %	0 %	25 %	50 %	537438405
55522	NC_022221	CAAGC	2	10	3227571	3227580	40 %	0 %	20 %	40 %	537438405
55523	NC_022221	CAA	3	9	3227748	3227756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438405
55524	NC_022221	ATA	2	6	3227818	3227823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438405
55525	NC_022221	ACC	2	6	3227881	3227886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438405
55526	NC_022221	TAC	2	6	3227906	3227911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438405
55527	NC_022221	CGG	2	6	3227948	3227953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438405
55528	NC_022221	TCA	2	6	3227959	3227964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438405
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55530	NC_022221	ATC	2	6	3228016	3228021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438405
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55532	NC_022221	GTGA	2	8	3228228	3228235	25 %	25 %	50 %	0 %	537438405
55533	NC_022221	GGTC	2	8	3228248	3228255	0 %	25 %	50 %	25 %	537438405
55534	NC_022221	ATC	3	9	3228273	3228281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438405
55535	NC_022221	GCTG	2	8	3228296	3228303	0 %	25 %	50 %	25 %	537438405
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55538	NC_022221	ACT	2	6	3228871	3228876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438407
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55540	NC_022221	G	6	6	3229017	3229022	0 %	0 %	100 %	0 %	537438407
55541	NC_022221	TGT	2	6	3229055	3229060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438407
55542	NC_022221	CCG	2	6	3229066	3229071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438407
55543	NC_022221	AAC	2	6	3229090	3229095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438407
55544	NC_022221	GGC	2	6	3229151	3229156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438407
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55546	NC_022221	CCA	2	6	3229276	3229281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438407
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55548	NC_022221	GC	3	6	3229309	3229314	0 %	0 %	50 %	50 %	537438407
55549	NC_022221	A	7	7	3229428	3229434	100 %	0 %	0 %	0 %	537438407
55550	NC_022221	CGA	2	6	3229439	3229444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438407
55551	NC_022221	AGC	2	6	3229448	3229453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438407
55552	NC_022221	GGC	2	6	3229482	3229487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438407
55553	NC_022221	GCC	2	6	3229496	3229501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438407
55554	NC_022221	GC	3	6	3229546	3229551	0 %	0 %	50 %	50 %	537438407
55555	NC_022221	TGA	2	6	3229552	3229557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438407
55556	NC_022221	GCG	3	9	3229660	3229668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438407
55557	NC_022221	CCA	2	6	3229684	3229689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438407
55558	NC_022221	ACC	2	6	3229740	3229745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438407
55559	NC_022221	TGC	2	6	3229772	3229777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438407
55560	NC_022221	CTG	2	6	3229800	3229805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438407
55561	NC_022221	GC	3	6	3229902	3229907	0 %	0 %	50 %	50 %	537438407
55562	NC_022221	AAT	2	6	3230010	3230015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438407
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55564	NC_022221	TAC	2	6	3230344	3230349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438408
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55566	NC_022221	GGC	2	6	3230422	3230427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438408
55567	NC_022221	GC	4	8	3230440	3230447	0 %	0 %	50 %	50 %	537438408
55568	NC_022221	CGG	2	6	3230473	3230478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438408
55569	NC_022221	TGA	2	6	3230505	3230510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438408
55570	NC_022221	CGG	2	6	3230512	3230517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438408
55571	NC_022221	ACG	2	6	3230529	3230534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438408
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55574	NC_022221	CGA	2	6	3230725	3230730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438408
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55576	NC_022221	ACG	2	6	3230769	3230774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438408
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55578	NC_022221	GTA	2	6	3230894	3230899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438408
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55580	NC_022221	TAT	3	9	3230932	3230940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438408
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55583	NC_022221	CGA	2	6	3230986	3230991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438408
55584	NC_022221	TAAT	2	8	3231036	3231043	50 %	50 %	0 %	0 %	537438408
55585	NC_022221	TGGC	2	8	3231052	3231059	0 %	25 %	50 %	25 %	537438408
55586	NC_022221	CGCCA	2	10	3231082	3231091	20 %	0 %	20 %	60 %	537438408
55587	NC_022221	CG	3	6	3231204	3231209	0 %	0 %	50 %	50 %	537438408
55588	NC_022221	TGCCGA	2	12	3231247	3231258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537438408
55589	NC_022221	GGATC	2	10	3231331	3231340	20 %	20 %	40 %	20 %	537438408
55590	NC_022221	CCT	2	6	3231357	3231362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438408
55591	NC_022221	CGG	2	6	3231453	3231458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438408
55592	NC_022221	GGCT	2	8	3231459	3231466	0 %	25 %	50 %	25 %	537438408
55593	NC_022221	CGC	2	6	3231478	3231483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438408
55594	NC_022221	CG	3	6	3231486	3231491	0 %	0 %	50 %	50 %	537438408
55595	NC_022221	CAT	2	6	3231494	3231499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438408
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55600	NC_022221	ATC	2	6	3231732	3231737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438408
55601	NC_022221	ACCT	2	8	3231749	3231756	25 %	25 %	0 %	50 %	537438408
55602	NC_022221	GCG	2	6	3231810	3231815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438408
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55604	NC_022221	CAGG	2	8	3231920	3231927	25 %	0 %	50 %	25 %	537438408
55605	NC_022221	TGC	2	6	3231981	3231986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438408
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55607	NC_022221	CG	3	6	3232043	3232048	0 %	0 %	50 %	50 %	537438408
55608	NC_022221	GC	3	6	3232058	3232063	0 %	0 %	50 %	50 %	537438408
55609	NC_022221	GAT	2	6	3232072	3232077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438408
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55612	NC_022221	CGA	3	9	3232102	3232110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438408
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55615	NC_022221	CGC	2	6	3232216	3232221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438408
55616	NC_022221	CGG	2	6	3232243	3232248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438408
55617	NC_022221	TTG	2	6	3232448	3232453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438409
55618	NC_022221	TCG	2	6	3232461	3232466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438409
55619	NC_022221	TCT	2	6	3232482	3232487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438409
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55621	NC_022221	ATG	2	6	3232564	3232569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438409
55622	NC_022221	TGG	2	6	3232610	3232615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438409
55623	NC_022221	CGG	2	6	3232618	3232623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438409
55624	NC_022221	AACGG	2	10	3232644	3232653	40 %	0 %	40 %	20 %	537438409
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55628	NC_022221	GC	4	8	3232885	3232892	0 %	0 %	50 %	50 %	537438409
55629	NC_022221	GCG	2	6	3232977	3232982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438409
55630	NC_022221	GC	3	6	3233023	3233028	0 %	0 %	50 %	50 %	537438409
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55636	NC_022221	GC	3	6	3233367	3233372	0 %	0 %	50 %	50 %	537438409
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55687	NC_022221	TCTT	2	8	3237799	3237806	0 %	75 %	0 %	25 %	537438413
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55735	NC_022221	CAT	2	6	3240074	3240079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438415
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55997	NC_022221	ATG	2	6	3258755	3258760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438431
55998	NC_022221	T	6	6	3258818	3258823	0 %	100 %	0 %	0 %	537438431
55999	NC_022221	CAC	2	6	3258893	3258898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438431
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