MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022221	GCA	2	6	280958	280963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5002	NC_022221	CTG	2	6	280989	280994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5003	NC_022221	CCGG	2	8	281016	281023	0 %	0 %	50 %	50 %	537435611
5004	NC_022221	CTT	2	6	281067	281072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435611
5005	NC_022221	GA	3	6	281084	281089	50 %	0 %	50 %	0 %	537435611
5006	NC_022221	T	6	6	281180	281185	0 %	100 %	0 %	0 %	537435611
5007	NC_022221	GC	4	8	281192	281199	0 %	0 %	50 %	50 %	537435611
5008	NC_022221	GCA	2	6	281210	281215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5009	NC_022221	GCT	2	6	281279	281284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5010	NC_022221	CGG	2	6	281323	281328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
5011	NC_022221	CT	3	6	281343	281348	0 %	50 %	0 %	50 %	537435611
5012	NC_022221	CGG	2	6	281373	281378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
5013	NC_022221	GCG	2	6	281379	281384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
5014	NC_022221	GCTG	2	8	281395	281402	0 %	25 %	50 %	25 %	537435611
5015	NC_022221	AGG	2	6	281455	281460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435611
5016	NC_022221	TGGCGC	2	12	281461	281472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435611
5017	NC_022221	CGA	2	6	281474	281479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5018	NC_022221	TGG	2	6	281538	281543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435611
5019	NC_022221	ACA	2	6	281561	281566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435611
5020	NC_022221	ACG	2	6	281571	281576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5021	NC_022221	CTGC	2	8	281610	281617	0 %	25 %	25 %	50 %	537435611
5022	NC_022221	GGC	2	6	281646	281651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
5023	NC_022221	GAA	2	6	281673	281678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435611
5024	NC_022221	CGA	2	6	281784	281789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5025	NC_022221	GTT	3	9	281801	281809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435611
5026	NC_022221	AGC	2	6	281861	281866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
5027	NC_022221	AGA	2	6	281867	281872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435611
5028	NC_022221	AAG	2	6	281875	281880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435611
5029	NC_022221	ATG	2	6	282176	282181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435612
5030	NC_022221	TCAT	2	8	282237	282244	25 %	50 %	0 %	25 %	537435613
5031	NC_022221	GCA	2	6	282274	282279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435613
5032	NC_022221	GCC	2	6	282322	282327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435613
5033	NC_022221	CGT	2	6	282664	282669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435614
5034	NC_022221	ATG	2	6	282752	282757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435614
5035	NC_022221	TGA	2	6	282787	282792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435614
5036	NC_022221	ATC	2	6	282855	282860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435614
5037	NC_022221	GCGA	2	8	282929	282936	25 %	0 %	50 %	25 %	537435614
5038	NC_022221	GCG	2	6	282965	282970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435614
5039	NC_022221	TGG	2	6	282977	282982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435614
5040	NC_022221	CAG	2	6	282983	282988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435614
5041	NC_022221	GC	3	6	283002	283007	0 %	0 %	50 %	50 %	537435614
5042	NC_022221	CGA	2	6	283095	283100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435614
5043	NC_022221	AAT	2	6	283136	283141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435614
5044	NC_022221	CG	3	6	283237	283242	0 %	0 %	50 %	50 %	537435615
5045	NC_022221	GGT	2	6	283252	283257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435615
5046	NC_022221	TAT	2	6	283327	283332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435615
5047	NC_022221	GCCA	2	8	283351	283358	25 %	0 %	25 %	50 %	537435615
5048	NC_022221	GAT	2	6	283372	283377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435615
5049	NC_022221	TCATTA	2	12	283382	283393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	537435615
5050	NC_022221	CGC	2	6	283525	283530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435615
5051	NC_022221	TCT	2	6	283552	283557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435615
5052	NC_022221	TCG	2	6	283581	283586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435615
5053	NC_022221	TAA	2	6	283693	283698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435616
5054	NC_022221	GGC	2	6	283732	283737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435616
5055	NC_022221	GCA	2	6	283753	283758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435616
5056	NC_022221	GCG	2	6	283767	283772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435616
5057	NC_022221	TGC	2	6	283773	283778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435616
5058	NC_022221	TGA	2	6	283839	283844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435616
5059	NC_022221	GAA	2	6	283868	283873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435616
5060	NC_022221	TAT	2	6	283955	283960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435616
5061	NC_022221	CG	3	6	283961	283966	0 %	0 %	50 %	50 %	537435616
5062	NC_022221	GTAT	3	12	284082	284093	25 %	50 %	25 %	0 %	537435616
5063	NC_022221	GCG	2	6	284105	284110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435616
5064	NC_022221	TGC	2	6	284211	284216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435616
5065	NC_022221	CACT	2	8	284323	284330	25 %	25 %	0 %	50 %	537435616
5066	NC_022221	TCG	2	6	284497	284502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435617
5067	NC_022221	GTC	2	6	284592	284597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435617
5068	NC_022221	GC	4	8	284618	284625	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
5069	NC_022221	AGC	2	6	284795	284800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
5070	NC_022221	CAA	2	6	284972	284977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435617
5071	NC_022221	AGT	2	6	285014	285019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435617
5072	NC_022221	GGC	2	6	285060	285065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435617
5073	NC_022221	CGAT	2	8	285073	285080	25 %	25 %	25 %	25 %	537435617
5074	NC_022221	ATTA	2	8	285129	285136	50 %	50 %	0 %	0 %	537435617
5075	NC_022221	TCT	2	6	285148	285153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435617
5076	NC_022221	TTCA	2	8	285207	285214	25 %	50 %	0 %	25 %	537435617
5077	NC_022221	CGC	2	6	285224	285229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
5078	NC_022221	CAG	2	6	285234	285239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
5079	NC_022221	CCA	2	6	285242	285247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435617
5080	NC_022221	CAG	2	6	285279	285284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
5081	NC_022221	T	6	6	285296	285301	0 %	100 %	0 %	0 %	537435617
5082	NC_022221	CCA	2	6	285323	285328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435617
5083	NC_022221	CGC	2	6	285381	285386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
5084	NC_022221	GC	3	6	285388	285393	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
5085	NC_022221	GCG	2	6	285401	285406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435617
5086	NC_022221	CGC	2	6	285473	285478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
5087	NC_022221	GCC	2	6	285513	285518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
5088	NC_022221	CG	3	6	285543	285548	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
5089	NC_022221	TCA	2	6	285653	285658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435617
5090	NC_022221	CG	3	6	285665	285670	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
5091	NC_022221	TCA	2	6	285700	285705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435617
5092	NC_022221	GAA	2	6	285726	285731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435617
5093	NC_022221	CTT	2	6	285788	285793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435617
5094	NC_022221	GCA	2	6	285842	285847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
5095	NC_022221	CT	3	6	285877	285882	0 %	50 %	0 %	50 %	537435617
5096	NC_022221	GGCT	2	8	285894	285901	0 %	25 %	50 %	25 %	537435617
5097	NC_022221	GTT	2	6	285936	285941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435617
5098	NC_022221	CACG	2	8	285950	285957	25 %	0 %	25 %	50 %	537435617
5099	NC_022221	T	6	6	285969	285974	0 %	100 %	0 %	0 %	537435617
5100	NC_022221	TA	3	6	286004	286009	50 %	50 %	0 %	0 %	537435617
5101	NC_022221	ATC	2	6	286030	286035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435617
5102	NC_022221	GC	3	6	286039	286044	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
5103	NC_022221	TGG	2	6	286054	286059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435617
5104	NC_022221	TGT	2	6	286124	286129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435617
5105	NC_022221	AAAT	2	8	286381	286388	75 %	25 %	0 %	0 %	537435618
5106	NC_022221	CGT	2	6	286418	286423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435618
5107	NC_022221	GGC	3	9	286493	286501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435618
5108	NC_022221	CCA	2	6	286561	286566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435618
5109	NC_022221	CT	3	6	286596	286601	0 %	50 %	0 %	50 %	537435618
5110	NC_022221	GCC	2	6	286726	286731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435618
5111	NC_022221	GCC	2	6	286733	286738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435618
5112	NC_022221	TGA	2	6	286749	286754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435618
5113	NC_022221	CGC	2	6	286840	286845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435618
5114	NC_022221	GACCA	2	10	286856	286865	40 %	0 %	20 %	40 %	537435618
5115	NC_022221	GCT	2	6	286934	286939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435618
5116	NC_022221	AGC	2	6	286989	286994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435619
5117	NC_022221	GC	3	6	287077	287082	0 %	0 %	50 %	50 %	537435619
5118	NC_022221	CGC	2	6	287130	287135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435619
5119	NC_022221	AAC	2	6	287295	287300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435619
5120	NC_022221	ATA	2	6	287342	287347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435619
5121	NC_022221	CACCG	2	10	287474	287483	20 %	0 %	20 %	60 %	537435620
5122	NC_022221	TCA	2	6	287517	287522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435620
5123	NC_022221	T	6	6	287543	287548	0 %	100 %	0 %	0 %	537435620
5124	NC_022221	CTGG	2	8	287654	287661	0 %	25 %	50 %	25 %	537435620
5125	NC_022221	TGA	2	6	287674	287679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435620
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5127	NC_022221	CAA	2	6	287737	287742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435620
5128	NC_022221	CGA	2	6	287764	287769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435620
5129	NC_022221	GCA	4	12	287830	287841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435620
5130	NC_022221	GGTCG	2	10	287858	287867	0 %	20 %	60 %	20 %	537435620
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5132	NC_022221	T	7	7	287917	287923	0 %	100 %	0 %	0 %	537435620
5133	NC_022221	TTTC	2	8	288112	288119	0 %	75 %	0 %	25 %	537435620
5134	NC_022221	TGC	2	6	288147	288152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435620
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5137	NC_022221	TCA	2	6	288402	288407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435621
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5139	NC_022221	GCC	2	6	288475	288480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435621
5140	NC_022221	ACCAG	2	10	288530	288539	40 %	0 %	20 %	40 %	537435621
5141	NC_022221	GCG	2	6	288579	288584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435621
5142	NC_022221	TCGC	2	8	288594	288601	0 %	25 %	25 %	50 %	537435621
5143	NC_022221	AAC	2	6	288632	288637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435621
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5155	NC_022221	CCGC	2	8	289077	289084	0 %	0 %	25 %	75 %	537435622
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5223	NC_022221	TG	3	6	298113	298118	0 %	50 %	50 %	0 %	537435626
5224	NC_022221	CTATG	2	10	298179	298188	20 %	40 %	20 %	20 %	537435626
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5226	NC_022221	GC	3	6	298281	298286	0 %	0 %	50 %	50 %	537435626
5227	NC_022221	ATTG	2	8	298288	298295	25 %	50 %	25 %	0 %	537435626
5228	NC_022221	GGC	2	6	298403	298408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435626
5229	NC_022221	GTTC	2	8	298455	298462	0 %	50 %	25 %	25 %	537435626
5230	NC_022221	AAAGG	2	10	298523	298532	60 %	0 %	40 %	0 %	537435626
5231	NC_022221	TCCAGC	2	12	298611	298622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537435627
5232	NC_022221	TGC	2	6	298623	298628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435627
5233	NC_022221	GGC	2	6	298635	298640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435627
5234	NC_022221	CGCTG	2	10	298693	298702	0 %	20 %	40 %	40 %	537435627
5235	NC_022221	GA	3	6	298829	298834	50 %	0 %	50 %	0 %	537435627
5236	NC_022221	AAC	2	6	298835	298840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435627
5237	NC_022221	TAAT	2	8	298925	298932	50 %	50 %	0 %	0 %	537435628
5238	NC_022221	TG	3	6	299031	299036	0 %	50 %	50 %	0 %	537435628
5239	NC_022221	TCCAGA	2	12	299113	299124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537435628
5240	NC_022221	TTG	2	6	299146	299151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435628
5241	NC_022221	ATC	2	6	299172	299177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435628
5242	NC_022221	GTC	2	6	299208	299213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435628
5243	NC_022221	CAC	2	6	299229	299234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435628
5244	NC_022221	GCG	2	6	299277	299282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435628
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5264	NC_022221	AACCC	2	10	300575	300584	40 %	0 %	0 %	60 %	537435629
5265	NC_022221	CG	4	8	300645	300652	0 %	0 %	50 %	50 %	537435629
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5271	NC_022221	GC	3	6	301109	301114	0 %	0 %	50 %	50 %	537435629
5272	NC_022221	GC	3	6	301161	301166	0 %	0 %	50 %	50 %	537435629
5273	NC_022221	GCG	2	6	301181	301186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435629
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5340	NC_022221	GC	3	6	304853	304858	0 %	0 %	50 %	50 %	537435631
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5365	NC_022221	AG	3	6	305737	305742	50 %	0 %	50 %	0 %	537435632
5366	NC_022221	TGG	2	6	305771	305776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435632
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5369	NC_022221	AAG	2	6	305828	305833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435632
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5401	NC_022221	T	6	6	308827	308832	0 %	100 %	0 %	0 %	537435635
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5487	NC_022221	GCA	2	6	313769	313774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435640
5488	NC_022221	A	6	6	313797	313802	100 %	0 %	0 %	0 %	537435640
5489	NC_022221	GCG	2	6	313815	313820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435640
5490	NC_022221	GGC	2	6	313841	313846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435640
5491	NC_022221	TCG	2	6	313867	313872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435640
5492	NC_022221	CAA	2	6	313908	313913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435640
5493	NC_022221	ATG	2	6	313944	313949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435640
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5500	NC_022221	CAGT	2	8	314284	314291	25 %	25 %	25 %	25 %	537435641

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