MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022221	GTC	2	6	253641	253646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4502	NC_022221	GCAG	2	8	253711	253718	25 %	0 %	50 %	25 %	537435588
4503	NC_022221	AGC	2	6	253747	253752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4504	NC_022221	AGT	2	6	253790	253795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435588
4505	NC_022221	TCA	2	6	253799	253804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435588
4506	NC_022221	CGC	2	6	253829	253834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435588
4507	NC_022221	CAG	2	6	253875	253880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4508	NC_022221	ACC	2	6	253900	253905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435588
4509	NC_022221	CG	3	6	253959	253964	0 %	0 %	50 %	50 %	537435588
4510	NC_022221	CCA	2	6	253991	253996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435588
4511	NC_022221	CGAG	2	8	254003	254010	25 %	0 %	50 %	25 %	537435588
4512	NC_022221	GCC	2	6	254064	254069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435588
4513	NC_022221	GCT	2	6	254073	254078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4514	NC_022221	TGG	2	6	254122	254127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435588
4515	NC_022221	GGC	2	6	254151	254156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435588
4516	NC_022221	CAG	2	6	254235	254240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4517	NC_022221	CAGA	2	8	254276	254283	50 %	0 %	25 %	25 %	537435588
4518	NC_022221	CAG	2	6	254289	254294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4519	NC_022221	CGTA	2	8	254307	254314	25 %	25 %	25 %	25 %	537435588
4520	NC_022221	ATA	2	6	254345	254350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435588
4521	NC_022221	CAG	2	6	254355	254360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435588
4522	NC_022221	CGC	2	6	254444	254449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435588
4523	NC_022221	GCC	2	6	254457	254462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435588
4524	NC_022221	TTCGG	2	10	254541	254550	0 %	40 %	40 %	20 %	537435588
4525	NC_022221	CCAG	2	8	254597	254604	25 %	0 %	25 %	50 %	537435588
4526	NC_022221	GC	3	6	254653	254658	0 %	0 %	50 %	50 %	537435588
4527	NC_022221	AGGG	2	8	254688	254695	25 %	0 %	75 %	0 %	537435588
4528	NC_022221	ATT	2	6	254975	254980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435589
4529	NC_022221	CGT	2	6	254981	254986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435589
4530	NC_022221	GT	3	6	254985	254990	0 %	50 %	50 %	0 %	537435589
4531	NC_022221	GAT	2	6	254991	254996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435589
4532	NC_022221	ACG	2	6	255190	255195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435589
4533	NC_022221	CAT	2	6	255209	255214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435589
4534	NC_022221	GCA	2	6	255218	255223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435589
4535	NC_022221	TTC	2	6	255231	255236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435589
4536	NC_022221	CCTTCG	2	12	255289	255300	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	537435589
4537	NC_022221	GGC	2	6	255315	255320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435589
4538	NC_022221	CT	3	6	255376	255381	0 %	50 %	0 %	50 %	537435589
4539	NC_022221	CGA	2	6	255425	255430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435589
4540	NC_022221	CAC	2	6	255540	255545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435589
4541	NC_022221	AGGC	2	8	255592	255599	25 %	0 %	50 %	25 %	537435589
4542	NC_022221	GTT	2	6	255611	255616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435589
4543	NC_022221	GGT	2	6	255657	255662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435589
4544	NC_022221	T	6	6	255731	255736	0 %	100 %	0 %	0 %	537435589
4545	NC_022221	GC	3	6	256318	256323	0 %	0 %	50 %	50 %	537435590
4546	NC_022221	CAT	2	6	256337	256342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435590
4547	NC_022221	CTGAA	2	10	256384	256393	40 %	20 %	20 %	20 %	537435590
4548	NC_022221	AAGCG	2	10	256448	256457	40 %	0 %	40 %	20 %	537435590
4549	NC_022221	GCT	2	6	256467	256472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435590
4550	NC_022221	TTC	2	6	256488	256493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435590
4551	NC_022221	GCTG	2	8	256504	256511	0 %	25 %	50 %	25 %	537435590
4552	NC_022221	AAGA	2	8	256611	256618	75 %	0 %	25 %	0 %	537435590
4553	NC_022221	AAC	2	6	256749	256754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435590
4554	NC_022221	GAA	2	6	256920	256925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435590
4555	NC_022221	TAA	2	6	256944	256949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435590
4556	NC_022221	ATG	2	6	257261	257266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435591
4557	NC_022221	A	6	6	257273	257278	100 %	0 %	0 %	0 %	537435591
4558	NC_022221	CTGA	2	8	257282	257289	25 %	25 %	25 %	25 %	537435591
4559	NC_022221	GCG	2	6	257348	257353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435591
4560	NC_022221	A	6	6	257354	257359	100 %	0 %	0 %	0 %	537435591
4561	NC_022221	GCT	2	6	257372	257377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435591
4562	NC_022221	GACT	2	8	257440	257447	25 %	25 %	25 %	25 %	537435591
4563	NC_022221	CGC	2	6	257497	257502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435591
4564	NC_022221	GAA	2	6	257549	257554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435591
4565	NC_022221	TCG	2	6	257599	257604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435591
4566	NC_022221	GC	3	6	257651	257656	0 %	0 %	50 %	50 %	537435591
4567	NC_022221	GCAA	2	8	257726	257733	50 %	0 %	25 %	25 %	537435591
4568	NC_022221	CTG	2	6	257763	257768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435591
4569	NC_022221	GAAA	2	8	257827	257834	75 %	0 %	25 %	0 %	537435591
4570	NC_022221	GAA	2	6	257863	257868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435591
4571	NC_022221	CTG	2	6	257936	257941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435591
4572	NC_022221	GACT	2	8	258010	258017	25 %	25 %	25 %	25 %	537435591
4573	NC_022221	GCA	2	6	258020	258025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435591
4574	NC_022221	TGC	2	6	258031	258036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435591
4575	NC_022221	GCG	2	6	258249	258254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435592
4576	NC_022221	TGGTG	2	10	258352	258361	0 %	40 %	60 %	0 %	537435592
4577	NC_022221	GGT	2	6	258368	258373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435592
4578	NC_022221	CGCC	2	8	258502	258509	0 %	0 %	25 %	75 %	537435592
4579	NC_022221	CTG	2	6	258572	258577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435592
4580	NC_022221	TAA	2	6	258580	258585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435592
4581	NC_022221	TCTG	2	8	258598	258605	0 %	50 %	25 %	25 %	537435592
4582	NC_022221	TTC	2	6	258623	258628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435592
4583	NC_022221	GGC	2	6	258805	258810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435592
4584	NC_022221	GC	3	6	258870	258875	0 %	0 %	50 %	50 %	537435592
4585	NC_022221	CGT	2	6	258878	258883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435592
4586	NC_022221	GTG	2	6	258884	258889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435592
4587	NC_022221	AAG	2	6	258900	258905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435592
4588	NC_022221	AAT	2	6	258921	258926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435592
4589	NC_022221	CTG	2	6	259177	259182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435593
4590	NC_022221	AGA	2	6	259248	259253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435593
4591	NC_022221	GCC	2	6	259377	259382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435593
4592	NC_022221	GAA	2	6	259390	259395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435593
4593	NC_022221	CGT	2	6	259396	259401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435593
4594	NC_022221	CCG	2	6	259464	259469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435593
4595	NC_022221	CTG	2	6	259495	259500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435593
4596	NC_022221	TCG	2	6	259530	259535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435593
4597	NC_022221	GAA	2	6	259543	259548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435593
4598	NC_022221	GCG	2	6	259588	259593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435593
4599	NC_022221	AAG	2	6	259604	259609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435593
4600	NC_022221	TGAT	2	8	259627	259634	25 %	50 %	25 %	0 %	537435593
4601	NC_022221	GTG	2	6	259681	259686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435594
4602	NC_022221	AGA	2	6	259702	259707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435594
4603	NC_022221	GCG	2	6	259726	259731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435594
4604	NC_022221	GCA	2	6	259814	259819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435594
4605	NC_022221	GTG	2	6	259828	259833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435594
4606	NC_022221	TGG	2	6	259868	259873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435594
4607	NC_022221	CGC	2	6	259919	259924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435594
4608	NC_022221	AAT	2	6	259968	259973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435594
4609	NC_022221	CAG	2	6	259978	259983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435594
4610	NC_022221	CAG	2	6	260014	260019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435594
4611	NC_022221	GGC	2	6	260034	260039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435594
4612	NC_022221	TGA	2	6	260043	260048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435594
4613	NC_022221	GGC	2	6	260064	260069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435594
4614	NC_022221	GGC	2	6	260103	260108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435594
4615	NC_022221	CTG	2	6	260131	260136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435594
4616	NC_022221	GCGG	2	8	260162	260169	0 %	0 %	75 %	25 %	537435594
4617	NC_022221	GCA	2	6	260192	260197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435594
4618	NC_022221	TGG	2	6	260328	260333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435594
4619	NC_022221	GTC	2	6	260390	260395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435594
4620	NC_022221	CCA	2	6	260438	260443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435594
4621	NC_022221	TGA	2	6	260444	260449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435594
4622	NC_022221	ATCC	2	8	260518	260525	25 %	25 %	0 %	50 %	537435594
4623	NC_022221	TCAT	2	8	260534	260541	25 %	50 %	0 %	25 %	537435594
4624	NC_022221	ATGGC	2	10	260620	260629	20 %	20 %	40 %	20 %	537435594
4625	NC_022221	GC	3	6	260648	260653	0 %	0 %	50 %	50 %	537435594
4626	NC_022221	GC	3	6	260678	260683	0 %	0 %	50 %	50 %	537435594
4627	NC_022221	GC	3	6	260693	260698	0 %	0 %	50 %	50 %	537435594
4628	NC_022221	GGC	2	6	260757	260762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435594
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4631	NC_022221	TGA	2	6	260895	260900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435594
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4633	NC_022221	ATGG	2	8	261349	261356	25 %	25 %	50 %	0 %	537435595
4634	NC_022221	GTCC	2	8	261420	261427	0 %	25 %	25 %	50 %	537435595
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4638	NC_022221	TG	3	6	261543	261548	0 %	50 %	50 %	0 %	537435595
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4642	NC_022221	TGC	2	6	261773	261778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435595
4643	NC_022221	TGA	2	6	261792	261797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435595
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4645	NC_022221	ACTTT	2	10	261915	261924	20 %	60 %	0 %	20 %	537435595
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4650	NC_022221	GCC	2	6	262119	262124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435596
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4652	NC_022221	CGC	2	6	262197	262202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435596
4653	NC_022221	TGGC	2	8	262219	262226	0 %	25 %	50 %	25 %	537435596
4654	NC_022221	TG	3	6	262232	262237	0 %	50 %	50 %	0 %	537435596
4655	NC_022221	TTG	2	6	262264	262269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435596
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4729	NC_022221	TCT	2	6	266513	266518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435599
4730	NC_022221	CCAG	2	8	266555	266562	25 %	0 %	25 %	50 %	537435599
4731	NC_022221	TCT	2	6	266654	266659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435599
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4739	NC_022221	A	6	6	267231	267236	100 %	0 %	0 %	0 %	537435600
4740	NC_022221	TGG	2	6	267262	267267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435600
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4743	NC_022221	CAA	2	6	267448	267453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435601
4744	NC_022221	GCG	2	6	267561	267566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435601
4745	NC_022221	CG	3	6	267596	267601	0 %	0 %	50 %	50 %	537435601
4746	NC_022221	TAC	2	6	267620	267625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435601
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4773	NC_022221	TGAT	2	8	268939	268946	25 %	50 %	25 %	0 %	537435603
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4861	NC_022221	GCA	2	6	273494	273499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435606
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4863	NC_022221	CGG	2	6	273596	273601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435606
4864	NC_022221	TGC	2	6	273610	273615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435606
4865	NC_022221	GGA	2	6	273641	273646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435606
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4899	NC_022221	TGA	2	6	275243	275248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435607
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4901	NC_022221	TGA	2	6	275273	275278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435607
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4983	NC_022221	CGC	2	6	279494	279499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435609
4984	NC_022221	TGG	2	6	279502	279507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435609
4985	NC_022221	TGA	2	6	279518	279523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435609
4986	NC_022221	GTG	3	9	279531	279539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435609
4987	NC_022221	A	6	6	279541	279546	100 %	0 %	0 %	0 %	537435609
4988	NC_022221	CTG	2	6	279561	279566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
4989	NC_022221	GCT	2	6	279608	279613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
4990	NC_022221	TGC	2	6	279781	279786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
4991	NC_022221	GAT	2	6	279809	279814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435609
4992	NC_022221	CTG	2	6	279990	279995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
4993	NC_022221	TGCTC	2	10	279997	280006	0 %	40 %	20 %	40 %	537435609
4994	NC_022221	TCA	2	6	280182	280187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435610
4995	NC_022221	TCCCT	2	10	280344	280353	0 %	40 %	0 %	60 %	537435610
4996	NC_022221	T	6	6	280503	280508	0 %	100 %	0 %	0 %	537435610
4997	NC_022221	CT	3	6	280644	280649	0 %	50 %	0 %	50 %	537435611
4998	NC_022221	GCG	2	6	280675	280680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
4999	NC_022221	TCA	2	6	280763	280768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435611
5000	NC_022221	GC	3	6	280902	280907	0 %	0 %	50 %	50 %	537435611

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