MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 1566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022001	ACC	3	9	58245	58253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239228
1002	NC_022001	CG	3	6	58259	58264	0 %	0 %	50 %	50 %	529239228
1003	NC_022001	CGC	2	6	58267	58272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239228
1004	NC_022001	GAC	2	6	58313	58318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239228
1005	NC_022001	GTGG	2	8	58345	58352	0 %	25 %	75 %	0 %	529239228
1006	NC_022001	CGG	2	6	58370	58375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239228
1007	NC_022001	CGA	2	6	58405	58410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239228
1008	NC_022001	AAC	2	6	58535	58540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529239228
1009	NC_022001	GCC	2	6	58575	58580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239228
1010	NC_022001	TCG	2	6	58581	58586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239228
1011	NC_022001	ACG	2	6	58587	58592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239228
1012	NC_022001	CCA	2	6	58603	58608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239228
1013	NC_022001	GCC	2	6	58900	58905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239229
1014	NC_022001	CTTC	2	8	58923	58930	0 %	50 %	0 %	50 %	529239229
1015	NC_022001	TCG	2	6	59036	59041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239229
1016	NC_022001	CGA	2	6	59070	59075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239229
1017	NC_022001	GTC	2	6	59122	59127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239229
1018	NC_022001	GCC	2	6	59131	59136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239229
1019	NC_022001	GCC	2	6	59149	59154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239229
1020	NC_022001	TGA	2	6	59241	59246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239229
1021	NC_022001	TGCCG	2	10	59251	59260	0 %	20 %	40 %	40 %	529239229
1022	NC_022001	CAG	2	6	59287	59292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239229
1023	NC_022001	TCGGC	2	10	59337	59346	0 %	20 %	40 %	40 %	529239229
1024	NC_022001	CGG	2	6	59365	59370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239229
1025	NC_022001	GTG	2	6	59372	59377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239229
1026	NC_022001	GCG	2	6	59382	59387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239229
1027	NC_022001	GGTC	2	8	59394	59401	0 %	25 %	50 %	25 %	529239229
1028	NC_022001	TGT	2	6	59479	59484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529239230
1029	NC_022001	GCC	2	6	59493	59498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239230
1030	NC_022001	TGT	2	6	59531	59536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529239230
1031	NC_022001	GCC	2	6	59538	59543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239230
1032	NC_022001	CTT	2	6	59556	59561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239230
1033	NC_022001	GACCGA	2	12	59574	59585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239230
1034	NC_022001	GTA	2	6	59628	59633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239230
1035	NC_022001	CGT	2	6	59639	59644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239230
1036	NC_022001	TTC	2	6	59677	59682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239230
1037	NC_022001	CGG	2	6	59744	59749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239230
1038	NC_022001	CTT	3	9	59781	59789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239230
1039	NC_022001	GTC	2	6	59796	59801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239230
1040	NC_022001	CTT	2	6	59805	59810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239230
1041	NC_022001	CGG	3	9	59843	59851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239230
1042	NC_022001	CTT	2	6	59856	59861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239230
1043	NC_022001	GAC	2	6	59875	59880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239230
1044	NC_022001	GC	3	6	59900	59905	0 %	0 %	50 %	50 %	529239230
1045	NC_022001	GCC	3	9	59922	59930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239230
1046	NC_022001	TGA	2	6	59942	59947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239230
1047	NC_022001	CGA	2	6	59969	59974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239230
1048	NC_022001	AGG	2	6	61170	61175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239231
1049	NC_022001	CG	3	6	61183	61188	0 %	0 %	50 %	50 %	529239231
1050	NC_022001	CGA	2	6	61195	61200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239231
1051	NC_022001	CTT	2	6	61216	61221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239231
1052	NC_022001	CGA	2	6	61285	61290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239231
1053	NC_022001	CGG	2	6	61305	61310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239231
1054	NC_022001	CGC	2	6	61418	61423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239231
1055	NC_022001	CTC	2	6	61436	61441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239231
1056	NC_022001	CGA	2	6	61444	61449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239231
1057	NC_022001	CGG	2	6	61471	61476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239231
1058	NC_022001	CTC	2	6	61490	61495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239231
1059	NC_022001	CGG	2	6	61545	61550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239231
1060	NC_022001	CA	3	6	61555	61560	50 %	0 %	0 %	50 %	529239231
1061	NC_022001	ACC	2	6	61598	61603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239231
1062	NC_022001	GACC	2	8	61621	61628	25 %	0 %	25 %	50 %	529239231
1063	NC_022001	GCC	2	6	61671	61676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239231
1064	NC_022001	CG	3	6	61742	61747	0 %	0 %	50 %	50 %	529239232
1065	NC_022001	GAC	3	9	61762	61770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1066	NC_022001	GAA	2	6	61810	61815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239232
1067	NC_022001	CGA	2	6	61869	61874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1068	NC_022001	CGC	2	6	61894	61899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239232
1069	NC_022001	CG	3	6	61925	61930	0 %	0 %	50 %	50 %	529239232
1070	NC_022001	ACC	2	6	61980	61985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239232
1071	NC_022001	GCC	2	6	62060	62065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239232
1072	NC_022001	CGT	2	6	62076	62081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1073	NC_022001	ACG	2	6	62082	62087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1074	NC_022001	CCTA	2	8	62120	62127	25 %	25 %	0 %	50 %	529239232
1075	NC_022001	CCG	2	6	62156	62161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239232
1076	NC_022001	GAC	2	6	62200	62205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1077	NC_022001	GCA	3	9	62206	62214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1078	NC_022001	GCCT	2	8	62224	62231	0 %	25 %	25 %	50 %	529239232
1079	NC_022001	CAT	2	6	62238	62243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239232
1080	NC_022001	CGC	2	6	62248	62253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239232
1081	NC_022001	TCT	2	6	62264	62269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239232
1082	NC_022001	CGC	2	6	62280	62285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239232
1083	NC_022001	CGC	2	6	62304	62309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239232
1084	NC_022001	CCT	2	6	62313	62318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239232
1085	NC_022001	CTA	2	6	62325	62330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239232
1086	NC_022001	CGA	2	6	62337	62342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1087	NC_022001	CCT	2	6	62385	62390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239232
1088	NC_022001	C	6	6	62414	62419	0 %	0 %	0 %	100 %	529239232
1089	NC_022001	GCCC	2	8	62458	62465	0 %	0 %	25 %	75 %	529239232
1090	NC_022001	CGA	2	6	62472	62477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239232
1091	NC_022001	CAC	2	6	62504	62509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239232
1092	NC_022001	TCC	2	6	62513	62518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239232
1093	NC_022001	CTT	2	6	63497	63502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239233
1094	NC_022001	CGGC	2	8	63566	63573	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
1095	NC_022001	TCG	2	6	63582	63587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1096	NC_022001	CG	3	6	63598	63603	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
1097	NC_022001	GTG	2	6	63632	63637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239233
1098	NC_022001	CGT	2	6	63668	63673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1099	NC_022001	AGCCG	2	10	63723	63732	20 %	0 %	40 %	40 %	529239233
1100	NC_022001	AGG	2	6	63756	63761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239233
1101	NC_022001	GCC	2	6	63773	63778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239233
1102	NC_022001	GCT	2	6	63791	63796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1103	NC_022001	TCG	2	6	63921	63926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1104	NC_022001	CCGC	2	8	63997	64004	0 %	0 %	25 %	75 %	529239233
1105	NC_022001	CGCA	2	8	64114	64121	25 %	0 %	25 %	50 %	529239233
1106	NC_022001	GCG	2	6	64122	64127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239233
1107	NC_022001	GGACA	2	10	64148	64157	40 %	0 %	40 %	20 %	529239233
1108	NC_022001	TGG	2	6	64224	64229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239233
1109	NC_022001	CGG	2	6	64237	64242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239233
1110	NC_022001	CCG	2	6	64260	64265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239233
1111	NC_022001	GAT	2	6	64291	64296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239233
1112	NC_022001	GCAC	2	8	64304	64311	25 %	0 %	25 %	50 %	529239233
1113	NC_022001	ATC	2	6	64328	64333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239233
1114	NC_022001	TCG	2	6	64437	64442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1115	NC_022001	GAC	2	6	64481	64486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1116	NC_022001	CGG	2	6	64510	64515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239233
1117	NC_022001	CCG	2	6	64516	64521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239233
1118	NC_022001	AGC	2	6	64527	64532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1119	NC_022001	CGA	2	6	64555	64560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1120	NC_022001	CCGG	2	8	64581	64588	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
1121	NC_022001	CGC	2	6	64603	64608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239233
1122	NC_022001	ACG	2	6	64614	64619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1123	NC_022001	GTG	2	6	64645	64650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239233
1124	NC_022001	GTC	2	6	64651	64656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1125	NC_022001	CGA	2	6	64684	64689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1126	NC_022001	CGA	2	6	64699	64704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1127	NC_022001	GAC	2	6	64706	64711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1128	NC_022001	GAG	2	6	64730	64735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239233
1129	NC_022001	GC	4	8	64794	64801	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
1130	NC_022001	GGC	3	9	64825	64833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239233
1131	NC_022001	GCA	2	6	64848	64853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1132	NC_022001	TG	3	6	64963	64968	0 %	50 %	50 %	0 %	529239233
1133	NC_022001	CG	3	6	64996	65001	0 %	0 %	50 %	50 %	529239233
1134	NC_022001	CGA	2	6	65011	65016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1135	NC_022001	CTG	2	6	65018	65023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1136	NC_022001	CTG	2	6	65039	65044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1137	NC_022001	CCAC	2	8	65082	65089	25 %	0 %	0 %	75 %	529239233
1138	NC_022001	CGT	2	6	65128	65133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1139	NC_022001	GGCTC	2	10	65157	65166	0 %	20 %	40 %	40 %	529239233
1140	NC_022001	CGG	2	6	65178	65183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239233
1141	NC_022001	GAC	2	6	65201	65206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1142	NC_022001	GCGG	2	8	65284	65291	0 %	0 %	75 %	25 %	529239233
1143	NC_022001	GGC	2	6	65296	65301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239233
1144	NC_022001	GCC	2	6	65303	65308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239233
1145	NC_022001	CGT	2	6	65326	65331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239233
1146	NC_022001	GCGG	2	8	65473	65480	0 %	0 %	75 %	25 %	529239234
1147	NC_022001	GCC	2	6	65492	65497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239234
1148	NC_022001	GCT	2	6	65543	65548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239234
1149	NC_022001	ATCC	2	8	65549	65556	25 %	25 %	0 %	50 %	529239234
1150	NC_022001	ACG	3	9	65564	65572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239234
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1152	NC_022001	CGT	2	6	65679	65684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239234
1153	NC_022001	TCG	2	6	65777	65782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239234
1154	NC_022001	ACG	2	6	65912	65917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239234
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1157	NC_022001	GACC	2	8	66006	66013	25 %	0 %	25 %	50 %	529239234
1158	NC_022001	AAG	2	6	66026	66031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239234
1159	NC_022001	CGC	2	6	66061	66066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239234
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1163	NC_022001	CAG	2	6	66220	66225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239234
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1165	NC_022001	CAG	2	6	66295	66300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239234
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1167	NC_022001	GC	3	6	66889	66894	0 %	0 %	50 %	50 %	529239235
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1169	NC_022001	GCA	2	6	66933	66938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239235
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1189	NC_022001	GTCG	2	8	67809	67816	0 %	25 %	50 %	25 %	529239236
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1230	NC_022001	TCT	2	6	68946	68951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529239237
1231	NC_022001	TGAC	2	8	68977	68984	25 %	25 %	25 %	25 %	529239237
1232	NC_022001	CCT	2	6	69016	69021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239238
1233	NC_022001	CGG	2	6	69033	69038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239238
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1235	NC_022001	CCAGCC	2	12	69109	69120	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	529239238
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1240	NC_022001	GGGC	2	8	69393	69400	0 %	0 %	75 %	25 %	529239239
1241	NC_022001	CGC	2	6	69412	69417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239239
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1247	NC_022001	ATC	2	6	69672	69677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239239
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1249	NC_022001	GCG	2	6	69944	69949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239240
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1252	NC_022001	CCG	2	6	70133	70138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239240
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1281	NC_022001	GCG	2	6	71202	71207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239242
1282	NC_022001	CGG	3	9	71209	71217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239242
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1498	NC_022001	GCCG	2	8	81592	81599	0 %	0 %	50 %	50 %	529239253
1499	NC_022001	CCA	2	6	81642	81647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239253
1500	NC_022001	GTTCA	2	10	81823	81832	20 %	40 %	20 %	20 %	529239254

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