MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 1566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022001	CCTG	2	8	32475	32482	0 %	25 %	25 %	50 %	529239208
502	NC_022001	AGC	2	6	32595	32600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239208
503	NC_022001	GCC	4	12	32612	32623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239208
504	NC_022001	GCG	2	6	32649	32654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239208
505	NC_022001	C	6	6	32727	32732	0 %	0 %	0 %	100 %	529239208
506	NC_022001	CCG	2	6	32742	32747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239208
507	NC_022001	AGA	2	6	32772	32777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239208
508	NC_022001	CAC	2	6	32796	32801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239209
509	NC_022001	CGC	2	6	32817	32822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239209
510	NC_022001	CTGGC	2	10	32848	32857	0 %	20 %	40 %	40 %	529239209
511	NC_022001	CAC	2	6	32892	32897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239209
512	NC_022001	CGA	2	6	32913	32918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239209
513	NC_022001	CGC	2	6	32919	32924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239209
514	NC_022001	CGC	2	6	32940	32945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239209
515	NC_022001	CGA	2	6	32970	32975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239209
516	NC_022001	CGC	2	6	33000	33005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239209
517	NC_022001	CGGC	2	8	33032	33039	0 %	0 %	50 %	50 %	529239209
518	NC_022001	CCG	3	9	33050	33058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239209
519	NC_022001	GAC	2	6	33079	33084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239209
520	NC_022001	CCA	2	6	33092	33097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239209
521	NC_022001	CGG	2	6	33111	33116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239209
522	NC_022001	ACC	2	6	33133	33138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239209
523	NC_022001	CAG	2	6	33175	33180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239209
524	NC_022001	CGCC	2	8	33231	33238	0 %	0 %	25 %	75 %	529239210
525	NC_022001	GGCC	2	8	33262	33269	0 %	0 %	50 %	50 %	529239210
526	NC_022001	CGC	3	9	33283	33291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
527	NC_022001	GGC	2	6	33292	33297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239210
528	NC_022001	CGC	2	6	33385	33390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
529	NC_022001	CGC	2	6	33403	33408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
530	NC_022001	CCGG	2	8	33446	33453	0 %	0 %	50 %	50 %	529239210
531	NC_022001	GCC	2	6	33458	33463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
532	NC_022001	CCG	2	6	33472	33477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
533	NC_022001	CGGGTG	2	12	33525	33536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	529239210
534	NC_022001	CGG	2	6	33537	33542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239210
535	NC_022001	TCA	2	6	33567	33572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239210
536	NC_022001	TGG	2	6	33578	33583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239210
537	NC_022001	CCCA	2	8	33602	33609	25 %	0 %	0 %	75 %	529239210
538	NC_022001	CGA	3	9	33670	33678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
539	NC_022001	ATC	2	6	33698	33703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239210
540	NC_022001	CAG	2	6	33719	33724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
541	NC_022001	GCC	2	6	33737	33742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
542	NC_022001	CGC	2	6	33748	33753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
543	NC_022001	CGG	2	6	33846	33851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239210
544	NC_022001	CGA	2	6	33879	33884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
545	NC_022001	GAG	2	6	33890	33895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239210
546	NC_022001	GCG	2	6	33902	33907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239210
547	NC_022001	CAC	2	6	33940	33945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239210
548	NC_022001	ACG	2	6	33963	33968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
549	NC_022001	CTGGAG	2	12	34049	34060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	529239210
550	NC_022001	TCGCCC	2	12	34071	34082	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	529239210
551	NC_022001	GCACG	2	10	34138	34147	20 %	0 %	40 %	40 %	529239210
552	NC_022001	CTC	2	6	34153	34158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
553	NC_022001	GCC	2	6	34221	34226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
554	NC_022001	CCT	2	6	34231	34236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
555	NC_022001	TCG	2	6	34278	34283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239210
556	NC_022001	GCT	2	6	34309	34314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239210
557	NC_022001	GGT	2	6	34354	34359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239210
558	NC_022001	GC	3	6	34440	34445	0 %	0 %	50 %	50 %	529239210
559	NC_022001	GAT	2	6	34462	34467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239210
560	NC_022001	GTC	2	6	34529	34534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239210
561	NC_022001	CGA	2	6	34537	34542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
562	NC_022001	TGC	2	6	34551	34556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239210
563	NC_022001	TCC	2	6	34565	34570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
564	NC_022001	ACC	2	6	34575	34580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239210
565	NC_022001	AGC	2	6	34602	34607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
566	NC_022001	CGT	2	6	34639	34644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239210
567	NC_022001	CTC	2	6	34706	34711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
568	NC_022001	CGG	3	9	34714	34722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239210
569	NC_022001	CTGCG	2	10	34733	34742	0 %	20 %	40 %	40 %	529239210
570	NC_022001	GAT	2	6	34807	34812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239210
571	NC_022001	GCC	4	12	34880	34891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
572	NC_022001	CCT	2	6	34921	34926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
573	NC_022001	CCG	2	6	35003	35008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
574	NC_022001	GCGCGA	2	12	35035	35046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	529239210
575	NC_022001	CCT	2	6	35110	35115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
576	NC_022001	CGC	2	6	35116	35121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
577	NC_022001	CTC	2	6	35137	35142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239210
578	NC_022001	CAG	2	6	35194	35199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
579	NC_022001	CCG	2	6	35298	35303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239210
580	NC_022001	GAA	2	6	35365	35370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239210
581	NC_022001	GCA	2	6	35408	35413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239210
582	NC_022001	CACCGA	2	12	35424	35435	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529239211
583	NC_022001	CTC	2	6	35479	35484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239211
584	NC_022001	CGG	2	6	35525	35530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239211
585	NC_022001	C	6	6	35543	35548	0 %	0 %	0 %	100 %	529239211
586	NC_022001	CGC	2	6	35553	35558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239211
587	NC_022001	CCG	2	6	35560	35565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239211
588	NC_022001	GCT	2	6	35669	35674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239211
589	NC_022001	GC	3	6	35681	35686	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
590	NC_022001	GC	3	6	35688	35693	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
591	NC_022001	CGGC	2	8	35696	35703	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
592	NC_022001	CGC	2	6	35712	35717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239211
593	NC_022001	CCT	3	9	35736	35744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239211
594	NC_022001	CGC	2	6	35755	35760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239211
595	NC_022001	AAG	2	6	35770	35775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529239211
596	NC_022001	CCT	2	6	35789	35794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239211
597	NC_022001	GCC	2	6	35839	35844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239211
598	NC_022001	GC	3	6	35850	35855	0 %	0 %	50 %	50 %	529239211
599	NC_022001	CCG	2	6	35856	35861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239211
600	NC_022001	TCGTTC	2	12	35892	35903	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529239212
601	NC_022001	GAC	2	6	35925	35930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239212
602	NC_022001	TCGTTC	2	12	35934	35945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529239212
603	NC_022001	CGA	2	6	35966	35971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239212
604	NC_022001	CTCGTT	2	12	35978	35989	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	529239212
605	NC_022001	TCC	2	6	36055	36060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239212
606	NC_022001	TCG	2	6	36064	36069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239212
607	NC_022001	GCAG	2	8	36079	36086	25 %	0 %	50 %	25 %	529239212
608	NC_022001	GCA	2	6	36585	36590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239213
609	NC_022001	TCGG	2	8	36659	36666	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
610	NC_022001	CAG	2	6	36680	36685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239213
611	NC_022001	TCGCT	2	10	36691	36700	0 %	40 %	20 %	40 %	529239213
612	NC_022001	GGC	2	6	36725	36730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239213
613	NC_022001	AGT	2	6	36774	36779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239213
614	NC_022001	CAG	2	6	36806	36811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239213
615	NC_022001	TCGCT	2	10	36817	36826	0 %	40 %	20 %	40 %	529239213
616	NC_022001	AGT	2	6	36900	36905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239213
617	NC_022001	CAG	2	6	36932	36937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239213
618	NC_022001	TCGCT	2	10	36943	36952	0 %	40 %	20 %	40 %	529239213
619	NC_022001	AGG	2	6	36973	36978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239213
620	NC_022001	CGGT	2	8	36993	37000	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
621	NC_022001	AGT	2	6	37026	37031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239213
622	NC_022001	CGG	2	6	37042	37047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239213
623	NC_022001	CAG	2	6	37058	37063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239213
624	NC_022001	TCGCT	2	10	37069	37078	0 %	40 %	20 %	40 %	529239213
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626	NC_022001	TCGG	2	8	37163	37170	0 %	25 %	50 %	25 %	529239213
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754	NC_022001	AGG	2	6	42525	42530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239217
755	NC_022001	CGC	2	6	42574	42579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239217
756	NC_022001	CGC	2	6	42592	42597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239217
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759	NC_022001	GGA	2	6	42697	42702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239217
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876	NC_022001	GCC	2	6	49909	49914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239223
877	NC_022001	CCA	3	9	49954	49962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239223
878	NC_022001	GTC	2	6	50042	50047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239223
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