MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021984	CCG	2	6	161432	161437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218884
2502	NC_021984	ATT	2	6	161450	161455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218884
2503	NC_021984	TTA	2	6	161513	161518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221986
2504	NC_021984	GCCG	2	8	161558	161565	0 %	0 %	50 %	50 %	529221986
2505	NC_021984	CGT	2	6	161569	161574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221986
2506	NC_021984	CAG	2	6	161702	161707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221986
2507	NC_021984	GCA	2	6	161838	161843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221986
2508	NC_021984	TCT	2	6	161847	161852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221986
2509	NC_021984	CGA	2	6	161902	161907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221986
2510	NC_021984	TCT	2	6	162102	162107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221986
2511	NC_021984	TCG	2	6	162265	162270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221986
2512	NC_021984	CGA	2	6	162288	162293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221986
2513	NC_021984	CATA	2	8	162337	162344	50 %	25 %	0 %	25 %	529221986
2514	NC_021984	GTC	2	6	162410	162415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221986
2515	NC_021984	TAC	2	6	162505	162510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221986
2516	NC_021984	TAA	2	6	162604	162609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530331571
2517	NC_021984	ATG	2	6	162616	162621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530331571
2518	NC_021984	GCG	2	6	162681	162686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530331571
2519	NC_021984	GGA	2	6	162734	162739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530331571
2520	NC_021984	TTG	2	6	162756	162761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530331571
2521	NC_021984	ACC	2	6	162768	162773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530331571
2522	NC_021984	TGA	2	6	162842	162847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530331571
2523	NC_021984	CGG	2	6	162916	162921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530331571
2524	NC_021984	AACG	2	8	163020	163027	50 %	0 %	25 %	25 %	530331571
2525	NC_021984	CGC	2	6	163147	163152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530331571
2526	NC_021984	TCA	2	6	163168	163173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530331571
2527	NC_021984	TC	3	6	163301	163306	0 %	50 %	0 %	50 %	530331571
2528	NC_021984	CGC	2	6	163307	163312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530331571
2529	NC_021984	GAG	2	6	163395	163400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530331571
2530	NC_021984	CTGC	2	8	163404	163411	0 %	25 %	25 %	50 %	530331571
2531	NC_021984	TAT	2	6	163431	163436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530331571
2532	NC_021984	CG	3	6	163443	163448	0 %	0 %	50 %	50 %	530331571
2533	NC_021984	TATT	2	8	163471	163478	25 %	75 %	0 %	0 %	530331571
2534	NC_021984	ATT	2	6	163480	163485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530331571
2535	NC_021984	GTC	2	6	163547	163552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218885
2536	NC_021984	CGC	2	6	163567	163572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218885
2537	NC_021984	CGG	2	6	163594	163599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218885
2538	NC_021984	C	6	6	163663	163668	0 %	0 %	0 %	100 %	529218885
2539	NC_021984	GAC	2	6	163670	163675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218885
2540	NC_021984	ACG	2	6	163701	163706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218885
2541	NC_021984	GCA	2	6	163870	163875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218886
2542	NC_021984	CGT	2	6	163882	163887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218886
2543	NC_021984	GATCA	2	10	163949	163958	40 %	20 %	20 %	20 %	529218886
2544	NC_021984	TGT	2	6	164034	164039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218886
2545	NC_021984	GCC	2	6	164084	164089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218886
2546	NC_021984	GCT	2	6	164140	164145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218886
2547	NC_021984	CTG	2	6	164192	164197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218886
2548	NC_021984	GCT	2	6	164260	164265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218886
2549	NC_021984	CAG	2	6	164282	164287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218886
2550	NC_021984	A	6	6	164343	164348	100 %	0 %	0 %	0 %	529218886
2551	NC_021984	TCT	2	6	164431	164436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218886
2552	NC_021984	TTA	2	6	164567	164572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218887
2553	NC_021984	GC	3	6	164599	164604	0 %	0 %	50 %	50 %	529218887
2554	NC_021984	CG	3	6	164646	164651	0 %	0 %	50 %	50 %	529218887
2555	NC_021984	CAT	2	6	164655	164660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218887
2556	NC_021984	CGTCA	2	10	164695	164704	20 %	20 %	20 %	40 %	529218887
2557	NC_021984	ACC	2	6	164705	164710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218887
2558	NC_021984	CAG	2	6	164749	164754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218887
2559	NC_021984	CTG	2	6	164812	164817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218887
2560	NC_021984	TTC	2	6	164854	164859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218887
2561	NC_021984	A	6	6	164868	164873	100 %	0 %	0 %	0 %	529218887
2562	NC_021984	CGG	2	6	164910	164915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218887
2563	NC_021984	GGGC	2	8	164955	164962	0 %	0 %	75 %	25 %	529218887
2564	NC_021984	GC	3	6	164983	164988	0 %	0 %	50 %	50 %	529218887
2565	NC_021984	AAT	2	6	164989	164994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218887
2566	NC_021984	CCG	2	6	165065	165070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218887
2567	NC_021984	GAA	2	6	165328	165333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218888
2568	NC_021984	ATT	2	6	165463	165468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218888
2569	NC_021984	CTG	2	6	165536	165541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218888
2570	NC_021984	A	6	6	165650	165655	100 %	0 %	0 %	0 %	529218888
2571	NC_021984	TCG	2	6	165740	165745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218888
2572	NC_021984	ACG	2	6	165877	165882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218888
2573	NC_021984	CGG	2	6	165917	165922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218888
2574	NC_021984	GGC	2	6	165955	165960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218888
2575	NC_021984	GGC	2	6	165976	165981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218888
2576	NC_021984	CGG	3	9	166014	166022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218888
2577	NC_021984	GGC	2	6	166042	166047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218888
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2579	NC_021984	CGG	2	6	166071	166076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218888
2580	NC_021984	AGA	2	6	166086	166091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218888
2581	NC_021984	CGG	2	6	166155	166160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218888
2582	NC_021984	CG	3	6	166174	166179	0 %	0 %	50 %	50 %	529218888
2583	NC_021984	CCGC	2	8	166229	166236	0 %	0 %	25 %	75 %	529218888
2584	NC_021984	CAC	2	6	166308	166313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218888
2585	NC_021984	ATCCC	2	10	166395	166404	20 %	20 %	0 %	60 %	529218889
2586	NC_021984	CCA	3	9	166446	166454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218889
2587	NC_021984	TGA	2	6	166476	166481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218889
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2590	NC_021984	T	6	6	166640	166645	0 %	100 %	0 %	0 %	529218889
2591	NC_021984	GAA	2	6	166752	166757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218889
2592	NC_021984	AGA	2	6	166853	166858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218889
2593	NC_021984	CGCTGC	2	12	166859	166870	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529218889
2594	NC_021984	AAT	2	6	166975	166980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218889
2595	NC_021984	CG	3	6	166983	166988	0 %	0 %	50 %	50 %	529218889
2596	NC_021984	AGA	2	6	166991	166996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218889
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2599	NC_021984	GGC	2	6	167074	167079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218889
2600	NC_021984	AAT	2	6	167089	167094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218889
2601	NC_021984	AGCGC	2	10	167103	167112	20 %	0 %	40 %	40 %	529218889
2602	NC_021984	AGC	2	6	167169	167174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218889
2603	NC_021984	ATC	2	6	167210	167215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218889
2604	NC_021984	GCG	2	6	167226	167231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218889
2605	NC_021984	ATGA	2	8	167380	167387	50 %	25 %	25 %	0 %	529218889
2606	NC_021984	TGA	2	6	167399	167404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218889
2607	NC_021984	CTT	2	6	167424	167429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218889
2608	NC_021984	GCG	2	6	167438	167443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218889
2609	NC_021984	TGA	2	6	167496	167501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218889
2610	NC_021984	TGCC	2	8	167825	167832	0 %	25 %	25 %	50 %	529218890
2611	NC_021984	GC	3	6	167842	167847	0 %	0 %	50 %	50 %	529218890
2612	NC_021984	ACC	2	6	167934	167939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218890
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2618	NC_021984	GCA	2	6	168139	168144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218890
2619	NC_021984	GGAT	2	8	168171	168178	25 %	25 %	50 %	0 %	529218890
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2621	NC_021984	CAA	2	6	168416	168421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218890
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2984	NC_021984	CTG	2	6	186247	186252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221989
2985	NC_021984	CGG	2	6	186277	186282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221989
2986	NC_021984	ACC	2	6	186341	186346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221989
2987	NC_021984	TGG	2	6	186408	186413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221989
2988	NC_021984	GTC	2	6	186416	186421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221989
2989	NC_021984	CGG	2	6	186426	186431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221989
2990	NC_021984	GAGC	2	8	186501	186508	25 %	0 %	50 %	25 %	529221989
2991	NC_021984	CATC	2	8	186528	186535	25 %	25 %	0 %	50 %	529221989
2992	NC_021984	TGGC	2	8	186656	186663	0 %	25 %	50 %	25 %	529221989
2993	NC_021984	CTT	2	6	190006	190011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221990
2994	NC_021984	TAT	2	6	190015	190020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221990
2995	NC_021984	AT	3	6	190118	190123	50 %	50 %	0 %	0 %	529221990
2996	NC_021984	CGT	2	6	190172	190177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221990
2997	NC_021984	ACC	2	6	190184	190189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221990
2998	NC_021984	ATC	2	6	190206	190211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221990
2999	NC_021984	ATT	2	6	190218	190223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221990
3000	NC_021984	T	6	6	190222	190227	0 %	100 %	0 %	0 %	529221990

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