MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021984	TAA	2	6	101260	101265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218847
1502	NC_021984	AAG	2	6	101519	101524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218847
1503	NC_021984	TTG	2	6	101547	101552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218847
1504	NC_021984	ACGC	2	8	101609	101616	25 %	0 %	25 %	50 %	529218847
1505	NC_021984	TAA	2	6	101729	101734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218847
1506	NC_021984	TCG	2	6	101745	101750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218847
1507	NC_021984	GCG	2	6	101903	101908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218848
1508	NC_021984	CGC	2	6	101921	101926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218848
1509	NC_021984	AACGT	2	10	102093	102102	40 %	20 %	20 %	20 %	529218848
1510	NC_021984	AC	3	6	102153	102158	50 %	0 %	0 %	50 %	529218848
1511	NC_021984	CG	3	6	102254	102259	0 %	0 %	50 %	50 %	529218849
1512	NC_021984	GGT	2	6	102356	102361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218849
1513	NC_021984	CAC	2	6	102425	102430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218849
1514	NC_021984	GCG	3	9	102448	102456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218849
1515	NC_021984	GGC	2	6	102468	102473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218849
1516	NC_021984	CTT	2	6	102571	102576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218849
1517	NC_021984	TAT	2	6	102649	102654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218849
1518	NC_021984	AC	3	6	102670	102675	50 %	0 %	0 %	50 %	529218849
1519	NC_021984	TCATGG	2	12	102715	102726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529218849
1520	NC_021984	CTG	2	6	102731	102736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218849
1521	NC_021984	CGC	2	6	102782	102787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218849
1522	NC_021984	GCC	2	6	102852	102857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218849
1523	NC_021984	ATT	2	6	102992	102997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218849
1524	NC_021984	TAA	2	6	103041	103046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218850
1525	NC_021984	CCGA	2	8	103147	103154	25 %	0 %	25 %	50 %	529218850
1526	NC_021984	CAG	2	6	103248	103253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218850
1527	NC_021984	TCG	2	6	103292	103297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218850
1528	NC_021984	ATG	2	6	103307	103312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218850
1529	NC_021984	TTC	2	6	103516	103521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218850
1530	NC_021984	CAT	2	6	103531	103536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218850
1531	NC_021984	T	6	6	103543	103548	0 %	100 %	0 %	0 %	529218850
1532	NC_021984	CGT	2	6	103602	103607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218850
1533	NC_021984	TAA	2	6	103608	103613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218850
1534	NC_021984	GC	4	8	103740	103747	0 %	0 %	50 %	50 %	529218850
1535	NC_021984	GCG	2	6	103785	103790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218850
1536	NC_021984	GGC	2	6	103843	103848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218850
1537	NC_021984	GC	3	6	103863	103868	0 %	0 %	50 %	50 %	529218850
1538	NC_021984	GAC	2	6	103879	103884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218850
1539	NC_021984	CG	3	6	103900	103905	0 %	0 %	50 %	50 %	529218850
1540	NC_021984	GAC	2	6	103918	103923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218850
1541	NC_021984	CGG	2	6	103941	103946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218850
1542	NC_021984	AAC	2	6	103963	103968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218850
1543	NC_021984	GC	3	6	104017	104022	0 %	0 %	50 %	50 %	529218851
1544	NC_021984	CGC	2	6	104040	104045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218851
1545	NC_021984	TTC	2	6	104046	104051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218851
1546	NC_021984	TCA	2	6	104066	104071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218851
1547	NC_021984	GC	3	6	104171	104176	0 %	0 %	50 %	50 %	529218851
1548	NC_021984	CCCAA	2	10	104243	104252	40 %	0 %	0 %	60 %	529218851
1549	NC_021984	CGC	2	6	104298	104303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218851
1550	NC_021984	TTC	2	6	104346	104351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218851
1551	NC_021984	GC	3	6	104361	104366	0 %	0 %	50 %	50 %	529218851
1552	NC_021984	CTG	2	6	104367	104372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1553	NC_021984	TTC	2	6	104518	104523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218851
1554	NC_021984	CTG	2	6	104601	104606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1555	NC_021984	CTT	2	6	104657	104662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218851
1556	NC_021984	CAA	2	6	104663	104668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218851
1557	NC_021984	CGT	2	6	104690	104695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1558	NC_021984	CGT	2	6	104765	104770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1559	NC_021984	CTT	2	6	104804	104809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218851
1560	NC_021984	CGA	2	6	104830	104835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1561	NC_021984	GTT	2	6	104841	104846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218851
1562	NC_021984	ATC	2	6	104863	104868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218851
1563	NC_021984	TTGTT	2	10	104950	104959	0 %	80 %	20 %	0 %	529218851
1564	NC_021984	TCT	2	6	105014	105019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218851
1565	NC_021984	CGT	2	6	105083	105088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1566	NC_021984	GCT	2	6	105095	105100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1567	NC_021984	CCTG	2	8	105103	105110	0 %	25 %	25 %	50 %	529218851
1568	NC_021984	ACG	2	6	105163	105168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1569	NC_021984	ATT	2	6	105171	105176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218851
1570	NC_021984	GAC	2	6	105177	105182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1571	NC_021984	G	6	6	105206	105211	0 %	0 %	100 %	0 %	529218851
1572	NC_021984	AGC	2	6	105250	105255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218851
1573	NC_021984	TTC	2	6	105265	105270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218851
1574	NC_021984	GTT	2	6	105448	105453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218852
1575	NC_021984	AGC	2	6	105505	105510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218852
1576	NC_021984	AGT	2	6	105568	105573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218852
1577	NC_021984	AAT	2	6	105664	105669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218852
1578	NC_021984	AT	3	6	105690	105695	50 %	50 %	0 %	0 %	529218852
1579	NC_021984	GCT	4	12	105758	105769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218852
1580	NC_021984	GTC	2	6	105878	105883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218852
1581	NC_021984	TGT	2	6	105898	105903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218852
1582	NC_021984	TAG	2	6	105930	105935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218852
1583	NC_021984	CGG	2	6	105967	105972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218852
1584	NC_021984	CAT	3	9	105973	105981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218852
1585	NC_021984	GCA	2	6	106081	106086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218852
1586	NC_021984	AAG	2	6	106087	106092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218852
1587	NC_021984	GCTTC	2	10	106330	106339	0 %	40 %	20 %	40 %	529218852
1588	NC_021984	GTA	2	6	106490	106495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218852
1589	NC_021984	GCT	2	6	106526	106531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218852
1590	NC_021984	TGCGT	2	10	106617	106626	0 %	40 %	40 %	20 %	529218852
1591	NC_021984	TACT	2	8	106647	106654	25 %	50 %	0 %	25 %	529218852
1592	NC_021984	TGC	2	6	106737	106742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218852
1593	NC_021984	GAT	2	6	106780	106785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218852
1594	NC_021984	GCCT	2	8	106838	106845	0 %	25 %	25 %	50 %	529218852
1595	NC_021984	ATA	2	6	106875	106880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218852
1596	NC_021984	CGG	2	6	106887	106892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218852
1597	NC_021984	TGG	2	6	106912	106917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218852
1598	NC_021984	TTC	2	6	107108	107113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218852
1599	NC_021984	CAC	2	6	107138	107143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218852
1600	NC_021984	AGG	2	6	107170	107175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218852
1601	NC_021984	CGC	2	6	107212	107217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218852
1602	NC_021984	GCT	2	6	107218	107223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218852
1603	NC_021984	CCA	2	6	107257	107262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218852
1604	NC_021984	ATC	2	6	107345	107350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218852
1605	NC_021984	TGA	2	6	107415	107420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218852
1606	NC_021984	GGC	2	6	107443	107448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218852
1607	NC_021984	TGA	2	6	107625	107630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218852
1608	NC_021984	TGG	2	6	107653	107658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218852
1609	NC_021984	AGA	2	6	107661	107666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218852
1610	NC_021984	T	6	6	107678	107683	0 %	100 %	0 %	0 %	529218852
1611	NC_021984	TGA	2	6	107980	107985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218853
1612	NC_021984	GCG	2	6	107989	107994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218853
1613	NC_021984	CTG	2	6	108018	108023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218853
1614	NC_021984	T	6	6	108099	108104	0 %	100 %	0 %	0 %	529218853
1615	NC_021984	CCA	2	6	108106	108111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218853
1616	NC_021984	CAGT	2	8	108179	108186	25 %	25 %	25 %	25 %	529218853
1617	NC_021984	TGATC	2	10	108317	108326	20 %	40 %	20 %	20 %	529218853
1618	NC_021984	GGC	2	6	108353	108358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218853
1619	NC_021984	ATG	2	6	108459	108464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218853
1620	NC_021984	GCG	2	6	108469	108474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218853
1621	NC_021984	GGC	2	6	108483	108488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218853
1622	NC_021984	ATC	2	6	108493	108498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218853
1623	NC_021984	CGG	3	9	108506	108514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218853
1624	NC_021984	GCA	2	6	108518	108523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218853
1625	NC_021984	ACC	2	6	108576	108581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218853
1626	NC_021984	ACC	2	6	108591	108596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218853
1627	NC_021984	TGA	2	6	108619	108624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218853
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1630	NC_021984	ATG	2	6	108672	108677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218853
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1633	NC_021984	TAT	2	6	109062	109067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218854
1634	NC_021984	CCG	2	6	109068	109073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218854
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1639	NC_021984	CG	3	6	109209	109214	0 %	0 %	50 %	50 %	529218854
1640	NC_021984	CGC	2	6	109299	109304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218854
1641	NC_021984	TGG	2	6	109305	109310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218854
1642	NC_021984	CTGC	2	8	109335	109342	0 %	25 %	25 %	50 %	529218854
1643	NC_021984	ACA	2	6	109407	109412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218854
1644	NC_021984	ACC	2	6	109430	109435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218854
1645	NC_021984	CCAG	2	8	109464	109471	25 %	0 %	25 %	50 %	529218854
1646	NC_021984	GCG	2	6	109479	109484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218854
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1649	NC_021984	CTG	2	6	109590	109595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218855
1650	NC_021984	TCG	3	9	109621	109629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218855
1651	NC_021984	GC	3	6	109648	109653	0 %	0 %	50 %	50 %	529218855
1652	NC_021984	CG	3	6	109705	109710	0 %	0 %	50 %	50 %	529218855
1653	NC_021984	ATCA	2	8	109713	109720	50 %	25 %	0 %	25 %	529218855
1654	NC_021984	TGC	2	6	109802	109807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218855
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1721	NC_021984	GCG	2	6	113020	113025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218856
1722	NC_021984	GCTG	2	8	113068	113075	0 %	25 %	50 %	25 %	529218856
1723	NC_021984	T	6	6	113105	113110	0 %	100 %	0 %	0 %	529218856
1724	NC_021984	CCGCG	2	10	113122	113131	0 %	0 %	40 %	60 %	529218856
1725	NC_021984	CTCCAG	2	12	113171	113182	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	529218856
1726	NC_021984	TGT	2	6	113202	113207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218856
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1729	NC_021984	GC	4	8	113281	113288	0 %	0 %	50 %	50 %	529218856
1730	NC_021984	GAC	2	6	113397	113402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218856
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1732	NC_021984	GGCA	2	8	113550	113557	25 %	0 %	50 %	25 %	529218856
1733	NC_021984	ATCA	2	8	113648	113655	50 %	25 %	0 %	25 %	529218856
1734	NC_021984	GCC	2	6	113744	113749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218856
1735	NC_021984	GCG	2	6	113761	113766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218856
1736	NC_021984	GCG	2	6	113835	113840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218856
1737	NC_021984	CCG	2	6	113847	113852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218856
1738	NC_021984	TCG	2	6	113878	113883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218856
1739	NC_021984	CG	3	6	113882	113887	0 %	0 %	50 %	50 %	529218856
1740	NC_021984	GCG	2	6	113990	113995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218856
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1742	NC_021984	GCA	2	6	114250	114255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218856
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1865	NC_021984	TCG	2	6	120202	120207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218861
1866	NC_021984	GCG	2	6	120367	120372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218861
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1868	NC_021984	GAT	2	6	120431	120436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218861
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1872	NC_021984	TCG	2	6	120514	120519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218861
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1880	NC_021984	AT	3	6	121138	121143	50 %	50 %	0 %	0 %	529218862
1881	NC_021984	CCG	2	6	121152	121157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218862
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1884	NC_021984	ATC	2	6	121338	121343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218862
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1984	NC_021984	GCTT	2	8	125561	125568	0 %	50 %	25 %	25 %	529218865
1985	NC_021984	GCC	2	6	125628	125633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218865
1986	NC_021984	CGC	2	6	125660	125665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218865
1987	NC_021984	AGTTT	2	10	125677	125686	20 %	60 %	20 %	0 %	529218865
1988	NC_021984	CAG	2	6	125700	125705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218865
1989	NC_021984	ATT	2	6	125706	125711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218865
1990	NC_021984	TTC	2	6	125743	125748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218865
1991	NC_021984	AGC	2	6	125770	125775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218865
1992	NC_021984	TCC	2	6	125785	125790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218865
1993	NC_021984	CCA	2	6	125795	125800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218865
1994	NC_021984	T	6	6	125835	125840	0 %	100 %	0 %	0 %	529218865
1995	NC_021984	CCG	2	6	125843	125848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218865
1996	NC_021984	CGG	2	6	125864	125869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218865
1997	NC_021984	T	7	7	125949	125955	0 %	100 %	0 %	0 %	529218865
1998	NC_021984	GGC	2	6	126148	126153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218866
1999	NC_021984	GTG	2	6	126240	126245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218866
2000	NC_021984	CAG	2	6	126273	126278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218866

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