MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021984	GCA	2	6	30068	30073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218803
502	NC_021984	GCG	2	6	30080	30085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218803
503	NC_021984	GCG	2	6	30106	30111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218803
504	NC_021984	AG	3	6	30219	30224	50 %	0 %	50 %	0 %	529218803
505	NC_021984	CG	3	6	30276	30281	0 %	0 %	50 %	50 %	529218803
506	NC_021984	GGC	2	6	30295	30300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218803
507	NC_021984	AT	3	6	30377	30382	50 %	50 %	0 %	0 %	529218804
508	NC_021984	TGCT	2	8	30386	30393	0 %	50 %	25 %	25 %	529218804
509	NC_021984	TATC	2	8	30442	30449	25 %	50 %	0 %	25 %	529218804
510	NC_021984	GTAA	2	8	30479	30486	50 %	25 %	25 %	0 %	529218804
511	NC_021984	TGG	2	6	30529	30534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218804
512	NC_021984	CGC	2	6	30585	30590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218804
513	NC_021984	ATT	2	6	30592	30597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218804
514	NC_021984	GC	3	6	30608	30613	0 %	0 %	50 %	50 %	529218804
515	NC_021984	GGT	2	6	30631	30636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218804
516	NC_021984	CCG	2	6	30657	30662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218804
517	NC_021984	CGC	2	6	30691	30696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218804
518	NC_021984	TTCG	2	8	30741	30748	0 %	50 %	25 %	25 %	529218804
519	NC_021984	GCA	2	6	30793	30798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218804
520	NC_021984	ATCTG	2	10	30810	30819	20 %	40 %	20 %	20 %	529218804
521	NC_021984	TTACG	2	10	30865	30874	20 %	40 %	20 %	20 %	529218804
522	NC_021984	TTA	2	6	30881	30886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218804
523	NC_021984	GC	3	6	30898	30903	0 %	0 %	50 %	50 %	529218804
524	NC_021984	TAT	2	6	31114	31119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218805
525	NC_021984	TAT	2	6	31121	31126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218805
526	NC_021984	CGC	2	6	31195	31200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218805
527	NC_021984	CGG	2	6	31233	31238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218805
528	NC_021984	GTCA	2	8	31250	31257	25 %	25 %	25 %	25 %	529218805
529	NC_021984	GGT	2	6	31276	31281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218805
530	NC_021984	CGC	2	6	31318	31323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218805
531	NC_021984	CAG	2	6	31346	31351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218805
532	NC_021984	CAA	2	6	31358	31363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218805
533	NC_021984	AGC	2	6	31412	31417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218805
534	NC_021984	GCG	2	6	31448	31453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218805
535	NC_021984	GTG	2	6	31454	31459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218805
536	NC_021984	GTG	2	6	31483	31488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218805
537	NC_021984	T	6	6	31566	31571	0 %	100 %	0 %	0 %	529218805
538	NC_021984	GGC	2	6	31597	31602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218805
539	NC_021984	GGGCG	2	10	31633	31642	0 %	0 %	80 %	20 %	529218805
540	NC_021984	GCC	2	6	31754	31759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218805
541	NC_021984	AAG	2	6	31764	31769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218805
542	NC_021984	AGC	2	6	31775	31780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218805
543	NC_021984	ATG	2	6	31791	31796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218805
544	NC_021984	CTC	2	6	31799	31804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218805
545	NC_021984	GCA	2	6	31822	31827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218805
546	NC_021984	GTC	2	6	31856	31861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218805
547	NC_021984	TGCGT	2	10	32012	32021	0 %	40 %	40 %	20 %	529221971
548	NC_021984	ACCG	2	8	32070	32077	25 %	0 %	25 %	50 %	529221971
549	NC_021984	GTT	2	6	32101	32106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221971
550	NC_021984	AGGC	2	8	32108	32115	25 %	0 %	50 %	25 %	529221971
551	NC_021984	ATA	2	6	32153	32158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221971
552	NC_021984	TAT	2	6	32178	32183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221971
553	NC_021984	ATT	2	6	32237	32242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221971
554	NC_021984	AAAAG	2	10	32406	32415	80 %	0 %	20 %	0 %	529218806
555	NC_021984	A	7	7	32426	32432	100 %	0 %	0 %	0 %	529218806
556	NC_021984	TTA	2	6	32459	32464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218806
557	NC_021984	CAG	2	6	32505	32510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218806
558	NC_021984	CCTG	2	8	32544	32551	0 %	25 %	25 %	50 %	529218806
559	NC_021984	AACA	2	8	32560	32567	75 %	0 %	0 %	25 %	529218806
560	NC_021984	TGT	2	6	32585	32590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218806
561	NC_021984	TCG	2	6	32596	32601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218806
562	NC_021984	CAG	2	6	32602	32607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218806
563	NC_021984	AAG	2	6	32611	32616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218806
564	NC_021984	ATC	2	6	32675	32680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218806
565	NC_021984	CGCA	2	8	32734	32741	25 %	0 %	25 %	50 %	529218806
566	NC_021984	T	6	6	32761	32766	0 %	100 %	0 %	0 %	529218806
567	NC_021984	ATT	2	6	32780	32785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218806
568	NC_021984	TAAA	2	8	32804	32811	75 %	25 %	0 %	0 %	529218806
569	NC_021984	TTA	2	6	32816	32821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218806
570	NC_021984	A	6	6	33219	33224	100 %	0 %	0 %	0 %	529221972
571	NC_021984	A	7	7	33229	33235	100 %	0 %	0 %	0 %	529221972
572	NC_021984	TTA	2	6	33269	33274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221972
573	NC_021984	GCG	2	6	33295	33300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221972
574	NC_021984	GCG	2	6	33322	33327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221972
575	NC_021984	TC	3	6	33329	33334	0 %	50 %	0 %	50 %	529221972
576	NC_021984	CTT	2	6	33340	33345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221972
577	NC_021984	TTAT	2	8	33373	33380	25 %	75 %	0 %	0 %	529221972
578	NC_021984	TGA	2	6	33569	33574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221972
579	NC_021984	AT	3	6	33579	33584	50 %	50 %	0 %	0 %	529221972
580	NC_021984	A	7	7	33604	33610	100 %	0 %	0 %	0 %	529221972
581	NC_021984	TCA	2	6	33659	33664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221972
582	NC_021984	GAT	2	6	33690	33695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221972
583	NC_021984	TGTTTG	2	12	33729	33740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221972
584	NC_021984	A	6	6	33746	33751	100 %	0 %	0 %	0 %	529221972
585	NC_021984	TTGG	2	8	33757	33764	0 %	50 %	50 %	0 %	529221972
586	NC_021984	A	6	6	33770	33775	100 %	0 %	0 %	0 %	529221972
587	NC_021984	TA	3	6	33782	33787	50 %	50 %	0 %	0 %	529221972
588	NC_021984	TGC	2	6	33795	33800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221972
589	NC_021984	TCT	2	6	33832	33837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221972
590	NC_021984	AGT	2	6	33868	33873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221972
591	NC_021984	TTA	2	6	33903	33908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221972
592	NC_021984	GTT	2	6	33937	33942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221972
593	NC_021984	A	6	6	33944	33949	100 %	0 %	0 %	0 %	529221972
594	NC_021984	GCG	2	6	34002	34007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221972
595	NC_021984	TATAA	2	10	34009	34018	60 %	40 %	0 %	0 %	529221972
596	NC_021984	TAC	2	6	34022	34027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221972
597	NC_021984	TGA	2	6	34035	34040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221972
598	NC_021984	AAT	2	6	34041	34046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221972
599	NC_021984	A	6	6	34108	34113	100 %	0 %	0 %	0 %	529221972
600	NC_021984	CTTT	2	8	34137	34144	0 %	75 %	0 %	25 %	529221972
601	NC_021984	AGC	2	6	34157	34162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221972
602	NC_021984	GAAG	2	8	34177	34184	50 %	0 %	50 %	0 %	529221972
603	NC_021984	AAT	2	6	34269	34274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218807
604	NC_021984	AT	3	6	34278	34283	50 %	50 %	0 %	0 %	529218807
605	NC_021984	CTT	2	6	34291	34296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218807
606	NC_021984	T	7	7	34295	34301	0 %	100 %	0 %	0 %	529218807
607	NC_021984	AGA	2	6	34304	34309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218807
608	NC_021984	ATA	2	6	34338	34343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218807
609	NC_021984	A	7	7	34384	34390	100 %	0 %	0 %	0 %	529218807
610	NC_021984	CGC	2	6	34419	34424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218807
611	NC_021984	CTT	2	6	34470	34475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218807
612	NC_021984	C	6	6	34477	34482	0 %	0 %	0 %	100 %	529218807
613	NC_021984	GTT	2	6	34498	34503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218807
614	NC_021984	T	6	6	34502	34507	0 %	100 %	0 %	0 %	529218807
615	NC_021984	ATAA	2	8	34508	34515	75 %	25 %	0 %	0 %	529218807
616	NC_021984	TTG	2	6	34520	34525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218807
617	NC_021984	AT	3	6	34539	34544	50 %	50 %	0 %	0 %	529218807
618	NC_021984	ATC	2	6	34578	34583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218807
619	NC_021984	T	6	6	34599	34604	0 %	100 %	0 %	0 %	529218807
620	NC_021984	GTGC	2	8	34631	34638	0 %	25 %	50 %	25 %	529218807
621	NC_021984	TTAA	2	8	34641	34648	50 %	50 %	0 %	0 %	529218807
622	NC_021984	ATG	2	6	34659	34664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218807
623	NC_021984	AT	3	6	35285	35290	50 %	50 %	0 %	0 %	529221973
624	NC_021984	AAC	2	6	35292	35297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221973
625	NC_021984	TGGA	2	8	35393	35400	25 %	25 %	50 %	0 %	529221973
626	NC_021984	TGT	2	6	35425	35430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221973
627	NC_021984	AGCGA	2	10	35435	35444	40 %	0 %	40 %	20 %	529221973
628	NC_021984	ATG	2	6	35469	35474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221973
629	NC_021984	TG	4	8	35500	35507	0 %	50 %	50 %	0 %	529221973
630	NC_021984	AAT	2	6	35525	35530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221973
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