MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021984	TCCG	2	8	419433	419440	0 %	25 %	25 %	50 %	529219050
6502	NC_021984	GAA	2	6	419494	419499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219050
6503	NC_021984	ATC	2	6	419620	419625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219050
6504	NC_021984	GC	3	6	419638	419643	0 %	0 %	50 %	50 %	529219050
6505	NC_021984	CGA	2	6	419661	419666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219050
6506	NC_021984	TC	3	6	419682	419687	0 %	50 %	0 %	50 %	529219050
6507	NC_021984	CGG	2	6	419688	419693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219050
6508	NC_021984	TTC	2	6	419700	419705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219050
6509	NC_021984	TGC	3	9	419717	419725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219050
6510	NC_021984	CG	3	6	419728	419733	0 %	0 %	50 %	50 %	529219050
6511	NC_021984	TCG	2	6	419759	419764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219050
6512	NC_021984	AGA	2	6	419853	419858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219050
6513	NC_021984	GCTG	2	8	419874	419881	0 %	25 %	50 %	25 %	529219050
6514	NC_021984	ATC	2	6	419911	419916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219050
6515	NC_021984	CGA	2	6	419940	419945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219050
6516	NC_021984	TGGC	2	8	419974	419981	0 %	25 %	50 %	25 %	529219050
6517	NC_021984	GCG	2	6	420016	420021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219050
6518	NC_021984	TCA	2	6	420044	420049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219050
6519	NC_021984	CAC	2	6	420055	420060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219050
6520	NC_021984	GGC	2	6	420067	420072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219050
6521	NC_021984	GGGCC	2	10	420196	420205	0 %	0 %	60 %	40 %	529219050
6522	NC_021984	GAA	2	6	420231	420236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219050
6523	NC_021984	CTG	2	6	420250	420255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219050
6524	NC_021984	CG	3	6	420259	420264	0 %	0 %	50 %	50 %	529219050
6525	NC_021984	AGTC	2	8	420312	420319	25 %	25 %	25 %	25 %	529219050
6526	NC_021984	TCCGT	2	10	420344	420353	0 %	40 %	20 %	40 %	529219050
6527	NC_021984	TC	3	6	420392	420397	0 %	50 %	0 %	50 %	529219050
6528	NC_021984	CAT	2	6	420480	420485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219050
6529	NC_021984	GTG	2	6	420511	420516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219050
6530	NC_021984	ACC	2	6	420534	420539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219050
6531	NC_021984	CGT	2	6	420931	420936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222009
6532	NC_021984	TTC	2	6	421087	421092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222010
6533	NC_021984	TA	3	6	421096	421101	50 %	50 %	0 %	0 %	529222010
6534	NC_021984	TTC	2	6	421259	421264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222010
6535	NC_021984	ATC	2	6	421289	421294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222010
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6537	NC_021984	TC	3	6	421398	421403	0 %	50 %	0 %	50 %	529222010
6538	NC_021984	GTG	2	6	422130	422135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529222011
6539	NC_021984	CTT	2	6	422158	422163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222011
6540	NC_021984	T	6	6	422162	422167	0 %	100 %	0 %	0 %	529222011
6541	NC_021984	TGC	2	6	422178	422183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222011
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6543	NC_021984	AGA	3	9	422218	422226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222011
6544	NC_021984	TTC	2	6	424990	424995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219051
6545	NC_021984	GCCA	2	8	425010	425017	25 %	0 %	25 %	50 %	529219051
6546	NC_021984	CTG	2	6	425035	425040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219051
6547	NC_021984	CGG	2	6	425140	425145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219051
6548	NC_021984	GTT	2	6	425167	425172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219051
6549	NC_021984	T	6	6	425218	425223	0 %	100 %	0 %	0 %	529219051
6550	NC_021984	ATC	2	6	425248	425253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219051
6551	NC_021984	CAT	3	9	425293	425301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219051
6552	NC_021984	TGC	2	6	425303	425308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219051
6553	NC_021984	GCA	2	6	425400	425405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219051
6554	NC_021984	GCC	2	6	425408	425413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219051
6555	NC_021984	GCT	2	6	425454	425459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219051
6556	NC_021984	TGG	2	6	425487	425492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219051
6557	NC_021984	TGT	2	6	425526	425531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219051
6558	NC_021984	ATTG	2	8	425532	425539	25 %	50 %	25 %	0 %	529219051
6559	NC_021984	CGC	2	6	425667	425672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219051
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6561	NC_021984	AGAC	2	8	425716	425723	50 %	0 %	25 %	25 %	529219051
6562	NC_021984	GCC	3	9	425924	425932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219051
6563	NC_021984	GC	3	6	425939	425944	0 %	0 %	50 %	50 %	529219051
6564	NC_021984	CGC	2	6	425967	425972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219051
6565	NC_021984	ACG	2	6	426010	426015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219051
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6567	NC_021984	GC	3	6	426139	426144	0 %	0 %	50 %	50 %	529219051
6568	NC_021984	TTC	2	6	426145	426150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219051
6569	NC_021984	AAT	2	6	426160	426165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219051
6570	NC_021984	CG	3	6	426193	426198	0 %	0 %	50 %	50 %	529219051
6571	NC_021984	ACGTA	2	10	426229	426238	40 %	20 %	20 %	20 %	529219051
6572	NC_021984	GACA	2	8	426299	426306	50 %	0 %	25 %	25 %	529219051
6573	NC_021984	CTT	2	6	426327	426332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219051
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6579	NC_021984	CAG	2	6	426893	426898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219052
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6581	NC_021984	CGAT	2	8	427020	427027	25 %	25 %	25 %	25 %	529219052
6582	NC_021984	CAG	2	6	427037	427042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219052
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6584	NC_021984	GC	3	6	427142	427147	0 %	0 %	50 %	50 %	529219052
6585	NC_021984	CGG	2	6	427150	427155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219052
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6588	NC_021984	T	6	6	427189	427194	0 %	100 %	0 %	0 %	529219052
6589	NC_021984	CAC	2	6	427229	427234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219052
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6591	NC_021984	TGAGA	2	10	427253	427262	40 %	20 %	40 %	0 %	529219052
6592	NC_021984	GC	3	6	427364	427369	0 %	0 %	50 %	50 %	529219052
6593	NC_021984	CCA	3	9	427378	427386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219052
6594	NC_021984	T	6	6	427394	427399	0 %	100 %	0 %	0 %	529219052
6595	NC_021984	GGC	2	6	427409	427414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219052
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6605	NC_021984	GCT	2	6	427819	427824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219052
6606	NC_021984	GAA	2	6	427934	427939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219052
6607	NC_021984	CAG	2	6	427982	427987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219052
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6619	NC_021984	TTCAG	2	10	428406	428415	20 %	40 %	20 %	20 %	529219052
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6622	NC_021984	TCAA	2	8	428478	428485	50 %	25 %	0 %	25 %	529219052
6623	NC_021984	CCG	2	6	428500	428505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219052
6624	NC_021984	CGTT	2	8	428520	428527	0 %	50 %	25 %	25 %	529219052
6625	NC_021984	TTCT	2	8	428546	428553	0 %	75 %	0 %	25 %	529219052
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6631	NC_021984	GCG	2	6	428819	428824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219053
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6988	NC_021984	AAG	2	6	449436	449441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219068
6989	NC_021984	CTC	2	6	449496	449501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529219068
6990	NC_021984	GC	3	6	449511	449516	0 %	0 %	50 %	50 %	529219068
6991	NC_021984	T	6	6	449517	449522	0 %	100 %	0 %	0 %	529219068
6992	NC_021984	CT	3	6	453446	453451	0 %	50 %	0 %	50 %	529219069
6993	NC_021984	TTG	2	6	453455	453460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219069
6994	NC_021984	GAG	2	6	453461	453466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219069
6995	NC_021984	GCC	3	9	453490	453498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219069
6996	NC_021984	GCC	2	6	453523	453528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529219069
6997	NC_021984	CG	3	6	453538	453543	0 %	0 %	50 %	50 %	529219069
6998	NC_021984	TCGC	2	8	453668	453675	0 %	25 %	25 %	50 %	529219069
6999	NC_021984	CCAGCG	2	12	453747	453758	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	529219069
7000	NC_021984	CTG	2	6	453847	453852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219069

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