MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021984	AGA	2	6	316694	316699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218992
5002	NC_021984	CAG	2	6	316720	316725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218992
5003	NC_021984	GGC	2	6	316743	316748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218992
5004	NC_021984	ATT	2	6	316762	316767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218992
5005	NC_021984	CGG	2	6	316818	316823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218992
5006	NC_021984	A	6	6	316840	316845	100 %	0 %	0 %	0 %	529218992
5007	NC_021984	CTG	2	6	316846	316851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218992
5008	NC_021984	CAGAAA	2	12	316852	316863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	529218992
5009	NC_021984	AGG	2	6	316910	316915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218992
5010	NC_021984	AATA	2	8	316948	316955	75 %	25 %	0 %	0 %	529218992
5011	NC_021984	GTTT	2	8	317044	317051	0 %	75 %	25 %	0 %	529218993
5012	NC_021984	GC	3	6	317069	317074	0 %	0 %	50 %	50 %	529218993
5013	NC_021984	ACGCT	2	10	317115	317124	20 %	20 %	20 %	40 %	529218993
5014	NC_021984	GCTG	2	8	317148	317155	0 %	25 %	50 %	25 %	529218993
5015	NC_021984	TCGT	2	8	317199	317206	0 %	50 %	25 %	25 %	529218993
5016	NC_021984	ATG	2	6	317246	317251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218993
5017	NC_021984	TGG	2	6	317280	317285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218993
5018	NC_021984	GAAA	2	8	317596	317603	75 %	0 %	25 %	0 %	529218993
5019	NC_021984	ACC	2	6	317737	317742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218993
5020	NC_021984	ATG	2	6	317756	317761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218993
5021	NC_021984	CGG	2	6	317905	317910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218993
5022	NC_021984	TTG	2	6	318142	318147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218994
5023	NC_021984	CATT	2	8	318151	318158	25 %	50 %	0 %	25 %	529218994
5024	NC_021984	TAAT	2	8	318184	318191	50 %	50 %	0 %	0 %	529218994
5025	NC_021984	ATC	2	6	318223	318228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218994
5026	NC_021984	GCA	2	6	318239	318244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218994
5027	NC_021984	CAG	2	6	318266	318271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218994
5028	NC_021984	AACG	2	8	318279	318286	50 %	0 %	25 %	25 %	529218994
5029	NC_021984	GC	3	6	318383	318388	0 %	0 %	50 %	50 %	529218994
5030	NC_021984	GCG	2	6	318478	318483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218994
5031	NC_021984	CGG	2	6	318530	318535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218994
5032	NC_021984	GGT	2	6	318770	318775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218994
5033	NC_021984	CGT	2	6	318792	318797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218994
5034	NC_021984	GCC	2	6	318813	318818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218994
5035	NC_021984	A	6	6	318831	318836	100 %	0 %	0 %	0 %	529218994
5036	NC_021984	TCG	2	6	318885	318890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218995
5037	NC_021984	AGA	2	6	318939	318944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218995
5038	NC_021984	GAA	2	6	319052	319057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218995
5039	NC_021984	GC	3	6	319060	319065	0 %	0 %	50 %	50 %	529218995
5040	NC_021984	TGA	2	6	319077	319082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218995
5041	NC_021984	GGC	2	6	319087	319092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218995
5042	NC_021984	GAC	2	6	319157	319162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218995
5043	NC_021984	TGC	2	6	319251	319256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218995
5044	NC_021984	CTG	2	6	319311	319316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218995
5045	NC_021984	TCA	2	6	319378	319383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218995
5046	NC_021984	AACG	2	8	319517	319524	50 %	0 %	25 %	25 %	529218995
5047	NC_021984	CGG	2	6	319525	319530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218995
5048	NC_021984	TCG	2	6	319554	319559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218995
5049	NC_021984	AGA	3	9	319572	319580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218995
5050	NC_021984	CAA	2	6	319591	319596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218995
5051	NC_021984	GTGAAA	2	12	319682	319693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	529218995
5052	NC_021984	GC	3	6	319779	319784	0 %	0 %	50 %	50 %	529218996
5053	NC_021984	GAA	2	6	319843	319848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218996
5054	NC_021984	GC	3	6	319877	319882	0 %	0 %	50 %	50 %	529218996
5055	NC_021984	GCTAC	2	10	319935	319944	20 %	20 %	20 %	40 %	529218996
5056	NC_021984	CTC	2	6	320047	320052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218996
5057	NC_021984	TC	3	6	320051	320056	0 %	50 %	0 %	50 %	529218996
5058	NC_021984	T	6	6	320092	320097	0 %	100 %	0 %	0 %	529218996
5059	NC_021984	ACC	2	6	320131	320136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218996
5060	NC_021984	GCAG	2	8	320218	320225	25 %	0 %	50 %	25 %	529218996
5061	NC_021984	GAA	2	6	320266	320271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218996
5062	NC_021984	CGT	2	6	320289	320294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218996
5063	NC_021984	AAC	2	6	320302	320307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218996
5064	NC_021984	GGA	2	6	320337	320342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218996
5065	NC_021984	GAA	2	6	320481	320486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218996
5066	NC_021984	GC	3	6	320559	320564	0 %	0 %	50 %	50 %	529218997
5067	NC_021984	ATCCGG	2	12	320575	320586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	529218997
5068	NC_021984	GGC	2	6	320591	320596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218997
5069	NC_021984	CAGG	2	8	320610	320617	25 %	0 %	50 %	25 %	529218997
5070	NC_021984	TCG	2	6	320651	320656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218997
5071	NC_021984	TGT	2	6	320775	320780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218997
5072	NC_021984	CAC	2	6	320807	320812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218997
5073	NC_021984	GC	3	6	320865	320870	0 %	0 %	50 %	50 %	529218997
5074	NC_021984	GGC	3	9	320873	320881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218997
5075	NC_021984	CGG	3	9	320932	320940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218997
5076	NC_021984	GC	3	6	320947	320952	0 %	0 %	50 %	50 %	529218997
5077	NC_021984	GCT	2	6	320974	320979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218997
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5080	NC_021984	TGA	2	6	321172	321177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218997
5081	NC_021984	TGAAA	2	10	321200	321209	60 %	20 %	20 %	0 %	529218997
5082	NC_021984	GC	3	6	321225	321230	0 %	0 %	50 %	50 %	529218997
5083	NC_021984	CAG	2	6	321365	321370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218998
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5085	NC_021984	TTC	2	6	321776	321781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218999
5086	NC_021984	AC	3	6	321864	321869	50 %	0 %	0 %	50 %	529218999
5087	NC_021984	T	6	6	321965	321970	0 %	100 %	0 %	0 %	529218999
5088	NC_021984	GCAG	2	8	322109	322116	25 %	0 %	50 %	25 %	529219000
5089	NC_021984	AGCG	2	8	322231	322238	25 %	0 %	50 %	25 %	529219000
5090	NC_021984	TAA	2	6	322241	322246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219000
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5092	NC_021984	TTA	2	6	322333	322338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529219000
5093	NC_021984	TGA	2	6	322349	322354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219000
5094	NC_021984	AG	3	6	322369	322374	50 %	0 %	50 %	0 %	529219000
5095	NC_021984	GAA	2	6	322703	322708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219000
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5099	NC_021984	TTAAT	2	10	322781	322790	40 %	60 %	0 %	0 %	529219000
5100	NC_021984	ATA	2	6	322811	322816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219000
5101	NC_021984	TGA	2	6	322827	322832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219000
5102	NC_021984	GTT	2	6	322838	322843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219000
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5105	NC_021984	CA	3	6	322913	322918	50 %	0 %	0 %	50 %	529219000
5106	NC_021984	AGGA	2	8	322924	322931	50 %	0 %	50 %	0 %	529219000
5107	NC_021984	GTT	2	6	322937	322942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219000
5108	NC_021984	ATCA	2	8	323076	323083	50 %	25 %	0 %	25 %	529219001
5109	NC_021984	GAT	2	6	323244	323249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219001
5110	NC_021984	GGT	2	6	323302	323307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219001
5111	NC_021984	TAA	2	6	323424	323429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219001
5112	NC_021984	GTT	2	6	323562	323567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529219001
5113	NC_021984	TGG	2	6	323588	323593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529219001
5114	NC_021984	GC	3	6	323624	323629	0 %	0 %	50 %	50 %	529219001
5115	NC_021984	GGA	2	6	323644	323649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529219001
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5118	NC_021984	TGC	2	6	323933	323938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219001
5119	NC_021984	TTC	2	6	323947	323952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529219001
5120	NC_021984	TATTT	2	10	323969	323978	20 %	80 %	0 %	0 %	529219001
5121	NC_021984	CCAG	2	8	324038	324045	25 %	0 %	25 %	50 %	529219001
5122	NC_021984	TATT	2	8	324170	324177	25 %	75 %	0 %	0 %	529219001
5123	NC_021984	A	6	6	324226	324231	100 %	0 %	0 %	0 %	529219001
5124	NC_021984	TGC	2	6	324338	324343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219002
5125	NC_021984	ACG	2	6	324356	324361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529219002
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5127	NC_021984	GAAACG	2	12	324424	324435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	529219002
5128	NC_021984	TGA	2	6	324471	324476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219002
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5130	NC_021984	TGA	2	6	324578	324583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219002
5131	NC_021984	GCCA	2	8	324736	324743	25 %	0 %	25 %	50 %	529219002
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5136	NC_021984	CGG	2	6	324894	324899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219002
5137	NC_021984	TGA	2	6	324945	324950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219002
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5139	NC_021984	TGA	2	6	325001	325006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529219002
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5142	NC_021984	GACT	2	8	325085	325092	25 %	25 %	25 %	25 %	529219002
5143	NC_021984	AC	3	6	325160	325165	50 %	0 %	0 %	50 %	529219002
5144	NC_021984	AAG	2	6	325190	325195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529219002
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5150	NC_021984	GGC	2	6	326649	326654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529219003
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5154	NC_021984	TGC	2	6	327032	327037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219003
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5162	NC_021984	TGGA	2	8	328511	328518	25 %	25 %	50 %	0 %	529222000
5163	NC_021984	TGC	2	6	328562	328567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222000
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5201	NC_021984	GCT	2	6	330041	330046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219005
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5229	NC_021984	T	6	6	331272	331277	0 %	100 %	0 %	0 %	529219005
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5233	NC_021984	AT	3	6	331630	331635	50 %	50 %	0 %	0 %	529222001
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5242	NC_021984	AGG	2	6	332107	332112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529222001
5243	NC_021984	GCC	2	6	332185	332190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222001
5244	NC_021984	CT	3	6	332292	332297	0 %	50 %	0 %	50 %	529222001
5245	NC_021984	TCA	2	6	332381	332386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529222001
5246	NC_021984	TGA	2	6	332404	332409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222001
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5251	NC_021984	TGA	2	6	332486	332491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529222001
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5255	NC_021984	TCG	2	6	332824	332829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222001
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5262	NC_021984	TC	3	6	333056	333061	0 %	50 %	0 %	50 %	529222001
5263	NC_021984	CGG	2	6	333089	333094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222001
5264	NC_021984	GCG	2	6	333097	333102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222001
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5352	NC_021984	AGGA	2	8	338384	338391	50 %	0 %	50 %	0 %	529219007
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5355	NC_021984	TA	3	6	338606	338611	50 %	50 %	0 %	0 %	529219007
5356	NC_021984	GACG	2	8	338649	338656	25 %	0 %	50 %	25 %	529219007
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5365	NC_021984	GCT	2	6	339009	339014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529219007
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5480	NC_021984	CCCA	2	8	344722	344729	25 %	0 %	0 %	75 %	529219011
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5486	NC_021984	CCA	2	6	345032	345037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529219011
5487	NC_021984	TAA	2	6	345058	345063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219011
5488	NC_021984	CAT	2	6	345079	345084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529219011
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5491	NC_021984	TAA	2	6	345782	345787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529219012
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