MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52001	NC_021984	GTC	2	6	3293060	3293065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221034
52002	NC_021984	TGC	2	6	3293079	3293084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221034
52003	NC_021984	TGG	2	6	3293094	3293099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221034
52004	NC_021984	TCG	2	6	3293128	3293133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221034
52005	NC_021984	GCCT	2	8	3293156	3293163	0 %	25 %	25 %	50 %	529221034
52006	NC_021984	GCG	2	6	3293172	3293177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221034
52007	NC_021984	CTT	2	6	3293185	3293190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221034
52008	NC_021984	GCC	2	6	3293204	3293209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221034
52009	NC_021984	TACT	2	8	3293260	3293267	25 %	50 %	0 %	25 %	529221034
52010	NC_021984	GGC	2	6	3293338	3293343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221034
52011	NC_021984	GCT	3	9	3293383	3293391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221034
52012	NC_021984	GTG	2	6	3293396	3293401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221034
52013	NC_021984	TG	3	6	3293409	3293414	0 %	50 %	50 %	0 %	529221034
52014	NC_021984	GCG	2	6	3293418	3293423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221034
52015	NC_021984	TGC	2	6	3293448	3293453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221034
52016	NC_021984	GTA	2	6	3293507	3293512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221034
52017	NC_021984	TAT	2	6	3293524	3293529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221034
52018	NC_021984	ACT	2	6	3294102	3294107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221035
52019	NC_021984	TTAT	2	8	3294190	3294197	25 %	75 %	0 %	0 %	529221035
52020	NC_021984	GCT	2	6	3294219	3294224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221035
52021	NC_021984	GCC	2	6	3294229	3294234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221035
52022	NC_021984	TGC	2	6	3294314	3294319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221035
52023	NC_021984	GCTG	2	8	3294368	3294375	0 %	25 %	50 %	25 %	529221035
52024	NC_021984	CT	3	6	3294403	3294408	0 %	50 %	0 %	50 %	529221035
52025	NC_021984	ATC	2	6	3294425	3294430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221035
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52027	NC_021984	CTG	2	6	3294508	3294513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221035
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52030	NC_021984	TTC	2	6	3294559	3294564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221035
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52032	NC_021984	CTG	2	6	3294616	3294621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221035
52033	NC_021984	TGC	3	9	3294674	3294682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221035
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52035	NC_021984	T	6	6	3294697	3294702	0 %	100 %	0 %	0 %	529221035
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52039	NC_021984	CAT	2	6	3294931	3294936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221036
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52041	NC_021984	GCA	2	6	3295024	3295029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221036
52042	NC_021984	GTC	2	6	3295066	3295071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221036
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52045	NC_021984	GC	3	6	3295488	3295493	0 %	0 %	50 %	50 %	529221037
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52047	NC_021984	GCAAAA	2	12	3295561	3295572	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	529221037
52048	NC_021984	A	7	7	3295632	3295638	100 %	0 %	0 %	0 %	529221037
52049	NC_021984	ACT	2	6	3295652	3295657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221037
52050	NC_021984	GC	3	6	3295730	3295735	0 %	0 %	50 %	50 %	529222588
52051	NC_021984	GAA	2	6	3295764	3295769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222588
52052	NC_021984	AGA	2	6	3295799	3295804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222588
52053	NC_021984	GC	4	8	3295832	3295839	0 %	0 %	50 %	50 %	529222588
52054	NC_021984	GTGAT	2	10	3295873	3295882	20 %	40 %	40 %	0 %	529222588
52055	NC_021984	CGC	3	9	3295901	3295909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222588
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52057	NC_021984	CTG	2	6	3295989	3295994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222588
52058	NC_021984	CGT	2	6	3295998	3296003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529222588
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52061	NC_021984	GAA	2	6	3296129	3296134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221038
52062	NC_021984	GAT	2	6	3296260	3296265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221038
52063	NC_021984	TGT	2	6	3296275	3296280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529221038
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52065	NC_021984	GGA	2	6	3296389	3296394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529221038
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52071	NC_021984	AGC	2	6	3296548	3296553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221039
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52083	NC_021984	C	6	6	3297901	3297906	0 %	0 %	0 %	100 %	529221040
52084	NC_021984	GCAAA	2	10	3297912	3297921	60 %	0 %	20 %	20 %	529221040
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52088	NC_021984	GC	3	6	3298039	3298044	0 %	0 %	50 %	50 %	529221040
52089	NC_021984	GAC	2	6	3298116	3298121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221040
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52101	NC_021984	GGCT	2	8	3298777	3298784	0 %	25 %	50 %	25 %	529221041
52102	NC_021984	ATC	3	9	3298786	3298794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221041
52103	NC_021984	TATT	2	8	3298899	3298906	25 %	75 %	0 %	0 %	529221042
52104	NC_021984	CGC	2	6	3298969	3298974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221042
52105	NC_021984	ATA	3	9	3298981	3298989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221042
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52108	NC_021984	CAG	2	6	3299091	3299096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221042
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52113	NC_021984	CGGCTC	2	12	3299214	3299225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529221042
52114	NC_021984	TGA	2	6	3299227	3299232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221042
52115	NC_021984	GGT	2	6	3299237	3299242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221042
52116	NC_021984	GCG	2	6	3299248	3299253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221042
52117	NC_021984	CATT	2	8	3299261	3299268	25 %	50 %	0 %	25 %	529221042
52118	NC_021984	CGA	3	9	3299298	3299306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221042
52119	NC_021984	GCCA	2	8	3299370	3299377	25 %	0 %	25 %	50 %	529221042
52120	NC_021984	A	7	7	3299439	3299445	100 %	0 %	0 %	0 %	529221042
52121	NC_021984	CGT	2	6	3299520	3299525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221042
52122	NC_021984	CCCG	2	8	3299552	3299559	0 %	0 %	25 %	75 %	529221042
52123	NC_021984	CAG	2	6	3299565	3299570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221042
52124	NC_021984	CTT	2	6	3299636	3299641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529221042
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52126	NC_021984	CGG	2	6	3299716	3299721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221042
52127	NC_021984	CT	4	8	3299762	3299769	0 %	50 %	0 %	50 %	529221042
52128	NC_021984	GAT	2	6	3299881	3299886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221043
52129	NC_021984	CTG	2	6	3299981	3299986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221043
52130	NC_021984	CGT	2	6	3299994	3299999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221043
52131	NC_021984	TGC	2	6	3300153	3300158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221043
52132	NC_021984	CGC	2	6	3300160	3300165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221043
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52134	NC_021984	CAA	2	6	3300296	3300301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221043
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52136	NC_021984	CAT	2	6	3300365	3300370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221043
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52142	NC_021984	AGCC	2	8	3300582	3300589	25 %	0 %	25 %	50 %	529221043
52143	NC_021984	A	6	6	3300613	3300618	100 %	0 %	0 %	0 %	529222589
52144	NC_021984	GAA	2	6	3300624	3300629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529222589
52145	NC_021984	GGCG	2	8	3300726	3300733	0 %	0 %	75 %	25 %	529222589
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52215	NC_021984	GCAGC	2	10	3307220	3307229	20 %	0 %	40 %	40 %	529221045
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52218	NC_021984	TCG	3	9	3307456	3307464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221045
52219	NC_021984	GCGTC	2	10	3307555	3307564	0 %	20 %	40 %	40 %	529221045
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52222	NC_021984	AAT	2	6	3307859	3307864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221046
52223	NC_021984	GCT	2	6	3307885	3307890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221046
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52226	NC_021984	GC	3	6	3308076	3308081	0 %	0 %	50 %	50 %	529221046
52227	NC_021984	CAC	2	6	3308165	3308170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221046
52228	NC_021984	CAT	2	6	3308255	3308260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529221046
52229	NC_021984	GCG	2	6	3308272	3308277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221046
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52349	NC_021984	TG	3	6	3317466	3317471	0 %	50 %	50 %	0 %	529221052
52350	NC_021984	GCG	2	6	3317572	3317577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221052
52351	NC_021984	CGG	3	9	3317593	3317601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221052
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52355	NC_021984	AGC	2	6	3317773	3317778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221052
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52433	NC_021984	TGG	2	6	3324064	3324069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529221055
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52451	NC_021984	GCG	2	6	3325035	3325040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221056
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52463	NC_021984	TCT	2	6	3325582	3325587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222592
52464	NC_021984	CAG	2	6	3325599	3325604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222592
52465	NC_021984	GC	3	6	3325616	3325621	0 %	0 %	50 %	50 %	529222592
52466	NC_021984	CAC	2	6	3325662	3325667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222592
52467	NC_021984	CGA	2	6	3325691	3325696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222592
52468	NC_021984	A	6	6	3325736	3325741	100 %	0 %	0 %	0 %	529222592
52469	NC_021984	CGG	2	6	3325783	3325788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222592
52470	NC_021984	GGCA	2	8	3325800	3325807	25 %	0 %	50 %	25 %	529222592
52471	NC_021984	AGC	2	6	3325866	3325871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222592
52472	NC_021984	CAC	2	6	3325890	3325895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529222592
52473	NC_021984	GCG	2	6	3325952	3325957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222592
52474	NC_021984	CTT	2	6	3325991	3325996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529222592
52475	NC_021984	TGT	2	6	3326026	3326031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529222592
52476	NC_021984	GCA	2	6	3326081	3326086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529222592
52477	NC_021984	CGG	2	6	3326111	3326116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529222592
52478	NC_021984	ACGC	2	8	3326147	3326154	25 %	0 %	25 %	50 %	529222592
52479	NC_021984	CCG	2	6	3326219	3326224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529222592
52480	NC_021984	CGC	2	6	3326333	3326338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221057
52481	NC_021984	GC	5	10	3326337	3326346	0 %	0 %	50 %	50 %	529221057
52482	NC_021984	GTC	2	6	3326352	3326357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221057
52483	NC_021984	GCA	2	6	3326465	3326470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221057
52484	NC_021984	GAT	2	6	3326478	3326483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529221057
52485	NC_021984	CTG	2	6	3326520	3326525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221057
52486	NC_021984	AAG	2	6	3326527	3326532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221057
52487	NC_021984	CAG	2	6	3326541	3326546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221057
52488	NC_021984	CAAC	2	8	3326561	3326568	50 %	0 %	0 %	50 %	529221057
52489	NC_021984	TTA	2	6	3326610	3326615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221057
52490	NC_021984	GC	3	6	3326653	3326658	0 %	0 %	50 %	50 %	529221057
52491	NC_021984	GCCA	2	8	3326736	3326743	25 %	0 %	25 %	50 %	529221057
52492	NC_021984	GGC	2	6	3326798	3326803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221057
52493	NC_021984	A	7	7	3326815	3326821	100 %	0 %	0 %	0 %	529221057
52494	NC_021984	GTTA	2	8	3326876	3326883	25 %	50 %	25 %	0 %	529221057
52495	NC_021984	GCTG	2	8	3326911	3326918	0 %	25 %	50 %	25 %	529221057
52496	NC_021984	TGC	2	6	3327022	3327027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221057
52497	NC_021984	CCA	2	6	3327067	3327072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529221057
52498	NC_021984	CTG	3	9	3327084	3327092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221057
52499	NC_021984	GCC	2	6	3327189	3327194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221057
52500	NC_021984	GGA	2	6	3327224	3327229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529221057

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