MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 75077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021984	GAA	2	6	283161	283166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529221997
4502	NC_021984	TAT	2	6	283248	283253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221997
4503	NC_021984	CG	3	6	283254	283259	0 %	0 %	50 %	50 %	529221997
4504	NC_021984	GTAT	3	12	283375	283386	25 %	50 %	25 %	0 %	529221997
4505	NC_021984	GCG	2	6	283398	283403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529221997
4506	NC_021984	TGC	2	6	283504	283509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221997
4507	NC_021984	CACT	2	8	283616	283623	25 %	25 %	0 %	50 %	529221997
4508	NC_021984	TCG	2	6	283790	283795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218970
4509	NC_021984	GTC	2	6	283885	283890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218970
4510	NC_021984	GC	4	8	283911	283918	0 %	0 %	50 %	50 %	529218970
4511	NC_021984	AGC	2	6	284088	284093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218970
4512	NC_021984	CAA	2	6	284265	284270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218970
4513	NC_021984	AGT	2	6	284307	284312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218970
4514	NC_021984	GGC	2	6	284353	284358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218970
4515	NC_021984	CGAT	2	8	284366	284373	25 %	25 %	25 %	25 %	529218970
4516	NC_021984	ATTA	2	8	284422	284429	50 %	50 %	0 %	0 %	529218970
4517	NC_021984	TCT	2	6	284441	284446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218970
4518	NC_021984	TTCA	2	8	284500	284507	25 %	50 %	0 %	25 %	529218970
4519	NC_021984	CGC	2	6	284517	284522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218970
4520	NC_021984	CAG	2	6	284527	284532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218970
4521	NC_021984	CCA	2	6	284535	284540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218970
4522	NC_021984	CAG	2	6	284572	284577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218970
4523	NC_021984	T	6	6	284589	284594	0 %	100 %	0 %	0 %	529218970
4524	NC_021984	CCA	2	6	284616	284621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218970
4525	NC_021984	CGC	2	6	284674	284679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218970
4526	NC_021984	GC	3	6	284681	284686	0 %	0 %	50 %	50 %	529218970
4527	NC_021984	GCG	2	6	284694	284699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218970
4528	NC_021984	CGC	2	6	284766	284771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218970
4529	NC_021984	GCC	2	6	284806	284811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218970
4530	NC_021984	CG	3	6	284836	284841	0 %	0 %	50 %	50 %	529218970
4531	NC_021984	TCA	2	6	284946	284951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218970
4532	NC_021984	CG	3	6	284958	284963	0 %	0 %	50 %	50 %	529218970
4533	NC_021984	TCA	2	6	284993	284998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218970
4534	NC_021984	GAA	2	6	285019	285024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218970
4535	NC_021984	CTT	2	6	285081	285086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218970
4536	NC_021984	GCA	2	6	285135	285140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218970
4537	NC_021984	CT	3	6	285170	285175	0 %	50 %	0 %	50 %	529218970
4538	NC_021984	GGCT	2	8	285187	285194	0 %	25 %	50 %	25 %	529218970
4539	NC_021984	GTT	2	6	285229	285234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218970
4540	NC_021984	CACG	2	8	285243	285250	25 %	0 %	25 %	50 %	529218970
4541	NC_021984	T	6	6	285262	285267	0 %	100 %	0 %	0 %	529218970
4542	NC_021984	TA	3	6	285297	285302	50 %	50 %	0 %	0 %	529218970
4543	NC_021984	ATC	2	6	285323	285328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218970
4544	NC_021984	GC	3	6	285332	285337	0 %	0 %	50 %	50 %	529218970
4545	NC_021984	TGG	2	6	285347	285352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218970
4546	NC_021984	TGT	2	6	285417	285422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218970
4547	NC_021984	AAAT	2	8	285674	285681	75 %	25 %	0 %	0 %	529218971
4548	NC_021984	CGT	2	6	285711	285716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218971
4549	NC_021984	GGC	3	9	285786	285794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218971
4550	NC_021984	CCA	2	6	285854	285859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218971
4551	NC_021984	CT	3	6	285889	285894	0 %	50 %	0 %	50 %	529218971
4552	NC_021984	GCC	2	6	286019	286024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218971
4553	NC_021984	GCC	2	6	286026	286031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218971
4554	NC_021984	TGA	2	6	286042	286047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218971
4555	NC_021984	CGC	2	6	286133	286138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218971
4556	NC_021984	GACCA	2	10	286149	286158	40 %	0 %	20 %	40 %	529218971
4557	NC_021984	GCT	2	6	286227	286232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218971
4558	NC_021984	AGC	2	6	286282	286287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529221998
4559	NC_021984	GC	3	6	286370	286375	0 %	0 %	50 %	50 %	529221998
4560	NC_021984	CGC	2	6	286423	286428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529221998
4561	NC_021984	AAC	2	6	286588	286593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529221998
4562	NC_021984	ATA	2	6	286635	286640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529221998
4563	NC_021984	CACCG	2	10	286767	286776	20 %	0 %	20 %	60 %	529218972
4564	NC_021984	TCA	2	6	286810	286815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218972
4565	NC_021984	T	6	6	286836	286841	0 %	100 %	0 %	0 %	529218972
4566	NC_021984	CTGG	2	8	286947	286954	0 %	25 %	50 %	25 %	529218972
4567	NC_021984	TGA	2	6	286967	286972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218972
4568	NC_021984	GCG	2	6	287015	287020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218972
4569	NC_021984	CAA	2	6	287030	287035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218972
4570	NC_021984	CGA	2	6	287057	287062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218972
4571	NC_021984	GCA	4	12	287123	287134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218972
4572	NC_021984	GGTCG	2	10	287151	287160	0 %	20 %	60 %	20 %	529218972
4573	NC_021984	GATTT	2	10	287203	287212	20 %	60 %	20 %	0 %	529218972
4574	NC_021984	T	7	7	287210	287216	0 %	100 %	0 %	0 %	529218972
4575	NC_021984	TTTC	2	8	287405	287412	0 %	75 %	0 %	25 %	529218972
4576	NC_021984	TGC	2	6	287440	287445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218972
4577	NC_021984	TTTGAA	2	12	287553	287564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	529218972
4578	NC_021984	TAAA	2	8	287657	287664	75 %	25 %	0 %	0 %	529218973
4579	NC_021984	TCA	2	6	287695	287700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218973
4580	NC_021984	GCC	2	6	287750	287755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218973
4581	NC_021984	GCC	2	6	287768	287773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218973
4582	NC_021984	ACCAG	2	10	287823	287832	40 %	0 %	20 %	40 %	529218973
4583	NC_021984	GCG	2	6	287872	287877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218973
4584	NC_021984	TCGC	2	8	287887	287894	0 %	25 %	25 %	50 %	529218973
4585	NC_021984	AAC	2	6	287925	287930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218973
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4587	NC_021984	GGCGC	2	10	287958	287967	0 %	0 %	60 %	40 %	529218973
4588	NC_021984	ATT	2	6	288018	288023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218973
4589	NC_021984	ATC	2	6	288036	288041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218973
4590	NC_021984	GAT	2	6	288053	288058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218973
4591	NC_021984	ACC	2	6	288084	288089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218973
4592	NC_021984	AG	3	6	288092	288097	50 %	0 %	50 %	0 %	529218973
4593	NC_021984	GAA	2	6	288185	288190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218973
4594	NC_021984	CAT	2	6	288245	288250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218973
4595	NC_021984	TCT	2	6	288322	288327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218974
4596	NC_021984	TG	3	6	288328	288333	0 %	50 %	50 %	0 %	529218974
4597	NC_021984	CCGC	2	8	288370	288377	0 %	0 %	25 %	75 %	529218974
4598	NC_021984	GC	3	6	288389	288394	0 %	0 %	50 %	50 %	529218974
4599	NC_021984	TAA	2	6	288395	288400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218974
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4601	NC_021984	ACG	2	6	288420	288425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218974
4602	NC_021984	CG	3	6	288424	288429	0 %	0 %	50 %	50 %	529218974
4603	NC_021984	AGC	2	6	288439	288444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218974
4604	NC_021984	GCA	2	6	288479	288484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218974
4605	NC_021984	TGA	2	6	288644	288649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218974
4606	NC_021984	ACG	2	6	288720	288725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218974
4607	NC_021984	GC	3	6	288776	288781	0 %	0 %	50 %	50 %	529218974
4608	NC_021984	TGG	2	6	288782	288787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218974
4609	NC_021984	CG	3	6	288825	288830	0 %	0 %	50 %	50 %	529218974
4610	NC_021984	CCG	2	6	288856	288861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218974
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4612	NC_021984	GT	3	6	288950	288955	0 %	50 %	50 %	0 %	529218974
4613	NC_021984	AG	3	6	289002	289007	50 %	0 %	50 %	0 %	529218974
4614	NC_021984	CCG	2	6	289090	289095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218974
4615	NC_021984	AAGT	2	8	289125	289132	50 %	25 %	25 %	0 %	529218974
4616	NC_021984	GGCA	2	8	289197	289204	25 %	0 %	50 %	25 %	529218974
4617	NC_021984	ATT	2	6	289218	289223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218974
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4621	NC_021984	CG	4	8	289649	289656	0 %	0 %	50 %	50 %	529221999
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4623	NC_021984	TAT	2	6	289743	289748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529221999
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4746	NC_021984	GGCCA	2	10	302161	302170	20 %	0 %	40 %	40 %	529218979
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4986	NC_021984	GC	3	6	315956	315961	0 %	0 %	50 %	50 %	529218992
4987	NC_021984	CGA	2	6	316068	316073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218992
4988	NC_021984	CTC	2	6	316146	316151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529218992
4989	NC_021984	GATCTG	2	12	316234	316245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	529218992
4990	NC_021984	CAC	2	6	316248	316253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218992
4991	NC_021984	AAC	2	6	316281	316286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218992
4992	NC_021984	CTAT	2	8	316298	316305	25 %	50 %	0 %	25 %	529218992
4993	NC_021984	GCC	2	6	316326	316331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218992
4994	NC_021984	TTA	2	6	316409	316414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218992
4995	NC_021984	GTG	2	6	316504	316509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218992
4996	NC_021984	CTT	2	6	316515	316520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218992
4997	NC_021984	CG	3	6	316541	316546	0 %	0 %	50 %	50 %	529218992
4998	NC_021984	CAA	2	6	316617	316622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218992
4999	NC_021984	GCGCTG	2	12	316636	316647	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529218992
5000	NC_021984	TGG	2	6	316688	316693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218992

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