MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021902	CGA	2	6	182785	182790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816896
3502	NC_021902	GGC	2	6	182864	182869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816896
3503	NC_021902	CGT	2	6	183074	183079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816896
3504	NC_021902	ATG	2	6	183086	183091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816896
3505	NC_021902	GC	3	6	183117	183122	0 %	0 %	50 %	50 %	528816896
3506	NC_021902	GGT	2	6	183139	183144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816896
3507	NC_021902	AAG	2	6	183165	183170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816896
3508	NC_021902	GTATT	2	10	183230	183239	20 %	60 %	20 %	0 %	528816896
3509	NC_021902	A	6	6	183244	183249	100 %	0 %	0 %	0 %	528816896
3510	NC_021902	CG	4	8	183250	183257	0 %	0 %	50 %	50 %	528816896
3511	NC_021902	GCA	2	6	183260	183265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816896
3512	NC_021902	TTA	2	6	183272	183277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816896
3513	NC_021902	GAA	2	6	183400	183405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816897
3514	NC_021902	GAA	2	6	183420	183425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816897
3515	NC_021902	CACGC	2	10	183484	183493	20 %	0 %	20 %	60 %	528816897
3516	NC_021902	CAT	2	6	183558	183563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816897
3517	NC_021902	CGCTAT	2	12	183567	183578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528816897
3518	NC_021902	AGT	2	6	183585	183590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816897
3519	NC_021902	GAA	2	6	183592	183597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816897
3520	NC_021902	GCC	2	6	183604	183609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816897
3521	NC_021902	CGG	2	6	183668	183673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816897
3522	NC_021902	CGC	2	6	183689	183694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816897
3523	NC_021902	CGC	2	6	183763	183768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816897
3524	NC_021902	GC	3	6	183767	183772	0 %	0 %	50 %	50 %	528816897
3525	NC_021902	TGG	2	6	183878	183883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816897
3526	NC_021902	CGG	2	6	183890	183895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816897
3527	NC_021902	GAT	2	6	183904	183909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816897
3528	NC_021902	GCG	2	6	183956	183961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816897
3529	NC_021902	TGA	2	6	183989	183994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816897
3530	NC_021902	GGCGCG	2	12	183997	184008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816897
3531	NC_021902	GCGCG	2	10	184035	184044	0 %	0 %	60 %	40 %	528816897
3532	NC_021902	GTT	2	6	184063	184068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816897
3533	NC_021902	CGC	2	6	184082	184087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816897
3534	NC_021902	CCG	2	6	184094	184099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816897
3535	NC_021902	GAT	2	6	184305	184310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816898
3536	NC_021902	CGA	2	6	184336	184341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816898
3537	NC_021902	GCG	2	6	184441	184446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816898
3538	NC_021902	CGC	2	6	184483	184488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816898
3539	NC_021902	CTTC	2	8	184504	184511	0 %	50 %	0 %	50 %	528816898
3540	NC_021902	A	6	6	184562	184567	100 %	0 %	0 %	0 %	528816898
3541	NC_021902	CGC	2	6	184580	184585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816898
3542	NC_021902	AG	3	6	184634	184639	50 %	0 %	50 %	0 %	528816898
3543	NC_021902	CG	3	6	184668	184673	0 %	0 %	50 %	50 %	528816898
3544	NC_021902	CGC	2	6	184717	184722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816898
3545	NC_021902	GCC	2	6	184730	184735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816898
3546	NC_021902	AGGT	2	8	184809	184816	25 %	25 %	50 %	0 %	528816898
3547	NC_021902	GAA	2	6	184832	184837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816898
3548	NC_021902	ATC	3	9	184881	184889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816898
3549	NC_021902	AG	3	6	184953	184958	50 %	0 %	50 %	0 %	528816898
3550	NC_021902	CCA	2	6	184965	184970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816898
3551	NC_021902	GTG	2	6	185012	185017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816898
3552	NC_021902	ATA	2	6	185078	185083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816898
3553	NC_021902	AT	3	6	185151	185156	50 %	50 %	0 %	0 %	528816898
3554	NC_021902	ATT	2	6	185195	185200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816898
3555	NC_021902	AGGC	2	8	185239	185246	25 %	0 %	50 %	25 %	528816898
3556	NC_021902	CAG	2	6	185264	185269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816898
3557	NC_021902	CAAT	2	8	185347	185354	50 %	25 %	0 %	25 %	528816898
3558	NC_021902	CCG	2	6	185400	185405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816898
3559	NC_021902	GAG	2	6	185439	185444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816898
3560	NC_021902	AGGCC	2	10	185446	185455	20 %	0 %	40 %	40 %	528816898
3561	NC_021902	ATT	2	6	185490	185495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816898
3562	NC_021902	TAT	2	6	185591	185596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816898
3563	NC_021902	GCG	2	6	185718	185723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816899
3564	NC_021902	AAT	2	6	185806	185811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816899
3565	NC_021902	GCG	2	6	185894	185899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816899
3566	NC_021902	CGC	2	6	185919	185924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816899
3567	NC_021902	GA	3	6	185948	185953	50 %	0 %	50 %	0 %	528816899
3568	NC_021902	CCG	2	6	185956	185961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816899
3569	NC_021902	GCG	2	6	185966	185971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816899
3570	NC_021902	GCA	2	6	186073	186078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816899
3571	NC_021902	TTC	2	6	186117	186122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816899
3572	NC_021902	CTG	2	6	186186	186191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816899
3573	NC_021902	GCG	2	6	186249	186254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816899
3574	NC_021902	CAC	2	6	186324	186329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816899
3575	NC_021902	C	6	6	186366	186371	0 %	0 %	0 %	100 %	528816899
3576	NC_021902	GC	3	6	186404	186409	0 %	0 %	50 %	50 %	528816899
3577	NC_021902	CAG	2	6	186528	186533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816899
3578	NC_021902	GCC	2	6	186618	186623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816899
3579	NC_021902	ATG	2	6	186685	186690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816899
3580	NC_021902	TCAC	2	8	186739	186746	25 %	25 %	0 %	50 %	528816899
3581	NC_021902	CGC	2	6	186828	186833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816899
3582	NC_021902	T	8	8	186875	186882	0 %	100 %	0 %	0 %	528816899
3583	NC_021902	TAT	2	6	186919	186924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816901
3584	NC_021902	GTTGAT	2	12	186948	186959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	528816901
3585	NC_021902	ATA	2	6	187043	187048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816901
3586	NC_021902	ATG	2	6	187053	187058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816901
3587	NC_021902	ATG	2	6	187143	187148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816901
3588	NC_021902	AAT	2	6	187149	187154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816900
3589	NC_021902	GGT	2	6	187371	187376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
3590	NC_021902	GTC	2	6	187407	187412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816900
3591	NC_021902	AAC	3	9	187425	187433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816900
3592	NC_021902	TGG	2	6	187537	187542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
3593	NC_021902	CGC	2	6	187557	187562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
3594	NC_021902	GTG	2	6	187572	187577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
3595	NC_021902	GGT	2	6	187637	187642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
3596	NC_021902	CGC	2	6	187666	187671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
3597	NC_021902	TCT	2	6	187727	187732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816900
3598	NC_021902	TCG	2	6	187745	187750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816900
3599	NC_021902	TTG	2	6	187758	187763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816900
3600	NC_021902	CCG	2	6	187768	187773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
3601	NC_021902	TTC	2	6	187813	187818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816900
3602	NC_021902	GAT	2	6	187964	187969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816900
3603	NC_021902	GCC	2	6	188040	188045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
3604	NC_021902	TAC	2	6	188063	188068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816900
3605	NC_021902	GC	3	6	188099	188104	0 %	0 %	50 %	50 %	528816900
3606	NC_021902	TTGA	2	8	188175	188182	25 %	50 %	25 %	0 %	528816900
3607	NC_021902	GCC	2	6	188243	188248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816902
3608	NC_021902	AT	3	6	188261	188266	50 %	50 %	0 %	0 %	528816902
3609	NC_021902	ACC	3	9	188318	188326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816903
3610	NC_021902	CAT	2	6	188365	188370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816903
3611	NC_021902	TCT	2	6	188382	188387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816903
3612	NC_021902	CG	3	6	188427	188432	0 %	0 %	50 %	50 %	528816903
3613	NC_021902	AAT	2	6	188451	188456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816903
3614	NC_021902	GGGC	2	8	188484	188491	0 %	0 %	75 %	25 %	528816903
3615	NC_021902	GTC	2	6	188501	188506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816903
3616	NC_021902	CGG	2	6	188532	188537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
3617	NC_021902	GGC	2	6	188545	188550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
3618	NC_021902	GCG	2	6	188602	188607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
3619	NC_021902	ATC	2	6	188617	188622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816903
3620	NC_021902	GAT	2	6	188644	188649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816903
3621	NC_021902	ATG	2	6	188684	188689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816903
3622	NC_021902	CGG	2	6	188701	188706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
3623	NC_021902	ATG	2	6	188738	188743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816903
3624	NC_021902	GGC	2	6	188807	188812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816904
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3859	NC_021902	CAG	2	6	201121	201126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816914
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3865	NC_021902	CCGTG	2	10	201351	201360	0 %	20 %	40 %	40 %	528816914
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3986	NC_021902	AGC	2	6	207061	207066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816917
3987	NC_021902	TGG	2	6	207111	207116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816917
3988	NC_021902	CGGAA	2	10	207140	207149	40 %	0 %	40 %	20 %	528816917
3989	NC_021902	TGC	2	6	207169	207174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816917
3990	NC_021902	GGC	2	6	207179	207184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816917
3991	NC_021902	CAT	2	6	207194	207199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816917
3992	NC_021902	AG	4	8	207278	207285	50 %	0 %	50 %	0 %	528816917
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3995	NC_021902	ACG	2	6	207380	207385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816917
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3998	NC_021902	TCGA	2	8	207694	207701	25 %	25 %	25 %	25 %	528816918
3999	NC_021902	TGC	2	6	207707	207712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816918
4000	NC_021902	GCCA	2	8	207713	207720	25 %	0 %	25 %	50 %	528816918

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