MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_021902	CTT	2	6	157138	157143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816871
3003	NC_021902	TTAAAG	2	12	157212	157223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	528816871
3004	NC_021902	GCG	2	6	157257	157262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816871
3005	NC_021902	CCG	2	6	157281	157286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816871
3006	NC_021902	ACC	2	6	157301	157306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816871
3007	NC_021902	GAA	2	6	157401	157406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816871
3008	NC_021902	CCTG	2	8	157425	157432	0 %	25 %	25 %	50 %	528816871
3009	NC_021902	TAA	2	6	157490	157495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816871
3010	NC_021902	TAA	2	6	157511	157516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816871
3011	NC_021902	GCG	2	6	157527	157532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816871
3012	NC_021902	CT	3	6	157542	157547	0 %	50 %	0 %	50 %	528816871
3013	NC_021902	TGG	2	6	157564	157569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816871
3014	NC_021902	GCG	2	6	157588	157593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816871
3015	NC_021902	GGC	2	6	157600	157605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816871
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3017	NC_021902	GCG	2	6	157633	157638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816871
3018	NC_021902	GTGACC	2	12	157668	157679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528816871
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3020	NC_021902	TCT	2	6	157719	157724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816871
3021	NC_021902	CGG	2	6	157798	157803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816871
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3023	NC_021902	GCAGC	2	10	157855	157864	20 %	0 %	40 %	40 %	528816871
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3030	NC_021902	TTAC	2	8	158743	158750	25 %	50 %	0 %	25 %	528816873
3031	NC_021902	TCA	2	6	158759	158764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816873
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3057	NC_021902	GT	3	6	160053	160058	0 %	50 %	50 %	0 %	528816874
3058	NC_021902	TGC	2	6	160124	160129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816874
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3067	NC_021902	GCT	2	6	160596	160601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816874
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3070	NC_021902	TAT	2	6	160800	160805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816874
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3104	NC_021902	TTAA	2	8	162263	162270	50 %	50 %	0 %	0 %	528816876
3105	NC_021902	A	6	6	162286	162291	100 %	0 %	0 %	0 %	528816876
3106	NC_021902	ATA	2	6	162462	162467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816876
3107	NC_021902	TAT	3	9	162469	162477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816876
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3109	NC_021902	T	7	7	162575	162581	0 %	100 %	0 %	0 %	528816876
3110	NC_021902	TA	3	6	162712	162717	50 %	50 %	0 %	0 %	528816877
3111	NC_021902	TTA	2	6	162772	162777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816877
3112	NC_021902	CT	3	6	162806	162811	0 %	50 %	0 %	50 %	528816877
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3115	NC_021902	GAAA	2	8	163030	163037	75 %	0 %	25 %	0 %	528816877
3116	NC_021902	A	6	6	163089	163094	100 %	0 %	0 %	0 %	528816877
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3123	NC_021902	ATT	2	6	163359	163364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816877
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3127	NC_021902	A	6	6	163481	163486	100 %	0 %	0 %	0 %	528816877
3128	NC_021902	TAC	2	6	163498	163503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816877
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3131	NC_021902	GAT	2	6	163650	163655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816877
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3137	NC_021902	TACGC	2	10	164045	164054	20 %	20 %	20 %	40 %	528816878
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3144	NC_021902	GTA	2	6	164432	164437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816878
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3239	NC_021902	TAAT	2	8	168623	168630	50 %	50 %	0 %	0 %	528816882
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3242	NC_021902	CAG	2	6	168843	168848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816883
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3246	NC_021902	TGA	2	6	168998	169003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816883
3247	NC_021902	TAT	2	6	169073	169078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816883
3248	NC_021902	TAT	2	6	169130	169135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816883
3249	NC_021902	CAT	2	6	169142	169147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816883
3250	NC_021902	CAT	2	6	169151	169156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816883
3251	NC_021902	TCTG	2	8	169243	169250	0 %	50 %	25 %	25 %	528816883
3252	NC_021902	TTA	2	6	169288	169293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816883
3253	NC_021902	GAT	2	6	169317	169322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816883
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3260	NC_021902	TAT	2	6	169586	169591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816883
3261	NC_021902	AT	3	6	169600	169605	50 %	50 %	0 %	0 %	528816883
3262	NC_021902	CT	3	6	169612	169617	0 %	50 %	0 %	50 %	528816883
3263	NC_021902	TAC	2	6	169659	169664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816883
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3266	NC_021902	CTTT	2	8	169765	169772	0 %	75 %	0 %	25 %	528816883
3267	NC_021902	ATA	2	6	169814	169819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816883
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3271	NC_021902	ATG	2	6	170024	170029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816883
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3273	NC_021902	AGC	2	6	170138	170143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816884
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3277	NC_021902	CCT	2	6	170294	170299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816884
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3279	NC_021902	GC	3	6	170375	170380	0 %	0 %	50 %	50 %	528816884
3280	NC_021902	CCA	2	6	170414	170419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816884
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3284	NC_021902	TGT	2	6	170617	170622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816884
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3286	NC_021902	CGT	2	6	170768	170773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816884
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3363	NC_021902	GC	3	6	175031	175036	0 %	0 %	50 %	50 %	528816888
3364	NC_021902	CG	3	6	175052	175057	0 %	0 %	50 %	50 %	528816888
3365	NC_021902	AG	3	6	175072	175077	50 %	0 %	50 %	0 %	528816888
3366	NC_021902	ACG	2	6	175083	175088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816888
3367	NC_021902	GC	3	6	175143	175148	0 %	0 %	50 %	50 %	528816888
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3485	NC_021902	GAC	2	6	181730	181735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816894
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3488	NC_021902	TGC	2	6	182002	182007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816895
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3490	NC_021902	CAG	2	6	182061	182066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816895
3491	NC_021902	GCA	3	9	182249	182257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816895
3492	NC_021902	GAA	2	6	182274	182279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816895
3493	NC_021902	TGA	2	6	182292	182297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816895
3494	NC_021902	CCA	2	6	182377	182382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816896
3495	NC_021902	TTCC	2	8	182450	182457	0 %	50 %	0 %	50 %	528816896
3496	NC_021902	GGC	2	6	182512	182517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816896
3497	NC_021902	TGG	3	9	182532	182540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816896
3498	NC_021902	TGC	2	6	182565	182570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816896
3499	NC_021902	TCGC	2	8	182661	182668	0 %	25 %	25 %	50 %	528816896
3500	NC_021902	GGC	2	6	182731	182736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816896

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