MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021902	CTG	2	6	130580	130585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816843
2502	NC_021902	CTA	2	6	130606	130611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816843
2503	NC_021902	AAC	2	6	130647	130652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816843
2504	NC_021902	TGG	2	6	130817	130822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816844
2505	NC_021902	GCCGC	2	10	130828	130837	0 %	0 %	40 %	60 %	528816844
2506	NC_021902	CGAA	2	8	130848	130855	50 %	0 %	25 %	25 %	528816844
2507	NC_021902	GTT	2	6	130875	130880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816844
2508	NC_021902	CGC	2	6	130898	130903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816844
2509	NC_021902	AGGA	2	8	130904	130911	50 %	0 %	50 %	0 %	528816844
2510	NC_021902	AAC	2	6	131008	131013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816844
2511	NC_021902	GAA	2	6	131124	131129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816844
2512	NC_021902	CGG	2	6	131277	131282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816844
2513	NC_021902	ATC	2	6	131354	131359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816844
2514	NC_021902	AGTTC	2	10	131403	131412	20 %	40 %	20 %	20 %	528816844
2515	NC_021902	GTC	2	6	131498	131503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816844
2516	NC_021902	GCC	2	6	131511	131516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816844
2517	NC_021902	ACC	2	6	131542	131547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816844
2518	NC_021902	CAC	2	6	131553	131558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816844
2519	NC_021902	ACG	2	6	131564	131569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816844
2520	NC_021902	GTG	2	6	131664	131669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816844
2521	NC_021902	GAT	2	6	131712	131717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816844
2522	NC_021902	CGC	2	6	131719	131724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816844
2523	NC_021902	TGG	2	6	131936	131941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816844
2524	NC_021902	GC	3	6	132134	132139	0 %	0 %	50 %	50 %	528816844
2525	NC_021902	GCG	2	6	132161	132166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816844
2526	NC_021902	GCG	2	6	132206	132211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816844
2527	NC_021902	GCC	2	6	132332	132337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816844
2528	NC_021902	GAC	2	6	132376	132381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816844
2529	NC_021902	GTG	2	6	132394	132399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816844
2530	NC_021902	CTT	2	6	132402	132407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816844
2531	NC_021902	GAT	2	6	132426	132431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816844
2532	NC_021902	GCG	2	6	132451	132456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816844
2533	NC_021902	CG	3	6	132455	132460	0 %	0 %	50 %	50 %	528816844
2534	NC_021902	ATG	2	6	132481	132486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816844
2535	NC_021902	GAT	2	6	132492	132497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816844
2536	NC_021902	CAG	2	6	132676	132681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816844
2537	NC_021902	CGTG	2	8	132708	132715	0 %	25 %	50 %	25 %	528816844
2538	NC_021902	ACT	2	6	132723	132728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816844
2539	NC_021902	CAA	2	6	132738	132743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816844
2540	NC_021902	GCG	2	6	132899	132904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816844
2541	NC_021902	AGGCG	2	10	132906	132915	20 %	0 %	60 %	20 %	528816844
2542	NC_021902	GTG	2	6	133024	133029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816844
2543	NC_021902	ACACC	2	10	133182	133191	40 %	0 %	0 %	60 %	528816845
2544	NC_021902	CTG	2	6	133213	133218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816845
2545	NC_021902	CTG	2	6	133348	133353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816845
2546	NC_021902	CGC	2	6	133371	133376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816845
2547	NC_021902	GCG	2	6	133516	133521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816845
2548	NC_021902	GCG	2	6	133550	133555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816845
2549	NC_021902	TGA	2	6	133589	133594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816845
2550	NC_021902	TGT	2	6	133595	133600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816845
2551	NC_021902	T	6	6	133696	133701	0 %	100 %	0 %	0 %	528816845
2552	NC_021902	TAAA	2	8	133946	133953	75 %	25 %	0 %	0 %	528816845
2553	NC_021902	TCT	2	6	133997	134002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816845
2554	NC_021902	GAC	2	6	134088	134093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816845
2555	NC_021902	GTA	2	6	134114	134119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816845
2556	NC_021902	GCG	2	6	134121	134126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816845
2557	NC_021902	CG	3	6	134238	134243	0 %	0 %	50 %	50 %	528816845
2558	NC_021902	CGT	2	6	134322	134327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816845
2559	NC_021902	CGC	2	6	134409	134414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816845
2560	NC_021902	GCG	2	6	134568	134573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816845
2561	NC_021902	GATGG	2	10	134670	134679	20 %	20 %	60 %	0 %	528816845
2562	NC_021902	GAT	2	6	134691	134696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816845
2563	NC_021902	GCA	2	6	134775	134780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816845
2564	NC_021902	CAC	2	6	134800	134805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816845
2565	NC_021902	CGG	2	6	134986	134991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816846
2566	NC_021902	GCC	2	6	135022	135027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2567	NC_021902	CG	3	6	135142	135147	0 %	0 %	50 %	50 %	528816846
2568	NC_021902	GGC	2	6	135187	135192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816846
2569	NC_021902	GCC	2	6	135220	135225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2570	NC_021902	TGC	2	6	135245	135250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2571	NC_021902	CCG	2	6	135264	135269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2572	NC_021902	ATCAGC	2	12	135287	135298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528816846
2573	NC_021902	CGA	2	6	135300	135305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2574	NC_021902	GTT	2	6	135352	135357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816846
2575	NC_021902	CGC	2	6	135429	135434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2576	NC_021902	GCT	2	6	135471	135476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2577	NC_021902	ATA	2	6	135580	135585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816846
2578	NC_021902	GCC	2	6	135674	135679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2579	NC_021902	AAG	2	6	135693	135698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816846
2580	NC_021902	CAG	2	6	135730	135735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2581	NC_021902	ATA	2	6	135737	135742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816846
2582	NC_021902	GAC	2	6	135751	135756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2583	NC_021902	CAG	3	9	135763	135771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2584	NC_021902	GGC	2	6	135805	135810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816846
2585	NC_021902	GCC	3	9	135814	135822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2586	NC_021902	AAT	2	6	135859	135864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816846
2587	NC_021902	CAC	2	6	135868	135873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816846
2588	NC_021902	GC	3	6	135904	135909	0 %	0 %	50 %	50 %	528816846
2589	NC_021902	GCC	2	6	135974	135979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2590	NC_021902	ATC	2	6	135980	135985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816846
2591	NC_021902	CGC	2	6	135999	136004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816846
2592	NC_021902	TGGA	2	8	136064	136071	25 %	25 %	50 %	0 %	528816846
2593	NC_021902	TTTGA	2	10	136102	136111	20 %	60 %	20 %	0 %	528816846
2594	NC_021902	ATA	2	6	136112	136117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816846
2595	NC_021902	TGC	2	6	136157	136162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2596	NC_021902	CAG	2	6	136234	136239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816846
2597	NC_021902	GCG	2	6	136272	136277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816846
2598	NC_021902	AATT	2	8	136297	136304	50 %	50 %	0 %	0 %	528816846
2599	NC_021902	CGC	2	6	136625	136630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816847
2600	NC_021902	TGC	2	6	136639	136644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816847
2601	NC_021902	GTCT	2	8	136667	136674	0 %	50 %	25 %	25 %	528816847
2602	NC_021902	GAA	2	6	136682	136687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816847
2603	NC_021902	G	7	7	136712	136718	0 %	0 %	100 %	0 %	528816847
2604	NC_021902	A	7	7	136749	136755	100 %	0 %	0 %	0 %	528816847
2605	NC_021902	CGA	2	6	136819	136824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816847
2606	NC_021902	G	6	6	136859	136864	0 %	0 %	100 %	0 %	528816847
2607	NC_021902	GTT	2	6	136869	136874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816847
2608	NC_021902	GTC	2	6	136887	136892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816847
2609	NC_021902	CTG	2	6	136905	136910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816847
2610	NC_021902	CGG	2	6	136997	137002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816847
2611	NC_021902	CGGCG	2	10	137012	137021	0 %	0 %	60 %	40 %	528816847
2612	NC_021902	GGC	2	6	137118	137123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816847
2613	NC_021902	CCA	2	6	137152	137157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816847
2614	NC_021902	CT	3	6	137231	137236	0 %	50 %	0 %	50 %	528816847
2615	NC_021902	TCTG	2	8	137269	137276	0 %	50 %	25 %	25 %	528816847
2616	NC_021902	TG	3	6	137340	137345	0 %	50 %	50 %	0 %	528816847
2617	NC_021902	TTG	2	6	137350	137355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816847
2618	NC_021902	TGG	2	6	137383	137388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816847
2619	NC_021902	TGA	2	6	137464	137469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816847
2620	NC_021902	TGG	2	6	137521	137526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816847
2621	NC_021902	ATG	2	6	137574	137579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816847
2622	NC_021902	GCG	2	6	137595	137600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816847
2623	NC_021902	GGC	2	6	137606	137611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816847
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2742	NC_021902	TGA	2	6	142953	142958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816851
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2750	NC_021902	CTT	2	6	143673	143678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816852
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2984	NC_021902	CGC	2	6	156000	156005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816869
2985	NC_021902	GCA	2	6	156104	156109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816869
2986	NC_021902	GAA	3	9	156119	156127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816869
2987	NC_021902	TGG	2	6	156163	156168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816869
2988	NC_021902	CGT	2	6	156235	156240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816869
2989	NC_021902	CTG	2	6	156264	156269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816869
2990	NC_021902	TGC	2	6	156292	156297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816869
2991	NC_021902	CTT	2	6	156590	156595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816870
2992	NC_021902	CGA	2	6	156603	156608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816870
2993	NC_021902	CG	3	6	156717	156722	0 %	0 %	50 %	50 %	528816870
2994	NC_021902	CTGT	2	8	156747	156754	0 %	50 %	25 %	25 %	528816870
2995	NC_021902	CAC	2	6	156789	156794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816870
2996	NC_021902	GCGCCA	2	12	156827	156838	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528816870
2997	NC_021902	GGC	2	6	156879	156884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816870
2998	NC_021902	GC	3	6	156919	156924	0 %	0 %	50 %	50 %	528816870
2999	NC_021902	CAG	2	6	157031	157036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816871
3000	NC_021902	GCA	2	6	157039	157044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816871

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