MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2124	NC_021902	CA	3	6	109085	109090	50 %	0 %	0 %	50 %	528816823
2125	NC_021902	CTG	3	9	109107	109115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816823
2126	NC_021902	GGC	2	6	109122	109127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816823
2127	NC_021902	GTG	2	6	109245	109250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816823
2128	NC_021902	CGG	2	6	109292	109297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816823
2129	NC_021902	ACG	2	6	109299	109304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816823
2130	NC_021902	CGCGG	2	10	109313	109322	0 %	0 %	60 %	40 %	528816823
2131	NC_021902	CTG	2	6	109374	109379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816823
2132	NC_021902	AGTT	2	8	109429	109436	25 %	50 %	25 %	0 %	528816823
2133	NC_021902	ACA	2	6	109487	109492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816823
2134	NC_021902	CAT	2	6	109509	109514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816824
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2136	NC_021902	TGA	2	6	109617	109622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816824
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2138	NC_021902	GCC	2	6	109711	109716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816824
2139	NC_021902	GAAA	2	8	109722	109729	75 %	0 %	25 %	0 %	528816824
2140	NC_021902	GGC	2	6	109773	109778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816824
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2142	NC_021902	AGCCGC	2	12	109961	109972	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528816824
2143	NC_021902	CGA	2	6	109974	109979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816824
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2145	NC_021902	GGT	2	6	110239	110244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816825
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2152	NC_021902	TGC	2	6	110595	110600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816825
2153	NC_021902	GGT	2	6	110608	110613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816825
2154	NC_021902	ACT	2	6	110625	110630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816825
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2159	NC_021902	CAT	2	6	110815	110820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816825
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2164	NC_021902	CTGG	2	8	110988	110995	0 %	25 %	50 %	25 %	528816826
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2229	NC_021902	CG	3	6	113487	113492	0 %	0 %	50 %	50 %	528816828
2230	NC_021902	A	7	7	113833	113839	100 %	0 %	0 %	0 %	528816829
2231	NC_021902	ATG	2	6	113858	113863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816829
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2233	NC_021902	GAC	2	6	113955	113960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816829
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2235	NC_021902	GCTG	2	8	114233	114240	0 %	25 %	50 %	25 %	528816829
2236	NC_021902	GGT	2	6	114309	114314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816829
2237	NC_021902	GCA	2	6	114333	114338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816829
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2239	NC_021902	GCA	2	6	114491	114496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816829
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2241	NC_021902	GA	3	6	114553	114558	50 %	0 %	50 %	0 %	528816829
2242	NC_021902	CAA	2	6	114622	114627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816829
2243	NC_021902	AGG	2	6	114647	114652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816829
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2245	NC_021902	TGA	2	6	114710	114715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816829
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2247	NC_021902	GA	3	6	114854	114859	50 %	0 %	50 %	0 %	528816830
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2368	NC_021902	TAC	2	6	121054	121059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816835
2369	NC_021902	CAC	2	6	121069	121074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816835
2370	NC_021902	GTAC	2	8	121108	121115	25 %	25 %	25 %	25 %	528816835
2371	NC_021902	GAT	2	6	121207	121212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816835
2372	NC_021902	CG	3	6	121286	121291	0 %	0 %	50 %	50 %	528816835
2373	NC_021902	GTA	2	6	121367	121372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816835
2374	NC_021902	GC	5	10	121418	121427	0 %	0 %	50 %	50 %	528816835
2375	NC_021902	CGGCAT	2	12	121435	121446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528816835
2376	NC_021902	TGG	2	6	121475	121480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816835
2377	NC_021902	CAG	2	6	121486	121491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816835
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2381	NC_021902	ATT	2	6	122513	122518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816837
2382	NC_021902	CGCC	2	8	122526	122533	0 %	0 %	25 %	75 %	528816837
2383	NC_021902	GCT	2	6	122538	122543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816837
2384	NC_021902	CTG	2	6	122552	122557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816837
2385	NC_021902	CGT	2	6	122572	122577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816837
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2388	NC_021902	TGG	2	6	122622	122627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816837
2389	NC_021902	ATT	2	6	122660	122665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816837
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2393	NC_021902	AAC	2	6	122956	122961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816837
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2395	NC_021902	CAG	2	6	123088	123093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816837
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2397	NC_021902	T	7	7	123168	123174	0 %	100 %	0 %	0 %	528816837
2398	NC_021902	A	6	6	123369	123374	100 %	0 %	0 %	0 %	528816838
2399	NC_021902	ATA	2	6	123415	123420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816838
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2402	NC_021902	TATG	2	8	123453	123460	25 %	50 %	25 %	0 %	528816838
2403	NC_021902	CAA	2	6	123503	123508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816838
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2406	NC_021902	GCT	2	6	123922	123927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816839
2407	NC_021902	TAT	2	6	123960	123965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816839
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2470	NC_021902	TATGG	2	10	129368	129377	20 %	40 %	40 %	0 %	528816843
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2485	NC_021902	GGT	2	6	129898	129903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816843
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2488	NC_021902	TGCG	2	8	130061	130068	0 %	25 %	50 %	25 %	528816843
2489	NC_021902	CGG	2	6	130069	130074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816843
2490	NC_021902	GAT	2	6	130078	130083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816843
2491	NC_021902	CAC	2	6	130135	130140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816843
2492	NC_021902	TGG	2	6	130217	130222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816843
2493	NC_021902	TTC	2	6	130259	130264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816843
2494	NC_021902	TGA	2	6	130350	130355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816843
2495	NC_021902	GTT	2	6	130426	130431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816843
2496	NC_021902	CGG	2	6	130456	130461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816843
2497	NC_021902	GGC	2	6	130487	130492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816843
2498	NC_021902	ACG	2	6	130497	130502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816843
2499	NC_021902	CGG	2	6	130503	130508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816843
2500	NC_021902	CAT	3	9	130537	130545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816843

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