MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021902	AGC	2	6	52527	52532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816764
1003	NC_021902	AGTG	2	8	52604	52611	25 %	25 %	50 %	0 %	528816765
1004	NC_021902	GCCA	2	8	52629	52636	25 %	0 %	25 %	50 %	528816765
1005	NC_021902	GCC	2	6	52697	52702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816765
1006	NC_021902	GC	4	8	52748	52755	0 %	0 %	50 %	50 %	528816766
1007	NC_021902	T	8	8	52767	52774	0 %	100 %	0 %	0 %	528816766
1008	NC_021902	ATC	2	6	52779	52784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816766
1009	NC_021902	CG	3	6	52834	52839	0 %	0 %	50 %	50 %	528816766
1010	NC_021902	GGC	2	6	52858	52863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816766
1011	NC_021902	GTCA	2	8	52868	52875	25 %	25 %	25 %	25 %	528816766
1012	NC_021902	CAA	2	6	53028	53033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816766
1013	NC_021902	GCA	2	6	53083	53088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816766
1014	NC_021902	GAA	2	6	53283	53288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816766
1015	NC_021902	CGG	2	6	53291	53296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816766
1016	NC_021902	TGG	2	6	53308	53313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816766
1017	NC_021902	GCG	2	6	53460	53465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816766
1018	NC_021902	GGC	2	6	53468	53473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816766
1019	NC_021902	GAC	2	6	53495	53500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816766
1020	NC_021902	CCG	2	6	53667	53672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816766
1021	NC_021902	AAC	2	6	53691	53696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816766
1022	NC_021902	GC	4	8	53704	53711	0 %	0 %	50 %	50 %	528816766
1023	NC_021902	TCG	2	6	53714	53719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816766
1024	NC_021902	TG	3	6	53799	53804	0 %	50 %	50 %	0 %	528816767
1025	NC_021902	GCG	2	6	53837	53842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816767
1026	NC_021902	CGG	2	6	53883	53888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816767
1027	NC_021902	GCA	2	6	53902	53907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816767
1028	NC_021902	GCA	2	6	53920	53925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816767
1029	NC_021902	CAG	3	9	53951	53959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816767
1030	NC_021902	GC	3	6	53970	53975	0 %	0 %	50 %	50 %	528816767
1031	NC_021902	TCA	2	6	54016	54021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816767
1032	NC_021902	GCG	2	6	54070	54075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816767
1033	NC_021902	GGGC	2	8	54078	54085	0 %	0 %	75 %	25 %	528816767
1034	NC_021902	T	6	6	54108	54113	0 %	100 %	0 %	0 %	528816767
1035	NC_021902	GTC	2	6	54158	54163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816767
1036	NC_021902	CGA	2	6	54181	54186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816767
1037	NC_021902	AAT	2	6	54221	54226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816767
1038	NC_021902	CAG	2	6	54296	54301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816767
1039	NC_021902	ATG	2	6	54327	54332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816767
1040	NC_021902	CGC	2	6	54346	54351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816767
1041	NC_021902	CCT	2	6	54376	54381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816767
1042	NC_021902	CAA	2	6	54427	54432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816767
1043	NC_021902	ATGTG	2	10	54438	54447	20 %	40 %	40 %	0 %	528816767
1044	NC_021902	GC	3	6	54455	54460	0 %	0 %	50 %	50 %	528816767
1045	NC_021902	AT	3	6	54486	54491	50 %	50 %	0 %	0 %	528816767
1046	NC_021902	TAT	2	6	54577	54582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816768
1047	NC_021902	GC	3	6	54799	54804	0 %	0 %	50 %	50 %	528816768
1048	NC_021902	C	6	6	54826	54831	0 %	0 %	0 %	100 %	528816768
1049	NC_021902	GC	3	6	54962	54967	0 %	0 %	50 %	50 %	528816768
1050	NC_021902	CGATG	2	10	55012	55021	20 %	20 %	40 %	20 %	528816768
1051	NC_021902	GCG	2	6	55046	55051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816768
1052	NC_021902	CGC	2	6	55066	55071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816768
1053	NC_021902	GAAA	2	8	55072	55079	75 %	0 %	25 %	0 %	528816768
1054	NC_021902	CCA	2	6	55114	55119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816768
1055	NC_021902	AGC	2	6	55133	55138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816768
1056	NC_021902	TGA	2	6	55156	55161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816768
1057	NC_021902	GC	3	6	55165	55170	0 %	0 %	50 %	50 %	528816768
1058	NC_021902	CGC	2	6	55231	55236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816768
1059	NC_021902	GACGGA	2	12	55336	55347	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528816768
1060	NC_021902	ACC	2	6	55445	55450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816768
1061	NC_021902	GC	3	6	55587	55592	0 %	0 %	50 %	50 %	528816768
1062	NC_021902	GAA	2	6	55673	55678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816768
1063	NC_021902	TTG	2	6	55685	55690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816768
1064	NC_021902	ACC	2	6	55718	55723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816768
1065	NC_021902	CGC	2	6	55728	55733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816768
1066	NC_021902	TC	3	6	55780	55785	0 %	50 %	0 %	50 %	528816769
1067	NC_021902	GGC	2	6	55809	55814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816769
1068	NC_021902	ACT	2	6	55844	55849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816769
1069	NC_021902	CG	3	6	55866	55871	0 %	0 %	50 %	50 %	528816769
1070	NC_021902	CGA	2	6	55897	55902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1071	NC_021902	G	6	6	55930	55935	0 %	0 %	100 %	0 %	528816769
1072	NC_021902	GGT	2	6	55949	55954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816769
1073	NC_021902	GGC	2	6	55970	55975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816769
1074	NC_021902	TCA	2	6	56093	56098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816769
1075	NC_021902	GCG	2	6	56116	56121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816769
1076	NC_021902	A	6	6	56191	56196	100 %	0 %	0 %	0 %	528816769
1077	NC_021902	GC	4	8	56274	56281	0 %	0 %	50 %	50 %	528816769
1078	NC_021902	CGGCG	2	10	56330	56339	0 %	0 %	60 %	40 %	528816769
1079	NC_021902	CG	3	6	56353	56358	0 %	0 %	50 %	50 %	528816769
1080	NC_021902	TGG	2	6	56359	56364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816769
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1082	NC_021902	CAG	2	6	56460	56465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1083	NC_021902	TGG	2	6	56472	56477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816769
1084	NC_021902	GCG	2	6	56533	56538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816769
1085	NC_021902	TCA	2	6	56548	56553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816769
1086	NC_021902	GTC	2	6	56565	56570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1087	NC_021902	CACG	2	8	56576	56583	25 %	0 %	25 %	50 %	528816769
1088	NC_021902	CTGGCG	2	12	56649	56660	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528816769
1089	NC_021902	ACT	2	6	56707	56712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816769
1090	NC_021902	TCC	2	6	56731	56736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816769
1091	NC_021902	GCC	2	6	56775	56780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816769
1092	NC_021902	GACACC	2	12	56805	56816	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	528816769
1093	NC_021902	CG	3	6	56820	56825	0 %	0 %	50 %	50 %	528816769
1094	NC_021902	GGCG	2	8	56840	56847	0 %	0 %	75 %	25 %	528816769
1095	NC_021902	ATC	2	6	56859	56864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816769
1096	NC_021902	GCTG	2	8	56865	56872	0 %	25 %	50 %	25 %	528816769
1097	NC_021902	GCA	2	6	56888	56893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1098	NC_021902	ATGG	2	8	56909	56916	25 %	25 %	50 %	0 %	528816769
1099	NC_021902	TCG	2	6	56917	56922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1100	NC_021902	GGC	2	6	56927	56932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816769
1101	NC_021902	GCG	2	6	56959	56964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816769
1102	NC_021902	TGGC	2	8	56975	56982	0 %	25 %	50 %	25 %	528816769
1103	NC_021902	CGA	2	6	57043	57048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1104	NC_021902	CAG	2	6	57089	57094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1105	NC_021902	CCG	2	6	57177	57182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816769
1106	NC_021902	CAA	2	6	57228	57233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816769
1107	NC_021902	ACC	2	6	57336	57341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816769
1108	NC_021902	GGT	2	6	57410	57415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816769
1109	NC_021902	CGC	2	6	57418	57423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816769
1110	NC_021902	TGA	2	6	57506	57511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816769
1111	NC_021902	GCTG	2	8	57517	57524	0 %	25 %	50 %	25 %	528816769
1112	NC_021902	CAG	2	6	57549	57554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1113	NC_021902	ATC	2	6	57625	57630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816769
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1115	NC_021902	A	6	6	57775	57780	100 %	0 %	0 %	0 %	528816769
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1118	NC_021902	GC	4	8	57946	57953	0 %	0 %	50 %	50 %	528816769
1119	NC_021902	GGC	2	6	58086	58091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816769
1120	NC_021902	GC	3	6	58174	58179	0 %	0 %	50 %	50 %	528816769
1121	NC_021902	ACG	2	6	58182	58187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
1122	NC_021902	TGG	2	6	58189	58194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816769
1123	NC_021902	CGGTC	2	10	58241	58250	0 %	20 %	40 %	40 %	528816769
1124	NC_021902	AGC	2	6	58307	58312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816769
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1126	NC_021902	GAT	2	6	58381	58386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816770
1127	NC_021902	CTGG	2	8	58425	58432	0 %	25 %	50 %	25 %	528816770
1128	NC_021902	GGC	2	6	58458	58463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816770
1129	NC_021902	A	6	6	58484	58489	100 %	0 %	0 %	0 %	528816770
1130	NC_021902	AGCTGG	2	12	58520	58531	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528816770
1131	NC_021902	TGA	2	6	58556	58561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816770
1132	NC_021902	A	6	6	58567	58572	100 %	0 %	0 %	0 %	528816770
1133	NC_021902	GCA	2	6	58602	58607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816770
1134	NC_021902	ACG	2	6	58658	58663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816770
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1138	NC_021902	AGA	2	6	58772	58777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816770
1139	NC_021902	GTC	2	6	58782	58787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816770
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1143	NC_021902	TCGT	2	8	58880	58887	0 %	50 %	25 %	25 %	528816770
1144	NC_021902	TGA	2	6	58890	58895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816770
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1149	NC_021902	GTAT	2	8	59193	59200	25 %	50 %	25 %	0 %	528816771
1150	NC_021902	A	7	7	59224	59230	100 %	0 %	0 %	0 %	528816771
1151	NC_021902	ATA	2	6	59261	59266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816771
1152	NC_021902	ATT	2	6	59300	59305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816771
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1157	NC_021902	A	6	6	59674	59679	100 %	0 %	0 %	0 %	528816771
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1160	NC_021902	TTGGCG	2	12	59795	59806	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528816771
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1165	NC_021902	TCCTG	2	10	59979	59988	0 %	40 %	20 %	40 %	528816771
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1167	NC_021902	A	6	6	60062	60067	100 %	0 %	0 %	0 %	528816771
1168	NC_021902	ATT	2	6	60153	60158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816771
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1239	NC_021902	CTGG	2	8	62649	62656	0 %	25 %	50 %	25 %	528816775
1240	NC_021902	GCT	2	6	62685	62690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816775
1241	NC_021902	TGC	2	6	62705	62710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816775
1242	NC_021902	GCG	2	6	62729	62734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816775
1243	NC_021902	GCA	2	6	62739	62744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816775
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1246	NC_021902	GGT	2	6	62825	62830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816776
1247	NC_021902	ACC	2	6	62859	62864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816776
1248	NC_021902	GC	3	6	62885	62890	0 %	0 %	50 %	50 %	528816776
1249	NC_021902	GCA	2	6	62945	62950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816776
1250	NC_021902	CGG	3	9	62956	62964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816776
1251	NC_021902	CGG	2	6	62981	62986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816776
1252	NC_021902	GCA	2	6	63001	63006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816776
1253	NC_021902	ACG	2	6	63049	63054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816776
1254	NC_021902	CGGTGA	2	12	63064	63075	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528816776
1255	NC_021902	GTG	3	9	63120	63128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816776
1256	NC_021902	CCG	2	6	63201	63206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816776
1257	NC_021902	ACC	2	6	63232	63237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816776
1258	NC_021902	GCC	2	6	63238	63243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816776
1259	NC_021902	TCA	2	6	63267	63272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816776
1260	NC_021902	GCT	2	6	63295	63300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1261	NC_021902	GCT	3	9	63322	63330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1262	NC_021902	GC	3	6	63356	63361	0 %	0 %	50 %	50 %	528816777
1263	NC_021902	CG	3	6	63367	63372	0 %	0 %	50 %	50 %	528816777
1264	NC_021902	GAT	2	6	63373	63378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816777
1265	NC_021902	GCT	2	6	63403	63408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1266	NC_021902	TG	3	6	63416	63421	0 %	50 %	50 %	0 %	528816777
1267	NC_021902	GCC	2	6	63527	63532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816777
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1269	NC_021902	GCT	3	9	63556	63564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1270	NC_021902	TGC	2	6	63570	63575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1271	NC_021902	TGA	2	6	63576	63581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816777
1272	NC_021902	TGGCGG	2	12	63594	63605	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528816777
1273	NC_021902	CGG	2	6	63624	63629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816777
1274	NC_021902	TCG	2	6	63633	63638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1275	NC_021902	GCT	2	6	63760	63765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1276	NC_021902	CGC	2	6	63792	63797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816777
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1279	NC_021902	GCT	2	6	63853	63858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1280	NC_021902	GCCC	2	8	63893	63900	0 %	0 %	25 %	75 %	528816777
1281	NC_021902	GGC	2	6	63910	63915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816777
1282	NC_021902	GCTCG	2	10	63943	63952	0 %	20 %	40 %	40 %	528816777
1283	NC_021902	CTA	2	6	63961	63966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816777
1284	NC_021902	GCTGG	2	10	63970	63979	0 %	20 %	60 %	20 %	528816777
1285	NC_021902	GGC	2	6	63980	63985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816777
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1288	NC_021902	TGGC	2	8	64028	64035	0 %	25 %	50 %	25 %	528816777
1289	NC_021902	CTG	2	6	64046	64051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
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1291	NC_021902	GCT	3	9	64099	64107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1292	NC_021902	CTG	2	6	64133	64138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
1293	NC_021902	GC	3	6	64199	64204	0 %	0 %	50 %	50 %	528816777
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1305	NC_021902	GCTGGG	2	12	64405	64416	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528816777
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1325	NC_021902	CTG	2	6	65123	65128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816777
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1342	NC_021902	AAC	2	6	65907	65912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816779
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1364	NC_021902	GCG	2	6	66537	66542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816779
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1373	NC_021902	CGG	2	6	66750	66755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816779
1374	NC_021902	ATG	2	6	66884	66889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816780
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1377	NC_021902	GTG	2	6	67114	67119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816780
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1414	NC_021902	ATC	2	6	68475	68480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816781
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1488	NC_021902	TCATG	2	10	72622	72631	20 %	40 %	20 %	20 %	528816789
1489	NC_021902	TCGC	2	8	72665	72672	0 %	25 %	25 %	50 %	528816789
1490	NC_021902	GTGA	2	8	72754	72761	25 %	25 %	50 %	0 %	528816790
1491	NC_021902	GTC	2	6	72775	72780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816790
1492	NC_021902	TTG	2	6	72865	72870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816790
1493	NC_021902	CGGAA	2	10	72880	72889	40 %	0 %	40 %	20 %	528816790
1494	NC_021902	CAG	2	6	72914	72919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816790
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1496	NC_021902	CAG	2	6	73009	73014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816790
1497	NC_021902	GCG	2	6	73019	73024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816790
1498	NC_021902	TTA	2	6	73087	73092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816790
1499	NC_021902	GCG	3	9	73100	73108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816790
1500	NC_021902	T	6	6	73168	73173	0 %	100 %	0 %	0 %	528816790

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