MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021902	CGG	2	6	25532	25537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816742
502	NC_021902	ATG	2	6	25540	25545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
503	NC_021902	TGA	2	6	25601	25606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
504	NC_021902	TGA	2	6	25699	25704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
505	NC_021902	CCA	2	6	25820	25825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816743
506	NC_021902	CGC	2	6	25862	25867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816743
507	NC_021902	TCA	2	6	25886	25891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816743
508	NC_021902	GAT	2	6	25925	25930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816743
509	NC_021902	GC	4	8	25938	25945	0 %	0 %	50 %	50 %	528816743
510	NC_021902	GCT	2	6	26000	26005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816743
511	NC_021902	TTC	2	6	26035	26040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816743
512	NC_021902	GCC	2	6	26043	26048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816743
513	NC_021902	GAC	2	6	26082	26087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816743
514	NC_021902	GCTG	2	8	26127	26134	0 %	25 %	50 %	25 %	528816743
515	NC_021902	CTG	2	6	26148	26153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816743
516	NC_021902	GCG	2	6	26195	26200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816743
517	NC_021902	CCA	2	6	26243	26248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816743
518	NC_021902	CAG	2	6	26280	26285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816743
519	NC_021902	T	6	6	26322	26327	0 %	100 %	0 %	0 %	528816743
520	NC_021902	GGC	2	6	26357	26362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816744
521	NC_021902	GAC	2	6	26386	26391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816744
522	NC_021902	GC	3	6	26406	26411	0 %	0 %	50 %	50 %	528816744
523	NC_021902	GC	3	6	26551	26556	0 %	0 %	50 %	50 %	528816744
524	NC_021902	TCAT	2	8	26604	26611	25 %	50 %	0 %	25 %	528816744
525	NC_021902	TGA	2	6	26650	26655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816744
526	NC_021902	GGT	2	6	26801	26806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816744
527	NC_021902	ACGCC	2	10	26809	26818	20 %	0 %	20 %	60 %	528816744
528	NC_021902	AAT	2	6	26894	26899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816744
529	NC_021902	AAG	2	6	26948	26953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816744
530	NC_021902	TCG	2	6	26978	26983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816744
531	NC_021902	GCAG	2	8	26988	26995	25 %	0 %	50 %	25 %	528816744
532	NC_021902	AG	3	6	27023	27028	50 %	0 %	50 %	0 %	528816744
533	NC_021902	GGT	2	6	27238	27243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816745
534	NC_021902	CA	3	6	27286	27291	50 %	0 %	0 %	50 %	528816745
535	NC_021902	ATA	2	6	27323	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816745
536	NC_021902	GC	3	6	27381	27386	0 %	0 %	50 %	50 %	528816745
537	NC_021902	TGG	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816745
538	NC_021902	GCGCG	2	10	27429	27438	0 %	0 %	60 %	40 %	528816745
539	NC_021902	GGC	2	6	27465	27470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
540	NC_021902	CAT	2	6	27542	27547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816745
541	NC_021902	GAT	2	6	27638	27643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816745
542	NC_021902	ACA	2	6	27677	27682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816745
543	NC_021902	AATC	2	8	27689	27696	50 %	25 %	0 %	25 %	528816745
544	NC_021902	CTG	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816745
545	NC_021902	ATC	3	9	27874	27882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816745
546	NC_021902	GCG	2	6	27884	27889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
547	NC_021902	GCC	2	6	27895	27900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816745
548	NC_021902	CG	3	6	27917	27922	0 %	0 %	50 %	50 %	528816745
549	NC_021902	TGA	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816745
550	NC_021902	GCG	2	6	28004	28009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
551	NC_021902	GCG	2	6	28025	28030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
552	NC_021902	CCG	2	6	28088	28093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816745
553	NC_021902	TTC	2	6	28195	28200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816746
554	NC_021902	CAG	2	6	28240	28245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
555	NC_021902	GCC	2	6	28313	28318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816746
556	NC_021902	TGA	2	6	28333	28338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816746
557	NC_021902	GC	3	6	28382	28387	0 %	0 %	50 %	50 %	528816746
558	NC_021902	AACC	2	8	28428	28435	50 %	0 %	0 %	50 %	528816746
559	NC_021902	GAC	2	6	28591	28596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
560	NC_021902	CAG	2	6	28666	28671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
561	NC_021902	GTG	2	6	28718	28723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816746
562	NC_021902	A	6	6	28742	28747	100 %	0 %	0 %	0 %	528816746
563	NC_021902	CGG	3	9	28764	28772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816746
564	NC_021902	CGA	2	6	28774	28779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
565	NC_021902	AGCC	2	8	28798	28805	25 %	0 %	25 %	50 %	528816746
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567	NC_021902	CAC	2	6	28921	28926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816746
568	NC_021902	AAT	2	6	28964	28969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816746
569	NC_021902	TCG	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816746
570	NC_021902	CCA	2	6	29025	29030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816746
571	NC_021902	AGC	2	6	29034	29039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
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573	NC_021902	CAT	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816746
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575	NC_021902	CGA	2	6	29139	29144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
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577	NC_021902	CAG	2	6	29577	29582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816747
578	NC_021902	GTC	2	6	29583	29588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816747
579	NC_021902	TGC	2	6	29623	29628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816747
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581	NC_021902	TAA	2	6	29673	29678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816747
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587	NC_021902	CGTC	2	8	29978	29985	0 %	25 %	25 %	50 %	528816747
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590	NC_021902	TCG	2	6	30067	30072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816747
591	NC_021902	CGG	2	6	30089	30094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816747
592	NC_021902	GAT	2	6	30099	30104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816747
593	NC_021902	CG	3	6	30149	30154	0 %	0 %	50 %	50 %	528816747
594	NC_021902	CAG	2	6	30207	30212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816747
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596	NC_021902	GC	3	6	30282	30287	0 %	0 %	50 %	50 %	528816747
597	NC_021902	AG	3	6	30351	30356	50 %	0 %	50 %	0 %	528816747
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600	NC_021902	CGCT	2	8	30561	30568	0 %	25 %	25 %	50 %	528816747
601	NC_021902	CAG	2	6	30627	30632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816747
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604	NC_021902	CG	3	6	30815	30820	0 %	0 %	50 %	50 %	528816747
605	NC_021902	CGA	2	6	30881	30886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816747
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610	NC_021902	TCT	2	6	31214	31219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816748
611	NC_021902	GGT	2	6	31239	31244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816748
612	NC_021902	TCT	2	6	31253	31258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816748
613	NC_021902	GAA	2	6	31263	31268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816748
614	NC_021902	GTA	2	6	31299	31304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816748
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616	NC_021902	GAT	2	6	31410	31415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816748
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621	NC_021902	ATG	2	6	31612	31617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816748
622	NC_021902	GA	3	6	31682	31687	50 %	0 %	50 %	0 %	528816748
623	NC_021902	CAAC	2	8	31695	31702	50 %	0 %	0 %	50 %	528816748
624	NC_021902	GGTGC	2	10	31724	31733	0 %	20 %	60 %	20 %	528816748
625	NC_021902	GCC	2	6	31738	31743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816748
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627	NC_021902	TTG	2	6	31876	31881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816748
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754	NC_021902	GGC	2	6	39133	39138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816754
755	NC_021902	GC	3	6	39214	39219	0 %	0 %	50 %	50 %	528816754
756	NC_021902	CTCTC	2	10	39232	39241	0 %	40 %	0 %	60 %	528816754
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