MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_021902	GC	3	6	459644	459649	0 %	0 %	50 %	50 %	528817147
9003	NC_021902	CGC	2	6	459657	459662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817147
9004	NC_021902	TGGC	2	8	459698	459705	0 %	25 %	50 %	25 %	528817147
9005	NC_021902	GTT	2	6	459765	459770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817148
9006	NC_021902	CGG	2	6	459779	459784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817148
9007	NC_021902	GGC	2	6	459786	459791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817148
9008	NC_021902	GCC	2	6	459802	459807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817148
9009	NC_021902	CGT	2	6	459921	459926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817148
9010	NC_021902	GCG	2	6	459981	459986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817148
9011	NC_021902	TCGGCG	2	12	459995	460006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528817148
9012	NC_021902	GCG	2	6	460027	460032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817148
9013	NC_021902	ATT	2	6	460044	460049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817148
9014	NC_021902	TGCT	2	8	460052	460059	0 %	50 %	25 %	25 %	528817148
9015	NC_021902	GGC	2	6	460074	460079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817148
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9017	NC_021902	CGA	2	6	460254	460259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817148
9018	NC_021902	CTG	2	6	460330	460335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817148
9019	NC_021902	TGC	2	6	460356	460361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817148
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9023	NC_021902	GGC	2	6	460614	460619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817148
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9033	NC_021902	CGC	2	6	460876	460881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817148
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9046	NC_021902	CG	3	6	461441	461446	0 %	0 %	50 %	50 %	528817148
9047	NC_021902	AG	3	6	461449	461454	50 %	0 %	50 %	0 %	528817148
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9053	NC_021902	GTAC	2	8	461886	461893	25 %	25 %	25 %	25 %	528817150
9054	NC_021902	AGA	2	6	461894	461899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817150
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9056	NC_021902	TGA	2	6	461912	461917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817150
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9059	NC_021902	TGA	2	6	462104	462109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817150
9060	NC_021902	CCGGTA	2	12	462153	462164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528817150
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9064	NC_021902	CAC	3	9	462315	462323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817150
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9087	NC_021902	AGGCG	2	10	463531	463540	20 %	0 %	60 %	20 %	528817152
9088	NC_021902	CG	3	6	463617	463622	0 %	0 %	50 %	50 %	528817152
9089	NC_021902	CTGG	2	8	463659	463666	0 %	25 %	50 %	25 %	528817152
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9094	NC_021902	CG	4	8	464460	464467	0 %	0 %	50 %	50 %	528817153
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9102	NC_021902	ATAA	2	8	464871	464878	75 %	25 %	0 %	0 %	528817153
9103	NC_021902	GGC	2	6	464904	464909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817154
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9106	NC_021902	GCT	2	6	464955	464960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817154
9107	NC_021902	GCGA	2	8	465037	465044	25 %	0 %	50 %	25 %	528817154
9108	NC_021902	GCA	2	6	465084	465089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817154
9109	NC_021902	CGG	2	6	465116	465121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817154
9110	NC_021902	TCG	2	6	465126	465131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817154
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9119	NC_021902	TTA	2	6	465402	465407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817155
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9121	NC_021902	CGC	2	6	465579	465584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817155
9122	NC_021902	ATG	2	6	465598	465603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817155
9123	NC_021902	TGC	2	6	465629	465634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817156
9124	NC_021902	TACCT	2	10	465636	465645	20 %	40 %	0 %	40 %	528817156
9125	NC_021902	TGC	2	6	465677	465682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817156
9126	NC_021902	TTG	2	6	465709	465714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817156
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9152	NC_021902	GCAGGA	2	12	467239	467250	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528817159
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9235	NC_021902	GCCA	2	8	471422	471429	25 %	0 %	25 %	50 %	528817163
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9239	NC_021902	ACC	2	6	471721	471726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817163
9240	NC_021902	CG	3	6	471770	471775	0 %	0 %	50 %	50 %	528817163
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9242	NC_021902	ACG	2	6	471801	471806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817163
9243	NC_021902	A	6	6	471810	471815	100 %	0 %	0 %	0 %	528817163
9244	NC_021902	CAA	2	6	471831	471836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817163
9245	NC_021902	ACG	2	6	471897	471902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817163
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9363	NC_021902	CGTCA	2	10	478774	478783	20 %	20 %	20 %	40 %	528817178
9364	NC_021902	GTC	2	6	478807	478812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817178
9365	NC_021902	TCC	2	6	479028	479033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817179
9366	NC_021902	GAAG	2	8	479063	479070	50 %	0 %	50 %	0 %	528817179
9367	NC_021902	GGAACT	2	12	479114	479125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528817179
9368	NC_021902	TGT	2	6	479153	479158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817179
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9373	NC_021902	A	6	6	479344	479349	100 %	0 %	0 %	0 %	528817180
9374	NC_021902	GTT	2	6	479376	479381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817180
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9377	NC_021902	CTG	2	6	479559	479564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817180
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9380	NC_021902	GTA	2	6	479652	479657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817180
9381	NC_021902	TC	3	6	479674	479679	0 %	50 %	0 %	50 %	528817180
9382	NC_021902	CTG	2	6	479713	479718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817180
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9385	NC_021902	CGT	2	6	479802	479807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817180
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9427	NC_021902	GTC	2	6	481726	481731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817185
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9433	NC_021902	AGTATT	2	12	482063	482074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	528817185
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9435	NC_021902	GTC	2	6	482152	482157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817185
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9463	NC_021902	GTCT	2	8	483953	483960	0 %	50 %	25 %	25 %	528817189
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9468	NC_021902	GTC	2	6	484100	484105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817189
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9471	NC_021902	GTT	2	6	484237	484242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817189
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9474	NC_021902	AGC	2	6	484301	484306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817189
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9476	NC_021902	GTAC	2	8	484352	484359	25 %	25 %	25 %	25 %	528817189
9477	NC_021902	TCTG	2	8	484383	484390	0 %	50 %	25 %	25 %	528817189
9478	NC_021902	TCG	2	6	484412	484417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817189
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9482	NC_021902	GCA	2	6	484837	484842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817190
9483	NC_021902	ATTC	2	8	484934	484941	25 %	50 %	0 %	25 %	528817190
9484	NC_021902	GAA	2	6	484943	484948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817190
9485	NC_021902	CTG	2	6	484970	484975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817190
9486	NC_021902	AGC	2	6	485023	485028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817190
9487	NC_021902	TCG	2	6	485110	485115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817190
9488	NC_021902	AAC	2	6	485136	485141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817190
9489	NC_021902	AGA	2	6	485188	485193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817190
9490	NC_021902	CGATC	2	10	485206	485215	20 %	20 %	20 %	40 %	528817190
9491	NC_021902	CTG	2	6	485216	485221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817190
9492	NC_021902	CTT	2	6	485324	485329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817190
9493	NC_021902	A	6	6	485348	485353	100 %	0 %	0 %	0 %	528817190
9494	NC_021902	GTC	2	6	485509	485514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817191
9495	NC_021902	CAG	2	6	485528	485533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817191
9496	NC_021902	ATC	2	6	485586	485591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817191
9497	NC_021902	GAC	2	6	485594	485599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817191
9498	NC_021902	TCG	2	6	485675	485680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817191
9499	NC_021902	GGT	2	6	485763	485768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817191
9500	NC_021902	GCT	2	6	485859	485864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817191

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