MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_021902	CG	3	6	311461	311466	0 %	0 %	50 %	50 %	528817012
6003	NC_021902	CGG	2	6	311479	311484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817012
6004	NC_021902	TGGA	2	8	311489	311496	25 %	25 %	50 %	0 %	528817012
6005	NC_021902	CAT	2	6	311651	311656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817012
6006	NC_021902	CCG	2	6	311676	311681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817012
6007	NC_021902	CTG	2	6	311819	311824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817012
6008	NC_021902	GGC	2	6	311836	311841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817012
6009	NC_021902	GGC	2	6	311854	311859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817012
6010	NC_021902	GCA	2	6	311926	311931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817012
6011	NC_021902	A	6	6	311966	311971	100 %	0 %	0 %	0 %	528817012
6012	NC_021902	GTG	2	6	311981	311986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817012
6013	NC_021902	GGC	2	6	312038	312043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817012
6014	NC_021902	CTA	2	6	312055	312060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817012
6015	NC_021902	GGC	2	6	312085	312090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817012
6016	NC_021902	GAG	2	6	312110	312115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528817012
6017	NC_021902	GGT	2	6	312173	312178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817012
6018	NC_021902	CGC	2	6	312387	312392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817013
6019	NC_021902	CGA	2	6	312415	312420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817013
6020	NC_021902	CGG	2	6	312430	312435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817013
6021	NC_021902	CGG	2	6	312454	312459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817013
6022	NC_021902	CGG	3	9	312484	312492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817013
6023	NC_021902	GCG	2	6	312495	312500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817013
6024	NC_021902	CGTC	2	8	312594	312601	0 %	25 %	25 %	50 %	528817013
6025	NC_021902	GGT	2	6	312634	312639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817013
6026	NC_021902	GCT	2	6	312646	312651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817013
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6028	NC_021902	GGC	2	6	312692	312697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817013
6029	NC_021902	CGC	2	6	312759	312764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817013
6030	NC_021902	GGT	2	6	312772	312777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817013
6031	NC_021902	GC	3	6	312813	312818	0 %	0 %	50 %	50 %	528817013
6032	NC_021902	GAA	2	6	312823	312828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817013
6033	NC_021902	TGG	2	6	312852	312857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817013
6034	NC_021902	CTG	2	6	312881	312886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817013
6035	NC_021902	GTG	2	6	312917	312922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817013
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6039	NC_021902	GGC	3	9	313317	313325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817014
6040	NC_021902	TGC	2	6	313366	313371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817014
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6042	NC_021902	GC	3	6	313403	313408	0 %	0 %	50 %	50 %	528817014
6043	NC_021902	CGG	5	15	313499	313513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817014
6044	NC_021902	GC	3	6	313526	313531	0 %	0 %	50 %	50 %	528817014
6045	NC_021902	CTTTGC	2	12	313574	313585	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528817014
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6048	NC_021902	TTA	2	6	313702	313707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817014
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6050	NC_021902	ATC	2	6	313771	313776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817014
6051	NC_021902	AGA	2	6	313838	313843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817014
6052	NC_021902	GAC	2	6	313851	313856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817014
6053	NC_021902	GAC	2	6	313929	313934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817014
6054	NC_021902	AGT	2	6	313942	313947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817014
6055	NC_021902	AGC	2	6	313951	313956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817014
6056	NC_021902	CAA	2	6	314042	314047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817014
6057	NC_021902	AGCGAT	2	12	314113	314124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528817014
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6059	NC_021902	GCC	2	6	314385	314390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817014
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6061	NC_021902	TAA	2	6	314435	314440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817014
6062	NC_021902	A	6	6	314535	314540	100 %	0 %	0 %	0 %	528817014
6063	NC_021902	CTT	2	6	314927	314932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817015
6064	NC_021902	GC	3	6	314985	314990	0 %	0 %	50 %	50 %	528817015
6065	NC_021902	AGA	2	6	314991	314996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817015
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6068	NC_021902	GTG	2	6	315153	315158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817015
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6070	NC_021902	GC	3	6	315273	315278	0 %	0 %	50 %	50 %	528817015
6071	NC_021902	ACTTT	2	10	315304	315313	20 %	60 %	0 %	20 %	528817015
6072	NC_021902	GA	3	6	315319	315324	50 %	0 %	50 %	0 %	528817015
6073	NC_021902	GC	3	6	315801	315806	0 %	0 %	50 %	50 %	528817016
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6081	NC_021902	TGG	3	9	316039	316047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817016
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6085	NC_021902	CGC	2	6	316330	316335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817017
6086	NC_021902	GCC	2	6	316428	316433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817017
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6088	NC_021902	ATC	2	6	316521	316526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817017
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6091	NC_021902	CAG	2	6	316874	316879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817017
6092	NC_021902	GCT	2	6	316888	316893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817017
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6094	NC_021902	CG	3	6	316924	316929	0 %	0 %	50 %	50 %	528817017
6095	NC_021902	ACGCC	2	10	317050	317059	20 %	0 %	20 %	60 %	528817017
6096	NC_021902	CGG	2	6	317096	317101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817017
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6103	NC_021902	C	6	6	317511	317516	0 %	0 %	0 %	100 %	528817017
6104	NC_021902	A	6	6	317528	317533	100 %	0 %	0 %	0 %	528817017
6105	NC_021902	CCG	2	6	317542	317547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817017
6106	NC_021902	AGCA	2	8	317660	317667	50 %	0 %	25 %	25 %	528817017
6107	NC_021902	ATA	2	6	317668	317673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817017
6108	NC_021902	CAAA	2	8	317701	317708	75 %	0 %	0 %	25 %	528817017
6109	NC_021902	TTA	2	6	317966	317971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817018
6110	NC_021902	GCAG	2	8	318006	318013	25 %	0 %	50 %	25 %	528817018
6111	NC_021902	TGC	2	6	318032	318037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817018
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6121	NC_021902	CCGC	2	8	318596	318603	0 %	0 %	25 %	75 %	528817018
6122	NC_021902	CCG	2	6	318659	318664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817018
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6237	NC_021902	GC	5	10	323698	323707	0 %	0 %	50 %	50 %	528817022
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6239	NC_021902	CAA	2	6	323802	323807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817022
6240	NC_021902	CGAG	2	8	323853	323860	25 %	0 %	50 %	25 %	528817022
6241	NC_021902	ATG	2	6	323914	323919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817022
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6243	NC_021902	GATC	2	8	324014	324021	25 %	25 %	25 %	25 %	528817022
6244	NC_021902	CCA	2	6	324059	324064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817022
6245	NC_021902	TTA	2	6	324118	324123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817022
6246	NC_021902	CGG	2	6	324159	324164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817022
6247	NC_021902	CGC	2	6	324170	324175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817022
6248	NC_021902	CGA	2	6	324221	324226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817022
6249	NC_021902	CTG	2	6	324304	324309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817022
6250	NC_021902	GGC	2	6	324316	324321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817022
6251	NC_021902	TTC	2	6	324325	324330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817022
6252	NC_021902	TCT	2	6	324472	324477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817023
6253	NC_021902	CGC	2	6	324509	324514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817023
6254	NC_021902	CAT	2	6	324527	324532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817023
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6257	NC_021902	CCT	2	6	324740	324745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817023
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6262	NC_021902	GTT	2	6	325113	325118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817024
6263	NC_021902	CTT	2	6	325128	325133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817024
6264	NC_021902	GCC	2	6	325157	325162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817024
6265	NC_021902	CG	3	6	325245	325250	0 %	0 %	50 %	50 %	528817024
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6273	NC_021902	TCGG	2	8	325611	325618	0 %	25 %	50 %	25 %	528817025
6274	NC_021902	TGC	2	6	325644	325649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817025
6275	NC_021902	TCCA	2	8	325664	325671	25 %	25 %	0 %	50 %	528817025
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6281	NC_021902	G	6	6	325897	325902	0 %	0 %	100 %	0 %	528817025
6282	NC_021902	CGG	2	6	325905	325910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817025
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6365	NC_021902	GCG	2	6	329755	329760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817030
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6480	NC_021902	GCCAG	2	10	334346	334355	20 %	0 %	40 %	40 %	528817033
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6486	NC_021902	GGC	2	6	334718	334723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817034
6487	NC_021902	CGAC	2	8	334778	334785	25 %	0 %	25 %	50 %	528817034
6488	NC_021902	CAG	2	6	334794	334799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817034
6489	NC_021902	CGG	2	6	334810	334815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817034
6490	NC_021902	A	6	6	334867	334872	100 %	0 %	0 %	0 %	528817034
6491	NC_021902	GCA	2	6	334889	334894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817034
6492	NC_021902	TCG	2	6	334951	334956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817034
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