MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021902	GCA	2	6	285160	285165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816990
5502	NC_021902	CAT	2	6	285218	285223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816990
5503	NC_021902	GTG	4	12	285357	285368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816990
5504	NC_021902	GAA	2	6	285429	285434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816990
5505	NC_021902	CCT	2	6	285454	285459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816990
5506	NC_021902	GGT	2	6	285521	285526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816990
5507	NC_021902	GGC	2	6	285590	285595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816990
5508	NC_021902	CCA	2	6	285638	285643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816990
5509	NC_021902	GCT	2	6	285650	285655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816990
5510	NC_021902	TGC	3	9	285661	285669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816990
5511	NC_021902	GGC	2	6	285719	285724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816990
5512	NC_021902	CCG	2	6	285733	285738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816990
5513	NC_021902	GC	5	10	285801	285810	0 %	0 %	50 %	50 %	528816990
5514	NC_021902	TGG	2	6	285820	285825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816990
5515	NC_021902	GGT	3	9	285842	285850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816990
5516	NC_021902	TAA	2	6	285899	285904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816990
5517	NC_021902	TCC	2	6	285936	285941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816990
5518	NC_021902	GCAG	2	8	286229	286236	25 %	0 %	50 %	25 %	528816991
5519	NC_021902	GGT	2	6	286431	286436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816991
5520	NC_021902	GCA	2	6	286466	286471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816991
5521	NC_021902	GCC	2	6	286496	286501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816991
5522	NC_021902	CTG	2	6	286563	286568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816991
5523	NC_021902	AAG	2	6	286570	286575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816991
5524	NC_021902	AGC	2	6	286644	286649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816991
5525	NC_021902	CAG	2	6	286672	286677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816991
5526	NC_021902	TGG	2	6	286692	286697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816991
5527	NC_021902	AGC	2	6	286753	286758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816991
5528	NC_021902	TTG	2	6	286825	286830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816991
5529	NC_021902	GC	3	6	286845	286850	0 %	0 %	50 %	50 %	528816991
5530	NC_021902	CGCC	2	8	286906	286913	0 %	0 %	25 %	75 %	528816991
5531	NC_021902	CGC	2	6	286930	286935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816991
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5533	NC_021902	TC	3	6	286985	286990	0 %	50 %	0 %	50 %	528816991
5534	NC_021902	GC	3	6	287064	287069	0 %	0 %	50 %	50 %	528816991
5535	NC_021902	GC	4	8	287159	287166	0 %	0 %	50 %	50 %	528816991
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5538	NC_021902	CG	3	6	287330	287335	0 %	0 %	50 %	50 %	528816991
5539	NC_021902	GTG	2	6	287388	287393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816991
5540	NC_021902	CAG	2	6	287478	287483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816991
5541	NC_021902	TGC	2	6	287509	287514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816991
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5543	NC_021902	CGG	2	6	287638	287643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816991
5544	NC_021902	CGT	2	6	287719	287724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816992
5545	NC_021902	AAT	2	6	287729	287734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816992
5546	NC_021902	GCC	2	6	287801	287806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816992
5547	NC_021902	AACG	2	8	287812	287819	50 %	0 %	25 %	25 %	528816992
5548	NC_021902	GTG	2	6	287856	287861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816992
5549	NC_021902	GC	3	6	287906	287911	0 %	0 %	50 %	50 %	528816992
5550	NC_021902	ACC	2	6	287955	287960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816992
5551	NC_021902	CTG	2	6	288089	288094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816992
5552	NC_021902	TTC	2	6	288098	288103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816992
5553	NC_021902	TTA	2	6	288132	288137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816992
5554	NC_021902	CCG	2	6	288153	288158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816992
5555	NC_021902	CAG	2	6	288185	288190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816992
5556	NC_021902	CCAG	2	8	288295	288302	25 %	0 %	25 %	50 %	528816992
5557	NC_021902	AGT	2	6	288328	288333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816992
5558	NC_021902	TGC	2	6	288429	288434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816992
5559	NC_021902	CGC	2	6	288550	288555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816992
5560	NC_021902	GAT	2	6	288862	288867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816993
5561	NC_021902	CAG	2	6	288881	288886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816993
5562	NC_021902	GTC	2	6	289016	289021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816993
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5564	NC_021902	TCA	2	6	289117	289122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816993
5565	NC_021902	T	6	6	289141	289146	0 %	100 %	0 %	0 %	528816993
5566	NC_021902	CGA	2	6	289205	289210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816993
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5569	NC_021902	TG	3	6	289308	289313	0 %	50 %	50 %	0 %	528816993
5570	NC_021902	GAT	2	6	289334	289339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816993
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5572	NC_021902	TGC	2	6	289422	289427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816993
5573	NC_021902	CTG	3	9	289460	289468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816993
5574	NC_021902	TGA	2	6	289473	289478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816993
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5580	NC_021902	TTG	2	6	289809	289814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816994
5581	NC_021902	GTG	2	6	289911	289916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816994
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5583	NC_021902	CG	3	6	290120	290125	0 %	0 %	50 %	50 %	528816994
5584	NC_021902	CAAGA	2	10	290175	290184	60 %	0 %	20 %	20 %	528816994
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5588	NC_021902	GAAC	2	8	290543	290550	50 %	0 %	25 %	25 %	528816994
5589	NC_021902	GCG	2	6	290563	290568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816994
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5593	NC_021902	GAA	2	6	290909	290914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816994
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5595	NC_021902	GGC	2	6	291018	291023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816994
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5598	NC_021902	CATC	2	8	291128	291135	25 %	25 %	0 %	50 %	528816994
5599	NC_021902	GCGG	2	8	291164	291171	0 %	0 %	75 %	25 %	528816994
5600	NC_021902	CGC	2	6	291287	291292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816994
5601	NC_021902	GCT	2	6	291293	291298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816994
5602	NC_021902	TGA	2	6	291328	291333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816994
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5604	NC_021902	GATT	2	8	291340	291347	25 %	50 %	25 %	0 %	528816994
5605	NC_021902	GCG	3	9	291438	291446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816994
5606	NC_021902	TAT	2	6	291590	291595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816994
5607	NC_021902	CGC	2	6	291607	291612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816994
5608	NC_021902	GGCG	2	8	291644	291651	0 %	0 %	75 %	25 %	528816994
5609	NC_021902	GCCCG	2	10	291656	291665	0 %	0 %	40 %	60 %	528816994
5610	NC_021902	GC	3	6	291672	291677	0 %	0 %	50 %	50 %	528816994
5611	NC_021902	CGCC	2	8	291712	291719	0 %	0 %	25 %	75 %	528816994
5612	NC_021902	TGA	2	6	291850	291855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816995
5613	NC_021902	CAG	2	6	291873	291878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816995
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5616	NC_021902	GCA	2	6	292052	292057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816995
5617	NC_021902	TCAGGC	2	12	292088	292099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528816995
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5619	NC_021902	CAG	2	6	292143	292148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816995
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5621	NC_021902	ATG	2	6	292177	292182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816995
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5986	NC_021902	CAG	2	6	310670	310675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817012
5987	NC_021902	CAA	2	6	310726	310731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817012
5988	NC_021902	CCA	2	6	310743	310748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817012
5989	NC_021902	TCA	2	6	310764	310769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817012
5990	NC_021902	CGA	2	6	310771	310776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817012
5991	NC_021902	GGC	2	6	310810	310815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817012
5992	NC_021902	CTG	2	6	310856	310861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817012
5993	NC_021902	GAA	2	6	311003	311008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817012
5994	NC_021902	TGCGC	2	10	311014	311023	0 %	20 %	40 %	40 %	528817012
5995	NC_021902	CTG	2	6	311039	311044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817012
5996	NC_021902	CCA	2	6	311076	311081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817012
5997	NC_021902	GCA	2	6	311098	311103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817012
5998	NC_021902	GC	3	6	311173	311178	0 %	0 %	50 %	50 %	528817012
5999	NC_021902	TAC	2	6	311231	311236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817012
6000	NC_021902	AGC	2	6	311277	311282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817012

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