MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021902	GAA	2	6	260649	260654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816970
5002	NC_021902	ACA	2	6	260759	260764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816970
5003	NC_021902	TCT	2	6	260912	260917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816970
5004	NC_021902	AGA	2	6	260957	260962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816970
5005	NC_021902	CGG	2	6	260993	260998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816970
5006	NC_021902	GC	3	6	261004	261009	0 %	0 %	50 %	50 %	528816970
5007	NC_021902	AGA	2	6	261015	261020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816970
5008	NC_021902	TC	3	6	261066	261071	0 %	50 %	0 %	50 %	528816970
5009	NC_021902	A	6	6	261085	261090	100 %	0 %	0 %	0 %	528816970
5010	NC_021902	GAT	2	6	261097	261102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816970
5011	NC_021902	CAT	2	6	261147	261152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816970
5012	NC_021902	GCG	2	6	261181	261186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816970
5013	NC_021902	CCG	2	6	261199	261204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816970
5014	NC_021902	ACG	2	6	261221	261226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816970
5015	NC_021902	GCT	2	6	261267	261272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816970
5016	NC_021902	AAG	2	6	261275	261280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816970
5017	NC_021902	CGT	2	6	261352	261357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816970
5018	NC_021902	GC	3	6	261441	261446	0 %	0 %	50 %	50 %	528816970
5019	NC_021902	TGA	2	6	261470	261475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816970
5020	NC_021902	CTT	2	6	261510	261515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816970
5021	NC_021902	GCC	2	6	261538	261543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816970
5022	NC_021902	CAA	2	6	261624	261629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816970
5023	NC_021902	ATC	2	6	261688	261693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816970
5024	NC_021902	AAG	2	6	261725	261730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816970
5025	NC_021902	AAT	2	6	261788	261793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816970
5026	NC_021902	CCTTTG	2	12	262016	262027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528816971
5027	NC_021902	TGA	2	6	262052	262057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816971
5028	NC_021902	CTG	2	6	262102	262107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5029	NC_021902	GCA	2	6	262137	262142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5030	NC_021902	G	6	6	262160	262165	0 %	0 %	100 %	0 %	528816971
5031	NC_021902	TCT	2	6	262382	262387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816971
5032	NC_021902	ATG	2	6	262396	262401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816971
5033	NC_021902	TGA	2	6	262473	262478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816971
5034	NC_021902	CCTG	2	8	262566	262573	0 %	25 %	25 %	50 %	528816971
5035	NC_021902	TCG	2	6	262624	262629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5036	NC_021902	GGA	2	6	262647	262652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816971
5037	NC_021902	TGC	2	6	262727	262732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5038	NC_021902	GTC	2	6	262735	262740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5039	NC_021902	GGCG	2	8	262773	262780	0 %	0 %	75 %	25 %	528816971
5040	NC_021902	TCT	2	6	262799	262804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816971
5041	NC_021902	GCTG	2	8	262823	262830	0 %	25 %	50 %	25 %	528816971
5042	NC_021902	CGC	2	6	262846	262851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816971
5043	NC_021902	GCG	2	6	262871	262876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816971
5044	NC_021902	CGA	2	6	262889	262894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5045	NC_021902	ATT	2	6	262897	262902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816971
5046	NC_021902	CTG	2	6	262912	262917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5047	NC_021902	CTG	2	6	262924	262929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816971
5048	NC_021902	GTG	2	6	262936	262941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816971
5049	NC_021902	AAG	2	6	262960	262965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816971
5050	NC_021902	CAT	2	6	262974	262979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816972
5051	NC_021902	AAT	2	6	262996	263001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816972
5052	NC_021902	CAA	2	6	263061	263066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816972
5053	NC_021902	GTC	2	6	263074	263079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816972
5054	NC_021902	GCT	2	6	263169	263174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816972
5055	NC_021902	CCG	2	6	263179	263184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816972
5056	NC_021902	GGC	2	6	263197	263202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816972
5057	NC_021902	GAT	2	6	263227	263232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816972
5058	NC_021902	GC	3	6	263267	263272	0 %	0 %	50 %	50 %	528816972
5059	NC_021902	CTG	2	6	263281	263286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816972
5060	NC_021902	TGG	2	6	263297	263302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816972
5061	NC_021902	CGG	2	6	263355	263360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816972
5062	NC_021902	CAT	3	9	263373	263381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816972
5063	NC_021902	CTG	3	9	263416	263424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816972
5064	NC_021902	GCTGGT	2	12	263427	263438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528816972
5065	NC_021902	CGCTG	2	10	263466	263475	0 %	20 %	40 %	40 %	528816972
5066	NC_021902	CG	3	6	263518	263523	0 %	0 %	50 %	50 %	528816972
5067	NC_021902	GGCG	2	8	263571	263578	0 %	0 %	75 %	25 %	528816972
5068	NC_021902	GCC	2	6	263712	263717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816972
5069	NC_021902	TGG	2	6	263773	263778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816972
5070	NC_021902	CTG	2	6	263806	263811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816972
5071	NC_021902	TTA	2	6	263897	263902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816973
5072	NC_021902	CGA	2	6	263932	263937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816973
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5074	NC_021902	TGG	2	6	264147	264152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816973
5075	NC_021902	GAT	2	6	264166	264171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816973
5076	NC_021902	TCG	2	6	264268	264273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816973
5077	NC_021902	AGCG	2	8	264276	264283	25 %	0 %	50 %	25 %	528816973
5078	NC_021902	GGC	2	6	264356	264361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816973
5079	NC_021902	TGA	2	6	264375	264380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816973
5080	NC_021902	ATT	2	6	264464	264469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816973
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5082	NC_021902	GCA	2	6	264487	264492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816973
5083	NC_021902	TGG	2	6	264537	264542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816973
5084	NC_021902	GCG	2	6	264548	264553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816973
5085	NC_021902	GTC	2	6	264584	264589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816973
5086	NC_021902	CG	3	6	264617	264622	0 %	0 %	50 %	50 %	528816973
5087	NC_021902	GTG	2	6	264707	264712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816973
5088	NC_021902	GACC	2	8	264725	264732	25 %	0 %	25 %	50 %	528816973
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5090	NC_021902	GTCA	2	8	264822	264829	25 %	25 %	25 %	25 %	528816973
5091	NC_021902	GAT	2	6	264848	264853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816973
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5093	NC_021902	GAA	2	6	264942	264947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816974
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5099	NC_021902	A	6	6	265216	265221	100 %	0 %	0 %	0 %	528816974
5100	NC_021902	CGT	2	6	265279	265284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816974
5101	NC_021902	GAT	2	6	265299	265304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816974
5102	NC_021902	CGG	2	6	265359	265364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816974
5103	NC_021902	CAGCGT	2	12	265366	265377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528816974
5104	NC_021902	CGA	2	6	265425	265430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816974
5105	NC_021902	GTGC	2	8	265456	265463	0 %	25 %	50 %	25 %	528816974
5106	NC_021902	TGA	2	6	265478	265483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816974
5107	NC_021902	GGT	2	6	265539	265544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816974
5108	NC_021902	CGCCA	2	10	265659	265668	20 %	0 %	20 %	60 %	528816974
5109	NC_021902	CGC	2	6	265736	265741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816974
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5111	NC_021902	TGG	2	6	265829	265834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816974
5112	NC_021902	TCAA	2	8	265989	265996	50 %	25 %	0 %	25 %	528816975
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5116	NC_021902	CGAAA	2	10	266169	266178	60 %	0 %	20 %	20 %	528816975
5117	NC_021902	ATA	2	6	266256	266261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816975
5118	NC_021902	TAAA	2	8	266309	266316	75 %	25 %	0 %	0 %	528816975
5119	NC_021902	GAT	2	6	266372	266377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816975
5120	NC_021902	ACGAGA	2	12	266470	266481	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	528816975
5121	NC_021902	AAT	2	6	266489	266494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816975
5122	NC_021902	ATGCG	2	10	266517	266526	20 %	20 %	40 %	20 %	528816975
5123	NC_021902	TGAA	2	8	266604	266611	50 %	25 %	25 %	0 %	528816975
5124	NC_021902	AAG	2	6	266622	266627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816975
5125	NC_021902	GAAA	2	8	266656	266663	75 %	0 %	25 %	0 %	528816975
5126	NC_021902	GCG	2	6	266670	266675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816975
5127	NC_021902	ATC	2	6	266712	266717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816975
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5129	NC_021902	ATA	2	6	266779	266784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816975
5130	NC_021902	CCG	2	6	266793	266798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816975
5131	NC_021902	CCA	2	6	266809	266814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816975
5132	NC_021902	ATA	2	6	266841	266846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816975
5133	NC_021902	AGG	2	6	266890	266895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816975
5134	NC_021902	ACC	2	6	266907	266912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816975
5135	NC_021902	TAAA	2	8	266922	266929	75 %	25 %	0 %	0 %	528816975
5136	NC_021902	ATA	2	6	267003	267008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816975
5137	NC_021902	GAT	2	6	267089	267094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816975
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5139	NC_021902	GTC	2	6	267272	267277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816975
5140	NC_021902	TGC	2	6	267407	267412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816976
5141	NC_021902	CTG	2	6	267417	267422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816976
5142	NC_021902	AAT	2	6	267440	267445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816976
5143	NC_021902	TCG	2	6	267447	267452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816976
5144	NC_021902	TCG	2	6	267486	267491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816976
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5148	NC_021902	CGC	2	6	268138	268143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816978
5149	NC_021902	CAC	2	6	268181	268186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816978
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5152	NC_021902	A	6	6	268370	268375	100 %	0 %	0 %	0 %	528816978
5153	NC_021902	CGCC	2	8	268381	268388	0 %	0 %	25 %	75 %	528816978
5154	NC_021902	GC	3	6	268456	268461	0 %	0 %	50 %	50 %	528816978
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5157	NC_021902	GAA	2	6	268520	268525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816978
5158	NC_021902	GC	3	6	268552	268557	0 %	0 %	50 %	50 %	528816978
5159	NC_021902	CCG	2	6	268570	268575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816978
5160	NC_021902	GCA	2	6	268615	268620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816978
5161	NC_021902	AAAG	2	8	268625	268632	75 %	0 %	25 %	0 %	528816978
5162	NC_021902	TTC	2	6	268658	268663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816978
5163	NC_021902	CAG	2	6	268724	268729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816978
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5229	NC_021902	CATT	2	8	271978	271985	25 %	50 %	0 %	25 %	528816982
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5232	NC_021902	GCA	2	6	272056	272061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816984
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5235	NC_021902	AGCG	2	8	272337	272344	25 %	0 %	50 %	25 %	528816984
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5237	NC_021902	TGCC	2	8	272483	272490	0 %	25 %	25 %	50 %	528816984
5238	NC_021902	TGC	2	6	272579	272584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816984
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5241	NC_021902	ATG	2	6	272711	272716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816984
5242	NC_021902	CCG	2	6	272732	272737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816984
5243	NC_021902	GCT	2	6	272768	272773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816985
5244	NC_021902	CCG	2	6	272778	272783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816985
5245	NC_021902	GC	3	6	272788	272793	0 %	0 %	50 %	50 %	528816985
5246	NC_021902	GAGC	2	8	272798	272805	25 %	0 %	50 %	25 %	528816985
5247	NC_021902	CCG	2	6	272819	272824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816985
5248	NC_021902	AGCGC	2	10	272844	272853	20 %	0 %	40 %	40 %	528816985
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5250	NC_021902	CCGC	3	12	272959	272970	0 %	0 %	25 %	75 %	528816985
5251	NC_021902	CTGG	2	8	273008	273015	0 %	25 %	50 %	25 %	528816985
5252	NC_021902	TGA	2	6	273016	273021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816985
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5254	NC_021902	GC	3	6	273066	273071	0 %	0 %	50 %	50 %	528816985
5255	NC_021902	ATGG	2	8	273101	273108	25 %	25 %	50 %	0 %	528816985
5256	NC_021902	GGAAAA	2	12	273149	273160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816985
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5265	NC_021902	CGCTT	2	10	273629	273638	0 %	40 %	20 %	40 %	528816985
5266	NC_021902	TGA	2	6	273680	273685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816985
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5270	NC_021902	GAT	2	6	273899	273904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816985
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5272	NC_021902	TCT	2	6	273922	273927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816985
5273	NC_021902	CTTT	2	8	274033	274040	0 %	75 %	0 %	25 %	528816985
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5362	NC_021902	T	6	6	278810	278815	0 %	100 %	0 %	0 %	528816988
5363	NC_021902	TTG	2	6	278868	278873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816988
5364	NC_021902	GCA	2	6	278927	278932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816988
5365	NC_021902	CGC	2	6	279041	279046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816988
5366	NC_021902	TGC	2	6	279160	279165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816988
5367	NC_021902	CGC	2	6	279172	279177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816988
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5369	NC_021902	CGA	2	6	279214	279219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816988
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5383	NC_021902	GGCA	2	8	279775	279782	25 %	0 %	50 %	25 %	528816988
5384	NC_021902	CGCGCC	2	12	279801	279812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816988
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5483	NC_021902	GCC	2	6	284106	284111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816989
5484	NC_021902	CGA	2	6	284116	284121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816989
5485	NC_021902	GCGT	2	8	284166	284173	0 %	25 %	50 %	25 %	528816989
5486	NC_021902	GAT	2	6	284183	284188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816989
5487	NC_021902	GAT	2	6	284288	284293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816989
5488	NC_021902	ATT	2	6	284312	284317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816989
5489	NC_021902	ATTG	2	8	284344	284351	25 %	50 %	25 %	0 %	528816989
5490	NC_021902	CG	3	6	284378	284383	0 %	0 %	50 %	50 %	528816989
5491	NC_021902	GAA	2	6	284456	284461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816989
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5493	NC_021902	CT	3	6	284666	284671	0 %	50 %	0 %	50 %	528816990
5494	NC_021902	CGTT	2	8	284776	284783	0 %	50 %	25 %	25 %	528816990
5495	NC_021902	GAT	2	6	284795	284800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816990
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5499	NC_021902	GATG	2	8	285056	285063	25 %	25 %	50 %	0 %	528816990
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