MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 90661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021902	GCTT	2	8	233865	233872	0 %	50 %	25 %	25 %	528816941
4502	NC_021902	CTGGCG	2	12	233933	233944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528816941
4503	NC_021902	GC	3	6	233946	233951	0 %	0 %	50 %	50 %	528816941
4504	NC_021902	TGG	2	6	233967	233972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816941
4505	NC_021902	TA	3	6	233986	233991	50 %	50 %	0 %	0 %	528816941
4506	NC_021902	TGA	3	9	234019	234027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816941
4507	NC_021902	ATG	2	6	234028	234033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816941
4508	NC_021902	CGG	2	6	234150	234155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816942
4509	NC_021902	GAT	2	6	234411	234416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816942
4510	NC_021902	CAT	2	6	234462	234467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816942
4511	NC_021902	GTA	2	6	234501	234506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816942
4512	NC_021902	CGC	2	6	234515	234520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816942
4513	NC_021902	CGC	2	6	234551	234556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816942
4514	NC_021902	T	6	6	234560	234565	0 %	100 %	0 %	0 %	528816942
4515	NC_021902	AAT	2	6	234588	234593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816942
4516	NC_021902	CATCAG	2	12	234606	234617	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528816942
4517	NC_021902	T	6	6	234637	234642	0 %	100 %	0 %	0 %	528816942
4518	NC_021902	GGT	2	6	234698	234703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816942
4519	NC_021902	GCA	2	6	234719	234724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816942
4520	NC_021902	T	6	6	234727	234732	0 %	100 %	0 %	0 %	528816942
4521	NC_021902	A	6	6	234820	234825	100 %	0 %	0 %	0 %	528816942
4522	NC_021902	GC	3	6	234836	234841	0 %	0 %	50 %	50 %	528816942
4523	NC_021902	A	8	8	234852	234859	100 %	0 %	0 %	0 %	528816942
4524	NC_021902	A	6	6	234876	234881	100 %	0 %	0 %	0 %	528816942
4525	NC_021902	CG	3	6	234896	234901	0 %	0 %	50 %	50 %	528816942
4526	NC_021902	GTA	2	6	234976	234981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816942
4527	NC_021902	ATC	2	6	234985	234990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816942
4528	NC_021902	TAA	3	9	235176	235184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816944
4529	NC_021902	TAA	2	6	235207	235212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816944
4530	NC_021902	TCTGT	2	10	235231	235240	0 %	60 %	20 %	20 %	528816944
4531	NC_021902	GAT	2	6	235241	235246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816944
4532	NC_021902	TGG	2	6	235258	235263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816944
4533	NC_021902	CAG	2	6	235299	235304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816944
4534	NC_021902	ACGC	2	8	235322	235329	25 %	0 %	25 %	50 %	528816944
4535	NC_021902	GGC	2	6	235358	235363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816943
4536	NC_021902	AG	3	6	235457	235462	50 %	0 %	50 %	0 %	528816943
4537	NC_021902	AAAC	2	8	235567	235574	75 %	0 %	0 %	25 %	528816945
4538	NC_021902	TCCT	2	8	235617	235624	0 %	50 %	0 %	50 %	528816945
4539	NC_021902	ATA	2	6	235651	235656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816946
4540	NC_021902	CCTG	2	8	235786	235793	0 %	25 %	25 %	50 %	528816946
4541	NC_021902	CG	3	6	235794	235799	0 %	0 %	50 %	50 %	528816946
4542	NC_021902	TCG	2	6	235841	235846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816946
4543	NC_021902	CCGA	2	8	235848	235855	25 %	0 %	25 %	50 %	528816946
4544	NC_021902	ACT	2	6	235891	235896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816946
4545	NC_021902	ACA	2	6	235930	235935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816946
4546	NC_021902	CAG	2	6	236100	236105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816946
4547	NC_021902	CGG	2	6	236108	236113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816946
4548	NC_021902	ACC	2	6	236232	236237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816946
4549	NC_021902	CAG	2	6	236346	236351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816946
4550	NC_021902	CTG	2	6	236352	236357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816946
4551	NC_021902	CGCTGC	2	12	236371	236382	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528816946
4552	NC_021902	GCC	2	6	236406	236411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816946
4553	NC_021902	CTG	2	6	236424	236429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816946
4554	NC_021902	TTA	2	6	236513	236518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816946
4555	NC_021902	CAA	2	6	236552	236557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816946
4556	NC_021902	TGG	2	6	236596	236601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816947
4557	NC_021902	CCA	2	6	236622	236627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816947
4558	NC_021902	TGC	2	6	236657	236662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4559	NC_021902	GCC	2	6	236721	236726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816947
4560	NC_021902	GC	3	6	236859	236864	0 %	0 %	50 %	50 %	528816947
4561	NC_021902	GCT	2	6	236921	236926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4562	NC_021902	CTG	2	6	237072	237077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4563	NC_021902	CTG	2	6	237201	237206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4564	NC_021902	GAA	2	6	237267	237272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816947
4565	NC_021902	GCA	2	6	237273	237278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4566	NC_021902	CTG	2	6	237315	237320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4567	NC_021902	GAA	2	6	237321	237326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816947
4568	NC_021902	TGG	2	6	237337	237342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816947
4569	NC_021902	GGT	2	6	237350	237355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816947
4570	NC_021902	TGCC	2	8	237391	237398	0 %	25 %	25 %	50 %	528816947
4571	NC_021902	GCT	2	6	237464	237469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4572	NC_021902	TCG	2	6	237484	237489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4573	NC_021902	GTG	2	6	237540	237545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816947
4574	NC_021902	TTC	3	9	237570	237578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816947
4575	NC_021902	ACCG	2	8	237582	237589	25 %	0 %	25 %	50 %	528816947
4576	NC_021902	A	6	6	237591	237596	100 %	0 %	0 %	0 %	528816947
4577	NC_021902	GACC	2	8	237668	237675	25 %	0 %	25 %	50 %	528816947
4578	NC_021902	TGA	2	6	237766	237771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816947
4579	NC_021902	CG	3	6	237824	237829	0 %	0 %	50 %	50 %	528816947
4580	NC_021902	ATG	2	6	237832	237837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816947
4581	NC_021902	TGTGGC	2	12	237851	237862	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528816947
4582	NC_021902	TGA	2	6	237896	237901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816947
4583	NC_021902	GC	3	6	237925	237930	0 %	0 %	50 %	50 %	528816947
4584	NC_021902	CGT	2	6	238017	238022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4585	NC_021902	TGC	2	6	238036	238041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4586	NC_021902	CAT	2	6	238043	238048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816947
4587	NC_021902	GAA	2	6	238055	238060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816947
4588	NC_021902	GAA	2	6	238089	238094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816947
4589	NC_021902	GAT	2	6	238140	238145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816947
4590	NC_021902	CGT	2	6	238230	238235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4591	NC_021902	GAA	2	6	238296	238301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816947
4592	NC_021902	GGC	3	9	238313	238321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816947
4593	NC_021902	GCG	2	6	238401	238406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816947
4594	NC_021902	TGC	2	6	238435	238440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816947
4595	NC_021902	TTGA	2	8	238488	238495	25 %	50 %	25 %	0 %	528816947
4596	NC_021902	GCTG	2	8	238496	238503	0 %	25 %	50 %	25 %	528816947
4597	NC_021902	GC	3	6	238508	238513	0 %	0 %	50 %	50 %	528816947
4598	NC_021902	TTC	2	6	238527	238532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816947
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4601	NC_021902	GT	3	6	238955	238960	0 %	50 %	50 %	0 %	528816948
4602	NC_021902	AG	3	6	238982	238987	50 %	0 %	50 %	0 %	528816948
4603	NC_021902	GCG	2	6	239089	239094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816948
4604	NC_021902	TAA	2	6	239213	239218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816948
4605	NC_021902	ATG	2	6	239221	239226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816948
4606	NC_021902	TCA	2	6	239549	239554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816949
4607	NC_021902	TAA	2	6	239559	239564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816949
4608	NC_021902	CTTA	2	8	239925	239932	25 %	50 %	0 %	25 %	528816950
4609	NC_021902	CTG	2	6	239972	239977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816950
4610	NC_021902	GCT	2	6	240162	240167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816950
4611	NC_021902	CAG	2	6	240168	240173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816950
4612	NC_021902	CA	3	6	240218	240223	50 %	0 %	0 %	50 %	528816950
4613	NC_021902	AAT	2	6	240390	240395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816951
4614	NC_021902	A	7	7	240406	240412	100 %	0 %	0 %	0 %	528816951
4615	NC_021902	T	6	6	240448	240453	0 %	100 %	0 %	0 %	528816951
4616	NC_021902	AATAA	2	10	240480	240489	80 %	20 %	0 %	0 %	528816951
4617	NC_021902	TGT	2	6	240677	240682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816952
4618	NC_021902	TTA	2	6	240687	240692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816952
4619	NC_021902	AAG	2	6	240724	240729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816952
4620	NC_021902	A	6	6	240816	240821	100 %	0 %	0 %	0 %	528816952
4621	NC_021902	GCA	2	6	240869	240874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816952
4622	NC_021902	GGT	2	6	240908	240913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816952
4623	NC_021902	GGCA	2	8	240973	240980	25 %	0 %	50 %	25 %	528816952
4624	NC_021902	A	6	6	241098	241103	100 %	0 %	0 %	0 %	528816952
4625	NC_021902	CGG	2	6	241144	241149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816952
4626	NC_021902	GCA	2	6	241163	241168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816952
4627	NC_021902	CAG	2	6	241251	241256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816952
4628	NC_021902	GCCA	2	8	241257	241264	25 %	0 %	25 %	50 %	528816952
4629	NC_021902	GCA	2	6	241295	241300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816952
4630	NC_021902	CGG	3	9	241324	241332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816952
4631	NC_021902	CGC	2	6	241405	241410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816953
4632	NC_021902	TTC	2	6	241427	241432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816953
4633	NC_021902	ATCA	2	8	241453	241460	50 %	25 %	0 %	25 %	528816953
4634	NC_021902	CAT	2	6	241480	241485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816953
4635	NC_021902	CGA	2	6	241530	241535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816953
4636	NC_021902	CAG	2	6	241549	241554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816953
4637	NC_021902	AT	3	6	241606	241611	50 %	50 %	0 %	0 %	528816953
4638	NC_021902	ACC	2	6	241652	241657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816953
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4640	NC_021902	CCT	2	6	241773	241778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816953
4641	NC_021902	CAA	2	6	241780	241785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816953
4642	NC_021902	CCT	2	6	241827	241832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816953
4643	NC_021902	GCC	2	6	241836	241841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816953
4644	NC_021902	GCGCCA	2	12	241890	241901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528816953
4645	NC_021902	CCA	2	6	242016	242021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816953
4646	NC_021902	CGG	2	6	242024	242029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816953
4647	NC_021902	CGC	2	6	242164	242169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816953
4648	NC_021902	T	6	6	242184	242189	0 %	100 %	0 %	0 %	528816953
4649	NC_021902	CAG	2	6	242191	242196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816953
4650	NC_021902	CG	3	6	242197	242202	0 %	0 %	50 %	50 %	528816953
4651	NC_021902	GC	3	6	242235	242240	0 %	0 %	50 %	50 %	528816953
4652	NC_021902	GCA	2	6	242325	242330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816953
4653	NC_021902	ATC	2	6	242332	242337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816953
4654	NC_021902	ATG	2	6	242357	242362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816953
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4658	NC_021902	CGG	2	6	242819	242824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816954
4659	NC_021902	GCT	3	9	242895	242903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816954
4660	NC_021902	ATT	2	6	242916	242921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816954
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4662	NC_021902	GTA	2	6	243015	243020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816954
4663	NC_021902	CGC	3	9	243026	243034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816954
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4665	NC_021902	GCC	2	6	243049	243054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816954
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4673	NC_021902	CCG	2	6	243441	243446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816955
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4682	NC_021902	TGG	2	6	244176	244181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816955
4683	NC_021902	CGAC	2	8	244260	244267	25 %	0 %	25 %	50 %	528816955
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4689	NC_021902	GAT	2	6	244420	244425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816955
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4692	NC_021902	CGG	2	6	244501	244506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816955
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4694	NC_021902	CGC	2	6	244652	244657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816955
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4702	NC_021902	CGG	2	6	244966	244971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816955
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4710	NC_021902	TCG	2	6	245445	245450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816955
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4716	NC_021902	GGTGG	2	10	245745	245754	0 %	20 %	80 %	0 %	528816956
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4722	NC_021902	TTC	2	6	246060	246065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816956
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4727	NC_021902	TCC	3	9	246485	246493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816957
4728	NC_021902	TGA	2	6	246524	246529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816957
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4730	NC_021902	CTG	2	6	246623	246628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816957
4731	NC_021902	TGA	2	6	246863	246868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816958
4732	NC_021902	GTTGT	2	10	246897	246906	0 %	60 %	40 %	0 %	528816958
4733	NC_021902	T	6	6	246931	246936	0 %	100 %	0 %	0 %	528816958
4734	NC_021902	CAA	2	6	246958	246963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816958
4735	NC_021902	AT	3	6	246966	246971	50 %	50 %	0 %	0 %	528816958
4736	NC_021902	ACG	2	6	246994	246999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816958
4737	NC_021902	ACG	2	6	247202	247207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816958
4738	NC_021902	TCA	2	6	247216	247221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816958
4739	NC_021902	CGA	2	6	247247	247252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816958
4740	NC_021902	GTCC	2	8	247330	247337	0 %	25 %	25 %	50 %	528816958
4741	NC_021902	CTGG	2	8	247434	247441	0 %	25 %	50 %	25 %	528816958
4742	NC_021902	GGC	2	6	247482	247487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816958
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4744	NC_021902	ATT	2	6	247532	247537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816958
4745	NC_021902	ATC	2	6	247656	247661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816959
4746	NC_021902	CCA	2	6	247675	247680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816959
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4748	NC_021902	GCT	2	6	248144	248149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816960
4749	NC_021902	CGT	2	6	248203	248208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816960
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4759	NC_021902	GTA	2	6	248805	248810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816961
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4767	NC_021902	CGG	2	6	249114	249119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816961
4768	NC_021902	TAA	2	6	249223	249228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816961
4769	NC_021902	A	6	6	249255	249260	100 %	0 %	0 %	0 %	528816961
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4774	NC_021902	TGCGCT	2	12	249470	249481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816962
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4779	NC_021902	GC	3	6	249692	249697	0 %	0 %	50 %	50 %	528816962
4780	NC_021902	GCGT	2	8	249754	249761	0 %	25 %	50 %	25 %	528816962
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4785	NC_021902	GC	3	6	249906	249911	0 %	0 %	50 %	50 %	528816962
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4847	NC_021902	TA	3	6	252576	252581	50 %	50 %	0 %	0 %	528816963
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4862	NC_021902	AAT	2	6	253571	253576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816964
4863	NC_021902	CTTG	2	8	253834	253841	0 %	50 %	25 %	25 %	528816965
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4988	NC_021902	CGG	2	6	259358	259363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816969
4989	NC_021902	CGG	2	6	259511	259516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816969
4990	NC_021902	GTT	2	6	259581	259586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816969
4991	NC_021902	AGTT	2	8	259624	259631	25 %	50 %	25 %	0 %	528816969
4992	NC_021902	TGG	2	6	260234	260239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816970
4993	NC_021902	GCA	2	6	260251	260256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816970
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4995	NC_021902	ATG	2	6	260342	260347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816970
4996	NC_021902	CTAT	2	8	260360	260367	25 %	50 %	0 %	25 %	528816970
4997	NC_021902	CAC	2	6	260394	260399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816970
4998	NC_021902	CG	3	6	260513	260518	0 %	0 %	50 %	50 %	528816970
4999	NC_021902	GAT	2	6	260530	260535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816970
5000	NC_021902	GGC	2	6	260593	260598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816970

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