MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Syncytium symbiont of Diaphorina citri

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021885	TTTAAT	2	12	633	644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317438
2	NC_021885	TAATTT	2	12	3355	3366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317440
3	NC_021885	ATTTTT	2	12	3379	3390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317440
4	NC_021885	ATTTAA	2	12	5576	5587	50 %	50 %	0 %	0 %	527317443
5	NC_021885	AGATAA	2	12	8872	8883	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527317447
6	NC_021885	CTGATT	2	12	12451	12462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527317451
7	NC_021885	CCCCGG	2	12	12628	12639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527317451
8	NC_021885	TCAAAG	2	12	12957	12968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527317451
9	NC_021885	CCATAA	2	12	13515	13526	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527317452
10	NC_021885	TCCTTT	2	12	13629	13640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317452
11	NC_021885	TTTATC	2	12	15527	15538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527317453
12	NC_021885	TATTAA	2	12	16432	16443	50 %	50 %	0 %	0 %	527317454
13	NC_021885	GAAATG	2	12	16999	17010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527317455
14	NC_021885	TCGTGT	2	12	17253	17264	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527317455
15	NC_021885	CTTTTA	2	12	17575	17586	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527317456
16	NC_021885	ATAAAA	2	12	17856	17867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317457
17	NC_021885	ATGTAG	2	12	21909	21920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317460
18	NC_021885	ATTGAT	2	12	24005	24016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	527317460
19	NC_021885	TAAAGG	2	12	25097	25108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527317461
20	NC_021885	CGTGAA	2	12	27105	27116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527317461
21	NC_021885	AAAGTT	2	12	27474	27485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527317461
22	NC_021885	GCAAGA	2	12	29590	29601	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527317464
23	NC_021885	TAAAAA	2	12	30480	30491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317464
24	NC_021885	CGTGCT	2	12	32918	32929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527317467
25	NC_021885	TATTAA	2	12	33330	33341	50 %	50 %	0 %	0 %	527317468
26	NC_021885	TATTCT	2	12	37696	37707	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527317478
27	NC_021885	AAAATA	2	12	39037	39048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317481
28	NC_021885	ATTTAA	2	12	39238	39249	50 %	50 %	0 %	0 %	527317481
29	NC_021885	TAAGGG	2	12	39404	39415	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	527317481
30	NC_021885	GGGTAA	2	12	40029	40040	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	527317483
31	NC_021885	TGGATC	2	12	40651	40662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527317485
32	NC_021885	ATTCCT	2	12	41148	41159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527317486
33	NC_021885	ATTAAA	2	12	41822	41833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317486
34	NC_021885	TGGTTA	2	12	44511	44522	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527317492
35	NC_021885	CGTCAT	2	12	45454	45465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527317493
36	NC_021885	ATGAAT	2	12	46412	46423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527317494
37	NC_021885	TACAGC	2	12	49659	49670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527317496
38	NC_021885	ATTTTT	2	12	52230	52241	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317498
39	NC_021885	TATACC	2	12	52609	52620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317498
40	NC_021885	TTCAGA	2	12	52981	52992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527317498
41	NC_021885	TTTCCC	2	12	54627	54638	0 %	50 %	0 %	50 %	527317499
42	NC_021885	ATAAAA	2	12	55005	55016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317499
43	NC_021885	TTCCAA	2	12	55127	55138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317500
44	NC_021885	ATTTTC	2	12	56297	56308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527317502
45	NC_021885	AGATTC	2	12	56573	56584	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527317502
46	NC_021885	TTCCTC	2	12	56641	56652	0 %	50 %	0 %	50 %	527317502
47	NC_021885	AATAAA	2	12	56837	56848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317502
48	NC_021885	AATTTA	2	12	62448	62459	50 %	50 %	0 %	0 %	527317505
49	NC_021885	AATGAT	2	12	65070	65081	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527317507
50	NC_021885	TTTTAA	2	12	70697	70708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317512
51	NC_021885	ATATTA	2	12	71863	71874	50 %	50 %	0 %	0 %	527317512
52	NC_021885	GTATTG	2	12	72578	72589	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527317513
53	NC_021885	ATTGGC	2	12	74105	74116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527317516
54	NC_021885	TAAATC	2	12	79531	79542	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527317519
55	NC_021885	AAAATT	2	12	79606	79617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317519
56	NC_021885	AAGGAC	2	12	80142	80153	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527317519
57	NC_021885	AAAAAT	2	12	80480	80491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317519
58	NC_021885	AAAAAT	2	12	84552	84563	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317522
59	NC_021885	CTAATT	2	12	86092	86103	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527317524
60	NC_021885	ATTTAA	2	12	86807	86818	50 %	50 %	0 %	0 %	527317525
61	NC_021885	ATTTCT	2	12	87595	87606	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527317525
62	NC_021885	AAATAA	2	12	90267	90278	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317528
63	NC_021885	AAAAAT	2	12	93123	93134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317529
64	NC_021885	AAAATA	2	12	93217	93228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317529
65	NC_021885	ATATTA	2	12	93709	93720	50 %	50 %	0 %	0 %	527317529
66	NC_021885	GGTTTT	2	12	94375	94386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317530
67	NC_021885	TATTAG	2	12	95704	95715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	527317531
68	NC_021885	ATTTTT	2	12	95754	95765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317531
69	NC_021885	ATCCAG	2	12	95834	95845	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527317532
70	NC_021885	ATCATT	2	12	97849	97860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527317534
71	NC_021885	TTAATT	2	12	98159	98170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317534
72	NC_021885	TAAAAA	2	12	101574	101585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527317537
73	NC_021885	GCGTAT	2	12	106992	107003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527317541
74	NC_021885	TAGAAA	2	12	110150	110161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527317544
75	NC_021885	TCATGT	2	12	110277	110288	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527317544
76	NC_021885	AATGGA	2	12	115470	115481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527317551
77	NC_021885	ATTGAA	2	12	115720	115731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527317552
78	NC_021885	ATTTTT	2	12	118319	118330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317553
79	NC_021885	TTCAAA	2	12	118487	118498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527317553
80	NC_021885	TATTTA	2	12	118963	118974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317553
81	NC_021885	TCGTTA	2	12	118997	119008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527317553
82	NC_021885	CAAAAA	2	12	119616	119627	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527317554
83	NC_021885	ATTTGT	2	12	121324	121335	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	527317557
84	NC_021885	TGAAAA	2	12	131092	131103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527317560
85	NC_021885	TTTTAA	2	12	131833	131844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317561
86	NC_021885	AGCATC	2	12	132193	132204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527317561
87	NC_021885	TCTATA	2	12	132857	132868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527317561
88	NC_021885	ATTTAA	2	12	134521	134532	50 %	50 %	0 %	0 %	527317563
89	NC_021885	AACTAA	2	12	135977	135988	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527317563
90	NC_021885	ATTTTT	2	12	136079	136090	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317563
91	NC_021885	AAGCAT	2	12	138148	138159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527317563
92	NC_021885	AATTCT	2	12	140055	140066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527317563
93	NC_021885	ATTATA	2	12	141024	141035	50 %	50 %	0 %	0 %	527317563
94	NC_021885	ACTTTA	2	12	141147	141158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527317563
95	NC_021885	GTTCCA	2	12	142254	142265	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527317563
96	NC_021885	ATTAGG	2	12	142343	142354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317563
97	NC_021885	ATTTTT	2	12	143280	143291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317563
98	NC_021885	TTCTTA	2	12	143547	143558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527317563
99	NC_021885	TAACAT	2	12	147704	147715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527317563
100	NC_021885	TGATAA	2	12	148979	148990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527317563
101	NC_021885	AATTAA	2	12	150555	150566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317564
102	NC_021885	TTTTTA	2	12	151232	151243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317564
103	NC_021885	GTTCCA	2	12	153895	153906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527317564
104	NC_021885	TTTAAT	2	12	155865	155876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317564
105	NC_021885	TTTTCA	2	12	156304	156315	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527317564
106	NC_021885	ATACAA	2	12	156688	156699	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527317564
107	NC_021885	TAATTT	2	12	157011	157022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317564
108	NC_021885	GACCAA	2	12	161432	161443	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	527317565
109	NC_021885	ATTTTT	2	12	161481	161492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317565
110	NC_021885	AATCCA	2	12	162214	162225	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527317566
111	NC_021885	TTTATT	2	12	162480	162491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317566
112	NC_021885	TAATTT	2	12	165244	165255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317568
113	NC_021885	CAATAA	2	12	166653	166664	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527317570
114	NC_021885	TTTTTA	2	12	167213	167224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317570
115	NC_021885	TATAAT	2	12	167278	167289	50 %	50 %	0 %	0 %	527317570
116	NC_021885	TAAATT	2	12	168195	168206	50 %	50 %	0 %	0 %	527317572
117	NC_021885	TTTCTG	2	12	172864	172875	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527317577
118	NC_021885	ACTAAA	2	12	174346	174357	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527317578
119	NC_021885	ATTACC	2	12	177363	177374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317582
120	NC_021885	ATCGTT	2	12	178322	178333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527317583
121	NC_021885	ATTTTT	2	12	179140	179151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	527317585
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.