MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	GA	3	6	3356	3361	50 %	0 %	50 %	0 %	526230601
2	NC_021871	GC	3	6	3401	3406	0 %	0 %	50 %	50 %	526230601
3	NC_021871	GC	3	6	5684	5689	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
4	NC_021871	GA	3	6	6265	6270	50 %	0 %	50 %	0 %	526230608
5	NC_021871	CG	4	8	7598	7605	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
6	NC_021871	AC	3	6	7732	7737	50 %	0 %	0 %	50 %	526230608
7	NC_021871	CG	3	6	7837	7842	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
8	NC_021871	GC	3	6	8875	8880	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
9	NC_021871	GA	3	6	10047	10052	50 %	0 %	50 %	0 %	526230608
10	NC_021871	AG	3	6	10229	10234	50 %	0 %	50 %	0 %	526230608
11	NC_021871	GC	3	6	11638	11643	0 %	0 %	50 %	50 %	526230609
12	NC_021871	AG	3	6	13312	13317	50 %	0 %	50 %	0 %	526230610
13	NC_021871	AT	3	6	13614	13619	50 %	50 %	0 %	0 %	526230611
14	NC_021871	TC	3	6	13775	13780	0 %	50 %	0 %	50 %	526230611
15	NC_021871	TG	3	6	15629	15634	0 %	50 %	50 %	0 %	526230612
16	NC_021871	GC	3	6	16599	16604	0 %	0 %	50 %	50 %	526230612
17	NC_021871	CG	3	6	17172	17177	0 %	0 %	50 %	50 %	526230613
18	NC_021871	GA	3	6	17326	17331	50 %	0 %	50 %	0 %	526230613
19	NC_021871	GA	3	6	17361	17366	50 %	0 %	50 %	0 %	526230613
20	NC_021871	GC	3	6	18194	18199	0 %	0 %	50 %	50 %	526230613
21	NC_021871	AC	3	6	20075	20080	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
22	NC_021871	TC	3	6	20278	20283	0 %	50 %	0 %	50 %	526230616
23	NC_021871	GC	3	6	20377	20382	0 %	0 %	50 %	50 %	526230616
24	NC_021871	CA	3	6	20471	20476	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
25	NC_021871	CA	3	6	20660	20665	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
26	NC_021871	TG	3	6	21183	21188	0 %	50 %	50 %	0 %	526230616
27	NC_021871	CA	3	6	21218	21223	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
28	NC_021871	AG	3	6	21605	21610	50 %	0 %	50 %	0 %	526230616
29	NC_021871	CT	3	6	21830	21835	0 %	50 %	0 %	50 %	526230617
30	NC_021871	GT	3	6	22166	22171	0 %	50 %	50 %	0 %	526230617
31	NC_021871	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	526230620
32	NC_021871	AG	3	6	26713	26718	50 %	0 %	50 %	0 %	526230622
33	NC_021871	GC	3	6	26863	26868	0 %	0 %	50 %	50 %	526230622
34	NC_021871	CG	3	6	27605	27610	0 %	0 %	50 %	50 %	526230624
35	NC_021871	TG	4	8	28060	28067	0 %	50 %	50 %	0 %	526230625
36	NC_021871	TG	3	6	29528	29533	0 %	50 %	50 %	0 %	526230630
37	NC_021871	GA	3	6	30496	30501	50 %	0 %	50 %	0 %	526230630
38	NC_021871	CA	3	6	33452	33457	50 %	0 %	0 %	50 %	526230636
39	NC_021871	GC	3	6	34406	34411	0 %	0 %	50 %	50 %	526230637
40	NC_021871	CT	3	6	34511	34516	0 %	50 %	0 %	50 %	526230637
41	NC_021871	AG	3	6	35265	35270	50 %	0 %	50 %	0 %	526230638
42	NC_021871	CG	3	6	35618	35623	0 %	0 %	50 %	50 %	526230639
43	NC_021871	CT	3	6	35637	35642	0 %	50 %	0 %	50 %	526230639
44	NC_021871	AT	3	6	35862	35867	50 %	50 %	0 %	0 %	526230639
45	NC_021871	TG	3	6	35874	35879	0 %	50 %	50 %	0 %	526230639
46	NC_021871	TG	3	6	36131	36136	0 %	50 %	50 %	0 %	526230639
47	NC_021871	GC	3	6	36231	36236	0 %	0 %	50 %	50 %	526230640
48	NC_021871	TA	3	6	36243	36248	50 %	50 %	0 %	0 %	526230640
49	NC_021871	CA	3	6	36330	36335	50 %	0 %	0 %	50 %	526230641
50	NC_021871	CA	3	6	37244	37249	50 %	0 %	0 %	50 %	526230643
51	NC_021871	CT	4	8	37543	37550	0 %	50 %	0 %	50 %	526230643
52	NC_021871	CG	3	6	38518	38523	0 %	0 %	50 %	50 %	526230646
53	NC_021871	TG	3	6	38642	38647	0 %	50 %	50 %	0 %	526230646
54	NC_021871	GC	3	6	41088	41093	0 %	0 %	50 %	50 %	526230651
55	NC_021871	GT	3	6	41105	41110	0 %	50 %	50 %	0 %	526230651
56	NC_021871	TG	3	6	41804	41809	0 %	50 %	50 %	0 %	526230652
57	NC_021871	TC	3	6	44269	44274	0 %	50 %	0 %	50 %	526230654
58	NC_021871	CG	3	6	45444	45449	0 %	0 %	50 %	50 %	526230658
59	NC_021871	TC	3	6	45751	45756	0 %	50 %	0 %	50 %	526230659
60	NC_021871	CG	3	6	45783	45788	0 %	0 %	50 %	50 %	526230659
61	NC_021871	GA	3	6	47754	47759	50 %	0 %	50 %	0 %	526230665
62	NC_021871	TC	3	6	47901	47906	0 %	50 %	0 %	50 %	526230665
63	NC_021871	GC	3	6	49112	49117	0 %	0 %	50 %	50 %	526230669
64	NC_021871	GT	3	6	49258	49263	0 %	50 %	50 %	0 %	526230669
65	NC_021871	AG	3	6	50567	50572	50 %	0 %	50 %	0 %	526230671
66	NC_021871	AC	3	6	50703	50708	50 %	0 %	0 %	50 %	526230671
67	NC_021871	TA	3	6	51418	51423	50 %	50 %	0 %	0 %	526230673
68	NC_021871	CG	3	6	51985	51990	0 %	0 %	50 %	50 %	526230674
69	NC_021871	AC	3	6	52071	52076	50 %	0 %	0 %	50 %	526230674
70	NC_021871	TC	3	6	52853	52858	0 %	50 %	0 %	50 %	526230675
71	NC_021871	CG	3	6	52953	52958	0 %	0 %	50 %	50 %	526230675
72	NC_021871	GT	3	6	54107	54112	0 %	50 %	50 %	0 %	526230676
73	NC_021871	CA	3	6	54357	54362	50 %	0 %	0 %	50 %	526230676
74	NC_021871	TA	3	6	54876	54881	50 %	50 %	0 %	0 %	526230676
75	NC_021871	AT	3	6	55671	55676	50 %	50 %	0 %	0 %	526230677
76	NC_021871	TA	3	6	56089	56094	50 %	50 %	0 %	0 %	526230677
77	NC_021871	CT	3	6	58049	58054	0 %	50 %	0 %	50 %	526230682
78	NC_021871	GC	3	6	58425	58430	0 %	0 %	50 %	50 %	526230683
79	NC_021871	TA	3	6	58960	58965	50 %	50 %	0 %	0 %	526230683
80	NC_021871	GC	3	6	59710	59715	0 %	0 %	50 %	50 %	526230684
81	NC_021871	AG	3	6	59985	59990	50 %	0 %	50 %	0 %	526230684
82	NC_021871	TA	3	6	60159	60164	50 %	50 %	0 %	0 %	526230684
83	NC_021871	GA	3	6	61504	61509	50 %	0 %	50 %	0 %	526230688
84	NC_021871	GC	4	8	62071	62078	0 %	0 %	50 %	50 %	526230689
85	NC_021871	GA	3	6	62234	62239	50 %	0 %	50 %	0 %	526230689
86	NC_021871	AG	4	8	63017	63024	50 %	0 %	50 %	0 %	526230692
87	NC_021871	AT	3	6	63105	63110	50 %	50 %	0 %	0 %	526230692
88	NC_021871	TA	4	8	64841	64848	50 %	50 %	0 %	0 %	526230693
89	NC_021871	AT	3	6	65732	65737	50 %	50 %	0 %	0 %	526230693
90	NC_021871	GA	3	6	66955	66960	50 %	0 %	50 %	0 %	526230694
91	NC_021871	TC	3	6	68958	68963	0 %	50 %	0 %	50 %	526230701
92	NC_021871	CT	3	6	69012	69017	0 %	50 %	0 %	50 %	526230701
93	NC_021871	AG	3	6	70934	70939	50 %	0 %	50 %	0 %	526230703
94	NC_021871	TA	3	6	71540	71545	50 %	50 %	0 %	0 %	526230705
95	NC_021871	TA	3	6	72135	72140	50 %	50 %	0 %	0 %	526230705
96	NC_021871	AT	3	6	72858	72863	50 %	50 %	0 %	0 %	526230706
97	NC_021871	GA	3	6	73152	73157	50 %	0 %	50 %	0 %	526230707
98	NC_021871	GT	3	6	74300	74305	0 %	50 %	50 %	0 %	526230710
99	NC_021871	TA	3	6	75344	75349	50 %	50 %	0 %	0 %	526230711
100	NC_021871	AT	3	6	75715	75720	50 %	50 %	0 %	0 %	526230712
101	NC_021871	TA	5	10	75843	75852	50 %	50 %	0 %	0 %	526230712
102	NC_021871	TC	3	6	77858	77863	0 %	50 %	0 %	50 %	526230716
103	NC_021871	AC	3	6	79481	79486	50 %	0 %	0 %	50 %	526230717
104	NC_021871	TA	3	6	82220	82225	50 %	50 %	0 %	0 %	526230720
105	NC_021871	TA	3	6	85382	85387	50 %	50 %	0 %	0 %	526230721
106	NC_021871	AT	3	6	85681	85686	50 %	50 %	0 %	0 %	526230721
107	NC_021871	AT	3	6	85958	85963	50 %	50 %	0 %	0 %	526230721
108	NC_021871	AT	3	6	88712	88717	50 %	50 %	0 %	0 %	526230724

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.