MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	CGCCTG	2	12	9356	9367	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526230608
2	NC_021871	CGAGGC	2	12	14827	14838	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526230612
3	NC_021871	CCTGCC	2	12	18232	18243	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	526230613
4	NC_021871	CAGCGT	2	12	20762	20773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526230616
5	NC_021871	CGATAC	2	12	26549	26560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526230622
6	NC_021871	TCATTA	2	12	35755	35766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	526230639
7	NC_021871	ATCGAT	2	12	36963	36974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230643
8	NC_021871	GCGGCT	2	12	37446	37457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526230643
9	NC_021871	CGAGGC	2	12	37644	37655	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526230643
10	NC_021871	TGACGT	2	12	38628	38639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526230646
11	NC_021871	CCGACA	2	12	40725	40736	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526230650
12	NC_021871	TGACCA	2	12	42586	42597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526230652
13	NC_021871	GTTCCA	2	12	50722	50733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526230671
14	NC_021871	ACACCC	2	12	58333	58344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230683
15	NC_021871	GCTGTC	2	12	60921	60932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230686
16	NC_021871	CACTGT	2	12	60933	60944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526230686
17	NC_021871	TAACCG	2	12	64267	64278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526230693
18	NC_021871	TTTTAA	2	12	75857	75868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230712
19	NC_021871	TGGATA	2	12	79254	79265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230717
20	NC_021871	TTGGTT	2	12	82077	82088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230720
21	NC_021871	TCCGTT	2	12	82441	82452	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	526230720
22	NC_021871	TTAATG	2	12	85083	85094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526230720
23	NC_021871	TTTCTT	2	12	89018	89029	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	526230724

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.